Ace alcanza la plataforma de ejecución. Mientras tanto, el barco de Luffy se acerca a la Puerta de la Justicia, que bloquea su camino a Marineford. Después de que Ace finalmente llegue a la plataforma de ejecución, Sengoku revela quién es el padre de Ace, pero Ace insiste en que Barba Blanca es su padre. Sin embargo, Sengoku revela al mundo a través del Den Den Mushi que la madre de Ace es Portgas D. Rouge, que lo mantuvo dentro de su vientre durante 20 meses y que tomó el apellido de su madre para convertirse él mismo en pirata. También revela que Ace es el hijo del Rey de los Piratas, Gold Roger, para el horror de Ace, los marines y los periodistas.

Mientras que los infantes de marina están a la espera del asalto de Barba Blanca y la ejecución de Ace, Garp tiene un flashback: meses antes de que Gold Roger fue ejecutado, reveló a Garp que va a tener un hijo y le dijo a Garp que lo cuide. Los infantes de marina han buscado a gente que estén conectados con Roger. Portgas D. Rouge, la madre de Ace, mantiene al niño dentro de su vientre durante 20 meses. Sin embargo, después Rouge dio a luz al niño, un niño al que llamó Gol D. Ace y murió de agotamiento. Ace fue mandado por Garp con Dadan poco después. Garp también introdujo a Luffy a la vida de Ace y se hicieron amigos. Durante el discurso de la ejecución de Sengoku, él se entera de que las puertas de Justicia se han abierto sin una orden, lo que permite al barco de Luffy pasar. Después la flota de Barbablanca aparece, el Moby Dick aparece bajo el agua frente a la plataforma de ejecución.

Barba Blanca revela su poder de Akuma No Mi frente a la Marina. Entramos en el pasado de Ace y Barbablanca: Ace fue el capitán de los Piratas de Spade. Ace se enfrenta a Jimbei para satisfacer a Barbablanca desde el rechazo de Ace a una oferta para convertirse en un Shichibukai. BarbaBlanca ofreció a Ace unirse a su tripulación cuando la batalla termino, Ace intentó matar a Barbablanca en vano. Barbablanca nombra a Ace comandante de la 2da división. Sin embargo, cuando Barbanegra deserto de la tripulación y asesino a un nakama, Ace dejó a Barbiblanca para capturar a Barbanegra. Cuando Ace le dice a BarbaBlanca en la plataforma de ejecución que hizo caso omiso a sus consejos, BarbaBlanca dice que él fue quien lo envió, cuando en realidad le dijo que no fuera, para que el rescate fuese justificado.

BarbaBlanca y sus aliados declaran a los infantes de marina su determinación de rescatar a Ace, mientras que Luffy y su grupo están llegando a Marineford. Un tsunami se acerca a Marineford en ambos lados como resultado de la Gura Gura No Mi. Sin embargo, Aokiji lo detiene con su habilidad, mediante la congelación. La división de comandantes de Barbablanca entran en acción, al igual que los Vice-Almirantes. Mihawk a continuación, lanza un gran ataque hacia Barbablanca.

Jozu logra soportar el ataque de Mihawk con su poder de fruta del diablo, que convierte su cuerpo en diamante. Kizaru intenta atacar a Barbablanca, pero Marco lo bloquea convirtiéndose en un ave fénix con su poder de fruta del diablo, y golpea a Kizaru. Jozu arroja un bloque gigante de hielo hacia los marinos pero, Akainu lo funde con su magma basado en su poder de Fruta del Diablo. Akainu contraataca, y hunde uno de los barcos de Barba Blanca, pero Barbablanca extingue el magma. Mientras tanto, Coby y Helmeppo empiezan a tener miedo, Oars Jr., un descendiente del original Oars, fuerza el paso hacia Ace, a quien él ve como un amigo cercano.

Oars Jr. se esfuerza en su camino a la plaza y derrota a la Unidad de los gigantes, lo que permite a los Piratas de Barbablanca avanzar. Él continúa a pesar de las protestas de Ace albergando que es un objetivo demasiado grande y Oars recuerda el momento en que Ace le hizo un sombrero que le protegía de la intemperie. Oars es atacado varias veces por Kuma, Doflamingo y Moria lo que le causó un colapso al intentar llegar a Ace.

