源光身负着从土蜘蛛族手中夺回勾玉的使命。乔装成自己兄长源赖光，与渡边纲一起出击。只要能从土蜘蛛族手中拿回勾玉，大哥的病与京城乱象都得以回复。于光渡边纲护卫下勇敢地直捣土蜘蛛族据点，不料却遭到对手突如其来袭击。不得以只好采取以退为进策略，先找位于附近村庄，再思考接下来该如何采取行动。

光和纲进入村庄后，发现这个村庄看似和平似乎不受土蜘蛛控制的影响下生活。然而接受村中长老款待后当晚随即发生袭击事件，光也澹澹地嗅出事有蹊跷。于是循着残留枕头上刀剑，前往村郊打算询问贞光事实真相，没想到竟然从贞光口中得知相当骇人听闻的真相。

在贞光协助之下，光和纲终于顺利直捣土蜘蛛族的巢穴。后来更因为贞光救出葛女，在葛女指引下，总算打败星熊童子，顺利拿到了勾玉，原来葛女就土蜘蛛族首领，因为星熊童子篡位才会有祀奉勾玉，并以民女与山麓村庄进行交易的惨事发生。随着星熊童子丧命，一切也随之划下句点。没想到急着赶回京城光所面对的竟然是。

源光从常陆国土蜘蛛手中夺回勾玉，并平安地回到了京城，但兄长赖光却已经气绝身亡了。心情因此陷入悲叹之中的光，以为了消除长途旅程秽气而斋戒藉口一直待家中足不出户。没想到罗城门上一曲思念兄长的笛声，唤来了光与万岁乐一段不寻常的邂逅。光在万岁乐若有似无的鼓舞下，决定进宫晋见皇上，没想到却听到相当意外消息。而左右大臣则与安倍晴明合作，处心积虑地为自己将来仕途打算。

光一行人在卜部的带领下，顺利地接近此行的目的地——咒岛。然而却渡海前往咒岛村庄里，遇到无船可用的难题。于是卜部自告奋勇，要解决这个难题，光也不疑有他地同意由卜部去执行这个任务，没想到卜部竟然下毒毒死城寨里所有人，也因此而波及无辜。此举让光震怒的同时，也失去了村民对光一行人的信赖面，对这种情况光到底该如何好。

光一行人在卜部的带领下顺利潜入海贼城寨中，眼看着已将水勾玉弄到手，没想到太郎丸竟然在此时用长枪杀害虎熊。原来一切都是昔日那段为了迎娶绫竹而结下的恩怨，虎熊自知死劫难逃，于是心念一转打算协助光将总引发事端水勾玉带走。没想到就光一行人乘船离开咒岛后不久，竟然发生了大海啸。

光一行人因为突如其来的大海啸而分散了，光被海浪冲到一处不知名的沙滩上，后来还因为遭熊击军队袭击而巧遇万岁乐出手相求于光，和万岁乐也因此被迫山洞里共处一晚。而贞光则遇到一名一路跟着不肯离去的男童——金太郎，至于卜部和纲则暂时在海边山洞里休养。随着黎明升起，光也从睡梦中醒来，但万岁乐早已不知去向，不久后四个人终于劫后重逢。

光为了夺火勾玉，前往由酒吞童子统率熊袭本营观察敌情，却意外遭到火药弹袭击。后来卜部决定模彷再制造一个。卜部顺利完成火药弹后，光一行人也随即进行潜入策略，没想到潜入时竟然出奇顺利。后来经过察访后才知道，原来酒吞童子早已率领千人大军正前往京城路上，准备攻打京城，而本营内只留下一名来自俄罗斯赤鬼看守。

光一行人带着水勾玉快马加鞭地赶回京城，没想到却因为少了火勾玉而遭到禁足处分。虽然如此，光还心系着京城安危，直到纲发现赖光亲笔留遗作中透露着安倍晴明暗藏内幕时，光才恍然大悟。就在光集合众人打算前往大枝山时，耐不住性子的酒吞童子已对京城展开攻击。

就在光一行人在 大枝山集合时，酒吞童子已迫不及待地对京城发动攻击。为了阻止京城遭到破坏，光一行人决定直捣酒吞童子本营，要求停止这种野蛮行为，甚至连酒吞童子身边荆木也看不下去希望酒吞童子立刻撤兵，以对等方式与朝廷商谈。但酒吞童子执意不肯，即使光手无寸铁地前往谈判，仍抵挡不了充满杀意的酒吞童子。

卜部从光身上夺走勾玉之后，随即回到晴明身边，但和光一起长途旅行过程中，已经改变了卜部的想法，甚至怀疑起晴明蒐集勾玉居心不良，于是不愿将勾玉交给晴明，后来却也因此丧命。光找到卜部后，从卜部口中得知晴明打算利用五行相克道理毁灭京城的企图，于是立刻带领纲等人前往罗城门打算阻止晴明。

