日暮戈薇在15歲生日當天被妖怪百足妖婦拖入自家神社的食古井內，穿越到了戰國時期的村莊，巫女楓姥姥發覺戈薇和去世多年的姐姐——桔梗極其相像，認為她很有可能是桔梗的轉世。百足妖婦再次來襲，並且打傷了戈薇，本該隨著死去的桔梗一同火化的寶物四魂之玉，從戈薇體內出現。為了避免村莊受到傷害，戈薇單獨把妖怪引到了被桔梗封印的半妖犬夜叉所在的森林，不得已之下解開了犬夜叉的封印，獲得自由的犬夜叉殺死百足妖婦後也打起了四魂之玉的主意……

Hoshiyomi plans to destroy humanity using the Naginata of Kenkon.

A parasite demon infects Shippo, causing him to attack his friends, but Inuyasha seems to be the Shippo's real target.