베델리우스 공작가의 차기 당주인 오즈 베델리우스는 15살을 맞아 성인식을 치르기 위해 성인식장으로 유서 깊은 저택에 머무른다. 오즈는 시종인 길버트, 여동생 에이다와 함께 저택에서 탐험 놀이를 하던 중 의문의 오르골 소리에 이끌려 따라가다가 갑자기 땅이 무너지고 지하 공간에 떨어지게 된다. 지하 숲속에서 오래된 묘비 앞에 놓인 회중시계를 발견하고, 시계를 손에 쥔 순간 오즈의 의식은 기괴한 공간으로 날아가 버린다.

오즈의 성인식 시작 전, 삼촌 오스카 베델리우스는 오즈에게 레인즈워스 여공작의 손녀 샤론을 소개해 주고, 오즈는 샤론에게 첫눈에 반한다. 수많은 사람이 지켜보는 가운데 오즈는 '침묵의 시계탑' 앞에서 마지막으로 맹세의 말을 읊는다. 의식을 마치던 찰나, 백 년 동안 정적을 지키던 침묵의 시계의 바늘이 움직이고 종이 울려 퍼지자 사람들은 크게 놀라고 그때 갑자기 누군가 쳐들어온다.

성인식이 끝날 무렵 갑자기 정체불명의 무리가 쳐들어와 오즈를 이공간의 세계 어비스로 떨어뜨린다. 오즈는 낯선 광경에 어리둥절해하며 출구를 찾아 헤매던 중 괴기한 인형인 체인한테 습격당하고 죽음의 위기에 처한다. 그때 앨리스가 나타나 자신과 계약하고 어비스를 빠져나가자고 제안한다. 과연 오즈는 이 위기를 헤쳐 나갈 수 있을까.

어비스에서 가까스로 탈출한 오즈가 현실로 돌아온 곳은 레인즈워스 가의 저택이었고, 눈을 떠 보니 10년이란 세월이 훌쩍 지나 있었다. 오즈는 샤론, 브레이크, 레이븐에게 그들이 4대 공작가가 조직한 판도라의 일원이라는 사실을 듣는다. 앨리스는 판도라에게 붙잡힐 것 같은 직감이 들자 오즈의 몸을 조종해서 도망가려고 한다.

오즈는 브레이크의 제안을 받아들여 판도라의 일을 돕기로 하고 앨리스, 레이븐과 함께 노던 브리야 마을로 향한다. 그곳은 사람들이 체인한테 잡아먹히는 살인 사건이 자주 일어나고 있었고, 레이븐은 오즈 몰래 사건을 조사하려고 한다. 한편, 불법 계약자인 범인은 특별한 체인인 앨리스를 잡아 막대한 힘을 손에 놓으려고 한다.

오즈, 앨리스, 레이븐은 앨리스의 기억의 파편을 찾기 위해 다시 성년식을 거행했던 저택을 찾아간다. 10년 전, 오즈가 판도라로 떨어진 후 저택은 판도라가 관리하고 있었다. 오즈는 앨리스와 저택을 수색하던 중 마냥 즐겁게 뛰놀아 다녔던 어린 시절 추억을 떠올린다. 한편, 침묵의 시계탑 앞에서 레이븐은 판도라의 조직원에게 습격당한다.

성인식장에 홀로 남은 앨리스 앞에 잔뜩 망가진 토끼 인형이 나타난다. 토끼 인형이 앨리스한테 외톨이라며 비웃자 앨리스는 괴로워한다. 한편, 앨리스는 이 저택에 잃어버린 기억의 파편이 있다는 걸 느낀다.

수도 레베이유에 있는 길버트에 집에서 눈을 뜬 오즈는 브레이크에게 지금까지 일어난 사건에 대한 자초지종을 듣는다. 하지만 브레이크는 자신 역시 어비스에 대한 모든 것을 알지 못한다고 말하며 자리를 뜨고, 오즈는 갑자기 가슴을 통증을 느끼며 괴로워한다.

길버트는 조심스레 앨리스에게 오즈가 아버지한테 상처받았던 과거의 일을 알려준다. 한편, 오즈는 우연히 만난 필립에게 연민을 느끼고 필립이 아버지와 행복하게 살길 바란다. 한편, 빈센트의 시종 에코가 나타나 필립을 잡으려고 하고 오즈는 필사적으로 에코의 뒤를 쫓는다.

오즈는 불법 계약자가 필립의 아버지라는 걸 알고 충격에 휩싸이고, 비 래빗이 체인을 공격하자 필립의 아버지를 살리기 위해 앨리스의 힘을 막으려 한다. 오즈는 자신의 아픈 과거를 대입하며 분노하지만, 이내 필립의 행복을 생각하라며 필립의 아버지를 설득한다.

길버트는 오즈에게 나이트레이 가의 양자가 된 이유를 털어놓는다. 오즈가 어비스로 떨어진 후, 길버트는 브레이크에게 나이트레이 가에서 양자로 맞이하고 싶다는 소식을 듣고, 베델리우스 가를 배신할 수 없다고 완강하게 거절했지만, 그것이 오즈를 구할 방법이라는 말을 듣고 마음이 흔들린다.

오즈와 앨리스는 길버트의 모자를 찾기 위해 길버트와 함께 아침 일찍부터 마을로 나서고, 술집에서 어떤 남자가 길버트의 모자를 들고 있는 걸 발견한다. 모자를 되찾기 위해 난데없는 팔씨름 대결이 펼쳐지고 오즈는 그곳에서 삼촌인 오스카 베델리우스와 재회하게 된다. 앨리스는 오즈가 삼촌을 만나 행복해하는 모습을 모자 돌연 외로움을 느끼고 골목 안에 숨어 있던 브레이크를 만나지만 누군가에 의해 납치당한다.

