Kontynuacja ostatniego odcinka trzeciej serii. Mulder i Jeremiah Smith uciekają przed mordercą i trafiają do wioski, w której pracują klony porwanych dzieci, również Samanthy. Scully odkrywa informacje nt. katalogowania ludzi, za pomocą Programu ds. Walki z Ospą. Informator Muldera – X – zostaje zamordowany. Palacz zleca uzdrowienie pani Mulder. Nową informatorką Muldera zostaje Marita Covarrubias.

Odcinek poświęcony Palaczowi. Opowiada historię jego życia – o tym jak uczestniczył on w zamachu na prezydenta Kennedy’ego i Martina Luthera Kinga. Ujawnia również, że Palacz, pomimo wielu wad, ma talent literacki.

Agenci Mulder i Scully rozbijają grupę terrorystyczną. Okazuje się, że Krycek jest członkiem tej grupy. Agenci dostają od niego cynk, o tajnej przesyłce dyplomatycznej, którą ma przywieźć rosyjski kurier. Okazuje się ona być skałą pozaziemską i pochodzi z meteoru tunguskiego, który spadł na Ziemię w 1908 roku. Podczas badania w laboratorium wychodzi na jaw, że w skale znajdują się mikroby Czarnego Raka. Naukowiec badający meteoryt ulega zakażeniu. Krycek idzie na współpracę z agentami, żądając w zamian ochrony. Początkowo Mulder umieszcza Kryceka w swoim mieszkaniu, a wkrótce potem udają się do Rosji. Odkrywają gułag i kopalnie, w której wydobywa się fragmenty meteorytu tunguskiego. Od jednego z więźniów Mulder dowiaduje się, że w obozie przeprowadzane są nielegalne eksperymenty na ludziach. Celem badań jest opracowanie szczepionki przeciwko Czarnemu Rakowi. Krycek dogaduje się z władzami gułagu. Tymczasem Mulder zostaje zainfekowany Czarnym Rakiem.

Kontynuacja poprzedniego odcinka. W Rosji zostaje wydane polecenie, aby były członek KGB zabił wszystkich którzy mieli kontakt ze skałą w USA. Mulder i Krycek usiłują uciec z obozu pracy na Syberii. Ulegają oni jednak wypadkowi: Mulder znajduje schronienie u tubylców, natomiast Krycek, aby przeżyć, musi dać sobie odciąć rękę.

Scully dowiaduje się, że ma raka nosogardła. Okazuje się, że choroba może być wynikiem uprowadzenia. Kontaktuje się ona z kobietą, która także była uprowadzona i też ma raka. Mulder jest gotów poprosić o pomoc Palacza.

Rozbija się pasażerski samolot. Mulder i Scully prowadzą w tej sprawie śledztwo. Okazuje się, że jednym z pasażerów, był stary znajomy agentów – Max Fening. Odkrywają oni, że samolot został zestrzelony wraz z UFO.

Kontynuacja poprzedniego odcinka. Mulder zostaje aresztowany, za utrudnianie śledztwa. Wojsko zaciera ślady po rozbiciu się UFO, usuwając wrak z jeziora. Wychodzi na jaw, że Obcy interesowali się właśnie Maxem.

W Wirginii, pracownica poczty zostaje zabita w toalecie. FBI wszczyna śledztwo w tej sprawie. Tymczasem Skinner zaciera ślady i pali zwłoki. Mulder sam prowadzi dochodzenie, gdyż Scully jest w szpitalu – lekarze podejrzewają przerzuty. Skinner próbuje uzyskać lekarstwo dla Scully, w tym celu musi wykonywać polecania Palacza. Mulder odkrywa, że pszczoły które zabiły pracownice poczty przenoszą zmutowany wirus ospy. Syndykat przeprowadza pierwszą próbę ataku na ludziach z użyciem pszczół. Za cel wybierają przedszkole.

Mulder budzi się w hotelu, w Rhode Island i nie pamięta niczego z ostatnich dwóch dni. Kiedy przyjeżdża Scully, trafiają do domku letniskowego państwa Cassandra i znajdują tam trupy właścicieli. Mulder nie dość, że zostaje aresztowany, to jeszcze oskarża swoją matkę o romans z Palaczem.

W Kanadzie grupa naukowców odnajduje zamarznięte zwłoki Obcego. Mulder wraz z towarzyszami sprowadza ciało do USA i przeprowadza amatorską sekcję. Tymczasem Scully aresztuje Michaela Kritschgau, który twierdzi, że ciało Obcego zostało spreparowane przez ludzi, którzy wstrzyknęli jej komórki rakowe. Scully identyfikuje zwłoki Muldera.