Hace diez años, en la ciudad de Fuyuki, un joven fue atrapado en un infierno masivo que incineró a sus padres y consumió una gran parte de la ciudad; cuando estaba muriendo, un hombre lo salva. Ahora este chico, Shirou Emiya, es un mecánico aficionado que asiste a la escuela en Homurabara Gakuen. Shirou también parece ser bastante mago, pero sus habilidades no están cerca del nivel de su difunto padre. Mientras tanto, la ciudad está empezando a estar plagada de derrames de gasolina y homicidios, y con el sentido de justicia de Shirou comienza a aparecer, ¿qué podría hacer alguien como él?

Rin parece tener problemas con el sirviente que tiene y el hecho de que ella no era lo suficientemente poderosa como para llamar a un sirviente más poderoso. De vuelta en la escuela, Ayako le ha pedido a Shirou que vigile al hermano de Sakura, Shinji Matou, que ha estado jugando en el club de arquería. Al final, Shinji aprovecha la naturaleza servicial de Shirou y lo hace ocuparse del dojo del club de arquería. Sin embargo, mientras que la cabeza de limpieza de Shirou sale a inspeccionar un ruido, solo para presenciar una pelea entre dos sirvientes.

Shirou le presenta a Saber a Sakura y al único maestro que dice que es un pariente lejano. La maestra prueba las habilidades de Saber para poder defender a Shirou bastante patéticamente, le permite quedarse en la casa con él. Cuando Rin y Archer hablan, él le pregunta por qué no persigue a Shirou, un objetivo fácil de matar. Ella dice que si apareciera frente a ella sin darse cuenta, lo mataría. En la escuela, algunas chicas faltan a la escuela por segundo día consecutivo. Después de la escuela, Shirou se ha quedado para investigar esta desaparición cuando se encuentra con Rin. Rin se enfrenta a Shirou llamándolo idiota por caminar sin hacer nada sin su sirviente y ella lo ataca. Shirou huye de ella y se encierra en un salón de clases. Shirou hace la única magia que conoce y fortifica un escritorio para protegerse contra un ataque de Rin. Toda la escuela está siendo iluminada por estos acontecimientos, todo esto siendo observado por un personaje misterioso en los árboles y el episodio termina.

Saber le gritó a Shirou por no llamarla cuando estaba en peligro. Saber comienza a ir a la escuela con Shirou. Cuando Rin aparece y dice que caminará con Shirou a la escuela, Saber lo permite después de que Rin hable con ella. Explicó que de esta manera los enemigos pueden pensar que es una trampa no ver a Saber con él, por lo que es menos probable que ataquen. Rin explica que deberían haber marcas de hechizos en la escuela y que si las destruyen demorarán la activación del campo de fuerza. pero no destruirlo, y lo más probable es que obligue al maestro a esconderse. Después de la escuela Shirou y Rin trabajan para encontrar marcas de hechizo y destruirlas. Terminan destruyendo una buena cantidad de ellos y lo llaman una noche. En el camino a casa, antes de que Shirou llegue a algún lado pero después de que Rin se vaya, él siente algo realmente fuerte. Él va a investigarlo y siente que viene del club de arquería. Shirou se dirige al interior, donde ve un gran círculo de hechizos en la pared y cuando trata de tocarlo se queda atónito por la magia. Luego ve a Rider y antes de que ella haga algo, Shinji entra, ordenando a Rider que la haga dar un paso atrás y le pregunta a Shirou si quiere jugar.

Shinji dice cosas como que no tiene intención de pelear y fue arrastrado a esta guerra. Él pide hacer una alianza con Shirou para ir tras Rin, pero Shirou se niega. Shinji dice que porque él no conoce la magia, otros Maestros no pueden detectarlo, lo que significa que Shinji no es el otro Maestro que Rin estaba detectando, lo que significa que hay un cuarto en la escuela. Antes de que Shirou se vaya, Shinji le cuenta a Shirou que uno de los Maestros ha establecido una base en un templo. Shirou llega a casa y Sabre y Rin le gritan, Rin ha venido después de que Shirou no regresó a casa. Shirou les cuenta acerca de Shinji y el Maestro en el templo. Shirou y Rin están de acuerdo, contra el juicio de Sabres, en que no deben atacar el templo todavía, ya que no saben qué Sirviente y puede ser una trampa. Saber aparece de nuevo con Shirou el templo, pero Shirou insiste en que no irán. Después de que Shirou duerme, Saber menciona lo ingenuo que es y se pone su armadura y se dirige hacia el templo donde vemos a un nuevo Sirviente que no habíamos visto antes de esperar.

Shirou se despierta después de tener otro sueño más del pasado de Saber y claramente se conmueve por lo que sucedió. Esa mañana, durante el desayuno, Ilya es presentada por Rin como otra persona que permanecerá allí por un tiempo y Taiga parece aceptarla bien. Mientras tanto, ha habido noticias sobre incluso más filtraciones de gas, lo que significa que el Maestro en Ryudouji parece estar escalando sus planes. Mientras Shirou, Rin y Saber están planeando qué hacer al respecto, Ilya entra a la sala con una gran cantidad de información sobre este tema.