深夜，一男一女匆匆奔逃，男的一身白衣，丰神俊朗，女的紅衣披掛，兩人奮力斬殺兩個追兵後，到江邊欲乘船離去，不料船家的搖櫓壞掉，兩人不得已上岸採購些食梁。男子路見喇嘛欺負百姓，便出手教訓。待兩人回到岸邊，發現船家已然被害，殺了追蹤而至的四名女子，緊跟着又來了一位氣勢凌人的婆婆。原來女的叫花月奴，男的叫江楓，兩人因相愛而得罪移花宮宮主，不得已出逃。這位婆婆便是一手養大月奴的花婆婆，兩人直至將要逼至自盡也未曾有怨言。婆婆疼愛月奴，最終放走二人後自盡，兩人悲傷不已。至此，移花宮派來的金銀雙煞、四花使、花婆婆俱都死去，宮主邀月氣憤異常。花江二人隱居大半年，月奴已懷有身孕。好景不長，兩人行蹤暴露，江楓深感生死叵測，向月奴提起義兄燕南天曾託付給自己藏寶錦盒。家丁江琴見財起歹心，假意對江楓誓死追隨。三人匆忙驅車趕至一處客棧，月奴已近臨盆，老闆夫婦將他們盛情挽留下來。江琴在粥裏下毒，後自告奮勇陪老闆之女胖妞找產婆，路遇十二星象。老闆娘見二人久去不回，無奈自己接生。江楓發現十二星相來襲，不料因聽嬰兒啼哭，分神被擒，被威脅交代燕南天的寶藏。月奴強提真氣，用出移花宮的梅花鏢，震退眾人。不料十二星相識破謊言，去而復返，又被移花宮右使魏無牙羞辱喝退。聰慧的月奴使老闆夫婦離開，江楓將錦盒交給老闆。宮主邀月追來，對江楓二人恨入骨髓，原來邀月曾是江楓的救命恩人，並對他一見傾心，無奈江楓喜歡的是月奴。邀月正欲折磨二人，誰料此時他們俱都毒發身亡。

江琴路遇老闆夫婦，回到客棧搜寶藏，原來竟是他出賣主人，騙十二星相去奪寶。十二星相奪寶不成，反被羞辱，打昏江琴後離去。邀月與魏無牙定下毒計：將兩個孩子分開撫養，一個交與燕南天，一個帶回移花宮，希望他們長大自相殘殺。魏無牙在江湖上冒稱燕南天，終於引出他來，魏無牙稱江楓與月奴俱被殺，留有一子。燕南天趕至客棧，以為兇手是十二星相，黯然埋葬他們夫婦後，帶着孩子離開。邀月對江楓甚是痴情，可嘆那種愛變為恨時，尤為可怕。目睹着邀月的恨，魏無牙對她竟也是一片愛意。另一方面，燕南天把孩子暫時交給一位大嬸照顧，孤身闖入“不義堂”，找十二星相尋仇，意外得知兇手竟是書童江琴，現藏身“惡人谷”。江湖險惡，燕南天廢去其武功，沒想到自己竟然被騙。惡人谷處處危險，縱使燕南天武功高強、小心謹慎，可終究還是被毒倒。

惡人谷的惡人們囂張異常，自以為封住其十八穴道，自保無虞，對他百般奚落。孰知燕南天已經練成自行衝破穴道的工夫，脱困而出，斬殺不少惡人。遇到號稱“殺人無數、神刀鬼醫”的惡人萬春流，他的一番善惡説辭，使得燕南天對惡人們升起一片善念，沒想到使自己陷入炸藥的全套。燕南天頂天立地，如今卻被惡人們折磨的體無完膚。鬼醫此時再次出現，他覺得燕南天受此重傷卻還有一息尚存，便想留他做實驗，研究藥草。那小孩此時已成為惡人們的關心對象，立志要把他培養成為第一惡人。幾年後，移花宮的小孩取名為花無缺，移花宮中人情冷漠，無缺沒人做朋友，他性格安靜、知書達理。邀月對無缺的疼愛，使魏無牙妒火中燒，他忍不住對邀月表達了愛意，邀月使用美人計，騙的他被挑去腳筋，扔下臭水溝。惡人谷的小孩取名小魚兒，惡人們對小魚兒嚴格要求，時常戲弄，使得小魚兒滿心痛苦委屈。在這種環境下的磨練下，小魚兒竟也漸漸開始適應，偶爾還會捉弄起惡人們。

