Août 1944, Villeneuve vit ses dernières heures sous l’Occupation. Tandis que les résistants, dirigés par Marie, continuent la lutte et prêtent main forte aux Américains, les miliciens, qui ont pris le contrôle de la ville, poursuivent leurs exactions. Suzanne et Antoine, que les épreuves de l'année passée ont rapprochés, assistent un jour à l’une de leur descente ; la scène est insoutenable. Ils décident alors de tuer Janvier, le chef de la milice...

Hortense et Heinrich poursuivent leur route vers la Suisse, tandis que Suzanne et Antoine sont activement recherchés par toutes les autorités. Les miliciens, affaiblis et de plus en plus inquiets pour leur avenir et celui de leurs familles, négocient auprès du commandant allemand Schneider une place dans le dernier train pour Belfort ; il accepte, à condition que la milice accomplisse pour lui un dernier travail.

Jean et Servier comptent bien tirer profit de l’arrestation d’Antoine et de Suzanne pour négocier avec les résistants et le Comité départemental de la Libération (C.D.L.) certaines garanties de protection. Marie, séparée des Américains après l’attaque de leur convoi par les Allemands, est capturée et conduite à Villeneuve où les représailles s’organisent suite à l’attentat contre le chef de la milice et les officiers allemands.

À la gare, Jean, les miliciens et leurs familles attendent le train qui doit les emmener loin de Villeneuve. Pendant ce temps, Daniel découvre que Gustave est livré à lui-même et fait du marché noir, tandis que Lucienne, seule avec sa fille et son père, est de retour à l’école après un an d'absence.

Maintenant aux mains des Américains, Heinrich et Hortense sont séparés. En cellule, cette dernière retrouve Jeannine, totalement seule. À la gare, l’ambiance est tendue. Il n’y aura pas de train pour Belfort et le commandant allemand exige que les miliciens exécutent le groupe de juifs qu’ils devaient convoyer.

Daniel, assisté de Lucienne, soigne les blessés de l’unité allemande réfugiée à l’école, afin de sauver sa peau et celle de Gustave. Pendant ce temps, De Kervern, le nouveau préfet, tente tant bien que mal de faire respecter l’autorité du Gouvernement provisoire auprès des résistants et du C.D.L. L’enjeu : chasser les derniers Allemands et prendre le contrôle de Villeneuve.

Septembre 1944 : les Allemands ont quitté Villeneuve mais un groupe de miliciens retient encore des otages dans l'école. Alors que le préfet suppléant arrive pour tenter d'obtenir la reddition des miliciens, les résistants sont divisés sur le sort qui leur sera réservé. Entre désir de justice et désir de vengeance, la Libération s'annonce tendue.

Septembre 1944 : Après la reddition des miliciens et devant l'impossibilité de les transporter vers Besançon pour leur procès, Bériot décide de monter une cour martiale dans l'école de Villeneuve. Il demande à Antoine et Suzanne d'accompagner Anselme comme juges, alors qu'Edmond est désigné procureur et Daniel Larcher avocat de la défense. Alors que le procès s'engage sur le sort qui sera réservé pour chaque milicien, Bériot reçoit de son supérieur l'ordre de truquer le procès.

Septembre 1944 : A l'heure du grand bal de la Libération, Vileneuve chante, danse, et libère ses pulsions. Entre amour et haine, Suzanne, Antoine, Raymond, Rita ou encore Bériot se laissent guider par leur instinct, tandis que les miliciens attendent leur probable exécuion.

Septembre 1944 : Tandis que Jean se cache toujours chez Rita, les problèmes du quotidien s'aggravent : ravitaillement, santé, hébergement, c'est la pénurie. Edmond et le CDL, qui étaient censés gérer ces problèmes, sont désavoués par Bériot qui nomme Daniel administrateur civil. Mais la réhabilitation de Daniel sera de courte durée...

Septembre 1944 : Daniel et Hortense, seuls et vilipendés par la foule, s’apprêtent à quitter la ville. Antoine a arrêté Marchetti : Bériot lui demande de la transférer secrètement à Dijon mais la nouvelle se répand comme une traînée de poudre. Bientôt, Antoine, Suzanne, Marchetti, Daniel et Hortense vont faire face à leur destin...