李莫愁因爱成恨，找陆展元寻仇，不想陆展元已死去数载，李莫愁迁怒陆门，欲将陆门九人全部杀死，陆立鼎为救侄女程英和女儿陆无双将昔日李莫愁送给陆展元的锦帕分成两半系在二女颈间。李莫愁杀死陆立鼎夫妇，二女逃跑途中遇见小杨过，李莫愁追至，小杨过施计将二人救走，不想李莫愁又随后追至，危难时黄药师赶到，救下二女,李莫愁使暗计掳 走陆无双。黄药师从李莫愁手中救下中毒的程英 郭靖带杨过上终南山学艺，杨过却心里惦念义父欧阳锋，并三番五次问及父亲死因，郭靖一怒之下掌击终南山下石碑，引得众道士误会围攻，杨过被道士鹿清笃抓住关进柴房,赵志敬己则率九十八人的七星大阵拦阻郭靖。鹿清笃欺负杨过，不想却被杨过捆绑在房内。 霍都去向小龙女求婚，没想到却遭小龙女所养的玉蜂袭击，李莫愁冷观一切，原来这正是她的阴谋。 郭靖说出杨过身世，并有意将其留在终南山修习，丘处机让赵志敬将杨过收在门下……

杨过不服赵志敬，杨过以自己的方式与其对抗,鹿清笃也报当日火烧之仇，屡屡刁难杨过，却次次被杨过戏弄。赵志敬只教杨过口诀，而不教其武功，小较之日，赵志敬让清文与杨过比试，杨过不会武功被打，情急之际，杨过使出欧阳锋曾教他的蛤蟆功，打伤鹿清笃逃走，众道追至，杨过逃入禁林，孙婆婆将杨过救到古墓中。 小龙女却不肯收留生人，孙婆婆将杨过送出，遇甄志丙带众道把守，双方交手，甄志丙将孙婆婆和杨过引进重阳宫，郝大通失手将孙婆婆打死，小龙女从天而降，郝大通败在小龙女手下欲自尽时被丘处机阻止，小龙女不是丘处机的对手，带杨过和孙婆婆回到古墓。小龙女将孙婆婆放入棺材，并向杨过讲述其它四具棺材……杨过一个人睡害怕，小龙女教杨过跟她一起睡，并将寒玉床让给他，杨过怕冷，在小龙女的诉责下杨过忍耐睡下……

小杨过给小龙女讲述自已的身世，得到小龙女的同情…… 丘处机看了清笃的伤确认是蛤蟆功所伤，丘处机决定去找小龙女要人。杨过偷跑下冰床被小龙女打，小龙女向杨过讲述冰床的好处和来历。丘处机和甄志丙求见小龙女无果，甄志丙劝丘处机先回，自己留等。杨过正式拜小龙女为师，成为古墓派弟子。小龙女将玉蜂浆给了甄志丙。 赵志敬因杨过之事徹消了首座弟子，派弟子清虚和清笃在禁林外等杨过，小龙女教杨过抓麻雀，杨过终于抓到三只麻雀，却烤了给小龙女吃，小龙女哭笑不得。小龙女要杨过出洞捉麻雀，杨过碰到清笃和清虚打了起来，杨过被众道士围上，小龙女救走杨过，杨过可以抓到八十一只麻雀，小龙女教杨过“天罗地网势”，练武中杨过长大。

小龙女告诉杨过他们古墓派最高武功乃是玉女心经，并讲述玉女心经的奥秘，杨过告诉小龙女全真教的口诀，可惜没有背全，杨过决定去重阳宫……杨过从清笃的嘴里套出全真教的口诀，杨过小龙女练全了全真剑法…… 杨过小龙女要练到玉女心经这一步了，玉女心经要二人敞开衣服修练，小龙女不知如何去练，杨过提意去那片鲜花坡赤臂练功……二人开始了修练玉女心经……练到最后一层的晚上,甄志丙思念小龙女时常在后山徘徊,这晚,赵志敬跟踪甄志丙戳穿其心事，二人打斗起来，打到杨过和小龙女练功之处，惊动了修练中的小龙女,小龙女受了严重内伤…… 赵志敬和甄志丙发誓不将此事外传，杨过带小龙女回到古墓，小龙女以为自己将死欲杀杨过，杨过逃走，杨过心念小龙女返回古墓，发现李莫愁和洪凌波正在要挟小龙女，杨过和小龙女躲过李莫愁

