Franky y Robin son llevados hacia la Torre de la Justicia, en el centro de Enies Lobby, donde está Spandam, el jefe del CP9. Sanji y Usopp se han unido al Rocket Man y conforme se van acercando a Enies Lobby preparan un plan para el asalto, pero Luffy decide empezar el asedio por su cuenta.

Luffy va primero y se enfrenta a la infantería de La Marina de camino a la Torre de la Justicia. Tras él los carpinteros de la Galley-La y la familia Franky irrumpen en Enies Lobby. Mientras, en la Torre de la Justicia se presentan tres nuevos miembros del CP9.

Los carpinteros de Galley-La y la familia Franky se enfrentan a los dos gigantes que vigilan la puerta a la entrada de la ciudad de Enies Lobby. Mientras, el CP9 al completo se reune en la Torre de la Justicia.

Nico Robin y Franky son llevados hasta Spandam. Mientras tanto, Luffy sigue avanzando y el enfrentamiento contra los gigantes que vigilan la puerta a terminado cuando el Rocket Man cae sobre el último de ellos que seguía en pie.

La banda quiere alcanzar a Luffy lo antes posible pero éste está muy por delante de ellos, acercándose ya al Palacio Judicial. Una gran batalla tiene lugar en las calles de Enies Lobby donde todos los marines y agentes del gobierno de la isla se enfrentan a los Sombrero de Paja, la Galley-La y la familia Franky.

La promesa que le hizo el CP9 a Robin de no tocar a los Sombrero de Paja a cambio de que se entregase ha sido rota. Mientras tanto, Luffy llega hasta el tejado del Palacio Judicial, enfrente de la Torre de la Justicia y un miembro del CP9 aparece delante de él.

Sogeking escucha la historia de los gigantes que protegían la puerta de Enies Lobby y la relación que tienen con los gigantes que los Sombrero de Paja se encontraron en Little Garden. Mientras, Luffy se enfrenta a Blueno en el tejado del Palacio Judicial.

Los gigantes de alían con Sogeking y ayudan al resto a llegar hasta el Palacio Judicial, donde deberán bajar el puente que conecta con la Torre de la Justicia. En ella, Spandam entrega a Kaku y Califa una Fruta del Diablo a cada uno como recompensa por sus servicios. Fuera, Luffy continua su batalla contra Blueno.

El grupo compuesto por los Sombrero de Paja, la Galley-La, la familia Franky y los gigantes llegan a las puertas del Palacio Judicial, en la plaza principal de Enies Lobby. Spandam es avisado de esto y no da crédito a lo que escucha. Luffy activa una técnica nueva llamada Gia Sekando para enfrentarse a Blueno.

Mientras dentro del Palacio Judicial se desata el caos, Luffy se enfrenta a Blueno en el tejado utilizando el Gia Sekando, una técnica que amplia sus poderes, y consigue derrotarlo.

Robin y Franky acuden a la terraza de la Torre de la Justicia. Allí ven a Luffy que quiere llegar hasta ellos para rescatarla, pero ella le pide que la deje morir y Luffy se detiene. El resto de la tripulación consigue también llegar al tejado del Palacio Judicial.

Llega el momento de retroceder 20 años en la historia y conocer a Nico Robin cuando todavía era una niña huérfana que vivía en Ohara. Allí es discriminada diariamente por la mayoría del pueblo debido a sus poderes adquiridos con la Fruta del Diablo y el abandono de su madre. Robin es amiga de los científicos y arqueólogos de la isla, que guarda la mayor biblioteca de conocimiento del mundo. Un día, Robin conoce Saul, un gigante que ha naufragado en la costa de la isla.

El Gobierno Mundial busca a Nico Olvia, la madre de Robin y sospechan que ha ido a Ohara por lo que se preparan para desembarcar en la isla para capturarla. Saul, al darse cuenta de la relación entre Nico Robin y Olvia, corre para advertir a los habitantes de Ohara de lo que prepara el Gobierno Mundial para silenciar la isla.

El Gobierno Mundial quiere destruir Ohara con todos sus habitantes ya que son los únicos capaces de leer los Poneglyph que hay distribuidos por el mundo. Spandine activa la Buster Call en Ohara y a continuación los buques de La Marina empiezan a disparar contra la isla. Olvia se encuentra con su hija y le pide a Saul que cuide de ella.

Gracias al sacrificio de Saul, Robin consigue escapar de Aokiji y huir de la isla de Ohara que ha sido completamente destruida por la Buster Call. Tras esto, Robin empieza una vida de fugitiva por el mundo ya que el gobierno a puesto un elevado precio por su cabeza. Durante este tiempo, Robin ha sido traicionada tantas veces que no confía en nadie. Ya en el presente, Luffy le declara la guerra al Gobierno Mundial y le pide a Robin que le diga que quiere vivir.

