Hank Galliston è l'editore in capo del Modern Skeptic e ha trascorso la sua vita a smascherare leggende metropolitane e finte cospirazioni. Adesso Hank si ritrova al centro di una massiccia e intricata rete di misteri in seguito al rapimento di sua moglie Laila per mano di un terrorista internazionale noto come White Vincent. Ad aiutarlo nelle ricerche ci sono l'Agente dell'FBI Rebecca Riley e i redattori del Modern Skeptic, Arron e Rachel.

Hank e Beck si trovano faccia a faccia con White Vincent nella tundra Canadese e Hank si trova con più domande che risposte, non soltanto in merito a sua moglie ma anche alla sua stessa esistenza, la sua ricerca del prossimo orologio. Determinati a decifrare il prossimo indizio, Hank e Beck si recano in India dove Hank viene messo di fronte a una verità scioccante. Rachel e Arron intanto stanno lavorando su un'altra pista che li porterà a scoprire la fine del misterioso Comandante.

Hank torna dall'India ancora più determinato a trovare sua moglie. Laila invece, in ostaggio di Vincent, è incaricata di riparare il prossimo orologio, ma sapendo che Hank è sulle sue tracce gli lascia una scia di indizi da seguire. Hank, Arron e Rachel riescono a scoprire chi possiede la chiave del prossimo orologio grazie all'intervento dell'FBI. Intanto i genitori di Hank stanno nascondendo un segreto.

White Vincent è ferito, ma Laila è ancora sua prigioniera; la donna si offre di curarlo con l'intenzione di trovare un modo per fuggire. L'uomo sa che ha bisogno di aiuto per trovare il prossimo orologio, così ingaggia Hank e per raggiungere lo scopo gli propone uno scambio con la moglie.

Frustrati e confusi riguardo la possibilità che Laila possa essere una Shepherd, Hank e Beck raggiungono Asunción, Paraguay, solo per imbattersi di nuovo in Vincent. Anche lui infatti è sulle tracce della misteriosa moglie di Hank e condivide con Hank delle informazioni riguardo il loro passato.

Hank visita i suoi genitori per avere delle risposte e scopre nuovi misteri riguardanti il suo passato. Beck, Paige, Arron e Rachel intanto raggiungono Istanbul alla ricerca di Laila. Hank incontra un uomo che sembra avere alcune delle risposte che sta cercando e scopre che il loro passato è intrecciato.

Laila racconta a Hank la sua versione della storia, mentre White Vincent scopre un indizio che lo porta vicino alla fine.

Laila e Hank si mettono in viaggio verso Strasburgo, mentre Rachel e Arron cominciano a credere che una talpa all'interno dell'FBI stia diffondendo informazioni segrete.

Hank, Beck e Laila sono giunti alle isole Faroer per trovare la True Cross; anche White Vincent è intenzionato a mettere le mani sul prezioso cimelio. Le scoperte fatte sull'isola potranno davvero cambiare il destino di tutti.

Hank, Beck e Laila sono ancora nelle Isole Far Oer e la loro salvezza è appesa a un filo. Dopo anni, la madre di Hank riesce finalmente a svelargli il segreto che ha custodito per tantissimo tempo; l'uomo si rende conto allora che suo padre è il pezzo mancante del puzzle.

Ferito e ancora scosso dall'incidente di macchina, Hank si sveglia sull'isola di Plum nelle mani di Melanie, la Madre. Spetterà al padre dell'uomo salvargli la vita.

In un'area sperduta del Tajikistan si trova "New Jerusalem" un monastero dove Melanie ha raggruppato delle ragazze orfane. Una di queste verrà selezionata per impiantarle un clone di Gesù Cristo....

Vincent risparmia le ragazze mentre Melanie convince Alima a sacrificarsi, ma l'impianto di Melanie comincia a trasformarsi in qualcosa di terribile. L'improvviso voltafaccia di Hank e Vincent porterà delle conseguenze inevitabili.