高校生の竜司の前に、突然帰国したハトコの英理子が現れた。竜司は、彼女に連れられ闇ブローカーの取引現場へ！ 闇ブローカーから、奇跡を起こすロスト・プレシャスを奪還したつもりが、出てきたのはナゾの少女。少女は初対面のはずの竜司に夢中で、彼にひっついて大喜び!? 美少女ローズと竜司の物語が始まる…！

ローズと竜司たちは突然、戸倉という研究員に世界遺物保護協会（ソサエティ）へと招待された。ドラゴンである彼女は協会でも様々なハイテク検査が行われて注目の的だけど、ローズは竜司と一緒に居られてご機嫌。お気に入りのアイスを食べて喜んでいた。だがその時、ローズを狙って黒い少年と闇ブローカーが迫っていた…！

ローズが奪われた！ オニキスと名乗る少年は、強大なブラック・ドラゴンの力で彼女へと服従を迫る。竜司は心の傷と向き合い、両親が残してくれたSクラスの遺物（ロスト・プレシャス）である短剣スラッシュブレスを解放して、ローズを奪還すべくオニキスを追う。それぞれの想いが交差し、決戦が始まる…！

夏の海へ実咲や真央たちと遊びにきた竜司。ローズや英理子も乱入して、白い砂浜は女の子でいっぱい！ だが平和だった海辺にドラゴンの皇女である銀髪の美少女マルガが現れ、竜司に危険な依頼を持ち込む。依頼のターゲットは、世界最高の遺物使いの一人『黒衣の制裁者』ジョージ。しかもジョージはローズを狙っていた…！

目的のロスト・プレシャスを確認した竜司たち。だがマルガの依頼した宝剣の奪還は不可能に近い。英理子はマルガをおとりにした計画を立てるが、突然の事件が計画を叩き壊す。さらにロスト・プレシャスにも、マルガにも秘密が…。ホワイト・ドラゴンが封じた悲しい過去とは？ 竜司とローズは、悲しみを打ち砕けるのか!?

遺物使い（ブレイカー）として世界遺物保護協会（ソサエティ）のパーティに出席した竜司。だがパーティの最中、会場のロスト・プレシャスを狙って狼少女の怪盗アイが現れる。しかも竜司とアイが密着して繋がれてしまい…。アイの襲撃のわけは？ そして彼女がソサエティと敵対する理由は？ 竜司たちに新たな危機が迫る！

英理子の大切なロスト・プレシャスを奪い、竜司まで連れ去ってしまったアイと彼女のマスターだが、その遺物の力が真実を暴き出す。そしてアイは竜司とマスターから追われることになり…。マスターが世界遺物保護協会（ソサエティ）を憎む理由とは？ 15年前に起きた悲劇とは？ 思いが交錯し、最後の戦いが始まる！

2学期が始まった。英理子のせいで、ローズと一緒に学校へ行くことになって大慌ての竜司。そこに赤毛の少女研究者ビアンカが現れる。ビアンカは、最高位の遺物使い（ブレイカー）である竜司を調査にきたのだ。色々なテストで竜司のヒミツが次々と明らかに!? でもテストの最中に思わぬトラブルが起きてしまい…!?

竜司とローズのもとに大きな絵のロスト・プレシャスが届いた。だが、突然そのロスト・プレシャスが発動し、遊びに来ていたアイと実咲、英理子とローズの四人が絵の中の町へと吸い込まれてしまう。その無人の町にはドラゴンの炎も通じない殺人鬼がいて！ 竜司もいない大ピンチに、四人の少女の命がけの逃走が始まった…！

休日の楽しいキャンプ。だが突然、竜司を狙って謎の少女が現れる。彼女は水を操るブルードラゴンの少女サフィ。婚約者であるオニキスを傷つけた復讐にきたのだ！ 竜司と英理子はサフィを退けるが、彼女の話は皆に影を落とす。またローズは初めて出会った同世代のドラゴンの少女に興味いっぱいで、なんだか危ない予感…。

ローズがオニキスのもとへと連れ去られてしまった。ローズを失い、自らがローズを害していたと知った竜司は抜け殻のような日々を過ごす。そんな中、竜司のもとに皇女マルガが現れ、オニキスの危険な狙いを告げる。そして竜司は、自らの心の奥底に秘められた願いに初めて気づく。ローズをかけて最後の決戦が始まる…!!