小魚兒開始把各種奸詐耍滑的手段運用的爐火純青，惡人們已經招架不了了，他的日子開始充滿陽光樂趣。日月如梭，小魚兒已經長成了俊俏的少年，隱隱有了“天下第一惡人”的架勢。小魚兒為了弄清那個“藥罐子叔叔（即燕南天）”的來歷，動用了屠嬌嬌的改頭換面術將燕南天扮成外出採藥的萬春流被殺的樣子，對哈哈兒、李大嘴和屠嬌嬌説是“藥罐子叔叔”復原了，殺了萬春流並留下字條要血洗惡人谷。他又外出找到萬春流，慫恿他扮成燕南天回去救惡人谷。這下便熱鬧了，惡人谷被惡人們自己燒了，互相打鬥幾招後，才明白是虛驚一場。小魚兒引起公憤，但憑藉機智和李大嘴的袒護得以逃脱。惡人谷來了個“打虎太歲”，帶來了個所謂“燕南天的寶藏”的地圖。小魚兒的師傅們希望藉此機會讓他出谷尋寶。臨走前，萬春流交給他一盒“針灸工具”自保，並且説小魚兒只是調皮搗蛋，未曾傷天害理，因為秉性純良，不算是惡人。萬春流向小魚兒説出了他所知道的當年的一切。小魚兒愧對燕南天，為查明身世出惡人谷，發誓絕對不做傷天害理之事。

小魚兒被村民歡送出谷，幾位師傅俱都有禮相送，李大嘴的人肉、匕首；屠嬌嬌的易容工具；哈哈兒的一袋金葉。邀月得知小魚兒出谷，開始實施復仇計劃，她讓花無缺出宮尋寶併為她殺一人，隨帶移花宮如冰、如霜二人，名為照顧，實為監督。小魚兒路上聽到音樂，被異族舞蹈吸引，認識了擁有苗漢血統的美麗女孩桃花。不懂苗族風俗的他，稀裏糊塗成了桃花的老公，他為逃脱，搶了別人的一匹馬。集市賣馬時，莫名其妙被人殺，幸虧桃花趕來，他製作混亂跑開，誰知又遇馬的主人，自稱“鐵心男”，並説要殺他的那人是“小仙女張菁”。小魚兒何其狡詐，不一會便欺負了張菁，帶“鐵心男”離去。在客棧，小魚兒與花無缺第一次碰面，並用易容術躲過張菁的搜索。

小魚兒的易容術還是沒逃過張菁的眼睛，奈何追上又有什麼用，張菁又被小魚兒戲弄，點了穴道綁在樹上。圖中，小魚兒用計使“鐵心男”下水，這才驚知眼前人是個女兒身。“鐵心男”原來是“鐵心蘭”，是車月國近衞大臣鐵戰的女兒，張菁是車月國公主。近日，國王突然死去，鐵戰被囚，鐵心蘭出來尋找燕南天救父親。小魚兒説出燕南天近況，鐵心蘭黯然。這邊，張菁在樹上被流氓欺負，巧遇到花無缺仗義相助。小魚兒與花無缺再次相遇，小魚兒酷愛自由，看不慣花無缺被如霜、如冰兩人約束，便特意引開兩人，帶着花無缺逛遍集市，玩些小玩意，逗的花無缺歡喜不已，兩人互生好感。小魚兒和鐵心蘭被張菁追殺，幸被一位來歷不明的蒙面女子所救，但只能躲在她的別院裏才保證其安全。小魚兒晚上追蹤蒙面女子，發現她在練“化石神功”，小魚兒見她漂亮，不忍看她練得像木頭，便劃掉壁上的口訣。蒙面女子正在練功，動憚不得，被小魚兒氣得行功走岔，走火入魔，受了內傷，小魚兒帶着鐵心蘭逃離別院。不料，張菁遇花無缺，説出蒙面女子用移花宮不外傳的“移花密技”，花無缺前去請教。

