Gjerningsmannens femte og siste problem er vår likegyldighet overfor barnearbeid. En skolebuss med barn forsvinner, og gjerningsmannen krever en motytelse for å slippe dem fri. Saga begynner å mistenke at gjerningsmannen er politi.

Saga og Martin avhører en mistenkt som viser seg å ha alibi for alle forbrytelsene. Gjerningsmannen er ferdig. Han har klart å sette søkelyset på fem problemer i samfunnet, men Saga har en følelse av at det vil komme mer.

Sporene og ledetrådene i etterforskningen leder Saga og Martin til en person som kan være gjerningsmannen. Etter hvert som de nærmer seg, blir saken plutselig mer personlig for Martin enn han hadde forestilt seg.

Saga er skadet etter en konfrontasjon med gjerningsmannen, som klarte å komme seg unna, men hun og Martin nekter å gi opp og gjør alt for å løse saken. Det blir en katt-og-mus-lek der gjerningsmannen har overtaket.

13 måneder etter hendelsene i første sesong begynner den ferske samboeren Saga Norén å etterforske en tilsynelatende bevisst smittespredning. Martin, som er nyseparert og kjemper med fortiden, blir også koblet inn i saken.

Fire personer iført dyremasker tar på seg ansvaret for smitten ved å legge ut en film på nettet. Samtidig blir det slått alarm om at flere har dødd av å spise blant annet forgiftede epler. Saga og Martin skjønner at sakene henger sammen.

Saga og Martin får et anonymt tips om hvor miljøaktivistene holder til, men når de skal slå til, er gruppen som sunket i jorden. Miljøaktivistene håper på nye og større oppdrag, men det råder uenighet i gruppen.

Saga og Martin etterforsker mordene på miljøaktivistene og mistenker at lederen deres fortsatt lever. Sporene fører til en IT-bedrift i København, men han ser ut til å ha gått under jorden. Samtidig får Martin stadig bedre kontakt med Pernille.

Saga og Martin finner ut hvem gjerningsmannen er, og kjemper for å nå frem i tide, men faren er langt fra over. Ledetrådene peker mot Kastrup flyplass, og vennskapet mellom Saga og Martin blir satt på prøve.

Saga og Martin innser at det finnes nok en gjerningsmann, og må forhindre en katastrofe som kan medføre tap av mange menneskeliv. Martin tar en viktig avgjørelse, og Saga står overfor et valg som vil endre alt.

Når en kjent dansk kjønnsdebattant og eieren av Københavns første kjønnsnøytrale barnehage blir funnet myrdet i Malmö, blir Saga tvunget til å samarbeide med en ny dansk kollega som har vondt for å godta Saga. De ser at morderen har vært nøye med de estetiske detaljene.

Det skjer enda et mord med samme detaljrikdom. Mistanken rettes nå mot den danske bloggeren Lise Friis Andersen. Men når Saga innser at sjefen hennes har blitt kidnappet, bruker hun heller alle sine krefter på finne ham.

Kan Lise Friis Andersen brukes som agn? Alle ofrene ser ut til å ha en forbindelse til henne. Kidnapperne krever løsepenger for Hans. Saga er preget av kidnappningsdramaet og har problemer med den nye sjefen. Sagas mor lar henne heller ikke være i fred.

Mens Hans fortsatt ligger i koma, oppdager man at det er begått et fjerde spektakulært mord. En mistenkt blir pågrepet og tatt inn til forhør. Saga gjør en feil i en gisselsituasjon, og overraskende fakta dukker opp i etterforskningen.

Lillian oppdager en ting på sykehuset: Hans har et brennemerke i munnen. De to andre ofrene blir undersøkt på nytt, og det viser seg at de har samme type merke. Saga finner ut at Linn er i kontakt med moren hennes og nå begynner å undersøke Sagas bakgrunn.

Saga blir stadig mer presset av sjefen sin, Linn. Hun og Henrik oppdager en sammenheng mellom mordofrene og noen kunstverk de ser på et museum. Alle kunstverkene tilhører en kjent dansk forretningsmann. Henrik bærer fortsatt på sin store hemmelighet.

Et eldre par blir funnet myrdet utenfor Ystad. Begge har brennemerker i munnen, akkurat som de andre ofrene. Saga og Henrik finner endelig et spor etter den mistenkte morderen, og jakten kan starte på begge sider av Øresund.

Jakten på morderen blir trappet opp. En interngransker besøker igjen Saga og sår tvil om hun er skikket til jobben. Saga og Henrik er nå overbevist om hvem morderen er, men stemmer teorien deres? Akkurat idet de skal fange morderen, har vedkommende forsvunnet.

Saga er blitt tvunget til å ta fri fra etterforskningen, og hennes gamle kollega Rasmus Larsson vikarierer. Freddie Holst leter febrilsk etter Jeanette, som bærer hans ufødte barn. Etterforskningen av dødsfallet til Sagas mor er fullført, og spørsmålet er om Saga vil bli holdt ansvarlig.

Jakten på gjerningsmannen og Freddies nyfødte barn fortsetter. Freddie får en SMS fra kidnapperen med et bilde av barnet og et møtested. Saga og Henrik finner avgjørende ledetråder. Men vil de komme frem i tide?

Nesten to år etter hendelsene i sesong tre blir en kvinne brutalt myrdet ved broovergangen på Pepparholmen. Henrik begynner å etterforske mordet, men savner Saga. Hun sitter i kvinnefengsel i Ystad, dømt for mordet på sin mor.

Henrik og kollegaen Jonas fortsetter å etterforske mordet på Margrethe Thormod. Deres to hovedspor er den venstreradikale gruppen Red October og den forsvunne flyktningen Taariq. Saga er nå frikjent og vil begynne å jobbe igjen.

Den svenske journalisten Richard, ekspert på venstreradikale grupper, er forsvunnet, men dukker plutselig opp igjen og avviser at Red October er innblandet i mordet. Saga og Henrik avhører ham og finner hull i forklaringen hans.

Taariq er fortsatt på frifot. Han har kjent igjen bilen som kidnappet Margrethe Thormod, og oppsøker eieren for å presse ham for penger. Et nytt mord på sykehuset i Malmö ser ut til å ha koblinger til de andre to mordene.