どこかの宇宙・海明星(うみのあけほし)に住む加藤茉莉香(かとうまりか)は、ごく普通の高校生。学校ではヨット部で部活を楽しみ、放課後は喫茶店ランプ館でウェイトレスのアルバイト――そんな毎日を過ごしていた。そんなある日、ランプ館に男女2人組の不思議なお客が現れた。女のほうが茉莉香に尋ねる。｢あなた宇宙に出たことある?｣｢もっと遠くからこの星を見てみたいと思わない?｣。素直に｢宇宙、いいですね～｣と答えた茉莉香だったが、それこそがこれから起きる思わぬ出来事の前触れだった。帰宅をした茉莉香の前に、再び昼間の2人が現れる。そして母・梨理香とともに真実が打ち明けられる……。

いよいよ決戦の時がやってきた。奇しくも決戦空域は、黄金の宇宙船を発見したあの空域だった。そこにタッチダウンしてきたのは、グランドクロス級の戦艦三隻。戦端が開かれ、まずは激しい電子戦でのつばぜり合いが始まる。各海賊船と連携して電子戦をしかける弁天丸。クォーツは｢いくら徒党を組もうとも、このグランドクロスには勝てない!｣と叫ぶ。果たして海賊たちは勝つことができるのか。茉莉香はいう。｢海賊船に詰まってる、これまでの経験に私は賭ける。だって海賊だから!｣。海賊の命運をかけた運命の戦いの行方は……。