小龙女劝说杨过放下断龙石后离开古墓，杨过放下断龙石又回到古墓，与小龙女同生共死，小龙女大为感动 李莫愁将小龙女和杨过绑在水中折磨。杨过愿为小龙女死从而破了古墓的规矩，小龙女用玉女心经的功夫甩掉李莫愁，杨过将小龙女放在棺材里，二个发现棺材下的密室，小龙女和杨过在密室里找到出口，李莫愁追来逼问出口，杨过、小龙女、李莫愁、洪凌波找到出口处,从水道出来……杨过和小龙女在终南山上附近搭建房子，练习九阴真经武功 李莫愁回来发现陆无双偷走了五毒秘笈……

杨过和小龙女将九阴真经练完，杨过愿意一生一世陪着小龙女，小龙女却心中不安。欧阳锋来找杨过，点了小龙女的穴道。 甄志丙趁欧阳锋传杨过武功时，将小龙女奸污，这一切被跟踪来的赵志敬看到，欧 阳锋想不透《九阴真经》发疯而去。小龙女误认为与自己肌肤相亲的人是杨过，杨过却不明其意，小龙女伤心第一次离去。赵志敬抓住甄志丙的把柄要挟，杨过四处打听小龙女的下落，酒馆中，杨过听到小二和两个道士议论白衣少女以为是小龙女，第二天，杨过跟踪而至，才发现白衣少女不是小龙女而是陆无双，失望不已。杨过一旁看陆无双与几个乞丐打架，发现陆无双生气时像小龙女，于是杨过救走陆无双。

李莫愁看到韩乞丐肩上的弯刀，认出是陆无双的上前寻问，打伤几个道士……杨过在山洞里为陆无双接骨……杨过又思念起小龙女。 杨过答应送陆无双回江南，二人路上扮作新娘新郎躲过李莫愁，李莫愁返回发现陆无双的裙边，正要动手，陈乞丐前来报仇搅乱队伍，杨过和陆无双趁乱逃走。 杨过和陆无双住进客栈，李莫愁追来，挨个房间搜寻，程英引开李莫愁助杨过和陆无双逃走，杨过和陆无双躲进申志凡的房间扮作道士，躲避李莫愁，被窝里杨过亲了陆无双，开始明白小龙女对他的那份感情。小龙女被李莫愁和洪凌波跟上，李莫愁要玉女心经二人打了起来，小龙女不愿动手，用玉女心经里一招甩开李莫愁离去。 杨过送陆无双被李莫愁紧追，杨过灵机一动，趁夜到蒙古大营，威胁耶律楚材做他的侍从躲李莫愁…… 耶律楚材来到龙驹寨，杨过和陆无双准备向耶律楚材告别之际，完颜萍来刺杀耶律楚材被耶律齐打败，完颜萍要寻死被耶律齐救下，伤心离去。

杨过同情完颜萍身世，跟来教完其三招逼耶律齐出左手，耶律齐果然出手，完颜萍却含泪而去，杨过追完颜萍而走，陆无双随后。陆无双碰到李莫愁，程英来报陆无双被李莫愁抓走。杨过、完颜萍、程英、耶律齐、耶律燕饭店一起救下陆无双，郭芙和武家兄弟赶来吓走李莫愁，耶律齐、燕、萍谢过郭芙，程英露出真面目，陆无双二人相认，杨过独自离去。 杨过独自上华山，碰到洪七公，洪七公请杨过吃蜈蚣，杨过承诺守洪七公三天三夜。 三天三夜已过，杨过却不见洪七公醒来，杨过正要离去，欧阳锋突然出现和洪七公比起了内功……

雪崩中洪、欧二人打了三天三夜，筋疲力尽，杨过将二人分开，二人无力再打，决定拿杨过来比试，欧阳锋和洪七公分别教杨过打狗棒法和蛤蟆功……欧阳锋悟出打狗棒的最后一招，洪七公服了欧阳锋二人相拥，欧阳锋终于想起了自己的名字。洪七公和欧阳锋冰释前嫌相拥而死。杨过埋葬了洪七公和欧阳锋后下山 杨过救下瘦马，王十三等丐帮弟子告诉杨过郭靖夫妇要办英雄宴之事。甄志丙发现杨过来英雄宴，杨过见过郭靖。 杨过告诉郭靖郝大通杀死孙婆婆之事，郝大通气愤这下离去……

郭芙开始关心杨过，武兄弟被冷漠，杨过和郭芙、武家兄弟赛马，武家兄弟输给杨过被罚洗全庄的马匹。郭芙、杨过、武家兄弟偷看黄蓉教鲁有脚打狗棒法，杨过听到打狗棒的口诀，黄蓉和杨过谈心时，黄蓉腹中胎动杨过使内功相助，被黄蓉觉察。 英雄大会上黄蓉将丐帮帮主之位传给鲁有脚，选武林盟主众人推选洪七公，金轮国师带霍都前来捣乱……