오즈와 길버트는 실종된 브레이크와 앨리스를 찾기 위해 샤론의 체인인 에쿠우스의 힘을 이용해 체셔 고양이의 공간으로 들어가고, 바로 체셔 고양이의 습격을 받으며 위험에 처한다. 한편, 그때 오스카와 레임은 판도라 본부 복도에서 쓰러져 자는 있는 빈센트 나이트레이를 발견한다.

길버트가 체셔 고양이의 공격으로 계단 밑으로 떨어져 홀로 남게 된 오즈는 또다시 죽음에 위기에 처한다. 그 순간, 앨리스의 기억에서 봤던 금발 머리의 남자가 나타나 오즈를 거울 속 세계로 데려가고, 그곳에서 오즈는 길버트를 재회한다. 의문의 금발 머리 남자는 오즈에게 앨리스를 구해달라고 말하며 서두르지 않으면 앨리스가 영원히 이 공간에 갇힐 거라고 경고한다.

오즈는 앨리스의 기억으로 만들어진 공간에서 끔찍한 장면을 보고 큰 충격을 받게 되고, 오즈의 몸 안에 있는 비 래빗의 힘이 폭주하면서 체셔 고양이의 공간 전체가 무너지기 시작한다. 한편, 의문의 금발 머리의 남자는 오즈의 폭주를 막기 위해 길버트를 오즈가 있는 곳으로 보낸다.

체셔 고양이의 공간에서 가까스로 탈출한 오즈와 앨리스는 4대 공작가들이 모인 판도라의 본부에 떨어지고, 사람들은 오즈와 비 래빗으로 변한 앨리스를 어비스에서 온 체인으로 생각해 그 둘을 체포하려고 한다. 한편, 브레이크는 레임과 얘기하던 중 샤론이 행방불명됐다는 사실을 알게 된다.

브레이크는 빈센트에게 납치된 샤론을 구하기 위해 자신이 그토록 알고 싶어했던 진실이 담긴 체셔 고양이의 방울을 포기한다. 샤론은 자신을 위해 큰 대가를 치른 브레이크에게 크게 화를 내고, 오즈는 평소에 볼 수 없던 두 사람의 모습을 보고 의아해한다. 한편, 오스카는 에이다의 편지를 들고 허겁지겁 오즈를 찾아간다.

오스카는 에이다의 짝사랑 남자를 찾기 위해 오즈와 앨리스, 길버트와 함께 루트위지 학교에 잠입한다. 오즈는 학교 도서관에서 자신이 좋아하던 소설책의 속편이 나온 걸 보고 기뻐하던 중 엘리엇과 리오를 만나게 된다. 오즈는 엘리엇과 소설책에 관해 얘기하던 중 의견이 엇갈려 말다툼을 하게 되고 그 자리를 박차고 나온다. 그때 한 여학생이 오즈 앞에 나타난다.

바스커빌의 추종자의 소굴에서 빠져나온 네 사람은 루트위지 학교의 지하 비밀 통로로 도주한다. 그러던 중 오즈는 엘리엇의 도발에 울분을 토하며 그동안 감춰왔던 속내를 털어놓는다. 한편, 오즈는 바스커빌의 추종자에게 다시 쫓기게 되고, 잭 베델리우스 해 준 말을 떠올리며 봉인된 힘을 발산한다.

레인즈워스 가의 저택으로 돌아온 오즈와 길버트는 루트위지 학교에서 있었던 일로 깊은 상심에 빠진다. 샤론은 앨리스가 자신을 소홀히 대하는 오즈 때문에 속상해하는 고민거리를 듣자, 소녀 감성이 발동해 앨리스에게 연애 상담을 해 준다. 한편, 오스카가 준비한 무사 귀환 축하 파티에 다들 술에 취해 소동을 부린다.

브레이크와 루퍼스 바르마 공작의 증언으로 브레이크의 과거, 앨리스와 어비스의 의지의 관계, 그리고 빈센트의 과거까지 하나둘씩 진실이 밝혀진다. 그것들이 모두 오즈와 앨리스, 길버트와 깊게 연관 되어 있자, 새로운 정보에 목마른 바르마 공작은 더 새로운 사실을 듣기 위해 브레이크를 판도라로 넘기려고 한다.

앨리스의 기억의 파편을 찾기 위해 오즈와 앨리스는 불법 계약자를 체포하는 데 힘을 쓴다. 하지만 좀처럼 기억의 파편을 찾지 못하자 오즈는 낙심한다. 길버트는 빈센트를 찾아가서 백 년 전의 진실을 물어보지만 빈센트는 끝까지 모른 척한다. 한편, 수도 레베이유에 불길한 그림자가 드리운다.

갑자기 레베이유에 체인 무리가 습격해 마을을 초토화한다. 앨리스는 직감적으로 어비스의 의지한테 심정의 변화가 생겨 체인들이 폭주하는 걸 느끼고, 판도라는 체인을 제압하기 위해 작전을 짠다. 레베이유로 돌아온 오즈와 앨리스, 길버트, 브레이크, 샤론은 사람들을 구하기 위해 사력을 다한다. 한편, 브레이크는 최후의 수단으로 매드 해터를 써서 체인을 소멸시켰지만, 또다시 체인 무리가 몰려온다.

오스카는 레인즈워스 저택에 머무는 오즈에게 베델리우스 저택으로 돌아가자고 하지만 오즈는 선뜻 집으로 돌아가는 걸 주저한다. 오스카는 그런 오즈의 마음을 눈치채고, 오즈의 아버지 자이 베델리우스는 10년 전 오즈의 성인식 날 저녁 행방불명됐다고 말한다. 한편, 오즈는 아버지의 체인의 존재를 알게 되자, 큰 충격을 받고 쓰러진다.