花無缺前去請教，愕然發現該女子所學竟是專門剋制“移花秘技”的武功，守約離去。蒙面女子前去龜山找其義父療傷，沒想到她的義父竟是當初被邀月所傷的魏無牙，他恨極邀月，命義女蘇櫻與移花宮作對，保護小魚兒周全。小魚兒按地圖趕到峨眉山，發現大批人馬打鬥，像自己手中的地圖散落各處，本想坐收漁利的他不幸被張菁發現，正逃離間，高手江別鶴趕來，安住眾人。眾人進谷尋寶，終發現這是個陰謀。正不平間，移花宮花無缺、如冰出現，明言説這是移花宮宮主的玩笑，如冰氣勢凌人，讓花無缺與羣雄比武，花無缺武功卓絕，眾人敢怒不敢言，只得表面稱是。孰料此時如冰竟讓小魚兒與花無缺決鬥。正打鬥間，邀月趕來，她藏寶計劃目的就是使花無缺在江湖立威，她故意給花無缺充分自由，讓他和小魚兒接近，希望他日後下手時更為痛苦。另一方面，鐵心蘭被通緝，無缺和小魚兒前去救鐵戰，奈何他固於忠義，不願離開。小魚兒巧舌如簧，終讓自己替鐵戰留了下來。花無缺按照小魚兒的吩咐，將鐵戰接至妓院和鐵心蘭重逢。牢中的小魚兒最終被提出來見了車月國皇后，他為人刁鑽機靈，竟與皇后達成三日後，神廟做法引國王鬼魂，揭開鐵戰一案事實的約定。三日之後，鐵戰假扮國王鬼魂，不料此時張菁趕至，計劃功敗垂成。

小魚兒裝神弄鬼，竟又得到皇后的令牌，託他查案，給予他莫大的權利。他用一條魚和奇奇怪怪的手段，玩弄了車月國所有的人。他的所為無缺一清二楚，兩人之間的信任使得彼此都很欣慰。小魚兒路遇相士算命，竟是蘇櫻所扮，不出所料，蘇櫻很快又被小魚兒戲耍一番，無奈看其瀟灑離去。小魚兒誘使兇手主動現身神閣，毒傷其手，讓其逃離。翌日小魚兒觀察眾人洗手後，對唯一落下的皇叔（皇上的弟弟）不依不饒。而後，皇叔主動現身，説出自己對國王的不滿，言辭激動，張菁聽其對自己父王不敬，激怒之下，一劍將其刺死，孰料這個皇叔竟是自己親生父親，並且和自己母后有多年情誼。皇后悲憤之下對小魚兒出手，無缺相救，不敵。震驚發現此人用的是“移花秘技”。此時，邀月又至，皇后竟然就是邀月的妹妹。她因當年對江楓有情，被邀月逐出移花宮。皇后不敵邀月，且不服她的性情，出言嘲笑後，毅然自盡。張菁尋仇，幸有鐵戰相救。邀月未下殺手，叫出無缺，第一次説出讓無缺與小魚兒生死決鬥的事情，無缺震驚不已。卻又不敢出言相問，幸好邀月也自覺兩人相差甚遠，此意暫時作罷。並讓他們繼續做朋友。這邊蘇櫻出現，小魚兒明知有詐，卻又自負聰明，不想露怯，終究中毒。蘇櫻古靈精怪，折磨的小魚兒苦不堪言，竟讓小魚兒以身相許，最後還在他胸前烙下個鎖印。鐵戰有意為女兒選婿，鐵心蘭對無缺和小魚兒無法選擇，稱由父親做主。鐵戰在街上遇到“脱離虎口”的小魚兒，提起親事，嚇得小魚兒尿遁。蘇櫻有意交小魚兒魏無牙獨創的化解“移花秘技”的武功，小魚兒不信花無缺會殺自己，不願學。