金轮国师也要争选武林盟主，鲁有脚败在霍都手下，霍都要求和郭靖他们比武三场以决胜负，来定武林盟主。朱子柳和霍都比第一场，朱子柳教霍都写“笔”字。小龙女出现与杨过相见。朱子柳用一阳指和书法结合之下打败霍都，霍都用暗气伤了朱子柳，反败为胜，朱子柳的毛笔飞出打到了小龙女的衣服上，杨过找霍都出气和霍都打了起来，杨过使出打 狗棒法绊倒霍都，使霍都出尽了丑，杨过使打狗棒法打败霍都。 霍都不服，杨过又用小龙女教的玉女剑法和霍都比试，霍都认输，达尔巴冲上，被杨过打的一败涂地。 金轮国师不服，要小龙女接他三招，小龙女和金过招，杨过和郭靖相助，打败金轮国师。

郭靖向小龙女提出要将郭芙嫁给杨过。小龙女说自已要做杨过的妻子，遭众英雄反对，赵志敬向众人说出了终南山杨过和小龙女赤身露体之事，郭靖夫妇赶走杨过和小龙女。 郭芙因提婚之事没有面子，生气跑出城。 甄志丙、赵志敬在酒楼上碰见金轮国师，金轮国师看出赵志敬以后可以利用。郭芙跑来被金轮国师抓住，武家兄弟、黄蓉追来和金轮国师打了起来，黄蓉被金轮国师抓住，杨过和小龙女帮忙救出黄蓉，杨过、小龙女和金轮国师对打的时候误出了玉女心经的最后一招，全真教的剑法和玉女剑合用就能达到玉女心经最高境界，二人打败霍都、达尔巴，解药拿回，小龙女给霍都玉蜂桨。黄蓉告诉小龙女，她与杨过不能长相厮守……

小龙女为了杨过悄悄离去，杨过四处找小龙女却碰到金轮国师，金轮国师又抓到黄蓉，杨过再次救黄蓉、郭芙和武家兄弟。 杨过、黄蓉败下阵，程英来打伤金轮国师，给黄蓉疗伤，程英救下杨过为他疗伤，带杨过来到茅屋，杨过又见到陆无双。陆无双来镇上给杨过买药，被李莫愁发现了他的踪迹，陆无双回来后告诉程英，程英决定留下照顾杨过，布置土阵准备和李莫愁一战…… 程英和无双都将自己的半块锦帕送给杨过，杨过在危机之时将五毒秘笈还给李莫愁，又将手帕拿给李莫愁，杨过坦白了无双和程英的心事，二女真诚真对，众人僵持之时傻姑闯进……

黄药师赶来吓走李莫愁，黄药师感谢杨过救了黄蓉和郭芙，黄药师欣赏杨过。 黄药师要杨过拜他为师，杨过婉拒。 小龙女寻死飘到绝情谷口，被公孙止发现救下。 李莫愁用十六字激得黄药师无法出手，黄药师将弹指功、玉箫剑法传给杨过，并支持杨过和小龙女的婚姻，要杨过替他报十六字之辱，杨过写信被程英察觉离去之心，李莫愁回来打伤傻姑，傻姑拿剪刀挥舞，使杨过想出用剪刀对付李莫愁的拂尘。 杨过带着傻姑来到铁匠铺，碰到黄药师的徒弟冯默风

李莫愁说出有辱黄药师的话，冯默风气愤用烧红的拐杖和李莫愁打起来…… 李莫愁道袍被烧，杨过将程英给自己缝的衣服给李莫愁遮羞，李莫愁逃走。 杨过从傻姑嘴里得知其父之死与黄蓉郭靖有关，决心报仇，杨过跟踪达巴尔找到金轮国师，杨过为金疗伤，二人合谋杀郭靖夫妇。

公孙止向小龙女求婚，小龙女答应。 金轮国师带杨过来见四王爷忽必烈，杨答应留下，金轮国师想利用杨过杀了郭靖。 周伯通来绝情谷捣乱…… 忽必烈向杨过介绍潇湘子、尼摩星、尹克西、马光佐等四大高手，席间四高手和金轮国师暗中较劲，周伯通又来到蒙古包捣乱，正好赶上金轮国师一行人抢吃牛肉…… 杨过发现周伯通身上掉下小龙女的铃铛，跟着周伯通来的了绝情谷，金轮国师一行人为了抢功也都跟着追来。

