밀짚모자 해적단은 세로운 배, 서니호의 이런 저런 설비를 만끽하며 즐거운 시간을 보낸다. 그러다 조로가 난파당한 배를 발견한다. 그리고 그 배에 타고 있던 사람들한테서 그들의 딱한 사정을 듣게 된다. 그 중 한 소년이 쵸파에게 자신들의 배로 가서 한 사람을 더 치료해줄 수 없냐는 말을 한다. 그 소년을 따라간 쵸파는 심한 상처를 입고 사경을 헤매는 그 배의 선장을 치료해주는데…

의문의 난파선 선원들과 대치하는 와중에 밀짚모자 해적단원들은 앗치노 패밀리 중 한 사람, 사르코가 파놓은 함정에 빠지고 만다. 사르코는 자신이 가지고 있는 기술을 총동원해 사실은 해적의 배인 자신의 배 한 척을, 해군의 배 여러 척으로 보이게 하는데... 그때 프랑키가 만들어 놓은 서니호의 솔저 도크 시스템이 작동하기 시작한다.

퍼즐이 이끄는 피닉스 해적단은 신세계에 갔다 강적을 만나 패하고 돌아오던 중, 설상가상으로 현상금 사냥꾼인 앗치노 패밀리를 만나 해적기를 빼앗기고 만다. 피닉스 해적단은 선장인 퍼즐이 의식을 되찾으면 반드시 해적단도 부활할 것이라고 믿고 있었지만 정작 의식을 되찾은 퍼즐은 해적으로서 다시 일어서는 것이 아니라 앞으로도 현상금 사냥꾼의 부하로서 살아가자고 하는데...

얼음바닷길을 쿠도 버스트를 이용해 빠져나온 서니호였지만 앗치노 패밀리의 릴이 다루는 솔개 물고기에게 밀짚모자 해적단의 해적기를 빼앗기고 만다. 상디를 비롯한 나미와 우솝은 뱃머리를 돌려 다시금 어렵게 빠져나온 얼음바닷길로 향하는데…

여자에게 유달리 약한 상디는 아르벨에게 어떤 공격도 하지 못하고, 로빈 또한 겉보기엔 그저 어린 여자애인 릴을 공격하는 건 꿈도 꾸지 못한다. 프랑키와 나미는 홋케라를 상대로 승리를 거뒀다고 생각했지만 그건 사실 홋케라가 꾸민 흉계였다. 그 시각, 브린드와 싸우던 루피는 바다에 빠지고 만다. 수영을 못하는 루피는 과연 살아날 수 있을까?

릴은 로빈이 집에 가겠다고 하자 기뻐하면서 기꺼이 로빈을 자신의 집으로 초대한다. 우솝은 결국 아르벨과 사르코에게 잡히고 만다. 그 시각, 러블리 랜드에 있던 브린드의 형, 칸파치노는 자신의 쌍둥이 동생인 브린드가 피닉스 해적단에 잡혔단 이야기를 듣고 피닉스 해적단의 배가 있는 곳으로 향하는데…

조로는 돈 앗치노를 향해 공격을 퍼붓고 이에 돈의 컬렉션인 해적기가 흠집이 날 뻔하자 돈 앗치노는 머리끝까지 화가 난다. 아빠가 주체할 수 없을 정도로 화가 났단 소식을 듣고 돈 앗치노에게 달려간 아르벨, 사르코 그리고 홋케라였지만 자신들만으로는 아빠를 달랠 수 없자 루피와 다투는 중이었던 장남과 차남, 칸파치노와 브린드에게 도움을 청한다.

루피가 러블리 랜드에 도착했다는 사실을 알자 나미를 비롯한 밀짚모자 해적단은 초조함을 감추지 못한다. 루피가 자신들보다 먼저 깃발을 찾게 해선 안 된다는 생각에 그들은 깃발이 있는 곳을 안다는 조로의 안내를 받으며 러블리 랜드 이곳저곳을 돌아다녀 보지만 결국 깃발이 있는 돈 앗치노의 방은 찾지 못한다. 그러던 중, 로빈이 나타나 자신이 해적기를 되찾아 오겠다고 하는데...

자신의 손에 닿는 건 무조건 녹여버리는 능력을 갖게 된 돈 앗치노와 맞서 싸우는 루피는 돈의 능력 때문에 자신의 펀치 기술은 날리지도 못하고 고전을 면치 못한다. 한편, 돈의 장남인 칸파치노를 쓰러뜨린 피닉스 해적단 선장인 퍼즐은 지로, 그리고 쵸파와 함께 자신들의 해적기를 되찾기 위해 러블리 랜드 안으로 들어간다.

밀짚모자 해적단의 해적기는 러블리 랜드 밖으로 날아갔다. 자신들의 해적기를 잃어버렸단 생각에 어쩔 줄 몰라 하던 밀짚모자 해적단에게 도움의 손길을 내민 건 다름 아닌 돈 앗치노 패밀리의 막내, 릴이었다. 릴은 자신의 솔개 물고기를 이용해 밀짚모자 해적단의 해적기를 찾아 쵸파에게 돌려주는데…

악의 화신, 우소다바다 박사는 세계 정복을 꿈꾸는 악당이다. 부하로 상디롭스와 조로길러가 있지만 우소다바다를 우습게 여긴다. 이에 분개한 우소다바다는 방송국에 쳐들어가 방송국을 점거하고 인재를 모집하려 한다. 한편, 정의의 사도 쵸파맨과 조수인 나미피아는 생계를 고민하고 있었다. 그러다 우연히 우소다바다 박사가 방송국을 점거했단 뉴스를 보게 되는데... 과연 쵸파맨은 우소다바다 박사를 물리치고 위기에 빠진 방송국을 구할 수 있을까?