花無缺對鐵心蘭有情，奈何鐵戰竟然讓無缺幫忙為鐵心蘭和小魚兒做媒。小魚兒怕真的要娶鐵心蘭，在山上邀鐵心蘭與花無缺共飲，説出自己要離開，並撮合他們。奈何此時邀月又至，小魚兒因為皇后之死出言不遜，邀月藉機又讓兩人生死決鬥。花無缺似乎永遠對邀月的命令言聽計從，雖不忍，卻仍將小魚兒逼落山崖，鐵心蘭傷心不已。不過眾人都猜測小魚兒未死。小魚兒闖進一山洞，遇到十二星相里的獻果神君，得知他對燕南天有仇怨。為得出更多消息，他治好了獻果神君的眼睛，拉近關係。沒想到獻果神君一見到小魚兒的相貌，立刻驚慌不已，口口聲聲喊道：江楓，不要殺我此時山洞外出現一名女子，她雖然帶了食物，卻是為折磨獻果神君、問出燕南天的寶藏而來，至今已十多年。小魚兒出手相助，獻果神君説那女子是“萬人迷”蕭咪咪，還提到江琴與江楓的死有關，無奈後來他警覺。蕭咪咪追蹤而來，獻果神君逃離之時，意外跌落山崖。小魚兒與蕭咪咪鬥智鬥勇，最後還是被摔暈在山崖。

魏無牙發現蘇櫻對小魚兒開始有情，提醒她不要用情過深，免得為情所傷。魏無牙因為蘇櫻失去內力，便送天蠶絲甲、火槍、暴雨梨花針筒以及臭鼬彈給她防身。小魚兒昏迷醒來，竟發現身處所謂的“銷魂宮”。這裏是蕭咪咪的皇宮，她是皇上，擁有眾多嬪妃。這裏有個鬼祟的人：江玉郎。江玉郎急報蕭咪咪有人殺入，趁其不備鑽入早已挖好的地道，小魚兒要挾隨後。沒想到這個江玉郎竟是個及其會隱忍的人，他在這裏呆了一年，如今才殺死那些嬪妃，得此機會，接下來要做的竟是等，等蕭咪咪離開。張菁採納鐵戰的建議，有意選婿。她向花無缺表達愛意，竟遭其婉拒。知其所愛竟是鐵心蘭，張菁更是妒火中燒。她設下忠義陷阱逼迫鐵戰殺鐵心蘭，幾經周折，鐵戰自盡而亡，他請花無缺帶鐵心蘭找小魚兒，留下玉佩為證。地道下的小魚兒和江玉郎被蕭咪咪發現，兩人絕處逢生竟尋得地下密道，找到歐陽亭的密室。據説歐陽亭是一百年前的絕頂高手。這裏有他的寶藏、兵器等等。他們開始搜寶，江玉郎説出自己父親是江別鶴威脅小魚兒，可小魚兒何其精明，江玉郎佔不得半點便宜。

江玉郎無奈交出特意藏起的“玄陰魔功”秘籍，兩人正相鬥心機，不料蕭咪咪殺來，為了懲罰他們，為他們戴上無法解開的“痴情鎖”，並搜走了“玄陰魔功”秘籍。蕭咪咪大意之下，中了藏寶室的機關。小魚兒搜走秘籍和江玉郎逃出。偶遇惡賭鬼軒轅之光，小魚兒為查明身世，謝絕惡賭鬼的好意，自願隨江玉郎去宜昌。路上惡賭鬼一路照應，幫他化解了幾次生死危機。江別鶴趕來，他憑藉高深的武功贏了與惡賭鬼賭局，惡賭鬼離去，小魚兒跟着江別鶴來到他的住處，想好好查探一番。老狐狸幫他解了痴情鎖，明裏放任他查探，其實對小魚兒早有防備，兩人暗鬥心機，説話半真半假，相互試探。老狐狸聲稱江楓是自己的恩人，為使小魚兒消除對自己的戒心，在表面上做足了功夫。