公孙绿萼接待杨过等人，绿萼给杨过说情花用处，公孙止告诉他们因周伯通来捣乱婚期退后一天，周伯通又逃了出来和攀一翁、潇湘子比武，周打败他们，公孙止让周留下他偷走的东西，周脱光衣服耍赖趁机溜走。 杨过终于见到小龙女。可小龙女不认杨过，金轮国师几人愿意陪杨过参加明日的婚礼。杨过向公孙绿萼说出姑姑就是自己所爱，绿萼同情杨过答应帮他。 杨过和小龙女相会被公孙止发现，公孙止命攀一翁杀杨过，樊却被杨过三招之内剪掉胡子，寻死自尽……

杨过救下樊一翁，杨过死也要留在绝情谷陪小龙女，杨终于打动了小龙女，小龙女认了杨过，公孙止伪善的原形毕露，要和杨过决一死战。 杨过、小龙女在剑房发现‘‘君子淑女”剑。杨过小龙女和公孙止比武，小龙女动情时伤口痛，杨过为了照顾小龙女被公孙止打落剑，公孙止将杨过绑在情花丛中，让情花扎遍杨过身体。小龙女为了给杨过要解药被迫答应嫁给公孙止。

绿萼与杨过到书房偷解药，被公孙止发现，二人被其推下鳄鱼潭…… 绿萼和杨过在鳄鱼潭中勇斗鳄鱼，杨过给绿萼披衣服时发现自己衣服里的绝情丹和水道的地图，绿萼和杨过找出口时碰到裘千尺，母女相认。裘千尺向杨过和绿萼讲述公孙止将她害成这样的原委，公孙止向小龙女坦言他和爱妻的过去。

杨过等三人用枣树皮做绳攀上天坑，樊一翁发现杨过和他打了起来，裘千尺吐枣核将攀打倒，裘要杨过杀了樊一翁，杨过不忍，留下了樊一翁的命。裘千尺扮成裘千仞来到婚礼。 公孙止认出裘千尺，杨过将情花解药给了小龙女吃。 裘千仞帮助杨过破解公孙止的武功，裘千尺得知他大哥裘千仞是郭靖黄蓉所杀，公孙止大败逃走，裘千尺逼杨过娶绿萼，杨过不从、裘千尺要杨过杀了郭靖、黄蓉。

裘千尺十八日才将另半枚绝情丹给杨过服下…… 蒙古军将襄阳城包围，杨过和小龙女进入襄阳城准备行刺郭靖……杨过刺杀郭靖失手，郭靖的不疑把杨过这一切都掩盖了过去，郭靖的深情厚义让杨过这次刺杀变成了一场哭 笑不得的“走火入魔”郭靖的一句话“莫杀错了好人！好人怎能错杀”的由衷之言，使杨过深感震动，使杨过心里矛盾，看着大宋百姓受蒙古人欺辱，他不知所措。

在郭靖处境危险时，杨过拼死救下郭靖。庆功会上大小武不服…… 正在这紧急关头，武家兄弟因为和杨过争功争宠私自偷入敌营，结果反受其缚，黄蓉要杨过陪郭靖去蒙古大营去救武家兄弟，这本是杨过又有一次机会刺杀郭靖，但机智的黄蓉扣下小龙女。 郭靖和杨过这次去救武家兄弟差点送了郭靖的性命，而敌方潇湘子等人为了跟杨过争夺“蒙古第一勇士”，一次次地“救护”郭靖，杨过要杀郭靖障碍重重，已方误事，敌方救人，郭靖在生死关头的大侠气质、豪迈作风和对杨过毫无利已的真挚关怀彻底地征服了杨过，杨过又一次违背了自己的初衷，由杀人者变成了救人者。黄药师的弃徒、乡村铁匠冯默风为救郭靖、杨过逃出蒙古大营惨死在了金轮国师手下。和杨过形影相随的瘦马这次也为主人捐躯沙场。

霍都随后就送来了金轮国师的挑战信，霍都羞辱武家兄弟没有给是师门添彩，金轮国师前来挑战，黄蓉看出小龙女的心事，向他明说了她的意思。 小龙女也同样把杨过身中情花之毒的事情告诉黄蓉，黄蓉要小龙女助郭靖躲过这一关，事后拿她人头去跟裘千尽换绝情丹救杨过，金轮国师赶到，小龙女和杨过出面抵挡，郭襄顺利出生，杨过拎着假郭靖将金轮国师等人引开，为保郭靖。 武三通突然出现看到自已多年不见的儿子，可两个儿子却为了郭芙要自相残杀。 黄蓉将刚出生的郭襄交给小龙女，金轮国师等人围攻杨过，杨过将假郭靖扔给了尼摩星等人，金轮国师早已识破杨过的计谋，金轮国师使计骗杨过出来，倒让小龙女当了金轮国师的当，杨过出来助战，二人双战金轮国师，李莫愁把郭襄误认为是杨过和小龙女的孩子趁机将其抢走，杨过和金轮国师追赶李莫愁争抢郭襄。 李莫愁钻进山洞，杨过怕李莫愁对郭襄不利，不顾生命冲入洞内。

