הלוג פוס של נאמי מתחיל להצביע לשמיים, והצוות מוצא, על ספינה בת 200 שנה, מפה של אי בשם "סקייפיה". הם מתחרים עם צוות החילוץ של מאסיקה דמוי הקוף, בזמן שהם מחפשים אחר רמזים נוספים על איך להגיע לשם.

כובעי הקש מחליטים ללכת לג'איה איילנד כדי לחפש אחר מידע על סקייפיה. בינתיים, אס מופיע פתאום על ספינתו של באגי. באגי לא מתיר לאף אחד מאנשיו לתקוף את אס מפני שמפחד מהעונש של וואייטבירד.

העיר המרכזית של ג'יאה מלאה בפיראטים מפורסמים שנלחמים ביניהם בקביעות. לופי וזורו נכנסים למריבה עם פיראט הידוע בשם "בלאמי הצבוע", אשר לועג לחלומותיהם ומתקיף אותם.

לופי, זורו ונאמי פוגשים את האדם שנחשף כבלאקבירד בשלב מאוחר יותר. הם עוזבים את מוק טאון, ונכנסים לקרב עם אחיו של מאסירה, שוג'ו - קוף חילוץ נוסף.

כובעי הקש פוגשים במונטבלאנק קריקט בחלק אחר של ג'איה. קריקט הוא צאצא של מונטבלאנק נורלאנד, "שקרן" ידוע לשמצה שסיפר על עיר הזהב בג'איה, וקריקט נודה עקב זה שחיפש אחר חפצים של עיר הזהב. יכולת להיות שקריקט הוא האדם היחיד שיודע להגיע לסקייפיה.

קריקט מסביר לכובעי הקש איך לרכוב על זרם אנכי מסוכן הנקרא הנוק-אפ סטרים כדי להגיע לסקייפיה. למרות זאת, עליהם קודם לתפוס את הסאות'בירד כדי שתצביע להם בכיוון הנכון בו הזרם יתפרץ מהים.

בזמן שכובעי הקש מחפשים אחר הסאות'בירד, בלאמי וצוותו תוקפים את הבית של קריקט, וגונבים את חפצי הזהב שהוא אסף במשך השנים מעבודות החילוץ שלו. כשכובעי הקש חוזרים ורואים מה קרה, לופי מחליט לקחת טיול צדדי חזרה למוק טאון.

לופי מחסל את בלאמי באגרוף יחיד. בינתיים, ראשי ממשלת העולם מודאגים בנוגע לוואייטבירד, שאנקס ולופי. המארינס מנסים להחליט מי יחליף את קרוקודייל כשיצ'יבוקאי, ואחד מחברי הצוות של בלאקבירד מופיע ללא הזמנה ומציע את בלאקבירד כמועמד.

הגואינג מרי מותאמת מחדש בידי מאסירה ושוג'ו כדי שתיהיה מתאימה יותר לתעופה, וכובעי הקש רוכבים על הנוק-אפ סטרים לסקייפיה.

כובעי הקש מגיעים לים שמעל לעננים. אוסופ כמעט ונופל מהגואינג מרי, אך ניצל בדקה האחרונה. בנוסף, מותקף הצוות ע"י לוחם שנראה מוזר, אבל ניצל ע"י אביר השמיים, גאן פול. הם מגיעים לבסוף לגבול שמעביר אותם לממלכה העליונה, סקייפיה.

כשהצוות מגיע לסייקפיה, מקבלות את פניהם קוניס וחיית המחמד שלה, סו. קוניס ואביה מסבירים איך החיים בסקייפיה, ואיך עובדים הדאילים.

נאמי מגלה מה קורה לכל אחד שנכנס ליער. בינתיים, שאר הצוות מחכים לשינוי ברוח, אבל מותקפים בחוצפה ע"י המשטרה של סקייפיה, שמתכוונים לבצע את שפיטת השמים.

לכובעי הקש יש בעיות עם אוכפי החוק המקומיים הנקראים "כובעי הברט הלבנים".

בזמן שהם מנסים לברוח מאי השמים, רובין, צ'ופר, נאמי וזורו נלקחים כבני ערובה בידי האל אנל.

קוניס מובילה את לופי, אוסופ וסאנג'י לספינה בכדי להגיע לאפר יארד, אך היא מזהירה אותם שזו מלכודת, וכמעט נפגעת משפיטת השמים.

לופי, אוסופ וסאנג'י מגיעים לבסוף לאפר יארד, רק כדי לגלות שכל הדרך ממולכדת, אך הם מגיעים לבסוף לשערי המבחנים. בינתיים, רובין זורו ונאמי חוקרים את אפר יארד, בזמן שצ'ופר נשאר מאחור כדי להגן על הספינה.

לופי, סאנג'י ואוסופ נכנסים לשער מבחן הכדורים, ופוגשים בכוהן סאטורי.