Nico Robin grita a sus compañeros que quiere vivir y la banda se prepara para el asedio a la Torre de la Justicia para rescatar a su amiga. Se muestra un flashback de Luffy de cuando era pequeño y conoció a Shanks, el pirata que le influyó para convertirse en pirata.

Zoro y Usopp recuerdan el momento en que conocieron a Luffy y acabaron uniéndose a su tripulación.

Nami recuerda su pasado y como conoció a Luffy, que terminó con la tiranía que sufría su pueblo a manos de Arlong.

Sanji y Chopper recuerdan su pasado y los motivos que les hicieron unirse a Luffy en su aventura por ser el rey de los piratas.

Resumen de las recientes acciones de Nico Robin desde que llegó a Water 7 y se encontró con el CP9.

Mientras la banda espera a que baje el puente para llegar así a la Torre de la Justicia, Franky ha sido conmovido por lo que pasado con Robin sus amigos y decide sacar los planos que tenía escondidos de Pluton para destruirlos delante de las narices de Spandam y del CP9.

Gracias a Kokoro y al Rocket Man, los Sombrero de Paja han entrado en la Torre de la Justicia y han rescatado a Franky que caía al vacío. Ahora deberán enfrentarse a todos los miembros del CP9 para conseguir la llave que abre las esposas de Robin, que mientras es llevada por Rucchi y Spandam hacia la Puerta de la Justicia.

Mientras Luffy busca a Rucchi por la Torre de la Justicia, Zoro empieza su combate contra Kaku en la habitación de éste. Sogeking intenta robarle la llave a Jabura mientras duerme, pero no lo consigue. Sanji llega hasta la habitación de Califa.

El combate entre Zoro y Kaku, que posee la habilidad Zoan de la jirafa, se traslada al piso de abajo donde están Jabura y Sogeking, que tras un error acaba esposado a Zoro. Sanji, debido a su caballerosidad con las mujeres, es incapaz de luchar contra Califa.

Nami decide ocupar el lugar de Sanji y enfrentarse ella a Califa, dejando que Chopper se encargue de Kumadori. Mientras tanto, Franky se está enfrentando a Fukurou en su intento de llegar hasta la cocina para recargarse de cola y aumentar así su fuerza. Luffy emplea una misteriosa técnica para destruir una puerta por la que se han llevado a Robin.

Zoro se ve obligado a luchar contra Jabura y Kaku utilizando a Sogeking como si fuera una espada. Mientras tanto, Chopper ayuda a Franky a conseguir cola de una nevera y tras recargarse, se enfrenta de nuevo a Fukurou derrotándolo.

Chopper se siente incapaz de luchar contra Kumadori ya que es mucho más fuerte que él y está a punto de matarlo. Desoyendo la advertencia que una vez le hizo la doctora Kureha, Chopper decide comerse una tercera Rumble Ball para liberar todo su poder.

Durante el periodo Edo, el detective Luffy debe enfrentarse al jefe Buggy, de la mafia local, para rescatar a una niña.

El mafioso Buggy quiere hacerse con todos lo pasteles que se regalarán al pueblo en una ceremonia y secuestra a la hija del rey. El detective Luffy tendrá que desbaratar sus planes.

Chopper se ha transformado en un gigantesco monstruo y derrota en un momento a Kumadori. Unos pisos más arriba, Nami se enfrenta a Califa y a su habilidad de crear burbujas de jabón. Lejos de allí, Spandam ordena a Rucchi que se encargue de Luffy mientras él lleva a Nico Robin a la Puerta de la Justicia.

Empieza el combate entre Luffy y Rucchi mientras Spandam arrastra a Robin hacia la Puerta de la Justicia. Pero de camino a allí, Spandam activa por error la Buster Call provocando el desconcierto en Enies Lobby.

La Marina empieza la evacuación de Enies Lobby dejando atrás a sus prisioneros, la familia Franky y los carpinteros de la Galley-La. Mientras tanto Chopper, transformado aún en monstruo, llega hasta la habitación donde Nami lucha contra Califa, pero está fuera de sí y no distingue entre amigo o enemigo.

Nami utiliza todo el poder de su Clima Tact, mejorado con diales de Skypiea, para derrotar a Califa. Franky se ve obligado a lanzar al monstruoso Chopper al mar para que regrese a su forma normal y finalmente, las esposas que unían a Zoro y Sogeking son abiertas.

Sanji aparece para salvar a Nami y Sogeking del ataque de Jabura, transformado con la habilidad del lobo. Mientras, Zoro vuelve a luchar contra Kaku en una árdua batalla. Franky, que ha salvado a Chopper de ahogarse, se dirige ahora corriendo hacia donde está Robin.