二人合伙对付金轮国师，杨过将李莫愁的银针倒插洞口，杨过使计诱进尼摩星和金轮国师中银针之毒。 李莫愁、杨过逃出山洞给郭襄找奶吃，二人路遇母豹，杨过擒住给郭襄喂奶。 尼摩星将中毒的双腿砍去，金轮国师亦运功逼毒。 杨过出手相救被毒蟒袭击的神雕，神雕深为感动，带杨过来到独孤求败居住过的山洞！ 杨过向神雕告别离开山洞，碰到武三通哭喊，听出其中之意，武家兄弟为郭芙要决一死战，杨过答应武三通来劝说武家兄弟的自相残杀，杨过的谎言和好言劝说正好让小龙女听到，小龙女伤心离去将小红马交给朱子柳。 几个人的争斗被山洞中的李莫愁听到，杨过再也没有本领来劝说武氏父子三人报仇之念，一场冲突，武氏兄弟中了李莫愁的毒针。 武三通要为儿子吸毒，杨过决意要在自己生命的最后关头做一件好事。杨过为武氏兄弟吸毒晕迷七天七夜。

全真教甄志丙、赵志敬前来抗蒙，霍都找赵志敬被甄志丙发现，赵志敬说出甄志丙强暴小龙女相威胁，被窗外小龙女和郭芙听到，小龙女追杀赵志敬和甄志丙，七天七夜后杨过醒来，天竺僧说情花毒已经深入骨髓，银针毒和情花毒相克，杨过命在旦夕，决意去绝情谷寻找解药。 郭芙拿着小龙女给她的淑女剑找杨过杨过算账，盛怒之下砍断杨过的右臂，杨过被郭芙砍断右臂后出走，杨过来找神雕。 郭靖责打郭芙，被黄蓉护着郭芙逃出襄阳城。 小龙女一路跟随着赵志敬和甄志丙，金轮国师路碰赵志敬和甄志丙被小龙女跟着，金轮国师答应赵志敬保护他，甄志丙不得不跟赵志敬投靠蒙古。 金轮国师和赵志敬等人路遇老顽童偷走蒙古军旗，金轮国师激老顽童趁他不在营中时偷旗无耻，要他把旗送还夜晚再来重偷。

金轮国师使诈，周伯通中计，小龙女救下周伯通，二人被堵在偷旗的洞内，周伯通教小龙女左右互搏之术，小龙女领悟到一人使用玉女心经的诀窍，金轮国师放毒蜘蛛封洞，小龙女引来群蜂破其蜘蛛，野蜂赶走金轮国师，周伯通以毒攻毒用蜂毒化解蜘蛛之毒得救。 在神雕精心的照顾下杨过很快就康复了…… 神雕带杨过来到剑冢洞取得重剑，杨过开始练重剑……跟随着神雕来到山涧中练重剑……

杨过向神雕告别潜到郭家要寻断臂之仇，正遇郭靖为杨过之事要砍郭芙一臂相还，黄蓉护郭芙逃出襄阳，途中遇李莫愁怀抱郭襄，黄蓉追至二人较量武功，黄蓉见李莫愁对郭襄情义颇深，假意杀郭襄要李莫愁以命相换，李莫愁迟疑，黄蓉感动，告诉李莫愁郭襄不是小龙女和杨过的孩子，此孩是自己的女儿，二人却发现郭襄不见了，郭芙看到杨过抱着郭襄跑来告诉黄蓉和李莫愁，三人同去终南山找杨过。

终南山重阳宫正要甄志丙接任掌教，霍都来宣蒙古王旨意，赵志敬以小龙女之事逼甄志丙把掌教之位让于他，甄志丙屈从，以身有病让于赵志敬接任掌教，众道不服赵志敬与之理论，霍都等人挑衅与众道动手，全真弟子将霍都、潇湘子困住，金轮国师赶到打伤王志坦，全真弟子又被金轮国师绑起，赵志敬命清笃杀死甄志丙，小龙女出现，言称亲手杀甄，先杀赵志敬，金、潇和小龙女动起手来，甄志丙替小龙女挡住金轮以死谢罪，丘处机等人全真五子功成后出来围攻小龙女，小龙女在金轮国师和丘处机的夹击下受伤，杨过出现救走小龙女 小龙女问杨过何以断臂，杨过具实相告，误会解除，丘处机等人拦住杨过和小龙女，尼摩星被杨过一掌打伤，杨过连续打败蒙古一族，劝说马光佐归农，杨过挟持孙不二，要在重阳宫大殿上和小龙女成亲，替祖师婆婆出气。 丘处机带人摆下七星大阵围攻杨过和小龙女时，周伯通带着玉蜂赶来，二人趁机逃出重阳宫，留下玉蜂浆。