江別鶴引小魚兒見自己假裝瘋癲的岳父段合肥，説是這個人可以幫助他查出身世。老人暗示小魚兒三更時分來找，説出偽君子江別鶴便是江琴，並且他有可能就是害死江楓的兇手，小魚兒還有個肚子上有疤的孿生兄弟，移花宮、魏無牙等人都是他查探的關鍵。江別鶴在外偷聽了許久，後命江玉郎密切注意小魚兒。小魚兒遵段合肥的意思，在妓院裏拿到藏在玉觀音裏的“南天寶藏”，這些動作都騙不了江別鶴，小魚兒也深知這點。江別鶴特地借段合肥大壽之日，邀請各路武林人士，他殺了段合肥、又在賓客酒裏下毒，這些罪過，通通被推到小魚兒身上。小魚兒引起公憤，眼看就要喪命，花無缺及時趕來，強行帶走了他。此時蘇櫻也尋他而來。小魚兒驚知鐵戰已死，鐵心蘭被交付與他。他急忙撇清關係，誰料此時花無缺又提出決鬥，不忍下手時，邀月又前來逼迫，危機之時，鐵心蘭竟當眾蜕去衣服，抱住花無缺，花無缺只得不動，為她遮羞。小魚兒跳入大海逃生，想到鐵心蘭的種種，愧疚不已。

小魚兒在海中昏迷，幸被以三當家為首的一路商人所救，而小魚兒卻因為鐵心蘭的事意志消沉，不吃不喝，通過努力做苦工來麻痹自己。蘇櫻不忍他繼續這樣，派人對他百般羞辱，終於始他動了真火。此時，小魚兒仍是心煩意亂，不想學蘇櫻的武功。鐵心蘭因為花無缺執意殺小魚兒和那天自己的脱衣舉動，對花無缺冷淡。無缺傷心不已，激動之下，撞傷自己。沒想到卻因此得到鐵心蘭的真心表白，深深為之感動。這邊，女王張菁有了心魔，她聽從大臣建議，出宮向一位神秘女巫阿哄求助。歷盡辛苦，她進入“白神洞”，找到阿哄。張菁為報復花無缺的負心，竟願付出更大的代價。

蘇櫻為使小魚兒學“移花秘技”費盡心思，但小魚兒仍不領情，回來路上竟發現江玉郎有陰謀。張菁街上發現買藥的鐵心蘭，便尾隨其後，在給無缺的藥裏下了讓人忍受萬劍穿心之苦的“穿心降”。張菁告訴心蘭：必須讓無缺十天之內對她死心，否則便會腸穿肚爛而死。三當家帶小魚兒去見“馬婆婆”，原來這位便是段合肥的老伴，她當初看出江琴的為人，被迫出走，便在此安身。他見小魚兒的相貌，便猜測他是江楓之子。

邀月抓了小魚兒，又命花無缺進行生死決鬥。花無缺領命後，為不讓鐵心蘭擔心，故意氣走她，自己更是痛苦萬分。他覺得自己越來越無法對小魚兒下手了。決鬥之時，蘇櫻和三位惡人師傅趕來，再加上花無缺的有心放水，小魚兒再次逃脱。小魚兒知道燕南天被鬼醫醫好，現已出谷，便藥倒四人，孤身去找燕南天查身世。他路遇無缺，兩人對決鬥之事都是滿心痛苦。花無缺答應給他三月時間找燕南天查身世，並許諾以後若殺了他，自己也不會活，兩人兄弟情誼盡顯。

