藤原拓海在高中畢業後，加入了高橋涼介成立的D計畫車隊，成為與上坡賽專家高橋啟介齊名的下坡賽專家，遠征栃木、埼玉、茨城並贏得勝利。但是，最後一場與紫色闇影城島俊也的比賽，卻嚐到了實力不如人卻獲勝的苦澀經驗。結束在茨城的最終決戰後，下一個舞台是賽車聖地神奈川！為了迎接嚴苛的戰鬥，拓海不斷獨自練習。這時候，他聽說有人在自己從沒去過的埼玉山路上「遇見D計畫的兩大王牌」。某天晚上，拓海陪阿樹開Levin上山試車，卻發現坡道聚了不少人，還說「聽說D計畫的兩大王牌來了」。

D計畫車隊贏得北關東地區最後的比賽。舞台終於要轉移到賽車聖地神奈川！第一戰的對手是神奈川三大勢力之一「246車隊」。上坡賽的對手，是開EVO的小早川。面對雙線道與單向道交錯出現，難以並行競爭的賽道，啟介說「我的工作有一半已經在昨天就做完了」，這是什麼意思！？

神奈川第二戰的對手是「片桐賽車車隊」。拓海的對手是曾與在他伊呂波山道展開拉鋸戰的小柏海！從公路賽車畢業，在職業賽車的世界累積經驗的小柏駕駛愛車MR-S。相對的，拓海也透過與紫色闇影的對戰進化了。「藤原與86的表現，是無法只靠理論解釋的！」就連涼介都無法分析的技巧。究竟兩人的勝負會有何結果──！

神奈川第三戰，「片桐賽車車隊」小柏海的MR-S與藤原拓海的86展開因緣的下坡賽對戰！兩人在櫪木•伊呂波山道之後再次對戰。對於在賽道上競速、在山路上競速，兩人都要找出各自的答案。

「片桐賽車車隊」上坡賽派出皆川英雄駕2JZ與高橋啟介的FD對戰。上坡賽專家啟介，被兄長涼介指出會讓他無法稱霸神奈川的弱點，而他因此被要求進行的是什麼練習！？

箱根‧椿山戰。在雨後濕滑的路況中，神奈川第三戰的「迴旋車隊」池田龍次的Z與啟介的FD的上坡賽開始了。主張與車子對話的「ZERO理論」的池田，他的理論就是封閉所有感情，讓心無雜念的自己傾聽車子的意志。雖然涼介對他的理論感到許多共鳴，但他還是看出其中不足的關鍵點。在比賽最激烈的時候，能見度零的濃霧「白色惡魔」擋住兩人的去路，能突破白茫茫濃霧的會是池田的Z，還是啟介的FD！

椿山一戰，濃霧瀰漫的上坡賽終於分出勝負，緊接著是「迴旋車隊」的奧山廣也的S15與拓海的86，在下坡賽的起跑點對峙。下坡賽在86先行的情況下開始了，奧山在濃霧中選擇追擊，但儘管能見度不佳，拓海的速度並沒有一絲畏懼的樣子，因此雙方的差距愈來愈大。那個時候，在箱根的公路休息站出現了一輛暗銀色的R32。站在旁邊的是下一個對戰車手－－響尾蛇車隊的北條凜。而涼介的FC則駛向那邊，另一個因緣的比賽即將開始了。

高橋涼介的FC與通稱「死神」的北條凜的R32，因為過去的恩怨而展開下坡賽。浮現在兩人內心的，是一個叫「香織」的女性哭泣的臉。三年前，被稱為「赤城的白色彗星」的涼介，在大學遇見較為年長的香織。涼介也無法控制的命運是指什麼。然後，R32毫不死心地拚命追撞FC。凜為什麼會對涼介抱持近乎殺意的情緒…池田龍次的Z也加入兩人的下坡賽，展開了三強爭霸的下坡追逐。

選擇先跑的FC與北條凜緊追不捨的R32。兩輛車籠罩著詭異的光芒。北條凜過去是高橋涼介大學時代的三年級學長。以前他曾有個父母親決地的結婚對象－－香織。但是愛上涼介的香織，告訴凜想取消父母親訂下的這門親事。凜苦苦哀求，但最後對香織感到失望，甚至對她父親的事業造成不良的影響。夾在中間的香織最後自殺，被留下來的兩人，在箱根的山路進行纏鬥不休的下坡賽，要為過去的恩怨做個了斷。

高橋涼介的FC與北條凜的R32，他們充滿因緣的下坡賽，在池田的Z加入戰局下，一路衝向終點。在終點前發生的奇蹟，讓涼介與北條凜兩人感覺到早已自殺身亡的「香織」的存在。另一方面，池谷與健二查到了下一個對戰對手開的是86，但是──。

在箱根，D計畫最後一戰即將開始。在負責下坡賽的乾信司一直沒出現的狀況下，高橋啟介的FD與北條豪的NSX開始進行上坡賽。北條豪的哥哥•凜，看出了D計畫與響尾蛇之間決定性的不同──。

D計畫在神奈川的最後對戰對手響尾蛇車隊。上坡賽是以高橋啟介的FD在後追北條豪的NSX開始的。在一旁盯著戰況的高橋涼介，說出在組成D計畫車隊的時候，自己曾猶豫該不該拔擢啟介當車手的事情。

上坡賽在第一輪沒分出勝負，因此比賽進入第二輪。真子跟沙雪也在觀賽的群眾裡，在她們旁邊的，是下一場下坡賽要跟拓海對戰的乾信司。信司對真子一見鍾情，但真子並不知道下一位對手竟然是信司。啟介的上坡賽結果如何？而且準備迎接下坡賽的拓海在神奈川的最後一戰會開賽嗎？ Fifth Stage終於要進入最高潮了！