赵志敬被逼向丘处机等人说出甄志丙玷污小龙女一事，周伯通趁机偷走玉蜂浆，周伯通耍赖脱衣时，玉蜂浆被扣在钟下的赵志敬捡去，赵志敬用其威胁众道，却被群蜂蜇咬中毒而死 杨过带着小龙女、郭襄潜水回到古墓，小龙女穿上了祖师婆婆留下的嫁衣，从箱中又发现了王重阳给祖师婆婆写的信，信中得知祖师婆婆和欧阳锋交过手，杨过从寒玉床上悟出救小龙女之法。 朱子柳、天竺僧等人来绝情谷为杨过寻找解药被抓，武家兄弟逃出回去报信，武家兄弟路遇耶律齐、耶律燕被追杀，出手相救…… 黄蓉劝说郭芙见了杨过向他道歉，郭芙不服，李莫愁亦看不惯…… 大小武、耶律兄妹又遇完颜萍被公孙止抓，出手相救……郭芙完颜萍又被公孙止抓住，耶律齐救下郭芙，李莫愁和黄蓉赶走公孙止……

武家兄弟将朱子柳等人被抓之事告诉黄蓉，黄蓉决定先到古墓找到杨过再一起去绝情谷求解药…… 杨过和小龙女带着郭襄在古墓生活，李莫愁带众人从水道进入古墓，李莫愁使诈困住众人，独自去找杨过和小龙女，耶律齐等人听到郭襄的哭声设法逃出，杨过助小龙女用内功打通经脉疗伤，李莫愁突至出手，毒掌内力传遍小龙女周身 杨过逼向李莫愁要解药，重剑的威力令李莫愁畏惧，杨过带小龙女离开到另一房间，耶律齐等人听着打斗声寻找杨过，杨过设计将李莫愁关进棺材，听到声音也躲进了棺材中，郭芙捡到李莫愁的冰魄银针，误伤棺材中的杨过和小龙女，还出口伤人，杨过盛怒下抢走郭襄，小龙女知道自己命不久已，让杨过走，杨过不肯，李莫愁从棺材中飞出…… 蒙古军烧山，众人逃出古墓，小龙女要杨过和她出去看看外面的世界……众人出来却不见黄蓉，郭芙把李莫愁误认为是黄蓉，李莫愁点中郭芙穴道扔进火中，耶律齐冲进火中救郭芙却被木树挡住出路，小龙女见郭芙遇难劝说杨过救郭芙，杨过将郭襄还给黄蓉，冲进火中救下郭芙和耶律齐，与小龙女离去。 杨过带小龙女来到秦岭山脉，遇到一灯大师和慈恩，慈恩杀性大起，杨过见过一灯大师，一灯大师赠于小龙女药丸，愿与二人一起去绝情谷找师弟天竺僧。 杨过、小龙女等人来到绝情谷，看到李莫愁逼洪凌波杀陆无双和程英，杨过赶来救下陆无双和程英，李莫愁将陆无双和程英扔进情花坳中，杨过跳进情花池救出陆无双和程英，自己却被情花刺伤，李莫愁将洪凌波扔进情花坳中做垫脚石，逃出情花坳。

公孙绿萼带杨过众人来见裘千尺，裘千尺认出了慈恩，要慈恩为大哥报仇，并要杨过娶绿萼，方可得到解药，杨过不从，绿萼姑娘假装生气将天竺僧等人关禁的地方放在枣核里告知杨过，杨过和小龙女按照地图找到火浣室，救出天竺僧等人，天竺僧却因亲自试情花之毒而昏迷， 慈恩抢走郭襄，黄蓉装疯将郭襄从慈恩手里骗出。 绿萼听到杨过说他心中只有小龙女，再容不得旁人，原本爱慕杨过的一颗心悲痛不已伤心欲绝的绿萼跑到断肠崖上……偶听公孙止和李莫愁要拿她来做诱饵骗裘千尺拿出半枚绝情丹，绿萼伤心之下自已投入情花丛中。 绿萼告诉母亲自己被父亲推进情花丛中，裘千尺带绿萼去大厅拿解药，黄蓉接下裘千尺枚枣核钉可获得半枚绝情丹，裘千尺让绿萼拿假解药给黄蓉，绿萼为救杨过拿出了真药却被公孙止抢走……

