Ingerencja Alfy w oś czasu cofa Ariona w przeszłość i ma go zmusić do rezygnacji z futbolu. Na pomoc zawodnikowi gimnazjum Raimona przybywa Fey Rune, którego drużyna postanawia rozegrać mecz z agentami czasu. Jego wynik może zdecydować o losach futbolu.

Przez załamanie się czasu ludzie przenieśli się do światów równoległych, dokonując ogromnych zmian i tworząc świat bez piłki nożnej. To organizacja Eldorado, która chce rządzić światem, jednocześnie bojąc się dzieci z hiperrewolucji, stających w obronie futbolu. Przyjaciel z przyszłości chce pomóc Arionowi obronić klub Raimona, który zniknął z powodu ingerencji w linię czasu, przez co zmieniła się jego historia. Czas to naprawić.

Poprzez efekt rezonansu Mark Evans broni strzał drużyny z przyszłości. Mark odkrywa w sobie ducha walki, który pomaga mu skutecznie bronić kolejne ataki na bramkę. Do gry dołącza pomocnik z równoległego świata Vlad Blade i dzięki niemu Arion i jego przyjaciele wygrywają. Teraz trzeba tylko przenieść się w czasie i sprawdzić dlaczego w drużynie Raiomna brakuje Viktora, młodszego brata Vlada.

Aby odnaleźć brata Vlada - Viktora, należy przenieść się w czasie do świata równoległego. Vlad spełnia swoje marzenie i rozgrywa krótki mecz z bratem. Jest zdecydowany wrócić do przeszłości i doświadczyć kontuzji, aby jego brat znowu pokochał futbol. Na jego drodze jednak znowu staje Alfa z protokołu Omega. Drużynę Raimona znowu czeka trudna rozgrywka w obronie prawdziwej historii piłki.

Everyone else time travels back 1 month ago to change back things to normal so that soccer wouldn't be banned anymore. Though they are now against a stronger opponent, Protocol Omega 2.0 which is led by Beta. The problem is that Tenma can't use his keshin armed and now, they are all violently being attacked by the other team

The rest of Raimon's keshins will appear to stop Beta from advancing through the field. Endou will use a catch hissatsu technique. Sangoku Taichi and Kurama Norihito are shown to be injuried. Nishizono Shinsuke replaces him as it can be seen that his uniform has changed while using his keshin, Goseishin Titanias, in the preview. Endou may also then replace Shinsuke, though he isn't seen with the Raimon uniform, but with his jacket. He's probably protecting Raimon's players from something. The hissatsu seems to be God Hand V as Endou has one hand on the other arm.

Shuu helped Raimon to escape from the match with his Keshin and also helped them to master Keshin Armed. Then, Team A5 appeared and challenged them for a match again. Shindou revealed his new hissatsu, Olympus Harmony. Later, Tenma fused with Shuu's aura and broke through Team A5. He then recupered his own body and used Keshin Armed, which this time succeeded, and scored a goal to Raimon. After that, Raimon said farewell to Shuu and left God Eden.

Raimon saw how Raimon's soccer building demolished. After that, they are going to the future and are infiltrate the soccer museum in the future to steal the Scriptures of the Champion to create the strongest team. They find the the book but the alarm is a problem. Tenma tried to get the book but he got touch by the alarm and the alarm goes off. Then they got a soccer battle with the Security Robots and Raimon won with 1-0. After that, they went back to their timeline and went to Tenma's house.

Raimon is looking at the Scriptures of the Champion but they can't figured out what is wrote in the book. Then, in El Dorado's headquarts, Protocol Omega 2.0 is seen, with Beta talking to Toudou about what Einamu and the others did. Toudou was about to send them to the Eternal Prison when Beta stopped him, saying they should give a chance to Einamu and the four others members of Team A5.

Endou Daisuke is the coach of Raimon for the second half. Raimon revealed their new Hissatsu Tactic, 3D Reflector and Tenma fused with his Keshin and scored the first goal for Raimon. Then Fei fused with Kyouryuu and scored the second goal with Kodai No Kiba. Tsurugi mastered Keshin Armed and scored the third point for Raimon. Beta doesn't like it and used ghost Mixi Max. Beta fused with her Keshin and scored the third goal for Protocol Omega 2.0 with Shoot Command 07. After that, Protocol Omega 2.0 scored two points and Raimon lost the match with 5-3. Beta used the Sphere Device to turn Daisuke into the Chrono Stone. After that, Daisuke told Raimon about the Scriptures of the Champion. Raimon returned to their own timeline and searched for information. After they found information, Raimon traveled to the Sengoku time.