אוסופ, סאנג'י ולופי נלחמים בסאטורי, אבל כוח המאנטרה שלו נראה חזק מדי.

כאשר צ'ופר מאויים בידי הכוהן שורה, הוא שורק במשרוקית כדי שגאן פול יבוא, אך לפני שהוא יכול להגיע, הכובן שורה תוקף את צ'ופר, ומתחיל להרוס את הגואינג מרי.

סאטורי מובס בידי לופי וסאנג'י.

צ'ופר ניצל ע"י קבוצה של סאות'בירד ענקיות, שאומרות לו שגאן פול היה אל. נאמי, זורו ורובין מגלים את הסיבה שבגללה אפר יארד הוא אי מוצק - הוא היה חלק מג'איה פעם - וזהו החלק שנורלאנד השקרן ראה. בינתיים, השאנדיאנים תוקפים את אפר יארד.

התקפתם של השאנדיאנים על אפר יארד החלה. הצוות מתאחד, וכולם מדברים על מה שקרה. צ'ופר מטפל בגאן פול, והפיראטים מתכננים לגנוב את הזהב על האי.

לאחר התחברות עם להקת זאבים, גאן פול מספר לצוות יותר על ההיסטוריה של אפר יארד.

אנל מסיר את הגבלותיהם של הכוהנים. בנוסף, אוסופ חוזה באיש מיסתורי המתקן את הסירה, וביום שלמחרת, מרי חורת לצורתה הרגילה. לאחר הורדתה מהמזבח של מרי, הפיראטים מתכננים את דרך הפעולה שלהם.

נחש פיתון ענק גורם לפיצולם של לופי, רובין, צ'ופר וזורו בזמן הליכתם לחורבות בדרום.

ווייפר מביס את שורה ומספר לשאנדיאנים על מטרתו, ואנל אומר כמה אנשים ישארו חיים בסוף תוכניתו.

זורו נלחם בלוחם השאנדיאני בראהאם, ומביס אותו עם הטכניקה מיוחדת שלו.

לופי נלחם בווייפר, אבל לאחר כמה זמן, הוא נופל לחורבות תת-קרקעיות. בינתיים, אנל מופיע על הגואינג מרי, ולאחר שגילה כי מטרתו האמיתית היא עיר הזהב, הוא מחסל את אוסופ וסאנג'י. לאחר מכן, נעלם, ומותיר את אחיו של סאטורי, הוטורי וקוטורי, לנקום.

צ'ופר מותקף ע"י גדאטסו, שמתגלה כאדיוט מוחלט. צ'ופר מביס אותו לבסוף, וגורם לו ליפול לים הכחול. קוניס ואביה עוזרים לאייסה, והולכים לכיוון האפר יארד.

אנל מביס כמה שאנדיאנים. בינתיים, גאן פול ונאמי מתחילים ומסיימים את הקרב עם קוטורי והוטורי. הוטורי מובס בידי נאמי, וקוטורי - בידי גאן פול.

בזמן שרובין בודקת כמה חורבות שהיא מצאה, יאמה, האוכף הראשי, תוקף אותה. יאמה מובס ע"י רובין בקלות. לאחר מכן, היא מגלה על העיר העתיקה, שאנדורה.

הכוהן אום מופיע, ומתחיל להילחם בכולם.

בחורבות העליונות, הקרב בין אום, זורו, ווייפר וגאן פול מתחיל. כשנאמי מופיעה, היא נבלעת ע"י נחש הפיתון הענק ביחד עם גאן פול ואייסה.

אום גורם למצב להיות גרוע, בכך שהוא יוצר כלוב תיל מסביב לאזור. לאקי מובסת בידי אנל, ונאמי, אייסה וגאן פול מגלים למה הפיתון השתולל כל כך.

זורו מביס את אום סוף סוף עם טכניקת המיוחדת שלו. בינתיים, פאגאיה וקוניס שומעים את האמת המבעיתה על כוונותיו האמיתיות של אנל - להשמיד כל אדם בשמים.

אנל מופיע כדי להקטין את קבוצת האנשים שנותרה קרוב ככל האפשר לתחזיותיו.

אנל תוקף את גאן פול, ומנחית עליו מכת מחץ. אז, הוא מביס את רובין כשהיא מנסה להפעיל עליו מניפולציה. זורו מרשים את אנל עם כוחו, אך מובס בקלות כשמנסה לגרום לאנל לשלם על מה שעשה לרובין. לבסוף, כדי להפיל את אנל, ווייפר היה צריך להשתמש בנשק סודי.

אנל מביס את ווייפר וזורו. כשנאמי רואה זאת, היא עוקבת אחר אנל למערה בה נמצאת התיבה של אנל, מאקסים. לופי מצליח לבסוף לצאת מהנחש, יחד עם אייסה, רק כדי לגלות על תוצאת הקרב עם אנל. כשאייסה אומרת ללופי שהיא יודעת היכן אנל נמצא, הוא מבקש ממנה לקחת אותו אליו.

