Alors qu'elle se promène en soirée, Yuuhi est sauvée de deux hommes qui tentent de la draguer par Jun'ichi, ne le connaissant que sous le nom de "Geno Killer". Le lendemain à l'école, lorsque Yuuhi est transférée dans la classe de Jun'ichi, les deux sont surpris de se retrouver si rapidement. Au cours d'une discussion avec Ayanokouji, elle invite Jun'ichi, choquant la classe. Cependant, il s'avère qu'il ne s'agit que d'une invitation pour prendre une tasse de thé, un moyen d'exprimer sa gratitude. Elle découvre qu'il était autrefois un délinquant. Le lendemain, Yuuhi est pressée de détails sur sa première rencontre avec Jun'ichi. Dans sa confusion pour clarifier les choses en classe, Jun'ichi l'embrasse, provoquant une bagarre pour avoir pris son premier baiser. Ce soir-là, Yuuhi se présente à la résidence Nagase, déclarant qu'elle emménage en tant que fiancée de Junichi, au grand étonnement de celui-ci et de Minato.

Une scène du passé de Yuuhi donne des détails sur le mariage arrangé entre Jun'ichi et Yuuhi et sur son emménagement avec lui. Yuuhi et Jun'ichi ont du mal à s'adapter à leur nouvelle vie commune, et Yuuhi passe sa première nuit sur le canapé. Le lendemain, après l'école, Yuuhi fait les courses avec Minato pour le dîner. Yuuhi est émerveillée par le supermarché et par l'habileté de Minato pour les courses. Ce soir-là, la résidence Nagase perd de l'électricité et Yuuhi trébuche dans le noir, tombant sur Jun'ichi, créant une situation très gênante. Minato réinitialise les disjoncteurs, rétablissant le courant, mais Yuuhi blâme Jun'ichi et le met en prise de tête, créant une autre situation gênante. Yuuhi finit par dormir dans la chambre de Minato, et les deux filles parviennent à discuter et à devenir de meilleures amies.

Le professeur de Jun'ichi, Seijirou Sugishita, disparaît dans une partie abandonnée de l'école. La présidente du conseil des élèves, Mitsuki Siina, enrôle Jun'ichi et ses amis pour le rechercher dans le bâtiment abandonné. En cherchant, Jun'ichi et Yuuhi tombent dans un piège et se retrouvent dans un trou. Les deux sont obligés de travailler ensemble pour essayer de s'échapper, mais n'y parviennent pas. Dans le même trou, M. Sugishita se réveille sous une couverture, et le trio est retrouvé peu après par Minato.

Karen Ayanokouji invite sa classe à une "petite" fête à la maison. Au début, il n'est pas intéressé, mais Minato, reçoit aussi une invitation, l'entraîne. À leur arrivée, Jun'ichi, Yuuhi et les autres découvrent que la fête se déroule sur un navire de croisière. Voyant à quel point ils sont mal habillé, Karen leur prête des vêtements , et Minato fait une forte impression sur Jun'ichi lorsqu'il la voit avec sa robe. Plus tard, les filles découvrent que la préparation du repas est en retard car les cuisiniers ont le mal de mer. Cela pousse Minato et les filles à agir pour sauver la fête. Les filles terminent les préparatifs, et Minato fait forte impression en découpant un thon. Karen fait aussi forte impression en luttant contre une pieuvre géante. Cela effraie Yuuhi, qui court sur le pont et active les feux d'artifice, qui provoquent un incendie dans la salle de fête. Tout le monde s'échappe sain et sauf, sauf Minato et Yuuhi, aussi Jun'ichi y retourne pour les sauver.