Oars Jr. trata de llegar hacia Ace, pero no puede y cae. Vicealmirante Ronse lanzó un ataque sorpresa a Barbablanca, pero fue derrotado fácilmente por un puñetazo terremoto. Barba Blanca ordenó a sus soldados atacar la plaza. Coby y Helmeppo se ocultan dentro de Marineford para escapar de la batalla, pero ellos ven que Akainu mata a un marino por intentar hacer lo mismo. Sengoku les dice que olviden la estrategia y ejecuten a Ace. Algo que cae del cielo, son Luffy y los presos que escaparon de Impel Down.

En un flashback, el tsunami creado por Barbablanca precipita al buque de Luffy. Tratan de subirse a la ola, pero se quedan bloqueados en la parte superior cuando Aokiji lo congela. Después de escuchar un informe de que la ejecución va a suceder pronto, en un intento de liberarse, caen. Luffy ve que Ace está vivo, entonces detiene a Crocodile que intenta atacar a Barbablanca. Luffy le avisa a Barbablanca que la ejecución será pronto y este le pregunta sobre el sombrero, Luffy dice que es de Shanks, y le advierte a Barba Blanca que él va a rescatar a Ace y que él va a convertirse en Rey de los Piratas.

Luffy sigue para salvar a Ace, luchando contra los infantes de marina en el camino. Kizaru lo ataca con un rayo de luz, pero Ivankov lo salva, sólo para ser atacado por Kuma, quien afirma conocer. Luffy se encuentra con Jango y Fullbody; Jango accidentalmente se hipnotiza a sí mismo y a Fullbody, y se escapa de Hina con el Gear Second. En otras partes, los Piratas de Barbablanca tienen dificultades para derrotar a los Vice-almirantes, y Squardo intenta colarse, sólo para encontrarse con alguien. Moria ataca con un grupo de zombies, mientras tanto Ace le grita a Luffy que no soportaría ser salvado por un débil, mientras que en realidad no quiere que Luffy muera. Sin embargo, Luffy le dice que no le importa, y decide salvarlo aunque muera. Jimbei llega, derrotando a los zombis de Moria con un chorro de agua salada, y Luffy derrota a un oficial gigante con el Gear Third, Sengoku revela a los infantes de marina que Luffy es el hijo de Dragón el Revolucionario.

Ace esta molesto porque los Piratas de Barbablanca y Luffy todavía están tratando de salvarlo, pero decide aceptar si vive o muere. Barbablanca acepta la ayuda de Buggy, y señaló que a pesar de ser débil, tiene seguidores poderosos que podrían representar una amenaza. Barbablanca, siente que la Marina tiene un plan. Jimbei pelea contra Moria y lo derrota, incluso cuando se roba algunas sombras para aumentar su poder. Smoker ataca a Luffy y lo arrincona, pero Hancock, enojada por el ataque que recibió Luffy, lo ataca y consigue darle una patada a pesar de sus poderes Logia con su Haki. Ivankov es encuentra con Kuma, diciendo que ellos se conocían. Sin embargo, Doflamingo revela a Ivankov que Kuma está muerto.

Doflamingo le dice a Ivankov que Kuma se ha modificado poco a poco en un Pacifista a lo largo del tiempo y que hace unos días, perdió por completo su personalidad. Luffy recibe la llave de las esposas de Ace de Hancock, quien sueña con una boda celebrada en Amazon Lily entre ella y Luffy con toda la tribu Kuja de testigos. Ivankov lucha contra Kuma, Luffy mientras sigue avanzando por el campo de batalla. Crocodile vence a una multitud de hombres de menor rango de los piratas de Barba Blanca, para llegar a él, pero es detenido por Jozu, pero Crocodile luego se detuvo por Doflamingo. Mihawk se acerca para bloquear el camino de Luffy.

Mihawk comienza a atacar a Luffy, mientras que Hancock y Ivankov están ocupadas. Luffy se las arregla para escapar utilizando a Buggy como un escudo humano, y el comandante de la quinta división llega para luchar contra Mihawk. Buggy y sus seguidores logran conseguir uno de los Den Den Mushi en el marco de su plan para convertirse en alguien famoso. Las órdenes de Sengoku son que se corte la transmisión, ya que el mundo sólo sabe que por ahora los marinos están ganando. Un ejército de Pacifistas, dirigido por Sentoumaru, ataca a los Piratas de Barbablanca por detrás.