黄蓉的劝说让小龙女不知所措……次日清晨，杨过却发现小龙女不见了…… 杨过四处找小龙女无果……大家来到天坑，程英替杨过下坑底找小龙女亦无果，杨过痛哭跑到断肠崖，杨过看到小龙女留在崖边的龙女花和断肠草，和小龙女在崖壁上留下十六年后相见的字迹。 黄蓉骗杨过是南海尼神把小龙女带走治伤，杨过略释怀信，众人离去，陆无双和程英留下陪杨过在绝情谷养伤，杨过将玉女心经传给了陆无双和程英。

蒙古军已撤退，黄蓉带众人回到襄阳…… 杨过不告而别，只给程英、陆无双留下一封信，杨过来到剑冢，见到神雕，神雕却要杨过练习木剑。 杨过和神雕一起练剑……杨过带神雕下山，到南海边等待小龙女，对小龙女的思念练起了默然销魂掌 十六年后，蒙古人欺压大宋百姓，郭靖和黄蓉得知蒙古再攻襄阳，担心出门的郭芙姊妹三人。 郭芙和破虏发现不见了郭襄，十六岁的郭襄在和一帮乞丐喝酒，郭芙把她拉走。 郭襄听到民间艺人说到神雕侠很感兴趣，郭襄的热心帮木偶艺人，木偶艺人将独臂的神雕侠送给了郭襄…… 因黄河结冰不能赶路，郭家姐弟来到安渡老店，郭襄又碰到艺人说书，大头鬼带郭襄去见神雕侠…… 郭襄听出西山一窟鬼要对付神雕大侠……西山一窟鬼路经万兽山庄时惊走了九尾令狐，史家五兄弟截住西山一窟鬼打了起来，杨过出现制服百兽……

杨过答应帮史家兄弟去黑龙潭找九尾银狐，郭襄跟随着杨过而去……郭襄说出当世的几位英雄，杨过也在其中……答应带郭襄同去黑龙潭上找九尾银狐…… 二人来到黑龙潭发现九尾银狐，杨过追九尾狠狐被瑛姑阻止。 一灯大师带着慈恩也在黑龙潭欲见瑛姑，杨过帮一灯大师把瑛姑邀出来见慈恩，瑛姑向杨过提出要求，请周伯通来见她…… 杨过带郭襄来到白花谷，杨过用黯然销魂掌让周伯通大开眼界……周伯通将他和瑛姑过去之事讲给杨过听，杨过告诉周伯通，一灯大师并不怪他，却责怪自己没有救你的儿子，周伯通答应来见瑛姑，化解与一灯大师几十的恩怨，瑛姑将银狐交给杨过…… 杨过带回九尾银狐给史家兄弟治病……杨过知道郭襄是郭芙的妹妹，郭襄不舍得离开杨过……

杨过送给郭襄三根金针，答应她三个心愿，郭襄第一根金针就是要看杨过真面目……郭襄向杨过提出第二个心愿是她十六岁生日之时要杨过去看她，杨过都答应了她…… 襄阳大乱，郭芙带着郭襄和破虏进城，郭芙向黄蓉告状郭襄路上竟认些不三不四的 朋友…… 霍都利用何师我杀死鲁有脚，夺取打狗棒，混进了丐帮…… 郭襄在羊太傅庙祭奠鲁有脚，郭芙找来，尼摩星出现抓住二人，杨过暗助郭襄打死尼摩星，郭襄思念杨过…… 史家兄弟助杨过暗中查霍都的情况…… 很多江湖中人送重礼来给郭襄祝寿令黄蓉和郭靖吃惊…… 郭芙让耶律齐为她争夺丐帮帮主之位……丐帮大会上，武家兄弟一一战败群雄…… 郭襄不参加丐帮大会，在屋内等待杨过到来……大头鬼告诉郭襄让她去校场等候杨过的到来……

