Luffy a bien grandi. Au bout de ses deux ans d'entraînement intensif, il est même devenu le maître de l'île de Rusukaina. Une fois ses adieux fait aux animaux avec qui il est devenu ami, il repart direction l'Archipel Sabaody où l'attendent Rayleigh et les membres de l'Équipage du Chapeau de Paille. Zoro qui arrive le premier se rend dans le bar tenu par Shakky.

Luffy se retrouve confronté au faux Luffy et à sa bande. Evidemment il les neutralise facilement en utilisant les pouvoirs que lui avait enseignés Rayleigh sur l'île Rusukaina.

Robin arrive sur le Sunny qui est maintenant muni du revêtement et rencontre Franky.

Sur le Grove 46 où se rassemblent un grand nombre de pirates, Caribou aperçoit un marine et lui donne un coup de lance. Chopper, Usopp et Nami, eux, arrivent sur le Sunny et retrouvent Robin et Franky.

La réunion des Faux Chapeaux de Paille continue jusqu’à ce que Sentoumaru arrive. Il assomme le faux Luffy et dévoile aux autres pirates sa véritable identité.

L'équipage parvient à se réunir alors que la Marine essaye de les stopper avant leur départ. C'est alors que Boa Hancock, Héraclès, Perona, Rayleigh, Haredas, les Okamas ainsi que l'Oiseau Géant qui a ramené Chopper, protègent tour à tour les membres de l'Équipage au Chapeau de Paille. Ces derniers sont alors enfin prêts. Le Thousand Sunny se submerge donc dans l'eau afin de se diriger vers leur prochaine destination : l'île des Hommes-Poissons !

Rayleigh, en compagnie de Shakky, regarde nostalgiquement le départ des Mugiwara en se remémorant sa rencontre avec Roger.

Alors que Caribou et son équipage s'apprête à aborder le Thousand Sunny, Meuh-Meuh, la vache des mers qui tire leur navire, reconnaît Nami et se rappelle des coups infligés par Luffy et Sanji lorsqu'elle servait Arlong.

Sanji, qui se déplace à une vitesse incroyable, frappe un tentacule du Kraken à l'aide de sa Diable Jambe. Zoro, lui, utilise une nouvelle technique pour couper un autre tentacule. Quant à Luffy, il utilise sa nouvelle technique : un Gear Third imprégné de Haki de l'Armement.

Le bateau pirate de Van Der Decken fait son apparition ! Van Der Decken ordonne au Bonze des mers de détruire le Sunny.

Alors qu'ils viennent juste d'arrivés devant l'île de Hommes-Poissons, les Chapeau de Paille se font déjà attaquer par un groupe de monstre-marins chevauchés par des Hommes-Poissons qui se font appeler «Les nouveaux pirates Hommes-Poissons». Franky enclenche alors un Coup de Burst qui propulse l'équipage sur l'île.

Franky sauve Robin et retrouve Nami qui l'informe qu'elle pense avoir trouvé une ville.

Luffy, Usopp et Chopper parviennent enfin à trouver un donneur de sang pour Sanji.

En pleine mer, Gyro se souvient de l'époque où il a été attaqué par les Nouveaux Pirates Hommes-Poissons et jura de ne jamais retourner sur l'île des Hommes-Poissons. Pendant ce temps, sur l'île, Nami retrouve Luffy et les autres. C'est alors que le roi de l'île, Neptune, accompagné de sa baleine et de Megalo apparaît devant eux et les convie à un banquet au palais Ryugu. De son côté, Hody démontre la puissance des stéroïdes qu'il utilise en détruisant le vaisseau de Gyro, utilisant seulement sa bouche, ses mains étant enchaînés. Zeo, un autre subordonnés de Hody, révèle que les Hommes-Poissons naissent en possédant une force 10 fois supérieur à celle des êtres humains. Cependant, grâce aux stéroïdes, cette force et leurs pouvoirs doubles pour chaque pilule qu'ils ingurgitent. Pourtant, chaque pilules utilisé réduis l'espérance de vie de son bénéficiaire.

Pendant que Caribou utilise son pouvoir pour capturer des sirènes afin de les revendre sur le marché d'esclaves, Luffy et les autres se rendent au palais du Roi Neptune. Arrivé au palais Ryugu, Luffy en profite pour ce balader et finit par tomber sur la princesse sirène, la magnifique Shirahoshi...

Une fois que la princesse sirène Shirahoshi apprit que son requin Megalo fut sauvé par Luffy, elle commence à l'apprécier et lui pose des tas de questions.

Au palais Ryugu, Zoro bat Neptune et ses hommes avant de les prendre en otages. Arrivé à l'entrée du palais, le prince Fukaboshi et ses deux frères, Ryuboshi et Manboshi, passent un message à Zoro destiné à Luffy.

Lorsque Brook et le Ministre de la Droite apprennent que la princesse Shirahoshi n'est plus dans sa chambre, ils se mettent immédiatement en route pour prévenir le Roi Neptune.

Robin, qui découvre l'existence d'un Ponéglyphe sur l'île des Hommes-Poissons, désire se rendre à la Forêt Marine. Cependant, des soldats essayent de l'arrêter mais Robin s'en débarrasse facilement.

Luffy, Shirahoshi et Megalo se dirigent toujours vers la Forêt Marine. Pendant ce temps, au Palais Ryûgû, le Roi attaché pleure la disparition de sa fille.

Alors que les habitants accusent toujours les Chapeaux de Paille de kidnapper la princesse sirène, Chopper essaie d'empêcher que Sanji regarde Shirahoshi craignant qu'il ne fasse une nouvelle hémorragie pouvant cette fois lui être fatale.

Alors que Zoro vient de terminer son combat contre Hody, ses sbires avalent des pilules d'énergies leur permettant de lui tenir tête. Neptune, comprenant la situation, créer un gigantesque courant marin pour que lui et ses hommes puissent quitter le palais.

Alors que L'Équipage des Nouveaux Hommes-Poissons terrorise la population et oblige les habitants à piétiner la photo de la reine Otohime, Caribou, lui, continue de kidnapper des sirènes. De son côté, Robin découvre enfin le Ponéglyphe de l'île des Hommes-Poissons dans la Forêt Marine. Pendant ce temps, Jinbei commence à raconter ce qui le lie à Arlong. Les douloureux souvenirs de Nami refont alors surface...

Jinbe débute son récit : un flaskback retraçant des évènements vieux de 16 ans sur l'île des Hommes-Poissons commence. Otohime interrompt la fuite d'un voleur en ville.

Le récit de Jinbe se poursuit. Sur l'île des Hommes-poissons les exploits de Fisher Tiger arrivent aux oreilles des habitants.

Après avoir appris à connaitre la jeune Koala durant leur périple, les hommes de Fisher Tiger débarquent enfin sur l’île natale de la jeune fille : l'île Foolshout.

Jinbe poursuit son récit. Après le décès de Tiger, Arlong, fou de rage, s'attaque à la Marine. Cependant, le Vice-Amiral Kizaru le stoppe et l'emprisonne à Impel Down.

Les anciens esclaves hommes-poissons membres des Pirates du Soleil retrouvent leur famille sur l'île des Hommes-poissons. Pendant ce temps, la nouvelle de l'adhésion de Jinbe à l'ordre des Grands Corsaires se répand sur l'île et la reine Otohime se réjouit de cette adhésion.