Raimon arrived in the Sengoku time and they are searching for information about Nobunaga. Shindou met Okatsu and Okatsu brought Shindou to her house for a talk. Tenma, Shinsuke and Aoi saw some boys playing soccer and Tenma and Shinsuke decided to join. When they lost the ball and a boy wanted to pick up the ball, two guys kidnapped the boy but Tenma stopped the two guys with the ball. The two guys wanted to attack Tasuke and Tenma but Kinoshita stopped them. Okatsu threw some water at Shindou.

Raimon must play against Team White Deer to free Tasuke and the others who were captured. AtShinsuke stopping the shot.

Shindou is still trying to get his Keshin Armed and almost succeeded to. To get closer to Nobunaga, Raimon infiltrates the cherry blossom viewing party disguised as dancers, but instead of dancing, they played soccer.

Raimon got arrested and Shindou explained to Nobunaga that they come from the future and that Nobunaga will not rule in Japan, which shocked everyone. Tasuke and his friends are learning soccer in order to play against Protocol Omega 2.0. Shindou is trying to get Keshin Armed and almost succeeded. Tasuke, Shishimaru and Gorouta are trying to create a block hissatsu, called Ichiyajou and Raimon is about to play against Protocol Omega 2.0.

Raimon is playing against Protocol Omega 2.0. Protocol Omega 2.0 reveals some new hissatsu and takes the lead in the first half. In the second half, Raimon counterattacks and Tasuke and his friends revealed their new hissatsu called, Ichiyajou and Raimon make it tied. Protocol Omega 2.0 received power of Beta and is counterattacking. Shindou tried to fuse with his Keshin but failed again. Beta scores another goal and Protocol Omega takes the lead again.

Shindou tried Keshin Armed again but failed. Nobunaga came to Shindou to talk to him an gave him some advice. After that, he mastered his Keshin Armed and scored the second goal for Raimon. Shindou Mixi Maxed with Nobunaga and easily dribbled around the Protocol Omega 2.0 members. Shindou used Setsuna Boost for the first time and scored the third and winning goal for Raimon. Beta restored Raimon's memory back to normal, but Gamma appeared. At the end, Okatsu and Shindou were seen crying about each other.

The Raimon's brainwashed members came back to the soccer club. There is also a new member called Nanobana Kinako, who said she's Raimon's ace striker as she won a striker battle against Tsurugi. Shindou showed his ability to mixi max with Nobunaga, which surprised Raimon's members. Daisuke said that they should take the aura from Jeanne d'Arc. The next morning, Kariya said that Kirino was jealous on Shindou because he had a Keshin, can use Keshin Armed and can use Mixi Max. Daisuke selected eleven members of Raimon, but Kirino wasn't. Kariya offered his place to Kirino and Raimon went to Jeanne's era, at 1427. Zanak Abalonic escaped from the Eternal Prison. He met Protocol Omega 3.0 at Jeanne d'Arc's era, beat them and took control over them.

As Raimon arrived in the medieval France era, they got surrounded by knights who believed that they were spies. Then, Jeanne d'Arc appeared and Shindou told her that they came from the future. Jeanne gave Raimon candy and brought them to her castle. During their stay there, they played soccer to pass time. Wonderbot then tried to Mixi Max Kinako with Jeanne but failed. In the afternoon, Jeanne asked if Raimon will help her and Kirino agreed.

Jeanne d'Arc and the others arrived at Charles palace. Kirino and Jeanne went inside while the others were outside playing soccer. Charles agreed with sending more soldiers for the war. Jeanne and the others went back to Shindou and the others along with the soldiers. Jeanne and Kirino had a talk about the war. Jeanne went outside and fought against the enemies. Kirino thought it was his fault and he ran outside, the others followed him. Zanak created a soccer field and Raimon must fight against Protocol Omega 3.0 in order to proceed. Gamma released his Keshin and scored the first goal. Jeanne is scared and Kirino is worried about her.

Raimon continued their fight against Protocol Omega 3.0. Kirino Ranmaru is still worrying about Jeanne and having a flashback of Shindou. Charles changed Raimon's formation for the second half. Kirino became injured and Shindou said that he shouldn't worry and he dashed to the opponents to stop them. Kirino has a flashback and realized that he is jealous and dashed to Shindou to help him. Kirino revealed his Keshin and later, he Mixi Maxed with Jeanne and Raimon won with 2-1 versus Protocol Omega 3.0.

