Ya de camino para encontrarse con Usopp, Yosaku les cuenta a Sanji y a Luffy su próximo destino, y también aprovecha para hablarles acerca del Shichibukai y su próximo enemigo, mientras que Nami finalmente llega a su isla natal, tomada por la banda de piratas tritones del capitán "Nariz de sierra" Arlong.

Luego de llegar a la isla, Zoro es capturado por los tritones y Ussop y Jhonny llegan al pueblo de Gosa, el cual recientemente había sido destruido por la banda de Arlong, también conocen a Nojiko una habitante de Cocoyashi quien revela ser la hermana de Nami, quien en realidad es una pirata que esta al mando de Arlong como la cartógrafa.

Zoro también descubre que Nami pertenece a los tritones, pero se da cuenta de que parece que no esta a gusto con ellos, ya que lo ayuda a escapar, Usopp también es capturado por los tritones al intentar ayudar a la gente del pueblo, ahí descubre a Nami, quien para evitar que siga interfiriendo sus planes lo mata.

Luffy llega finalmente a la isla y se reúne con Zoro y los demás, y aunque descubre de parte Jhonny que Nami ha matado a Usopp, pero el mismo Usopp aparece ante ellos diciéndoles que todo fue un montaje para que cayera al agua y se salvara el pellejo, el grupo se encuentra con Nojiko quien les cuenta la historia de Nami y la de ella a excepción de Luffy que decide no escucharla y se duerme.

El grupo descubre parte del pasado de Nami y Nojiko, y la persona que fue como una madre para ellas, excepto Luffy quien se había marchado de ahí porque no le interesaba oirla.

Continua la historia, finalmente les cuenta el día que los tritones llegaran a la isla, se apoderaron de todo, y mataron a la madre de Nami por no poder pagar el impuesto que impusieron por las vidas de cada persona de la isla, ella solo pago la cuota de Nami y Nojiko, y como Nami fue obligada a unirseles por saber dibujar mapas.

Termina la historia, ahora comprenden la situación, Nami acepto a unirse a los tritones pero solo para cumplir un trato que Arlong le propuso, pagarle 100 millones a cambio de liberar su aldea, pero cuando solo restaba poco para tener la cuota, el Capitán de la Marina Nezumi, un oficial corrupto a las órdenes de Arlong, le arrebata al dinero, el pueblo cansado de los abusos de Arlong deciden alzarse en armas para expulsarlo, o morir en el intento. Engañada e impotente, una Nami sollozante le pide a Luffy su ayuda, quien enojado por la forma en que la trataron, él y los demás deciden ir a pelear contra el tritón para liberar su pueblo.

La batalla entre los tritones y los piratas de Luffy comienza, pero en una jugada sucia Arlong arroja a Luffy al océano, con el tiempo en su contra Zoro se enfrenta al espadachín de la banda, el triton pulpo Hatchan, quien al poseer seis brazos puede utilizar el Rokutōryū, eso incluido al mal estado en que se encuentra hacen el combate difícil.

Hatchan es finalmente derrotado por un exhausto Zoro, mientras que Sanji se arroja al agua para ayudar a Luffy siendo perseguido por el tercer miembro más fuerte de los tritones, Kuroobi el tritón karateka, Sanji no tiene otra que enfrentarle en su propia cancha, mientras que Ussop logra sacar del lugar al tirador de la banda, el triton Chew, aunque ser un cobarde total le complica las cosas.

Después de recibir varios golpes, Sanji logra sacar al triton del agua y vencerlo con un juego de poderosas patadas, mientras que Usopp viendo que no podía huir siempre de su enemigo lo enfrenta y lo derrota con una ingeniosa táctica, Nami llega a la escena y ve que él único triton que queda es Arlong.

Con la ayuda de Nojiko y Sanji, Luffy consigue salir del agua y comienza su combate contra Arlong quien se encontraba a punto de matar con Zoro, al principio consigue darle unos golpes, pero es acorralado por el increíble poder del tritón.

Continua la pelea entre Luffy y Arlong, despues el combate se traslada al interior del cuartel de Arlong hasta llegar a un cuarto especial, la habitación de trabajo de Nami.

Arlong revela las intenciones de usar a Nami para su propósito, ante un furioso Luffy que siente como Arlong la ha maltratado a lo largo de los años, consigue la fuerza para vencerle y destruir Arlong Park en el proceso, su grito furioso se escucha por todo el lugar, mientras que Nami sorprendida solo puede derramar unas lágrimas de agradecimiento.

Hay fiesta en villa Cocoyashi y en toda la isla luego de la caída de Arlong Park y de su imperio. Mientras sus amigos celebran con el pueblo, Nami reflexiona todo lo sucedido ante la tumba de Bellemere, al día siguiente ella zarpa con sus nuevos compañeros, despidiéndose de todos.

