Cuando un empleado de un supermercado comete un asesinato imposible, el gobierno convoca al Dr. Lee Rosen y su equipo de “Alfas”: individuos únicos con mutaciones neurológicas que les confieren poderes especiales. El equipo debe determinar quién es el asesino y encontrarlo, pero pronto descubren que hay un plan maestro en acción

Un Alpha causa muertes y disturbios, por lo que el Gobierno llama a Rosen y al equipo para encontrar al culpable y detenerlo antes de que sea demasiado tarde.

El equipo del doctor Leigh Rosen se enfrenta en este capítulo a Tract Beaumont, una adolescente con poderes que está provocando disturbios a lo largo de la Costa Este de EE UU.

Durante una misión del equipo Alpha, Gary rescata a Anna, una mujer autista. Tras conocerla, Gary se da cuenta de que no padece autismo, sino que posee un tipo de inteligencia superior capaz de comunicarse con los Alpha a través de las ondas electromagnéticas de su cerebro.

El equipo se desplaza a Pensilvania para investigar una serie de extraños asesinatos. Todas las pruebas apuntan como culpable a David Burton, un miembro del equipo de fútbol que parece tener pocas amistades, pero pronto se darán cuenta de su error cuando David se convierta en la siguiente víctima.

El gobierno va tras un joven Alpha que posee la capacidad de transformar aparatos de tecnología común en artículos de alta tecnología. El equipo Alpha se movilizará para ayudarlo. Mientras, Bill considerará la posibilidad de convertirse en padre y Gary mantendrá un fuerte enfrentamiento con su madre.

El equipo atraviesa problemas graves cuando un Alpha utiliza sus poderes para controlar a Nina y Cameron. Pronto descubrirán que ésta fue la causa de un suicidio masivo años atrás. Mientras tanto, Rachel centra sus esfuerzos en buscar un tratamiento para su padre, que padece cáncer.

El equipo captura a un Alpha que se dedica a la obstetricia y utiliza células madre para incrementar los nacimientos de Alphas. Cuando Rosen y los suyos regresan a la oficina, descubren que están bajo el punto de mira de un Alpha capaz de evitar cualquier forma de detección.

Cuando Nathan Cley sospecha que uno de los miembros del equipo es un Bandera Roja, encierra a todos en Binghamton para descubrir quién de ellos es un traidor. El equipo debe descubrir la identidad del topo mientras intentan escapar del centro.

Cuando Nathan Cley sospecha que uno de los miembros del equipo es un Bandera Roja, encierra a todos en Binghamton para descubrir quién de ellos es el traidor. El equipo debe desenmascarar al topo mientras intentan escapar del centro.

El equipo Alpha busca a Isaac, uno de los miembros más conflictivos de Bandera Roja. Mientras tanto, Isaac va tras su propia presa: la hija del doctor Rosen, Dani, que es también un Alpha. Además, tras una gran confrontación entre Bandera Roja y el Departamento de Defensa, Rosen toma una drástica decisión que afectará el destino de todos los Alphas.

Ya han pasado ocho meses desde que Rosen descubrió al mundo la existencia de los Alphas. El Gobierno pretende convertir esta realidad en una leyenda urbana para que nadie le dé vueltas al tema y sea una noticia de dominio público.

Un Alpha que ha cometido asesinatos, dotado de una velocidad sobrenatural, busca en Rosen la cura a su peligrosa habilidad.

Bill acude a un club de lucha de Alphas de incógnito, después de haber atrapado a un Alpha que había asesinado a otro de su condición.

Nina está fuera de control. El equipo tratará de vigilar sus movimientos porque se dan cuenta que usa sus poderes para conseguir aquello que quiere.

Rosen atiende a un antiguo paciente Alpha en el hospital. El equipo descubre los increíbles fenómenos que han llevado a la desaparición de Rachel.

Rosen descubre una colonia aislada de Alphas gracias a Skylar y conseguir así su ayuda para examinar el artilugio de Stanton.

Un Alpha con poder para controlar la mente humana se apodera de los pensamientos de todo un instituto. Rosen tendrá que pedir ayuda para pararlo.

El equipo descubre una droga que otorga a los humanos la invulnerabilidad de los Alphas. Esta sustancia efectiva es letal a la vez.

Rosen y sus compañeros descubren que Stanton planea utilizar granadas experimentales para generar una tormenta eléctrica y acabar con millones de neoyorquinos.

Mientras el equipo trata de superar la muerte de Danielle, una misteriosa mujer abandona a un bebé en la oficina. Gary se obsesiona con tratar de protegerlo.

Mientras el equipo busca a un Alpha que podría ser vital para los planes de Stanton, Gary tiene que ir al hospital cuando su madre se ve implicada en un accidente de tráfico.

Parte del equipo comienza a trabajar de incógnito para interrogar a uno de los hombres de Stanton. Al mismo tiempo, Bill, Gary y Kat tratan de encontrar a Skylar.

Mientras el equipo lucha por desmantelar el plan de Stanton de acabar con la población de 19 ciudades americanas, Rosen busca vengarse del asesino de su hija.