לופי ואנל מתחילים להלחם. קוניס מספרת לתושבי סקייפיה האחרים על הסכנות הכרוכות בהישארות על אי השמים.

אנל מפעיל מכונה שתביא לסופו של אי השמים - דת'פיה.

לופי נופל מן התיבה. נאמי מתחילה להלחם באנל, בזמן שסאנג'י ואוסופ מנסים להציל אותה.

אוסופ וסאנג'י מתפצלים כדי להציל את נאמי, אך הראשון שמגיע לסיפון התיבה הוא אוסופ.

ענני הגשם של אנל מתקרבים לאי השמים, והפינוי נמצא במחצית דרכו.

ההיסטוריה של נורלאנד וקאלגארה מתגלה בתור פלאשבק של ווייפר.

נורלאנד וקאלגארה נהנים, כמו גם הכפריים וצוותו של נורלאנד, אך זה משתנה יום אחד, כאשר הכפריים מתחילים לשנוא את חבריהם החדשים.

הסיבה לשנאה מתגלה ומוסברת, וקאלגארה נודר לפגוש את נורלאנד שוב.

אי המלאכים נהרס מהתקפתו של אנל. לופי מחליט לצלצל בפעמון המוזהב לפני שאנל ייקח אותו.

נאמי מגלה דרך להגיע לאנל - ע"י חיתוך הג'אינט ג'אק. רובין מספרת לרובין שלנורלאנד יש צאצא שמחפש עבור עיר הזהב, ושזאת הסיבה לכך שלופי רוצה לצלצל בפעמון המוזהב.

לופי מביס את אנל, ובתהליך, מצלצל בפעמון המוזהב.

המלחמה על אי השמים, שנמשכה 400 שנים, מסתיימת. מונטבלאנק קרירט והאחים מאסירה שומעים את צלצולו של הפעמון המוזהב, ומבינים שעיר הזהב הייתה בשמים. אנל, שנזרק אל הים הכחול, מתקדם לעבר הפיירי וארת'. אנשי השמיים חוגגים את סיומה של המלחמה עם מדורה גדולה.

רובין מפענחת את הפונגליפים על הפעמון המוזהב, ומבינה איך למצוא את הריו-פונגליף. היא מגלה, בנוסף, שהפונגליפים על הפעמון נכתבו בידי גול די. רוג'ר, שיכל להבין פונגליפים, שגילה את הריו-פונגליף, וביקר בסקייפיה בעבר. לאחר מכן, כובעי הקש גונבים שלל אוצרות מבטן הנחש הענק, ומתחילים בעזיבתם את סקייפיה.

הפעמון המוזהב מצלצל כשכובעי הקש חוזרים לים, מה שמסמל שהם מוזמנים לחזור, ושכולם מודים להם מעומק ליבם על מה שעשו. כשהספינה מגיעה לים סוף סוף, צרות מופיעות כשמתגלה כי הספינה נחתה בבסיס מארין.

המארינס משוכנעים שהגואינג מרי היא ספינת רפאים, לאחר שזו מתרסקת לתוך המבצר שלהם מלמעלה. חברי הצוות מתפזרים בשטח.

בתחפושת, סאנג'י מראה לשפים של המארין את הדרך הנכונה להכין ארוחה.

זורו נאסר, בעוד שנאמי וצ'ופר מסייעים לרופאה לחוצה בטיפול במארינס פצועים.

רובין ואוסופ מתחזים לאותו מפקח שאמור לבקר, ואוסופ נזרק לתא המעצר עם זורו. לופי וסאנג'י מתגלים ע"י ג'ונת'ן לאחר תקרית קטנה.

המפקח האמיתי נזרק לתא המעצר עם זורו ואוסופ, בזמן שסאנג'י ולופי ממהרים להציל את השניים כשהם מנסים להימנע מגילוי.

לאחר ששיחררו את זורו ואוסופ, לופי וסאנג'י מנסים לברוח מנאווארונה. כשהיחידה המיוחדת היהירה נערכת, ד"ר קובאטו מובילה את נאמי וצ'ופר אל הרציפים.

הצוות נפגש ברציפים כאשר הם מוקפים במארינס. ע"י שימוש בנאמי כבת ערובה מזויפת, הם מרמים את המארינס וחוזרים לגואינג מרי.

הצוות מחפש את הגואינג מרי כספינת מארין כדי שיוכלו להשיג את האוצר שלהם בחזרה. הם מליטים שעם הזהב, הם ישכרו בונה ספינות.

אוסופ מחלק את הצוות לשתי קבוצות - קבוצת השבת הזהב וקבוצת השבת הווייבר. המפקח שפרד מחליט לתפוס את לופי בעצמו.

סאנג'י, זורו, אוסופ ורובין ממשיכים לחפש אחר האוצר. לופי מוביל את נאמי אל המפקדה של הקפטן, שם הם משיבים את הזהב שלהם.