A medida que los cadáveres sin cabeza comienzan a aparecer en Metrópolis, Lois y Clark escapan de los espeluznantes titulares a una isla tropical.

Lois y Clark van de incógnito como marido y mujer para investigar a las parejas desaparecidas en el Instituto Larry Smiley, un lugar para ayudar a las parejas a reparar los problemas de sus matrimonios. Encontrarán los verdaderos planes de Larry y volverán a encontrar su romance.

Los padres de Lois y Clark aparecen para pasar la Navidad con ellos. Mindy Church reorganiza la Intergang y crea un virus kryptoniano para hacer morir a Superman. Ahora y por primera vez en su vida, Clark está enfermo, pero esta enfermedad puede matarlo, a menos que Sam Lane lo ayude con un arriesgado proceso de recuperación.

Las chispas no vuelan en el matrimonio de Clark. Mientras tanto, la vida de Lois se desarrolla como una mala novela después de que Lex escapa de la prisión.

Mientras los alienígenas le traen a Superman el conocimiento de su pasado y su destino, un aterrador asesino es enviado para deshacerse del superhéroe. Mientras tanto, Lois teme que Clark se esté alejando de ella.

Superman deja la Tierra para ir a Nueva Krypton para ayudar a los habitantes de su tierra natal en su guerra civil contra el siniestro Lord Nor. Mientras tanto, en Smallville, Nor mantiene a los padres de Clark como rehenes como esclavos.

Después de que Superman es desenmascarado como un impostor en un tribunal kryptoniano, el Hombre de Acero se enfrenta a Nor en un combate mortal.

Superman ayuda a Lois a escapar de la prisión, solo para encontrarse con la ira del vengativo Prof. Cole, quien conspira para aniquilar Metrópolis.

Con Superman perdido en un túnel del tiempo, un Superman alternativo de otra dimensión ayuda a Lois a combatir al diabólico Tempus, el nuevo presidente electo.

Lois y Clark recurren al padre de Lois mientras luchan contra problemas de infertilidad; Un ex convicto telequinético convierte su mente en un arma mortal.