Los Pacifistas, derrotan a los Piratas de Barbablanca en su camino, pero el plan no es totalmente eficaz, debido a que Barba Blanca ataca a los buques. Los infantes de marina se retiran de la plaza, con la intención de elevar el muro de fortificación y ejecutar a Ace antes de terminar con los Piratas de Barbablanca y Luffy, y los comandantes de Barbablanca se apresuran para llegar a Ace. Las órdenes de Sengoku son aplicadas y todos los Den Den Mushi dejan de emitir, pero el que robo Buggy todavía sigue transmitiendo imágenes. Squardo, uno de los aliados de Barba Blanca que había estado ausente por algún tiempo, apuñala a Barba Blanca en el pecho con su espada.

Squardo apuñala a Barbablanca, Squardo afirma que Barbablanca hizo un acuerdo con la marina y consistía en sacrificar a sus aliados para salvar a Ace. Como los piratas de Barbablanca cuestionan a Barbablanca y se desmoralizan, la Infantería de Marina aprovecha y Aokiji congela Buggy, cortando las imágenes. Barbablanca castiga a Squardo, pero lo perdona. Se abre un camino y Barbablanca, dice que lo siguieran si están dispuestos a dar la vida. Barbablanca salta a la palestra, decidido a salvar a Ace, aunque muera en el intento.

En un desesperado intento de detener el avance de Barbablanca, los infantes de marina activan las paredes para bloquearle el camino, pero se detuvo por el hielo. Squardo se da cuenta de su error en el apuñalamiento de Barbablanca y llora, pero Marco lo calma. Mientras tanto, Luffy y sus aliados se acercan a la plataforma de ejecución y la Marina no puede pararlos. Barbablanca se enfrenta a John el gigante, y lo derrota con un golpe en el pecho. Luffy estira sus brazos para alcanzar a Ace, pero los marines activan las paredes y Luffy cae. Sin embargo, queda un camino libre en el que Oars jr. cayo herido y impide que el muro se levante. Akainu utiliza su ataque Meteoro Volcán para derretir el hielo en un intento de evitar que los piratas de Barbablanca alcancen a Ace.

El ataque de Akainu derrite casi todo el hielo y destruye los barcos de Barbablanca, colocándolos en agua hirviendo, lo que les permite a los cañones bombardear, mientras que los Pacifistas bloquean la salida. El hueco dejado abierto por Oars Jr. es vulnerable, Luffy y algunos Piratas de Barbablanca tratan de romperlo, pero son obligados a regresar. Sengoku se prepara para ejecutar ahora a Ace. Ya que los Piratas de Barbablanca no pueden salvarlo o escapar, pero Oars recupera la conciencia. Jimbei lanza a Luffy por encima del muro, y Luffy comienza a luchar contra los tres almirantes, como Barbablanca decide jugar su carta de triunfo.

Luffy intenta burlar a los almirantes, pero Kizaru fácilmente lo alcanza y lo golpea contra el suelo. Los verdugos se preparan para ejecutar a Ace, pero interviene Crocodile, diciendo que él puede matar a Barbablanca más tarde y no quiere que los infantes de marina ganen. Aokiji ataca a Luffy, pero Marco lo golpea lejos antes de que pueda acabar con él. Mr. 3 se esconde en los pasajes debajo de Marineford, después de haber logrado escapar de la congelación de Aokiji. Los piratas de Barbablanca se apuran en llegar hacia la abertura en la pared, lo que llevó a las fuerzas de la marina en disparar sus cañones contra ellos, pero Barbablanca había ocultado un barco sumergido y lo saca, Oars agarra el barco y lo impulsa dentro de la plaza con los piratas a bordo. Mientras las fuerzas de Barbablanca llegan a la plaza, Sengoku y Garp se preparan para luchar contra ellos.