Jun'ichi demande à Minato de voir un film de monstres avec lui, ce qui met Yuuhi en colère que Jun'ichi n'ait jamais pensé à l'inviter. Juste avant que le trio ne parte, Minato simule un appel téléphonique et invente un mensonge pour partir forçant Jun'ichi et Yuuhi à y aller seul. Après le film, Yuuhi heurte un homme, renversant sa nourriture sur lui. Jun'ichi vient rapidement à la rescousse de Yuuhi et la sauve. Jun'ichi et Yuuhi poursuivent leur rendez-vous, mais sont surpris par Mitsuki dans le parc, et sont forcés de partir rapidement pour éviter ses questions. Sur le chemin du retour, le chapeau de Yuuhi est emporté par le vent sur un rocher au bord de la rivière. Jun'ichi va récupérer son chapeau mais tombe accidentellement dedans. Yuuhi les ramène chez eux et cherche frénétiquement des médicaments et des couvertures dans la maison. Minato rentre et guérit Jun'ichi avec des ramen instantanés. Le lendemain, tout le monde à l'école parle du rendez-vous .

Karen invite Jun'ichi et ses amis d'école dans un hôtel de montagne pour se racheter des événements de la fête. Là-bas, tout le monde continue de traîner et taquine Jun'ichi qui n'est pas impressionné. Karen prend cela comme signe que Jun'ichi n'est pas satisfait du luxe de l'hôtel, alors elle emmène le groupe faire une longue randonnée jusqu'à la source d'eau chaude secrète de la famille Ayanokouji. Là, ils découvrent que la source d'eau chaude secrète est mixte, ce qui pose problème. Minato part à la recherche de la source du bruit fait par uen bête. Inquiet pour sa sœur, Jun'ichi la suit peu après avec le reste du groupe, pour trouver Minato se baignant dans la source chaude avec un ours et son ourson. L'ours et l'ourson partent, et le groupe entre pour se baigner, les garçons d'un côté, les filles de l'autre, et Jun'ichi essaie de contrôler son envie de ne pas regarder les filles. Jun'ichi cède finalement, mais découvre que les filles sont déjà parties.

C'est le Festival Culturel de l'école et Yuuhi, Karen, Fuyuhiko et Tsukasa (avec le reste de leurs camarades de classe) tiennent un café Yakisoba. Cependant, ils font face à une forte concurrence du stand Yakisoba tenu par Minato et le club de tennis. Pendant ce temps, Jun'ichi est kidnappé par Mitsuki, Nagomi et M. Sugishita pour un entraînement secret en vue d'une mission dangereuse. Au café Yakisoba, les filles finissent par porter leur maillot de bain scolaire pour attirer les clients et finissent par triompher du stand Yakisoba du club de tennis. À la fin du festival, tout le monde est appelé sur le terrain de l'école pour assister à l'épique bataille de Jun'ichi dans son "Big Genokiller" contre une pieuvre robotique.

Tsukasa organise la rencontre sportive de l'école car Mitsuki est malade. Après l'école, Tsukasa montre à Jun'ichi et Yuuhi une photo embarrassante d'eux deux du festival culturel qu'elle compte soumettre à un concours de médias. Cela pousse Jun'ichi à évoquer des choses embarrassantes du passé de Tsukasa pour mettre fin à ses taquineries. Cela rappelle à Tsukasa son rêve d'enfance de devenir doubleuse. Le lendemain, les élèves reçoivent une tâche d'investigation sur leur carrière et Tsukasa entreprend de réaliser son rêve en postulant et en se préparant à une audition. Malheureusement, le jour de l'audition, Tsukasa est très nerveuse et perd sa voix pendant l'audition. Plus tard cependant, après une discussion avec Jun'ichi, Tsukasa décide de renouveler son ambition de devenir doubleuse.

La photo de Tsukasa de Jun'ichi et Yuuhi du Festival Culturel arrive en première place. Minato persuade Yuuhi de l'aider pour la fête surprise d'anniversaire de Jun'ichi en lui achetant un cadeau, mais Yuuhi a du mal à choisir un cadeau. Elle finit par se faufiler dans la chambre de Jun'ichi pour trouver ce qu'il pourrait aimer et découvre sa cachette de magazines pour adultes. En parcourant les magazines, Yuuhi est surprise par Minato et avoue avoir du mal à trouver un cadeau pour Jun'ichi. Minato propose à Yuuhi de faire un gâteau à la place, en guise de cadeau. Le lendemain, Jun'ichi reçoit de nombreux cadeaux d'anniversaire de la part d'amis et de la famille. Après la fête, Jun'ichi trouve le gâteau que Yuuhi a préparé, et tout le monde en prend une part. Le gâteau n'est pas très réussi, mais Jun'ichi dit à Yuuhi qu'il est délicieux parce qu'elle l'a fait pour lui. Minato commence à se sentir jalouse.