郭襄来到校场，接到了杨过送给她的第一件礼物…… 宣布耶律齐为丐帮帮主时，何师我阻拦，言称打狗棒不在不能做帮主，并要和耶律齐比武。何师我暗中用兵刃伤了耶律齐，同时也被耶律齐的软猬甲所伤，何师我在台上耀武扬威，杨过给郭襄送来了第二件礼物，达尔巴……达尔巴上台揭穿霍都的真面目，从霍都手中找出打狗棒，青灵子将打狗棒交给郭襄…… 装死的霍都突然起身挟持郭芙，被两枚石子打死，黄药师现身为郭襄祝寿，杨过带着南阳大火从烟花中从天而降，。杨过见过郭靖和黄蓉，拒做丐帮帮主，与黄药师悄然离去，耶律齐为丐帮帮主。 杨过和黄药师离去令郭襄失望，黄蓉告诉她杨过和郭家的渊源…… 杨过和黄药师用黯然销魂掌法消遣潇湘子、尹克西和黑脸汉子……

杨过在和黄药师比试掌法中无意说到南海神尼，黄药师竟不认识她，杨过精神崩溃…… 郭襄从黄蓉口中得知杨过和他们家的渊源…… 郭襄给郭靖黄蓉留下信去找杨过，郭襄路上打听杨过的消息被金轮国师听到，金轮国师骗郭襄是郭靖的朋友，带走郭襄，郭襄和金轮国师遇见长须鬼和大头鬼，长须鬼和大头鬼欲救郭襄，被金轮国师杀死，郭襄始知金轮国师实乃恶人，郭襄不吃金轮国师的东西，趁他睡着偷偷溜走，金轮国师追上郭襄，郭襄不忍用石子砸死金轮国师，用石头把他压住逃走 郭襄激金轮国师带他去见杨过，金轮国师答应郭襄，金轮国师先带郭襄来到蒙古营中，柯镇恶听到蒙古军说郭襄被金轮国师抓住，柯镇恶路遇仇人沙通天等四人，柯镇恶求四人容他办完一件事后再来受死，柯镇恶找程英、陆无双，到襄阳报信郭襄被金轮国师抓走。 杨过码头喝酒听到船工说要去嘉兴，杨过来到铁枪庙，柯镇恶来赴约给沙通天等人九花玉露丸，杨过听到柯镇恶说起杨康之事，愤怒之下要杀柯镇恶，柯镇恶宁死也不说杨康的好，杨过终相信父亲就是这样的人，柯镇恶告诉杨过郭襄被金轮国师抓走杨过要柯镇恶替他给杨康立碑。 陆无双和程英告诉了郭靖郭襄被抓，黄蓉要亲自去救郭襄…… 金轮国师带郭襄去绝情谷……

黄蓉、程英、北上继续找郭襄，路上遇到蜜蜂黄蓉让大家跟着蜜蜂走，到了老顽童的住处，黄蓉来见老顽童，老顽童却闭门不见，一灯大师接待黄蓉…… 黄蓉在老顽童的蜂翅膀上的字误出小龙女在绝情谷谷底下。 杨过等待小龙女无望之下跳下崖，正赶来的郭襄跟着也跳了下去，赶来的金轮国师只抓到郭襄的一只鞋子，二人掉进崖底水潭，郭襄将第三根银针拿出，要杨过答应她第三个愿望，就要好好活着。 黄蓉等人赶到断肠崖见金轮国师却不见郭襄。 周伯通、一灯大师和金轮国师打起来…… 雌雕受伤坠入深谷，雄雕将雌雕和郭襄救上来…… 杨过看到玉蜂，得知小龙女就在潭水下，杨过跳下潭水中，进入洞天府地，见到他整日思念的小龙女……小龙女和杨过互吐情思，讲述离别后的经历。 蒙古皇帝蒙哥亲自来攻打襄阳城……

郭靖、耶律齐苦守襄阳城，黄蓉、黄药师、周伯通、一灯大师、程英、陆无双、陆无双等人赶回为襄阳助战，在蒙古后军放火，蒙哥看到郭靖长箭穿夫吓得后退，收兵明日再战。杨过与小龙女神雕前往襄阳助战。金轮国师将郭襄绑在战车高架上来要挟郭靖投降，郭靖等人摆阵救郭襄，金轮国师要郭襄劝郭靖投降，郭襄大骂金轮国师无耻，郭靖安慰黄蓉要以国家为主，众人眼看郭襄被烧，杨过小龙女和神雕赶来救下郭襄，架车倒下，金轮国师不顾一切保护郭襄，郭襄终于叫了一声金轮国师为师父。

耶律齐被蒙古军包围，郭芙给杨过跪下求他救耶律齐，蒙军大败。杨过以高强武功，万军之中杀死了蒙古皇帝，蒙军顿时崩溃，解了襄阳十六年的围困。 襄阳城庆祝，郭靖对杨过还是那句话“为国为民，侠之大者” 杨过小龙女不告而别，郭襄目送杨过和小龙女、神雕离走，留下神雕侠在世间流传。