燕南天路遇花無缺，見他相貌酷似江楓，兩人有了一面之緣。燕南天為尋段合肥找到江別鶴，竟向他打聽江琴下落。江別鶴唯恐燕南天查出自己，幾次暗算不成，竟引他進入移花宮，使得邀月和燕南天大打出手，兩人定下花無缺與小魚兒比武結束恩怨的約定。女王張菁招江玉郎為婿，江玉郎為了權利名利，跟隨她進入車月國。不想他看到為父守孝的鐵心蘭，起了歹心，被女王撞見，與鐵心蘭一起被祭海，這些事情使腹有胎兒的張菁心灰意冷。鐵心蘭被人所救，逃離車月國。小魚兒在找燕南天的途中，又遇蘇櫻，但他不理蘇櫻的勸阻，執意決鬥之事。

蘇櫻以結拜姐妹之名，取得鐵心蘭的隨身玉佩，帶她到龜山，以此要挾無缺。無缺中計中毒，苦不堪言。這邊燕南天帶江別鶴到處找小魚兒，但為救江玉郎假扮的小魚兒耗盡內力，被江別鶴暗算，搜走南天秘籍。蘇櫻為使小魚兒的武功提升，逼花無缺寫出移花秘技口訣。花無缺清毒後，同樣逼迫蘇櫻交出口訣，最後被魏無牙藥倒。

小魚兒及時趕到，救回燕南天，燕南天身負重傷，卻用心教導他“南天劍法”，最後不支死去。小魚兒趕至移花宮，追究燕南天所説的“秘密”，但邀月未答應。此時，未就魏無牙綁架的花無缺，兩人結伴同行。路上，邀月想念江楓，對小魚兒態度有些改變。兩人進入魏無牙設的密室陷阱，眼看無論可逃。小魚兒用計氣出魏無牙，魏無牙也同是由愛生恨之人，他對當年復仇的計劃幾欲脱口而出，又對邀月出言輕薄，邀月惱怒之下殺了他。

小魚兒和邀月被困密室，蘇櫻尋到密室外，她放了花無缺和鐵心蘭，三人同心要鑿開石壁。密室內，小魚兒出於好心，照顧邀月，邀月心中不是滋味。此時，江別鶴練“玄陰魔功”，苦於無進展，竟按照邪法殺了江玉郎，吃“親子之肉”練功，果然功力大進。三人鑿開密室，邀月雖然對小魚兒有點好感，卻仍放不下情仇，堅持他們的決鬥。面對蘇櫻的懇求，小魚兒無法答應，只好狠心將她氣走。小魚兒又遇惡人谷的師傅們，與鬼醫説了燕南天的死訊，鬼醫唏噓不已。蘇櫻為了小魚兒，竟不惜想用計毒殺無缺，幸被小魚兒識破，無缺知她用情至深，對她無絲毫怪罪。翌日，白衣花無缺與黑衣小魚兒開始了邀月期待二十年的生死決鬥。小魚兒因習得南天劍法，與花無缺斗的難分難解。

蘇櫻發現鐵心蘭服毒欲自殺，更驚知花無缺已存死志。蘇櫻穩住她毒勢，再前去找小魚兒，誰知小魚兒已甘願生生受了花無缺一掌後死去。移花宮主邀月終於得意地揭開了隱藏二十年的陰謀，花無缺悲憤難已，正欲自絕，不想鬼醫竟出口阻止。原來小魚兒事先服下了可以使人假死的藥物瞞天過海，邀月計劃失敗，失魂落魄，怔在當場。眾人返回救治鐵心蘭之後，便各有去處。四大惡人和蘇櫻遇到江別鶴，三人死亡，鬼醫逃走，蘇櫻墜下山崖。江別鶴魔功已成，便要剷除移花宮，稱霸武林，逼的邀月自盡。鬼醫拼着最後一口氣將此事告知小魚兒，小魚兒兄弟二人要殺江別鶴為武林除害，但是差距實在太大。此時江玉郎的鬼魂出現，嚇得江別鶴魂不附體，終於被殺。原來這個江玉郎就是幸未死去的蘇櫻所扮，小魚兒與她終於冰釋前嫌，鐵心蘭和無缺都為之欣慰。