Han pasado unos días desde la batalla y mientras la banda disfruta de un merecido descanso en Water 7, un barco de La Marina llega a la ciudad y su tripulación, comandada por el vicealmirante Garp, se dirige hacia donde la banda del Sombrero de Paja descansa. Por otra parte, Usopp busca la manera de regresar a la banda.

El vicealmirante Garp ha resultado ser el abuelo de Luffy y trae consigo a dos viejos amigos de éste que ahora son parte de La Marina. También revela la identidad del padre de Luffy, Monkey D. Dragon , líder del ejército revolucionario y el criminal más buscado del mundo.

Luffy tiene una conversación con Coby y Helmeppo, que ahora viajan a bordo del buque de Garp. Se revela la existencia del Nuevo Mundo, que es como se conoce a los mares que hay en la segunda mitad de la Grand Line. Garp, como favor especial, decide no arrestar a Luffy por esta vez y La Marina se marcha. Tras esto, se celebra una gran fiesta en la ciudad en honor a la victoria de los Sombrero de Paja en Enies Lobby.

Pese a los esfuerzos del Gobierno Mundial por evitarlo, Shanks se reune con Shirohige con la intención de pedirle que evite a toda costa un enfrentamiento entre Ace y Kurohige. Tras la fiesta en Water 7, Franky se propone construir a los Sombrero de Paja un barco con el que podrán completar su aventura y Galley-La Company se ofrece a ayudarle.

Mientras Luffy y Chopper pasean por la parte baja de la ciudad de Water 7, la más perjudicada por el Aqua Laguna, conocen a una chica que busca al yagara de su familia que desapareció durante la tormenta. Ambos deciden ayudarla a encontrarlo.

Mientras Zoro busca en la ciudad a alguien que pueda reparar su espada destrozada en la batalla de Enies Lobby, conoce a una mujer que se encarga de un horfanato ella sola y consigue que Zoro la ayude en las tareas domésticas.

Mientras Sanji hace unas compras acompañado por Chimney, conoce a un viejo cocinero que prepara unos platos magníficos. Sanji quiere saber qué ingrediente secreto usa para conseguir este sabor pero el anciano se niega a decírselo.

Usopp sigue practicando la mejor manera de volver a la banda de Luffy mientras que Franky y los capataces de la Galley-La dan los últimos retoques al nuevo barco que están construyendo. Al día siguiente la familia Franky acude al refugio donde están los Sombrero de Paja y llevan consigo las nuevas recompensas que ofrecen por la banda.

Antes de que la banda acuda a ver terminado su nuevo barco, la familia Franky pide a Luffy que se lleve a su jefe al mar por la alta recompensa que ofrecen por su cabeza y el peligro que correría si se queda en Water 7. Luffy acepta llevarse a Franky, pero éste no tiene ninguna intención de abandonar la ciudad. Los Sombrero de Paja quedan maravillados al ver su nuevo barco terminado.

Tras conseguir que Franky llegue hasta el nuevo barco de los Sombrero de Paja, éste rechaza de primeras la oferta de Luffy de unirse a la banda, pero gracias a la actuación de Nico Robin cambia de idea. Franky se despide así de su familia en Water 7 y se prepara para ver cumplir su sueño, navegar a bordo del mejor barco que haya construido jamás.

El vicealmirante Garp ha regresado a Water 7 y esta vez tiene la intención de capturar a su nieto. Mientras, la banda de Luffy espera a que Usopp se disculpe para así volverlo a aceptar en la banda, pero Garp se les echa encima y no pueden esperar más tiempo en huir de la ciudad.

En el último momento Usopp pide perdón a la banda y Luffy le acepta de nuevo en su tripulación, tras esto ponen todo su empeño en escapar de los ataques del vicealmirante Garp, que quiere hundir el nuevo barco de los Sombrero de Paja, bautizado por Iceburg como Thousand Sunny. Mientras tanto, las nuevas recompensas de la banda dan la vuelta al mundo.

Portgas D. Ace ha encontrado por fin a Kurohige en la isla Banaro y se enfrenta a él y a su banda. Kurohige revela su habilidad, con la cual es capaz de controlar la oscuridad y anular los poderes de las Frutas del Diablo. El resultado de esta batalla entre los dos piratas será de una gran transcendencia en el futuro.