Raimon was seen training in the soccer building. Amemiya Taiyou appeared and told about his recovery and that he already knew what Raimon was doing. Gouenji appeared with a new artifact and Daisuke selected eleven new members and those members went to The Three Kingdoms era. There, they saw Ryuu Gentoku with a canon. Raimon and Ryuu Gentoku walked to a building and Zanark brainwashed Chouhi and Kanu. Three members of Zanark Domain challenged Raimon in a soccer battle with Chouhi and Kanu at their side. Shindou, Tenma, Tsurugi, Kinako and Ryuu Gentoku were seen playing in the battle. But then, Ryuu Gentoku left the goal open and shocked all the members of Raimon.

Raimon resumes the soccer battle against Zanark Domain. Shindou blocked the shoot in order to save the goal. Raimon won the soccer battle with 1-0. After that, they advanced their journey to search Shokatsu Koumei. They must proceed the challenge that Shokatsu Koumei has made. After that, they have to play soccer against Terracotta. Ryuu Gentoku was placed as goalkeeper and Shinsuke said that he have to defend the goal. After some shoots that Ryuu Gentoku has blocked, he injured himself with blocking the shoots without a hissatsu and Shinsuke replaced him. Shindou and Kirino helped Shinsuke to defend the goal. Ryuu Gentoku encouraged Shinsuke and Shinsuke used Buttobi Punch. At the end, Raimon won with 2-1 and they met Shokatsu Koumei.

Drużyna staje twarzą w twarz z Zhuge Liangi. Jednak po wszystkich ich wysiłkach Liang nie chce im pomóc. Sytuacja staje się jeszcze gorsza, gdy Zanark pojawia się ze swoją nową drużyną.

Liang nagle otacza Sola swoim duchem walki. Sol strzela bramkę do domu, wyrównując wynik do przerwy.

Drużyna rusza w poszukiwaniu nowych bohaterów Ryomy Sakamoto i Souji Okitę.

Człowiek, kórego Arion i koledzy spotkali, okazał się Ryouma Sakamoto - dokładnie ta osoba, której szukali. Zanark wykorzystuje chęć Soujiego Okity pokonania Sakamoto do swoich celi.

Souji Okita jest gotowy walczyć z Ryoumą Sakamoto, aby chronić szogunat, nawet jeśli oznacza to oddanie życia. Tymczasem Sakamoto zostaje zawrócony u bram zamku Nijou, gdy próbuje uzyskać bezpośrednią audiencję u Shoguna.

Drużyna otrzymuje wsparcie Ryommy i Okity w starciu z Zanarkiem.

Słynne hasło Marka Evansa napełnia Ariona nostalgicznymi wspomnieniami, jak rozpoczęli podróż w i czasie, aby stworzyć najsilniejszą drużynę piłkarską w historii u boku trenera Evansa.

Arion i przyjaciele spotykają chłopca, który mieszka z dinozaurami. Chłopak prowadzi drużynę do najpotężniejszego dinozaura.

Arion i przyjaciele spotykają przywódcę dinozaurów. Muszą stoczyć niebezpieczną walkę.

Bohaterowie doznali druzgoczącej porażki. Ćwiczą do rewanżu u boku dinozaurów.

Arion Sherwind razem z członkami drużyny Raimon chce przywrócić dawne zasady gry. Klub Raimona musi dziś walczyć z drużyną, która przewyższa go siłą. Mecz rozgrywany jest w dolinie dinozaurów, a zawodnicy są coraz bardziej zmęczeni. Sytuacja zmienia się, gdy Fey za namową Goldie aktywuje swojego ducha walki.

Drużyna Raimona odwiedza nowy świat. Potrzebują mądrości króla Artura i aury królowej smoków. Dzięki artefaktowi, który zdobywa Goldie, drużyna przenosi się do czasów Rycerzy Okrągłego Stołu, aby rozegrać mecz, który zdecyduje czy Arion może zostać nowym rycerzem.

Zawodnicy drużyny Raimona, którzy przenieśli się w czasie do zmodyfikowanej linii, wchodzą w role rycerzy Króla Artura. Arion, Frei oraz przywołane przez niego duble mają rozegrać mecz, który zadecyduje, czy piłkarz stanie się kolejnym rycerzem. Niestety w starciu z zaczarowaną królową smoków zostaje porwana Goldie. Drużyna rusza na poszukiwania przyjaciółki.