从卜部口中得知事实真相的光下定决心要阻止晴明毁灭京城。但晴明也早已布下天罗地网打算阻挠光一行人的脚步，贞光与金太郎协助、与纲舍身护主义举下，光终于见到了晴明，只不过当光箭射穿了晴明面具后出现面前脸孔竟然。

光一心想阻止的晴明的真面目竟然就是万岁乐，虽然面对这个令他难以接受的结局，光还是心系着纲、卜部、贞光、金太郎们想法与京城安危，最后选择以自我牺牲的方式来阻止万岁乐施法，京城总算免于被毁灭的命运。

物换星移，时空转换成现代东京。光在一次灵异现象中看到失踪刚好满一年的大哥，再加上相关线索陆续出现，让光加快了寻找大哥下落脚步。

自从赖光的一些神秘照片出现后，光便认定那些照片和赖光失踪有绝对的关联性，于是积极地展开调查没想到过程中频频遭遇到奇怪体验，一名神秘男子几乎每次都会出现。本来不相信光这番说词，纲后来也发现事有蹊跷，于是决定一起参与调查，甚至连卜部和贞光也都一起加入，后来还发生了和神秘照片中类似的情景。

最近盛传着一个会电视节目收播后沙暴画面上看到已死去人都市传说，没想到光真的在画面上看到赖光。这个传说起因听说就在东京铁塔，而纲刚好接到相关工作，于是光和金太郎要求下带着他们一起前往东京铁塔进行采访。东京铁塔前身为芝公园，本来就流传着一些灵异传说，没想到光和金太郎还真那里体验到了呢。

贞光后乐园墙上涂鸦中看到已故父亲的名字，还突然听到父亲说话的声音，这个灵异现象让贞光回想起儿时一段不愉快的经验。但后来也因为这个灵异现象，让贞光从儿时不愉快经验中释怀。

光梦中发现自己莲花池里被火焰包围，然后消失醒来时刚好深夜1点半，没想到梦中情景就跟赖光留下来照片一样。于是光和纲决定寻找照片中樱花与莲花拍照地点。后来在卜部指点下，锁定地点于上野，没想到才刚到那里又发生一连串不可思议事件。

听说涩谷车站附近每逢月圆就会有白色狗出现，这就纲接到工作主题为了顺利拿到房租，光也一同随行帮忙，没想到光真看到白色狗。白狗要求光归还缺角月亮，还因此引发一场车祸。然而纲却只看见车祸现场，原来这又另一起超自然事件。后来光凭着自己直觉，前往一处神社，也慢慢解开了白狗出现谜团。

光和贞光们发现纲最近行径怪异不已。深夜自己一个人出门，就西装笔挺好像要去约会似的。于是决定跟踪没想到竟然发现纲好像和一位美女论及婚嫁了。搞了半天原来误会一场。然而光也因为这场误会在卜部指引下，前往麻布找到了可以实现愿望金之星，至于愿望不真能实现就不得而知了。

光煮了一桌大餐，打算给纲一个惊喜为庆祝生日没想到纲竟然整夜都没有回来。光虽然火大，却也开始担心起纲安危。原来纲为了搜寻赖光所留下线索，误入时空歪斜里面，因而受困。后来光万岁乐协助之下前往异次元，纲也因此得以脱困。

光过去记忆，得知万岁乐这个名字之后，逐一苏醒。一时之间无法承受过去沉重的记忆，光选择以逃避的方式来面对昔日与现伙。然而当纲们发现光失踪的时候，也决定和昔日一样团结起来为光效力。

东京都内开始发生一些异常现象。光知道这些现象都和自己有关，虽然一心想一肩扛起所有责任，但终究还接受了大家协助。后来大家齐心协力之下，终于找到歪斜发生地点，光也得以前往另外一个空间，与万岁乐会合，没想到呈现光面前竟。

大家协助之下，光终于到了万岁乐口中的东京车站门。后来在万岁乐带领下，光搭上了万世桥车站，看过那班列车甚至还穿越时光，回到平安时代罗城门上。按照万岁乐指示，把火勾玉碎片复元后，大家终于都从时间歪斜中得到释放。

不知道自己将来该何去何从，甚至还露宿街头。卜部巧遇虎熊之后，因为虎熊缘故，有了一趟奇妙体验。最后还因此发现自己未来该走的路。

万岁乐公园内和一名老人展开了一场不可思议时间对话，这段对话甚至让万岁乐有那个老人就自己化身的想法。但当万岁乐再回首时，才发现原来那自己错觉。