L'été est fini. Avec la rentrée, un nouvel élève nommé Antony arrive et intègre la classe de Sakura. Au déplaisir de Lionel, ce dernier ne tarde pas à faire la connaissance de la jeune chasseuse de cartes. Mais est-ce bien le principal problème alors qu'une pluie anormale se met à tomber sur la ville et uniquement sur elle…

Sakura décide d’intervenir pour stopper l'étrange pluie qui tombe sur Tomoeda mais elle ne parvient plus à transformer son sceptre. Alors que Kerberos, Yué, Tiffany se retrouvent prisonniers avec elle de gigantesques colonnes d’eau, Sakura comprend que désormais elle doit invoquer le pouvoir de son étoile pour utiliser le nouveau sceptre magique…

Changer les Clow Cards en Sakura Cards épuise la jeune chasseuse qui a bien du mal à se lever. Heureusement, Tiffany et Lionel sont là pour la soutenir. De retour à l'école, elle est confrontée à un nouveau problème: le piano de la salle de musique semble réagir à la voix de Tiffany et les attaque…

Sakura entend dire que si l’on fabrique soi-même un ours en peluche qu’on l'offre à une personne qu’on aime, cette personne vous aimera en retour. La nuit venue, alors qu'elle commence à en fabriquer un, Sakura ressent la magie de Clow Read et sort pour en savoir plus. C'est alors que Lionel se met à l'attaquer…

Confectionner un ours en peluche est une activité qui peut sembler innovante et sans danger… Mais quand les pouvoirs magiques de la lune s’en mêlent, plus rien n’est normal! Et quand l’adorable peluche se transforme en un gigantesque monstre dévastant tout sur son passage, que faire pour l’arrêter ?

Épuisée d'avoir transformé deux cartes le même soir, Sakura manque de s'endormir en plein cours. Matthieu, de son côté, se pose des questions sur la fringale permanente et la fatigue qui l'accaparent. Alors qu'il ramène un livre chez Sakura, il se transforme en Yué et s'interroge avec Kerbéros sur la disparition progressive de ses forces…

Antony aide Sakura à balayer les feuilles de son jardin. En bougeant la bicyclette de Thomas, il lui appose un peu de sa magie. Un peu plus tard, Sakura remarque que les Clow Cards sont tristes et froides. Comprenant que les celles-ci se nourrissent de la magie, elle essaye de les transformer en Sakura Cards, toutes en une seule fois...

Dominique, le père de Sakura lui offre un calendrier qui appartenait à sa femme, Nathalie. Celui-ci provoque la joie de jeune fille et remémore beaucoup de souvenirs à Thomas. Découvrant que c'est le jour de l’anniversaire de son arrière grand-père maternel, Sakura en parle à son père et décide de lui offrir un cadeau…

Sakura est captivée par la lecture de son livre "Alice au pays des merveilles" et en parle avec enthousiasme à Antony. Les voyant, Tiffany ne peut s'empêcher de taquiner Lionel. Finalement, la journée s'achève pour tous à la bibliothèque où Sakura se retrouve absorbée dans son livre à jouer le rôle d'Alice…

Une vente de charité est organisée à l'école. La classe de Sakura, revêtue d'uniformes dessinés par Tiffany, s'occupe du stand des friandises et du salon de thé. Alors qu'il est tranquillement à l'écart en train de se régaler de sucreries offertes par Sakura, Kéro se retrouve face à Gothar. Prenant ce dernier pour un lutin, il l'oblige à manger du chocolat…

Lionel continue à s'interroger sur les réactions qu'il a à chaque fois qu'il pense ou qu'il voit Sakura. En acceptant de l'accompagner avec Tiffany et Antony à une exposition sur les ours en peluche, il ignore qu'ils vont se retrouver coincés tous les deux dans un ascenseur et qu'ils vont vivre des instants bien précieux…

De retour d'une patrouille qui s'est déroulée sans anicroche, Yué et Kerberos ne parviennent pas à retrouver leurs formes d’emprunt. Avec la pluie qu'il tombe, ils n'ont d'autre solution que de se cacher dans la chambre de Sakura. Commence alors une cohabitation amusante, le temps que la jeune chasseuse découvre une solution…

Le cours de sport de la classe de Sakura amène une confrontation sportive entre Lionel et Antony. Ce dernier qui ne rate aucun de ses tirs, ne manque pas de rappeler au jeune chinois qu'il se doit d'être plus concentré sur sa mission. En repartant, Anthony rencontre Matthieu. L'aura du jeune homme réveille Yué qui reconnaît en lui son ancien maître, Clow Read…

