미범의 멤버들은 마약 밀수 조직간의 싸움을 막기 위해서 도쿄와 홍콩을 오가는 크루즈선에 잠입한다. 여기에 전설의 해커인 카가미까지 새롭게 가세하여 결국 범행을 막는 데 성공한다. 얼마 후, 미범의 새로운 거점에 모인 멤버들 앞에 두 명의 법무성 관료가 나타난다. 총괄 책임자인 코사카는 이자와의 과거와 위험성을 언급하면서도 즉시 수사를 시작하라고 지시한다. 그것은 미범이 동시에 두 명의 위험인물을 지목해낸 첫 케이스로, 멤버들은 변호사인 타시로와 교도소에서 갓 출소한 유흥업소 종업원인 후지쿠라 사이의 접점을 쉽게 찾아내지 못하는데...

보석으로 풀려났던 전 경찰청 차장 마치다가 시신으로 발견되자, 이자와는 경시청으로 불려가서 취조를 받다가 코사카와 대치한다. 그 와중에 미범이 새로운 위험인물을 지목하고, 이자와는 다시 수사에 투입된다. 이번 타깃은 자신의 집 근처에 사는 아스카라는 여고생을 스토킹하는 바바라는 남자이다. 바바를 조사하던 미범의 멤버들은 그가 단순한 스토커가 아닐 거라 판단하고 잠입 수사를 시작한다. 그런데 바바를 미행하던 도중에 아스카가 누군가에게 납치당하는 일이 벌어지는데...

명문 발레단에 소속된 발레리나인 야히로 마이가 위험인물로 지목된다. 야히로는 인터넷을 이용해 치사량의 비소를 입수했으며, 독극물로 사람을 죽이는 내용이 올라온 사이트를 여러 번 찾아봤던 것으로 밝혀진다. 야마우치는 야히로가 일주일 후에 열리는 세계적인 콩쿠르에 참가한다는 점에 주목하고, 이자와와 오다기리는 잡지사 기자로 위장해서 발레단으로 잠입한다. 그런데 그 와중에 공사 현장에서 일어난 사고를 목격하고 기절했던 야히로가 기억을 잃고 마는데...

코사카는 미범이 지목한 새로운 위험인물을 수사하라고 지시한다. 그 인물은 뜻밖에도 자살하려는 사람들을 위해 NPO 법인에서 ‘생명의 상담원’으로 일하는 카요라는 여성이다. 카요는 스턴건을 산 기록이 있으며 인터넷에서 실종으로 위장하는 방법을 검색한 것으로 드러난다. 게다가 10년 전에 일어난 묻지마 폭행 사건으로 남편을 잃은 피해자 가족이다. 야마우치와 이자와는 NPO에서 연수를 받는 스태프로 위장하고, 오다기리와 요시오카는 카요가 운영하는 셰어하우스의 새 입주자로 위장하여 각각 잠입 수사를 시작하는데...

명문고에 다니는 17세의 남자 고등학생인 아사이가 26세의 전업주부인 유키를 살해하고 토막 내는 엽기적인 살인 사건이 벌어진다. 어떻게든 이자와를 미범 팀에서 쫓아내고 싶어 하는 소네자키는 왜 미범이 이 사건을 미리 탐지하지 못했느냐며 리더인 이자와에게 책임이 있다고 비난한다. 미범의 총괄 책임자인 코사카는 범인이 이미 체포됐음에도 불구하고 이 사건을 다시 조사하자고 제안한다. 한편 요시오카는 미범 팀에서 빠지고 싶다고 하는데...

대형 피트니스클럽의 사장인 니시나 사야카가 위험인물로 지목된다. 사야카는 5년 전에 발생한 강도 살인 사건에서 전임 사장이자 남편이었던 테루유키를 잃고 자신도 죽을 뻔했다가 살아난 피해자다. 그 후 회사를 이어받은 사야카는 착실하게 실적을 늘려 경영자로서의 재능을 발휘해 왔지만, 위험한 독극물을 몰래 입수했다는 사실이 드러난 것이다. 미범 멤버들은 피트니스클럽으로 잠입해서 수사를 시작한다. 얼마 후, 사야카의 회사가 소유한 실업팀의 코치인 타츠미가 사야카를 협박하며 돈을 요구하기 시작하는데...

코사카는 멤버들에게 지금까지 미범 시스템이 탐지했지만 수사하지 못했던 위험인물 3명이 실종됐다는 사실을 알린다. 소네자키는 과거에도 정의의 사도 행세를 하며 법으로 처벌할 수 없는 범죄자들을 심판한 경찰이 있었다면서 미범의 멤버 중에 범인이 있을 것이라고 의심한다. 이자와와 멤버들은 연쇄 실종 사건에 대해 수사를 시작하지만, 실종자들이 납치됐을 것으로 의심되는 장소는 전부 CCTV가 없는 곳들뿐이었는데...

도쿄 정상회담을 노린 폭탄 테러가 일어날 위기 상황에 미범의 총괄 책임자인 코사카가 갑자기 사라져 버린다. 코사카의 태블릿에서 테러에 관여한 자료가 나오고, 카가미는 코사카가 미범에서 외국의 분쟁 지역을 떠돌던 전 용병의 자료를 찾아봤던 흔적을 찾아낸다. 하지만 멤버들은 누구보다 미범의 법제화를 바랐던 코사카가 테러에 관여했다는 사실을 쉽게 믿지 못한다. 이자와는 코사카의 친아버지가 26년 전에 영화관에서 독가스를 뿌려 많은 사상자를 냈던 범인이라고 털어놓는데...

도쿄 정상회담을 노린 테러를 미리 막는 것에는 성공하지만, 그 과정에서 테러에 관여한 것으로 추정됐던 코사카가 사살된다. 특수부대는 권총을 든 채 코사카의 시신 앞에 서 있는 이자와를 체포하려 하지만, 이자와는 그들에게 저항하고 야마우치까지 제압한 후에 그 자리를 벗어난다. 소네자키는 자신이 테러에 관여했다는 사실을 완강하게 부인하고 경시청의 상부는 모든 책임을 코사카에게 돌린다. 결국 미범은 해체 위기에 처하고, 멤버들은 각자 조사를 받게 된다. 한편, 오다기리는 총에 맞아 쓰러진 시노다를 발견하고 충격을 받는데...

미범의 멤버들은 테러 계획의 배후에 있었던 미즈시마 아유무의 정체가 시노다였다는 사실을 알고 충격을 받는다. 그 순간 미범이 카가미를 위험인물로 탐지한다. 카가미는 권총을 들고 시노다가 입원해 있는 병원으로 향하고, 이자와와 요시오카는 그를 막기 위해 병원으로 달려간다. 야마우치는 오다기리의 골전도 벨트에 교묘한 도청장치가 설치돼 있었음을 알게 되고, 오다기리는 코사카의 죽음을 자신의 탓으로 돌리며 경찰을 그만두려 하는데...