Le niveau 6 d'Impel Down est un niveau secret de la prison sous-marine renfermant les plus dangereux criminels de l'histoire, des criminels dont les primes excèdent largement les 100 Millions de Berrys.

Les prisonniers libérés du niveau 2 par Baggy sèment la panique au sein de la si réputée prison d'Impel Down. Du côté de Marine Ford, Sengoku, l'Amiral en Chef de la Marine est furieux contre Garp qui rigole des évènements que Luffy provoquent.

Alors que Luffy continue son avancée vers le niveau 4, Mr. 3 et Baggy délivrent Bonclay de sa cellule. Lorsque ce dernier apprend la présence de Luffy au niveau 3, il part immédiatement à sa recherche. Dehors, les Marines chargés d'escorter Ace souhaitent entrer dans Impel Down pour aider à la capture de Luffy.

Après avoir reçu la visite de Hancock et de Momonga, Magellan est informé de la panique qui règne à Impel Down et reprend les commandes de ses troupes. Sadi, elle, informe le directeur qu'elle vient d'envoyer Minotaurus, un des Gardiens Démoniaques, stopper Luffy et Bonclay au niveau 3.

Luffy, Mr. 3, Mr. 2 et Baggy continuent leur chute vers le niveau 4 : l'Enfer des Flammes.

Les nombreux avertissements de Mr. 2 sur la force du Directeur d'Impel Down résonnent en vain au niveau 4 : le combat est inévitable entre Luffy et le détenteur du fruit du Venin, Magellan.

Après avoir infligé un puissant coup à Magellan, Luffy tombe, les mains victimes de la toxine du poison, hurlant de douleur. Pendant ce temps, Mr. 2, toujours en fuite, continue de courir, frappant les gardes sur son chemin. Bien que les larmes l'assaillent, il se rassure en se répétant qu'il ne pouvait faire autrement...

Magellan ordonne l’emprisonnement de Luffy dans une cellule du niveau 5 : l'enfer des glaces. Au niveau 5, les prisonniers souffrent tellement du froid que leur corps gèle…

Alors que Mr. 2 délivre Luffy de sa cellule, Mr. 3 et Baggy, eux, font face aux Loups Blancs du niveau 5. De leur côté, les grandes figures du personnel d'Impel Down ne sont qu'a moitié rassuré.

Mr. 2 en apprend plus sur le niveau 5.5 et fait enfin la connaissance d'Emporio Ivankov. Ce dernier lui fait d'ailleurs très vite une démonstration des pouvoirs du Horu Horu no Mi en changeant un homme en femme.

Alors que Luffy poursuit son traitement, Mr. 2 et Ivankov retournent dans la salle principale pour discuter et manger. Ivankov explique alors à Bonclay qu'il tient ses pouvoirs du Horu Horu no Mi, le fruit des Hormones.

Alors que Luffy se réveil guéri à la surprise de tous, Magellan se dirige au niveau 6 par l’ascenseur. Domino, qui l'accompagne lui rappelle leur mission : conduire le prisonnier Portgas D. Ace devant les portes d'Impel Down à 9h00 précise.

Luffy, guéri et en pleine forme, se dirige avec l'aide d'Ivankov et d'Inazuma vers le niveau 6 où est emprisonné son frère, Ace. Cependant, Magellan, déjà présent devant sa cellule, fait sortir Ace et l'emmène.

Luffy étant coincé au niveau 6, décide, à contrecœur, de libérer Crocodile de sa cellule. Afin d'éviter une trahison, Ivankov menace de dévoiler un secret gênant à son sujet...

Toutes les troupes d'Impel Down se rendent au niveau 4 pour stopper le groupe de Luffy qui continuent de se battre. Pendant ce temps, Baggy et Mr. 3 atteignent le niveau 2 et libèrent des prisonniers afin de couvrir leur fuite. C'est le chaos à Impel Down !

Luffy, Jinbe, Crocodile, Mr. 2, Mr. 1, Ivankov, Inazuma et les New Kamas continuent de se battre au niveau 4. Pendant se temps, Barbe Noire, s'étant introduit lui aussi dans Impel Down, rencontre Shiliew au niveau 1.

Devant la porte du Niveau 3, Luffy se bat contre Hannyabal qui n'abdique pas malgré la supériorité de Luffy. Cependant, le sous-directeur d'Impel Down, se fit piétiner par Marshall D. Teach, qui arrive en rigolant, sans avoir le temps de faire quoi que ce soit.

Après s'être reçu un "Jet Pistol" de plein fouet, Barbe Noire utilise son Yami Yami no Mi, le Fruit des Ténèbres et annule l'élasticité de Luffy. Le Grand Corsaire explique ensuite les détails de son combat contre Ace.

Alors que Magellan a réussi à rattraper le groupe de Luffy et des évadés, Ivankov décide de rester en arrière pour l'affronter et ainsi permettre à Luffy et ses alliés d'atteindre le niveau 2.

Luffy se retrouve hors de lui lorsque Magellan se vente d'avoir vaincu Emporio Ivankov et Inazuma.

Pendant que Luffy combat Magellan, Crocodile, Jinbe, Daz Bones et Baggy s'occupent de voler un bateau de la Marine pour s'échapper de la prison sous-marine.

Alors que Luffy et nos amis s'enfuient, Magellan s'apprête à partir à leur poursuite. Jinbe, lui, remercie les requins baleine et se tourne vers ses amis qui exultent : ils se sont évadés !

Au niveau 4, l'Equipage de Barbe Noire apparait guéri du poison mortel de Magellan. C'est en vérité Shiliew de la Pluie, l'ancien gardien-chef d'Impel Down qui leur a administré l'antidote.

Des nouvelles de l'équipage ! Nami est encore sur Weatheria avec Haredas. On apprend que l'île céleste, se déplace grâce au vent tout droit en direction de l'Archipel des Sabaody.

Des nouvelles de l'équipage ! Sanji est poursuivi par les Okamas sur l'île de Kedétrav . Afin de pouvoir partir de l'île, le cuisinier accepte d'affronter Caroline, l'okama le plus fort de royaume.

Des nouvelles de l'équipage ! Robin, capturé par la garde de Tequila Wolf, a été envoyé en prison. Cependant, grâce à Soran et à l'armée des révolutionnaires Robin et les autres ont pu être libérés.

Des nouvelles de l'équipage ! Zoro cherche un moyen de s'échapper de l'île sur laquelle il se trouve : l'île de Kuraigana. Perona, envoyée elle aussi par Kuma, accepte de l'aider. Soudain, notre sabreur se fait brusquement attaqué...