Barbablanca ataca a la marina en la plaza, Aokiji viene a pelear con él pero Jozu llega a manejarlo. Luffy es atacado por dos vicealmirantes y Kizaru, a continuación, se derrumba por sus lesiones y cansancio. Barbablanca le dice a Luffy que se mantenga al margen del resto de la batalla, pero admira su persistencia. La batalla continúa, Akainu contra Barbablanca, los piratas aliados llegan para ayudar a los piratas de Barbablanca, y los Pacifistas llegan para luchar contra ellos. Marco vuela para rescatar a Ace, pero Garp lo golpea de nuevo y declara que cualquiera que trate de rescatar a Ace tendrá que matarlo primero.

Shirohige tiene un momento de debilidad y Akainu lo aprovecha para asestarle un golpe crítico. Dos de sus comandantes, Marco y Jozu, son también víctimas de los ataques de Kizaru y Aokiji respectivamente. Luffy suplica a Ivankov que le vuelva a inyectar una nueva dosis de Tensión Hormonal para poder salvar a su hermano, pero Iva-san le advierte que eso reduciría drásticamente su esperanza de vida.

Luffy ha recuperado sus energias gracias a Ivankov y vuelve a correr hacia su hermano. En el patíbulo, dos nuevos soldados de La Marina se preparan para ejecutar a Ace. En el camino de Luffy aparece Coby que no duda en enfrentarse al Sombrero de Paja. Shirohige continua enfrentándose a varios marines y Jinbe acude a ayudarle junto a otros piratas. Mientras, Sengoku ordena que se ejecute inmediatamente a Ace y cuando los dos ejecutores se disponen a ello, Luffy lanza involuntariamente su Haki del Rey provocando el desconcierto en Marineford.

Shirohige ordena a sus hombres que protegan a Luffy para que pueda llegar hasta Ace. La Marina intenta detenerlo a toda costa pero Sombrero de Paja cuenta con la ayuda además de todos los travestis de Ivankov, que aún está sorprendido de la explosión de Haki de Luffy. Cuando faltan pocos metros para llegar al patíbulo, Inazuma reaparece y crea para Luffy un puente para llegar hasta Ace.

Cuando Luffy veía su camino libre hasta Ace, Garp se interpone en su camino. Abuelo y nieto se enfrentan para defender cada uno los caminos que han elegido mientras el puente creado por Inazuma se viene abajo. Cuando Luffy llega al patíbulo, intenta liberar a Ace con la ayuda de Mr. 3 que resultó estar disfrazado de soldado ejecutor. Pero Sengoku desata el poder de su habilidad con la intención de aplastar él mismo a Ace y Luffy.

Ace ha sido liberado y sus aliados lo celebran, pero La Marina se echa encima de él y de Luffy, por lo que tienen que luchar juntos para salir ahora de Marineford. Shirohige entonces ordena a su banda y al resto de capitanes que regresen al Nuevo Mundo sin él. Sus hombres tienen que aceptar a regañadientes su orden y Ace agradece a Shirohige todo lo que ha hecho por él.

Shirohige cree que es el momento de huir de Marineford y ordena a su tripulación y al resto de piratas que emprendan la retirada sin él. Ace le da su último agradecimiento antes de emprender su huída con Luffy y los demás. Es entonces cuando Akainu empieza a burlarse e increpar a Shirohige y Ace, que no puede pasar por alto tal afrenta, se dispone a hacerle tragar sus palabras.

Ace es golpeado y atravesado por el puño de magma del almirante Akainu y cae en los brazos de Luffy. Es entonces cuando piensa sobre su pasado y recuerda su objetivo en la vida: averiguar el motivo por el cual había nacido. Akainu continua su ataque esta vez sobre Luffy, pero Jinbe, Marco y Vista le paran los pies. Todos los piratas están conmocionados por la herida de Ace y no creen en su recuperación.

Luffy se derrumba tras el trauma emocional de ver morir a Ace en sus brazos y pierde el conocimiento, por lo que Jinbe se hace cargo de llevarlo a un lugar seguro. Los piratas de Shirohige y sus aliados prometen protegerlo a toda costa. Mientras tanto Shirohige, enmudecido por la rabia, inicia una despiadada lucha contra Akainu que provoca el derrumbe de Marineford y hace una brecha entre él y sus piratas. Es entonces cuando entra en escena alguien a quien nadie esperaba.