Drużyna Raimona rusza razem z Królem Arturem na poszukiwania Groty Żalu, w której Królowa Smoków więzi Goldie. W drodze będą musieli zmierzyć się z jadowitymi wężami i ogniem. To część królewskiego treningu, który ma wzmocnić drużynę i przekonać Ariona, że nadaje się na kapitana drużyny. Czy jednak uda się pokonać Czarnego Rycerza, któremu służy Królowa Smoków i wygrać mecz z Perfekcyjną Kaskadą?

Trwa mecz z drużyną androidów, których jedynym celem jest wyeliminowanie drużyny Raimona. Dzięki mocy i inteligencji Królowej Smoków, Goldie udaje się pokonać strach, zagrać przeciwko robotom i ochronić tych, których kocha. Arion, po przejęciu mocy króla Artura przekonuje się, że nie tylko zdolności przywódcze prowadzą drużynę do zwycięstwa. Siła drużyny pochodzi wyłącznie ze współpracy i jedności wszystkich zawodników.

Organizacja walczy z członkami Hiperrewolucji, osobami obdarzonymi specjalnym genem, który rozwija się poprzez futbol. Ich zdolności nie służą jego rozwojowi, ale zagrażają ludzkości, ponieważ swoją siłę wzmacniają specjalną aurą. Aby uratować ludzkość, organizacja Eldorado potrzebuje pomocy piłkarzy Raimona.

Dzieciaki hiperrewolucji znowu atakują. Ich przywódca Simeon dąży do przejęcia władzy nad całym światem. Powstrzymać ich może jedynie wygrana w meczach z drużyną Raimona. Niestety nie ma żadnych danych na temat zdolności piłkarskich dzieciaków hiperrewolucji, a pierwszy mecz z Nugenem już za chwilę. Kto wygra Ragnarok - bitwę o losy ludzkości?

Po 10 latach od zdobycia przez drużynę Inazuma pucharu FFI, rozgrywki w Japonii bardzo się zmieniły. Zawładnęła nimi tajemnicza organizacja „Piąty Sektor”. Arion Sherwind, próbuje dostać się do piłkarskiego klubu w gimnazjum Raimona, ale uświadamia sobie, że obecna gra znacznie różni się od jego wyobrażeń. Arion Sherwind razem z członkami drużyny Raimon chce przywrócić dawne zasady gry.

Były członek Eldorado przechodzi na stronę dzieciaków hiperrewolucji, doradzając im jak walczyć z przeciwnikami futbolu. Tymczasem do zawodników Raimona dołącza Zanark, który wie jak pokonać dzieciaki. Niestety gra w pojedynkę nie przynosi żadnego efektu. Drużyna będzie musiała się zjednoczyć, jeśli chce zwyciężyć i ocalić świat.

Po kontuzji Romeo, do drużyny Eldorado dołącza nowy bramkarz Mecha - Mark, android stworzony na podobieństwo Marka Evansa. Ricardo dostaje wskazówki od trenera, a lepsza komunikacja między zawodnikami od razu przynosi efekty. Zwycięski gol należy do Zamarka, ale aby pozostać w drużynie, musi okiełznać swoją moc.

Drużyna musi wygrać! Póki co wynik, to jeden do jednego. Czas, wyjść na murawę. Ciągle jednak nie wiadomo kto będzie napastnikiem rywala.

W grze pojawia się pewien zawodnik, który na boisku nie ma sobie równych. Na imię ma Zanark...

Simeon w końcu przechodzi do działania. Co zrobi Fei? Niektórym może być naprawdę ciężko...

Trwają przygotowania do powtórki finału. Sporym zaskoczeniem jest informacja, która dociera do drużyny.

Trener Mark Evans powraca. A wkrótce finał przeciwko drużynie Simeona, o nazwie Ragnah.

Drużyna przeżywa poważny kryzys. Zawodnicy są mocno atakowani, a Simeon pokazuje na co tak naprawdę go stać.

Zbliża się chwila, gdy rozstrzygną się losy drużyny. Kto zwycięży? Inazuma, czy rywale?

Po powrocie do teraźniejszości drużyna znowu może grać w piłkę do woli. Ten sport jest niezniszczalny!