Yuuhi commence à comprendre ses sentiments pour Jun'ichi. En conséquence, elle simule d'être malade, et Jun'ichi reste à la maison pour s'occuper d'elle. Yuuhi exige un nouveau baiser, et les deux confessent enfin leurs sentiments. À l'école, les filles encouragent Yuuhi à prendre l'initiative pour faire progresser sa relation avec Jun'ichi, et Karen annonce ses intentions envers Jun'ichi. Le lendemain, Fuyuhiko confronte Jun'ichi à propos de ses sentiments pour sa sœur et lui conseille de prendre une décision. Sur la suggestion de Nagomi, Yuuhi se rend dans la chambre de Jun'ichi au milieu de la nuit habillée en servante, et malgré quelques moments gênants, les deux parviennent à se rapprocher. Le soir suivant, Yuuhi rend visite à sa famille, laissant Jun'ichi et Minato seuls. Minato en profite pour exprimer ses sentiments pour son frère, et Jun'ichi n'est toujours pas sûr de ce qu'il ressent pour sa sœur.

Yuuhi rencontre son père et rejette son engagement avec Jun'ichi, disant qu'elle préfère décider par elle-même sans pressions externes. À son retour, Yuuhi ressent une étrangeté qu'elle ne peut pas expliquer dans la maison Nagase, mais ni Minato ni Jun'ichi ne sont prêts à admettre quoi que ce soit. Cela crée une rupture entre Yuuhi et Jun'ichi, que tout le monde à l'école remarque. Interrogée sur la prétendue rupture entre les deux, Yuuhi ment pour dissimuler la véritable nature de la situation. Après l'école, Jun'ichi est emmené pour rencontrer ses parents, qui sont soudainement revenus au pays, laissant Yuuhi et Minato seuls à la maison pour la soirée. Après le dîner, Yuuhi révèle à Minato son intention de quitter la maison Nagase, l'annulation de l'engagement et sa douleur d'avoir été trompée. Minato avoue enfin son amour pour Jun'ichi et sa peine concernant la situation, et Yuuhi la prend dans ses bras.

Après le retour de Jun'ichi chez lui, Yuuhi est tellement furieuse contre Jun'ichi de lui avoir menti qu'elle décide de rompre avec lui et de quitter la maison. Le lendemain, Minato a également quitté la maison afin que Jun'ichi puisse prendre une décision et choisir entre elle et Yuuhi. Lorsque Jun'ichi rentre chez lui après l'école, il réfléchi au moment où Minato était revenue de son entraînement et avait décidé de s'occuper de lui quelques années plus tôt. Soudain, M. Sugishita apparait pour dire à Jun'ichi de devenir un homme et d'être fidèle à lui-même, et il part se promener. Yuuhi a elle décidé de rester chez Karen et Minato est restée avec Nagomi. Lorsque Jun'ichi rentre chez lui, il se sent seul et il réfléchi à son passé ainsi qu'à la fille qu'il aime le plus, avec l'aide d'un Geno-killer imaginaire, son moi passé avant l'arrivée de Minato. Il parvient à fusionner avec son alter ego, et Jun'ichi confesse son amour à Minato.

With the summer crisp smell in the air, Jun'ichi and the group head to one of Ayanaounji's Families privately owned islands. To have a so called "Student Vacation" But, the school president has a plan to make this vacation as perverted as possible. Though a much concieted effort, she exclaims to have received sun skin lotion from a sponsor company of hers. In a scene it shows on the lotion containers. "Warning, May cause extreme daringness" "Ingredients, etc, etc, etc" in other words, a love potion. With this the girls each on their own torment Jun'ichi throughout the day and have a perverted but entertaining time. Thus Nagomi comes in with her alienated antics and saves the day by knocking everyone out with her chopoooo's. The following morning everyone thinks it was just a dream. Thus ending their perverted vacation, as well as the series.