黑神目高以超高９８％的支持率成为箱庭学园的新任学生会长，她决定实现当初的政见，设置一个目标箱，随时接受每一位学生的任何请求。尽管她的青梅竹马人吉善吉并不太想加入学生会，而第一封投书是希望能够把不良少年赶出遭到霸占的剑道场，于是黑神带着人吉前往查看，三两下就把那些不良少年给摆平了，后来那些不良少年甚至都改邪归正。

就讀箱庭學園的少女黑神目高，是一名成績優秀，運動萬能，外表秀麗，家財萬貫，十全十美的一年級生，於第98代學生會長選舉中以壓倒性的98%支持度勝出。她根據選舉公約設置了「目標箱」，並招攬了青梅竹馬人吉善吉和其他特別的朋友作為成員，一起解決學生的問題。

隨著意見箱所引發的事越來越高調，統領學園的其他勢力開始注意到黑神的異常性。在合作不果後，這群人正式展開各種抗衡手段。這些爭鬥的過程，使黑神顯得更像一個實實在在的人類，繼而被要求去面對千絲萬縷的家族關係。儘管，她真正追求的事情，由始至終都十分簡單……

Kurokami Medaka is an exceptional first year student at Hanokiwa Academy who got elected as president of the student council with a smashing 98% of the votes. Extremely intelligent, strong, and rich; she wants to help anyone in need. To do that, she introduces a suggestion box that allows any student to contact her. Later known as the Medaka Box, it will bring forth incredible challenges to Kurokami and her friends of the student council.

Lycéenne de première année, Kurokami Medaka est une jeune fille qui souhaite obtenir le poste de présidente des élèves. Si elle remporte cette élection, elle prétend qu'elle est prête à résoudre tous les soucis, qu'ils soient sentimentaux, ou même familiaux des élèves. Elle leur affirme que s'ils confient par écrit ces problèmes dans une boîte spéciale, elle n'hésitera pas à leur venir en aide, de quelque manière que ce soit.

C'est ainsi que Medaka obtient le poste, grâce aux 98 % des voix que lui ont donné les élèves. Dès lors, elle demande à Hitoyoshi Zenkichi, un ami d'enfance, de rejoindre le conseil des étudiants, afin de la soutenir dans cette tâche…

Die Geschichte handelt von Medaka, dem stärksten Mädchen der Hanokiwa Academy, welches den Schulsprecherrat leitet. Die Schülerschaft kann 24 Stunden am Tag und 365 Tage im Jahr Wünsche und Beschwerden in die Vorschläge-Box einreichen, die Medaka eingeführt hat. Gemeinsam mit den Schülerratsmitgliedern Zenkichi, Akune und Kikaijima stellt sich Medaka den Herausforderungen in der Schule und versucht stets die Probleme der Schüler, welche oft von übernatürlicher Art sind und Kämpfe fordern, zu lösen.

Kurokami Medaka, primo anno, è subito eletta presidente del consiglio studentesco. Ella vuole migliorare la scuola, così la sua prima decisione è di istituire una casella di posta per i suggerimenti; inoltre costringe tutti gli studenti del consiglio a indossare la fascia con le loro competenze. Per fortuna Hitoyoshi Zenkichi, il suo amico d'infanzia, le verrà in aiuto...

24時間365日、私は誰からの相談でも受け付ける！！

支持率98%。ぶっちぎりのナンバーワンで第98代生徒会長となった箱庭学園一年十三組の「黒神めだか」は、

選挙戦での公約通り「目安箱」を設置する。

「貴様たちの夢は貴様たちの所有物だ。自ら挑み自ら叶えよ！しかし貴様たちの悩みは私の所有物だ。

ひとつ残らず私に貢げ！！」

生徒たちから投書された案件を幼馴染の「人吉善吉」と共に解決していくめだか。目安箱は、「めだかボックス」

などと呼ばれ、生徒たちから好評を博していた。

메다카는 학생들의 고민을 해결해준다는 것을 공약으로 내세워 98%라는 경이적인 투표율로 당선되었다. 하코니와 학원 내에 설치된 투서함은 24시간 365일, 어떤 학생이 어떤 고민이라도 투서할 수 있는, 통칭 「메다카 박스」! 학생들의 온갖 고민을 해결하기 위해 완벽한 학생회장 쿠로카미 메다카가 분투하는 날들이 시작됐다!!

Medaka Kurokami została wybrana na przewodniczącą Rady Studentów Akademii Hakoniwa i od razu postanowiła iż ma zamiar pomóc wszystkim studentom w szkole. Wraz z Zenkichim Hitoyoshi zbiera sugestię poszczególnych studentów i rozpoczyna długą pracę podczas, której rozwiązuje problemy tak banalne jak sprzątanie klubowego pomieszczenia, poprzez poszukiwania zaginionych psów aż do pomocy w ustaleniu osobowości. Podczas trwania serii Kouki Akune i Mogana Kikaijima dołączają do Rady Studentów, aby pomóc bohaterom w rozwiązywaniu problemów.

Kurokami Medaka, estudante do primeiro ano, é eleita como presidente do conselho estudantil, e a primeira coisa que ela faz é estabelecer uma caixa de sugestões, mais tarde apelidada pelos alunos por "Medaka Box". Medaka incentiva os alunos a apresentarem qualquer problema para a caixa sem hesitação e promete resolver qualquer problema que lhe foi informado.

Desde que Medaka ganhou as eleições como membro do Conselho com 98% dos votos, ela acaba sendo a única membro do conselho, então ela pede a seu amigo de infância, Hitoyoshi Zenkichi, para ajuda-la, assim tornando-o um novo membro do Conselho de Estudantil. Logo Medaka recrutas mais duas pessoas para o conselho, o ex-membro do clube de judô Akune Kouki como secretário e a atual membro do clube de natação Kikaijima Mogana, por empréstimo de ¥ 300 por dia, como tesoureira.

Agora os membros do Conselho Estudantil passam os dias solucionando os problemas apresentados pela Medaka Box.

Президент, который управляет советом академией Ханокива, юная Мэдаки Кураками просто хотела быть любимой. Для этого выдающейся во всех отношениях девушке пришлось осчастливить людей, и начать ей пришлось со своих одноклассников. Она повесила всем известный ящик для предложений, и выбрала своими помощниками нескольких ребят, чтобы они помогли ей создать новую более интересную студенческую жизнь. Вот только девушка представляла совсем не так всеобщее блага как все остальные, в итоге это просто разрушило академию, да и девушка поняла, что она не слишком нормальная.

Medaka Kurokami es, en el verdadero sentido de la palabra, perfecta. Hermosa, inteligente y atlética, el sueño de Medaka es hacer felices a los demás. Así que cuando se postule para la Presidenta del Consejo Estudiantil de la prestigiosa Academia Hakoniwa, solo se puede ganar la elección con el 98% de los votos. Lo primero que hace el nuevo presidente es crear una "Caja de Medaka", una caja de sugerencias que permite a los estudiantes enviar cualquier tipo de solicitud de asistencia. Junto con la cínica Zenkichi Hitoyoshi, su amiga de la infancia que ha sido fuerte para ayudar, Medaka cumple estas solicitudes a un ritmo ridículo. Por cada trabajo completado, agrega flores a la sala del consejo estudiantil, con el objetivo de llenar toda la escuela. Sin embargo, ¡los dos están a punto de descubrir que ayudar a los demás puede ser mucho más difícil de lo que piensan cuando comienzan a descubrir un plan devastador centrado en la academia e incluso en la propia Medaka!