Los hechos ocurridos en Arlong Park le han valido a Luffy su primera recompensa, 30 millones, en casa y todas partes, muchos quedan sorprendidos, otros intrigados y muchos más admirados, mientras el grupo zarpa hacia Grand Line.

Buggy despues de ser derrotado por Luffy, comienza una travesía para recuperar su cuerpo, donde se enfrenta a una enorme ave, conoce a Gaimon y luego se encuentra con Alvida.

Buggy finalmente llegan a la isla donde estaba su tripulación, esta se encuentra atrapada por una tribu de caníbales, despues de liberarlos zarpan en busca de la persona que los fastidio a todos. Mientras tanto Nami convence a todos de realizar una parada en Loguetown.

Loguetown, la ciudad donde comenzó la Era de los Piratas y donde acabó la vida de Gold Roger. La banda decide abastecerse por última vez de suministros antes de irrumpir en la Grand Line y esta ciudad es una parada obligatoria, ya que es la última ciudad antes de llegar a la Grand Line. Antaño esta ciudad estaba llena de piratas, ahora, un solo hombre se encarga de mantenerla limpia, el capitán de la Marina llamado Smoker.

Luffy tiene un encuentro con el Capitán Smoker mientras observa la torre donde fue ejecutado el mismísimo Gold Roger. Zoro por su parte decide reemplazar las katanas que perdió durante su pelea contra Mihawk, y acaba conociendo a la Sargento Mayor Tashigi, que tiene un casual parecido con alguien de su pasado.

La tripulación sigue abasteciendose en Loguetown de víveres y cosas útiles para entrar en la Grand Line. Usopp mientras busca objetos modernos conoce a una niña que resulta ser la hija de un peligroso cazarecompensas, Daddy ‘The Father’. Después de conocerse, Daddy descubre que Usopp es hijo de Yasopp, el único hombre que ha podido vencerle, y decide retarle a un duelo.

La banda sigue dispersa por Loguetown y Sanji acabará metido en un concurso de cocina donde el premio es un raro ejemplar de pez elefante. Sanji participará con tal de conseguir el premio, pero deberá enfrentarse a una bella cocinera llamada Carmen.

Luffy llega finalmente a la plataforma donde fue ejecutado Gold Roger. Una vez ha conseguido subir hasta arriba, Buggy aparece y consigue atraparlo con la intención de ejecutarlo allí arriba. El resto de la banda se enfrentará a la Marina y a los piratas de Alvida que se encuentran en la plaza para impedirlo.

Milagrosamente salvado en el último momento por un rayo que cae sobre Buggy, Luffy y su banda aprovechan la confusión del momento para salir corriendo hacía el Going Merry y huir de Loguetown. En su huida Zoro tendrá que enfrentarse a la Sargento Tashigi y Luffy al capitán Smoker.

En una noche tormentosa una chica llamada Apis escapa de la Marina y llega hasta el barco de Luffy y su banda, pero cuando la chica se da cuenta que está en un barco pirata, empieza a esconder los motivos por los que la Marina va detrás de ella.

El Calm Belt se revela como un lugar sin vientos ni corrientes y el hogar de múltiples Reyes del Mar. Apis prepara un plan con la ayuda de Luffy para salir de esta peligrosa zona y llegar hasta Isla Gunkan. Es allí donde Luffy y Nami descubrirán el motivo por el que Apis es buscada por la Marina.

Ahora que la tripulación está al tanto de los motivos por los que Apis es perseguida, escaparán a toda prisa de la isla para que Ryuuji pueda ser salvado, pero se encontrarán a un enemigo que querrá al dragón para él. Zoro y Ussop prepararán el barco mientras Nami y Apis llevan a Ryuuji en una carreta y Sanji y Luffy entretienen a la Marina.

Después de llegar a lo que parece ser Lost Island, la tripulación encuentra un antiguo templo con viejas pinturas que podrían indicar donde se encuentra realmente Lost Island.

Zoro se queda atrás luchando contra Erik mientras el resto de la banda corre hacía el barco con el objetivo de llegar a Lost Island, pero solo encuentran más problemas. La flota del almirante Nelson les está esperando.

Luffy, Sanji y Zoro inician un feroz ataque contra la flota del almirante Nelson que los tiene rodeados. Ryuuji intenta ayudarles llamando a sus amigos, pero los cañones enemigos le hieren gravemente.

Ryuuji con su último grito, consigue llamar a sus camaradas y que ayuden a Luffy en la lucha contra el almirante Nelson. De repente el secreto de Lost Island se desvela delante de la tripulación y Apis por su parte se da cuenta de que Ryuuji solo queria llegar a la isla para morir en ella.

Despues de dejar atrás la Isla Gunkan, el Going Merry va directo hacía la Grand Line. Pero antes la tripulación de Sombrero de Paja deberá cruzar la Red Line por el único punto posible, la Montaña Inversa, y utilizando la peligrosa corriente ascendente.