Kurohige y sus piratas llegan a Marineford y Shirohige se lanza contra él para vengar a sus dos hijos muertos por su culpa. La lucha entre ambos empieza y Shirohige consigue neutralizar los poderes de Kurohige, pero las heridas que acumula son demasiadas para continuar el combate, y los piratas de Kurohige aprovechan para atacarle a la vez. Shirohige ve llegar su hora y hace una importante revelación antes de morir.

La muerte de Edward Newgate da la vuelta al mundo, creando un falsa sensación de paz. Mientras, Kurohige empieza su plan y sus hombres lo cubren junto al cuerpo de Shirohige con una lona. Mientras, Jinbe continua con la intención de poner a salvo a Luffy, y más ahora que Akainu vuelve a aparecer dispuesto a acabar con la vida del hijo de Dragon. Inazuma e Ivankov le intentarán parar los pies. Entonces, Kurohige sale de debajo de la lona para enseñar al mundo el porqué ésta va a ser su era.

Kurohige declara que destruirá Marineford con sus nuevos poderes y hunde en el desánimo a todos los marines que están allí. Pero Sengoku planta cara a Kurohige y con sus palabras vuelve a levantar el ánimo a sus hombres que se lanzan a por los piratas que huyen. Coby entonces se preguntan donde está la justicia de asesinar a piratas que huyen cuando la guerra claramente ya ha acabado.

Mientras, Akainu continua su persecución a Luffy y Jinbe, a pesar de las interferencias de varios aliados de Luffy que le salen al paso, consigue alcanzarles y herir de gravedad a ambos.

La batalla en Marineford continua, aunque claramente ya hay un bando vencedor. Trafalgar Law ha llegado con la intención de rescatar a Luffy, Sengoku continua su lucha con Kurohige mientras que Akainu ahora lucha contra los comandantes de Shirohige. Coby no logra entender como es posible que la guerra continue y sigan muriendo hombres en ambos bandos, por lo que decide detener la guerra interponiéndose entre Akainu y los piratas de Shirohige.

Law y su tripulación llevan a Luffy y Jinbe al interior de su submarino para atender sus heridas y emprender la huida. Mientras, la aparición de Shanks parece que ha detenido la batalla por unos instantes y le pide a Sengoku que de por terminada la guerra y le entregue los cuerpos de Ace y Shirohige para que tengan un entierro digno.

Con el destino de Luffy en juego, Law empieza la operación para salvarle la vida.

Mientras, las noticias del fin de la guerra y la victoria de la Marina llena de celebraciones el mundo entero, pero a pesar de todo, hay nuevos problemas: Kurohige está libre con sus nuevos compañeros reclutados en el nivel 6 de Impel Down, los territorios protegidos por Shirohige caen bajo el ataque de sus enemigos y las palabras postumas de éste, anunciando que el One Piece existe, desencadena una ola de piratería por todos los mares.

Iva se despide de Jinbe y los otros para dirigirse a su reino Kamabakka. Boa Hancock, los piratas de Law y Jinbe se dirigen a Amazon Lily para ocultar a Luffy hasta que se recupere. Ya instalados, Luffy se despierta y empieza a arrasarlo todo en busca de Ace.

Luffy y su tripulacion se quedan sin víveres y encuentran una extraña isla donde descubren que todo es comestible, desde árboles de carne hasta hongos de azúcar. Allí conocen a un extraño hombre llamado Toriko que busca el ingrediente legendario que yace en esa isla.

Luffy es llevado por su abuelo hasta el hogar de la Familia Dadan y allí conoce a Ace, que muestra un gran desprecio hacía Luffy, incluso cuando éste lo único que quiere es ser su amigo y acompañarlo a todas partes, pero Ace se deshace de él siempre molesto por su presencia. Aún así Luffy no se rendirá.

Después de cruzar el bosque en busca de Ace, Luffy llega hasta un lugar llamado Gray Terminal, donde no hay leyes y es el hogar de muchos sin techo. Allí ve como Ace roba a unos piratas y se lleva el botín al bosque, hasta un escondite donde comparte un gran tesoro con otro niño llamado Sabo. Entonces aparecen unos piratas y se llevan a Luffy como rehén para interrogarle sobre dónde esconde Ace y Sabo el tesoro.