Ayant définitivement pris conscience de ses sentiments pour Sakura, Lionel décide de parler à Stéphanie lors de son prochain voyage à Hong Kong. Celle-ci surprend tout le monde en arrivant par le premier avion. Alors que le groupe décide de finir la journée en flânant en ville, nos héros sont confrontés à une attaque de pingouins. Stéphanie s’aperçoit alors que les choses ont évolués entre Lionel et Sakura. Si devant son cousin, elle fait bonne figure, elle s'effondre dans les bras de Tiffany…

Afin de remplir son rôle de chasseuse de cartes, Sakura s'absente la nuit en laissant son double comme alibi à la maison. Kéro se demande si Thomas ne serait pas au courant de ce subterfuge voire de toute la situation. Noël approche et Sakura se demande ce qu'elle va offrir à ses amis. Alors qu'elle prévoit d'aller acheter un portefeuille pour son père avec Thomas, elle doit faire face aux dernières facéties de Clow Read…

Le jour du nouvel an est l'occasion pour Sakura de revêtir son kimono et de découvrir les cartes de vœux envoyées par ses camarades. Se rendant au sanctuaire avec sa famille, elle y rencontre Tiffany et sa mère. Après une séance de photo, Sakura et Tifafny vont chercher leurs prédictions. Celle de Sakura, soumise à la magie de Clow, lui apprend que son premier rêve de l'année lui révèlera la vérité. Pendant ce temps, Thomas se rend chez Matthieu pour savoir pourquoi celui-ci est absent à leur rendez-vous…

Tandis que Kéro est resté à la maison où il s'empiffre de crème glacée, Sakura s'initie pour la première fois au joie de la montagne. Après une journée riche en émotion, le groupe passe la soirée ensemble et sur la demande de Nadine, Anthony raconte une histoire effrayante de “l'abominable femme des neiges ”. Sakura, terrifiée, n'arrive pas à dormir. Elle se rend dans la salle commune où elle retrouve Lionel…

De retour de quelques courses, Sakura intervient dans ce qui semble être une dispute entre Thomas et Matthieu. Mais il s'agit en fait du tournage d'une scène d'un film produit par leur classe et dirigé par Samantha. Très vite, Sakura se retrouve recruter pour jouer le rôle de la jeune sœur de Matthieu. Alors que le tournage se poursuit dans la demeure d'Antony, Matthieu s'évanouit et bascule dans le vide…

Au cours du festival de l'école de Thomas, le film fait par la classe de ce dernier est projeté sur grand écran. Le succès est au rendez-vous et les critiques des plus agréables. Après avoir emmené Sakura et ses amis se rafraîchir, Matthieu leur propose de visiter l'école. Lors de la visite du stand du village des étoiles, Sakura se retrouve seule avec Matthieu et décide de lui révéler ses sentiments…

Depuis qu'il a transmis ses pouvoirs à Matthieu, Thomas passe son temps à dormir. Emue par la bienveillance de Lionel à son égard, Sakura lui propose de l'accompagner au festival de la lune qui se passera au parc en fin de semaine. Mais, les jours passant, la jeune fille semble de nouveau de plus en plus fatiguée. Le matin du rendez-vous, Lionel passe prendre Sakura et il découvre qu'elle lui a tricoté une écharpe…

Antony sent que les pouvoirs de Sakura sont de plus en plus forts et que l'aventure tire à sa fin. Après avoir affronté une multitude de bonhommes de neige, Sakura se pose des questions sur la disparition de Clow Read et la mission qui lui est confiée. Elle utilise la carte du passé pour faire un voyage dans le temps et comprendre, avec l'aide de Clow Read, ce qui se passe autour d’elle…

Antony révèle à Sakura et à ses amis qu'il est la réincarnation de Clow Read. Grâce à la clé qui détient les pouvoirs de l'ombre, il rend à Gothar et à Samantha leurs formes originelles puis plonge la population de la ville dans un sommeil éternel. Sakura qui ne veut pas de conflit inutile, souhaite que tout s'arrête. Mais rien n'y fait. Elle décide de changer en cartes de Sakura les 8 dernières Clow Cards. Mais celles de la lumière et de l'obscurité résistent…

"Tout est terminé" disait Antony dans l’épisode précédent. Et c’est vrai dans un sens: Antony, réincarnation de Clow Read, ne s’opposera plus à Sakura. Il quitte la scène pour retourner vivre en Angleterre mais avant, il invite Sakura, Tiffany et Lionel chez lui pour leur révéler les raisons de ses agissements. Mais quand est-il des sentiments de Sakura pour Lionel, alors que celui-ci lui a avoué son amour et qu'il doit repartir pour Hong Kong…