Anakin guida un attacco alla nave da guerra di Grievous.

Padme e C-3PO vengono catturati nel mezzo di una battaglia spaziale.

Anakin e Obi Wan si trovano nel mezzo di una guerra territoriale.

Ahsoka disobbedisce agli ordini di Anakin.

A Cad Bane viene affidata una nuova missione distruttiva.

Anakin, Ahsoka e Ki Adi Mundi guidano un'invasione per distruggere una fabbrica di droidi.

Anakin scopre il passato comune fra Obi-Wan e la Duchessa.

Su Coruscant, alla Duchessa Satine giunge la voce che la Guardia della Morte si sta mobilitando. In fuga dalle autorità repubblicane, Satine e Obi-Wan partono alla scoperta delle vere motivazioni del gruppo.

II Senatore Onaconda Farr muore in circostanze misteriose.

Il pianeta Ryloth è sotto assedio. Il Maestro Jedi Ima-Gun Di richiede rinforzi alla Repubblica.

Durante un giro su Coruscant, C-3PO e R2-D2 vengono rapiti.

Ahsoka Tano viene presa prigioniera.

Obi-Wan e Anakin cercano una via d'uscita

dalla Cittadella.

Gli Jedi e il Principe di Mon Cala devono fuggire.

Jar Jar Binks deve fingersi il capo del suo popolo.

Anakin, Ahsoka, Obi-Wan e Rex si fingono schiavisti.

Obi-Wan compete con i cacciatori di taglie.

Savage e Darth Maul si riuniscono per vendicarsi di Obi-Wan.

Gli apprendisti si infiltrano nel covo dei pirati.

Usando Satine, Darth Maul attira Obi-Wan in una trappola.

Anakin e Ahsoka indagano su un attentato al tempio Jedi.

Nei laboratori sterili di Kamino, il clone malato Tup e il suo amico Fives delle ARC Trooper vengono messi in quarantena per essere esaminati a seguito dello scioccante omicidio di un Maestro Jedi. Con l'aiuto di droide medico AZI-3, Fives è determinato a andare a fondo della condizione di Tup e scoprire i segreti sepolti all'interno del programma di clonazione della Repubblica.

Mentre si trova su Scipio per finanziare una missione, Padmé Amidala viene chiamata da un vecchio amico, Rush Clovis, per aiutarlo a scoprire la corruzione che si annida nel Clan Bancario. Padmé e Clovis devono però eludere il cacciatore di taglie Embo per fuggire dal pianeta con le informazioni incriminanti.

Durante una missione, i Jedi trovano una spada laser appartenente al Maestro Sifo-Dyas, morto da tempo, spingendo così Yoda, Obi-Wan Kenobi ed Anakin Skywalker ad aprire un'inchiesta sulla scomparsa del defunto. Questo innervosisce il malvagio Cancelliere Palpatine / Darth Sidious, il quale ordina al conte Dooku di eliminare eventuali prove che possano portare i Jedi a scoprire la verità circa la cospirazione dei Sith che si annida in Senato.

Mentre Mace Windu e Obi-Wan Kenobi lanciano un'offensiva su un complesso di assemblaggio nemico, Anakin, Rex e la Bad Batch devono accompagnare Echo in una missione sotto copertura nello Star Destroyer dell'ammiraglio Trench. L'obiettivo è quello di collegare il clone al sistema separatista per spiare le loro manovre. Questo piano non rassicura i membri del Bad Batch, i quali sospettano che Echo sia un doppio agente e che probabilmente lavori per i separatisti. Il clone riesce ad inviare con successo un segnale per far credere che la loro nave sia in realtà separatista, in modo che l'intera squadra possa entrare nel cacciatorpediniere senza preoccupazioni. Una volta a bordo, Tech riesce a collegare Echo al sistema separatista senza essere individuato dal nemico. Il soldato intercetta così un messaggio da Trench a Skako Minor che richiede un piano contro l'offensiva di Windu e Kenobi.