Ace y Luffy consiguen rescatar a Luffy derrotando a Porchemy, pero el capitán de los piratas Bluejam no pasa por alto este ataque a su banda y jura vengarse.

Gracias a este rescate, Luffy por fin empieza a llevase bien con Ace y Sabo.

Sabo se instala a vivir con la Familia Dadan en el Monte Corvo, estrechando así la amistad con Ace y Luffy. Los tres hacen incursiones a Gray Terminal y a la ciudad con frecuencia, y en una de éstas, Sabo se cruza con su padre y hace ver que no lo conoce. Después de esto, les cuenta a Ace y Luffy quien es él en realidad.

Hartos de estar siempre de malas con Dadan, Ace, Luffy y Sabo deciden valerse por si mismos y construir una guarida para ellos y así continuar con sus sueños de llegar a ser piratas.

Ace, Sabo y Luffy están de caza y aparece un enorme oso que pone en aprietos a los tres hermanos, entonces un viejo capitán pirata que pasaba por allí les salva la vida usando Haki para detener al oso. Éste les cuenta que hace años luchó contra Gold Roger y perdió la batalla y a su tripulación. Ace al oír esto se marcha enfadado y Sabo le cuenta a Luffy quien es el padre de Ace.

Ace, Sabo y Luffy ayudan a Naguri en la construcción de su barco pirata. Al mismo tiempo se lanzan un desafío entre ellos, aquel de los tres que consiga derrotar al tigre gigante será capitán cuando tengan su propio barco. Pese a todo, los intentos por vencer al felino van fracasando uno tras otro.

Sabo, Luffy y Ace son capturados en Grey Terminal por los piratas Bluejam que habían sido contratados por el padre de Sabo para recuperar a su hijo. Con la promesa de su padre de que Ace y Luffy no sufrirán ningún daño si vuelve a casa, a Sabo no le queda más remedio que volver a la alta sociedad. Pero una vez allí se entera del plan del rey para "limpiar la basura" de Gray Terminal antes de la llegada de un Tenryuubito al país.

Sabo queda atónito de la pasividad e indiferencia de los nobles de la ciudad frente al plan de incendiar Gray Terminal con todos sus habitantes y corre para advertir a sus hermanos del peligro.

Ace y Luffy, ajenos al desastre que se avecina, están ayudando a los piratas Bluejam a colocar unas misteriosas cajas por todo Gray Terminal sin saber su contenido.

Cuando el fuego estalla, todos se ven atrapados entre las llamas.

Mientras Dadan y Ace se quedan atrás luchando contra Bluejam entre las llamas, el resto de la familia Dadan y Luffy consiguen escapar, pero les queda la incógnita de si Dadan y Ace regresarán.

Días después, Sabo acepta que nunca tendrá la libertad que él busca viviendo entre nobles y prepara todo para huir de la isla el mismo día que el Tenryuubito visita el país.

El barco de Sabo es completamente destruido por el fuego del Tenryuubito que no puede soportar su presencia. Al mismo tiempo, Ace y Dadan regresan a la casa de los bandidos para alivio de Luffy y el resto de la familia, pero la alegría dura poco, Dogra llega con las malas noticias de la muerte de Sabo.

Días después, Ace recibe una carta de Sabo que fue escrita antes de que emprendiera su corto viaje por el mar.

Aunque van pasando los años, Ace y Luffy no dejan de entrenar duro ni un día con tal de conseguir ser lo bastante fuertes como para salir al mar a cumplir sus sueños. El primero en hacerlo es Ace, y tres años después le llega el turno a Luffy de emprender su propia aventura.

Garp llega a la isla Fuschia con la intención de protegerla de cualquier ataque debido al auge de la piratería tras la muerte de Shirohige, pero Dadan no verá con buenos ojos su visita. Mientras, en algún lugar del Nuevo Mundo, tiene lugar el funeral de Ace y Shirohige.

En Amazon Lily, Luffy sigue descontrolado por la rabia y tristeza de haber perdido a su hermano y se enfrenta a Jinbe que intenta calmarlo aún teniendo que emplear su fuerza contra él. Jinbe recuerda a Luffy que todavía tiene compañeros por los que seguir viviendo.