Sanji parece estar en desventaja contra la fuerza de Jabura, pero saca todo su poder con el Diable Jembe, una técnica que aumenta el poder destructivo de sus patadas.

La dura batalla que enfrenta a Zoro y Kaku está destrozando la Torre de la Justicia. Franky a conseguido alcanzar a Luffy que se está enfrentando a Rucchi en una sala sumergida.

Zoro desata todo el poder de su espíritu combativo con una técnica nueva con la que derrota a Kaku por completo. Mientras tanto, Luffy ha activado el Gia Sekando para así darle la oportunidad a Franky de seguir avanzando y llegar hasta Nico Robin. Rucchi activa entonces su transformación para luchar contra Luffy.

Cuando Spandam arrastra a Robin sobre el Puente de la Vacilación, en el último tramo antes de la Puerta de la Justicia, un disparo lo derrumba. Sogeking, desde lo alto de la Torre de la Justicia, intenta impedir que Spandam se lleve a Robin. Franky aparece entonces, y gracias a las llaves que ha lanzado Sogeking, libera a Robin.

La Buster Call ha empezado a caer sobre Enies Lobby. Franky y Robin acaban con Spandam y todos los soldados de La Marina que estaban sobre el Puente de la Vacilación. Luffy continua su batalla contra Rucchi. El resto de la banda corre hacia el Puente de la Vacilación para salvarse de la Buster Call y encontrar la forma de huir de Enies Lobby.

En la época Edo, se celebra un festival a los pies de un cerezo milenario. Pero este desaparece una noche y culpan al detective Luffy, cuando en realidad ha sido Foxy quién lo ha robado.

Los buques de La Marina han llegado a los alrededores de Enies Lobby y empiezan a bombardear la isla. Rucchi inunda entonces el túnel por el que deben pasar Zoro, Nami, Sogeking y Sanji. Luffy, que ha visto como el Gia Sekando no ha sido suficiente para derrotar a Rucchi, muestra otra técnica más destructiva aún, el Gia Sado.

Rob Rucchi ha recibido de lleno el Gia Sado de Luffy y cae en un buque de La Marina, donde continua la batalla entre ellos. El vicealmirante Doberman cuenta la historia de como Rucchi se convirtió en el brazo ejecutor de la justicia del Gobierno Mundial.

Sobre el Puente de la Vacilación continúa la lucha de Franky y Robin contra La Marina, mientras que el resto de la banda sigue corriendo por el túnel para llegar allí sin saber que éste se está inundando. La Buster Call continúa destrozando Enies Lobby y tanto la familia Franky como los carpinteros de la Galley-La están en apuros en la ciudad.

La banda se salva de morir ahogada gracias a la actuación de Kokoro que resulta ser una sirena de la isla Gyojin. Franky, que ve como su familia ha sido aniquilada por la Buster Call en Enies Lobby, apremia a Luffy para que termine su lucha y se una a ellos lo antes posible, para así escapar en un barco de La Marina que han robado.

Desde los buques de La Marina que rodean el Puente de la Vacilación llegan marines cada vez más fuertes que ponen en apuros a la banda sobre el puente mientras esperan a su capitán. Luffy, que ha activado de nuevo el Gia Sekando, se promete derrotar a Rucchi antes de salir de este estado.

Luffy cae víctima del ataque más poderoso de Rucchi, el Rokuougan, tras lo cual Sogeking se quita la máscara y reta a Rucchi desde el Puente de la Vacilación. Luffy, al ver de nuevo a Usopp que le pide que derrote a Rucchi cueste lo que cueste, consigue fuerzas para volver a levantarse y lanzar un último ataque contra su rival.

Tras emplear toda su fuerza en derrotar a Rob Rucchi, Luffy queda tendido en el suelo sin poder moverse. La Marina, al saber de la derrota de Rucchi, decide destruir el Puente de la Vacilación para así acabar con la banda de Sombrero de Paja, pero alguien inesperado llega desde el mar para darles una última oportunidad de sobrevivir.

El Going Merry ha aparecido bajo el Puente de la Vacilación justo a tiempo de salvar a la banda. Gracias a Sanji, que ha cerrado la Puerta de la Justicia, La Marina es incapaz de perseguir a los Sombrero de Paja y consiguen huir de allí. Por otra parte, la familia Franky y la Galley-La también están a salvo en el Umi Ressha y se dirigen a Water 7.

El Going Merry exhala su último aliento. Tras salvar a los Sombrero de Paja la quilla del barco se parte y la tripulación, sobre un barco de Galley-La Company, le otorga un emocionante funeral al que ha sido su barco desde el inicio de su viaje en el East Blue.