Audrey (Emily Rose) bleibt in Haven, um etwas über ihre eigene Vergangenheit herauszufinden. Ein altes Foto in der lokalen Zeitung zeigt eine Frau, die ihre Mutter sein könnte. Mit Nathan (Lucas Bryant) stößt sie auf den nächsten seltsamen Vorfall in der Stadt. Die beiden untersuchen die anscheinend unspektakuläre Zerstörung einer Bar. Doch als sich weitere merkwürdige Geschehnisse häufen – und auch Audrey davon betroffen ist – müssen die beiden versuchen, so schnell wie möglich die Verbindung zwischen den Vorkommnissen herauszufinden. Wer oder was ist dafür verantwortlich?

Ein mysteriöser Verbrecher mit einer überraschenden Bindung zu Haven, kehrt in die Stadt zurück, um sich an Chief Wournos zu rächen. Währenddessen ringt Audrey mit einer schockierenden Enthüllung über sich selbst und die Stadt Haven droht zusammenzubrechen. Nathan findet die Wahrheit über seinen Vater heraus und als eine FBI-Agentin auftaucht, die sich als Audrey Parker vorstellt, ist die Verwirrung perfekt.

Die biblischen Plagen suchen Haven heim. Doch Audrey (Emily Rose) hat noch mehr Probleme: Eine mysteriöse Frau behauptet, sie wäre die echte Audrey. Nathan (Lucas Bryant) trauert noch immer um seinen Vater. Währenddessen setzt Reverend Driscoll (Stephen McHattie) seine dunklen Pläne in die Tat um, die Kontrolle über Haven an sich zu reißen. Dabei sind ihm Audrey und ihre Freunde ein Dorn im Auge.

Ominöse Energieentladungen töten einige Bewohner Havens. Audrey (Emily Rose) und Nathan (Lucas Bryant) wollen der Entstehung der Energieblitze auf den Grund gehen. Unerwartete Hilfe bekommen sie vom mysteriösen ‚Cleaner‘ Dwight (Adam ‚Edge‘ Copeland), der versucht, übernatürliche Phänomene zu vertuschen. Duke (Eric Balfour) entschließt sich dazu, die Hilfe seiner Ex-Frau anzunehmen, um sich vor seinem tätowierten Verfolger zu schützen. Beverly Hills 902010-Star Jason Priestley gibt sich in dieser Folge ebenfalls ein Stelldichein.

An Havens Küste wird ein toter Mann angespült. Bei ihren Untersuchungen stoßen Audrey (Emily Rose) und Nathan (Lucas Bryant) auf eine gefährliche Gemeinschaft, die ein dunkles Geheimnis hütet. Unterdessen bittet Duke (Eric Balfour) Evi Ryan (Vinessa Antoine) um Hilfe, herauszufinden, was Ed Driscoll (Stephen McHattie) über den Tod seines Vaters weiß.

In Havens Polizeipräsidium bricht eine tödliche Seuche aus. Sofort stellt der neue Polizeichef die Station und alle, die sich darin aufhalten, unter Quarantäne. Auch Audrey (Emily Rose) und Nathan (Lucas Bryant) können sich nicht mehr in Sicherheit bringen. In einem Wettlauf gegen die Zeit versuchen sie, den Verursacher der Krankheit zu finden.

In Havens Wäldern verschwindet ein Kind spurlos. Gemeinsam mit einem Suchtrupp brechen Audrey (Emily Rose) und Nathan (Lucas Bryant) in die Wildnis auf, um den vermissten Jungen zu suchen. Plötzlich treffen sie auf Reverend Driscoll (Stephen McHattie) und seine Anhänger. Sie verfolgen eigene dunkle Pläne und schnell wird es für Audrey und Nathan äußerst brenzlig.

Als Haven von rachsüchtigen Geistern heimgesucht wird, stachelt Reverend Driscoll (Stephen McHattie) seine Anhänger dazu an, Einwohner mit übernatürlichen Fähigkeiten zu töten. Nathan (Lucas Bryant) und Duke (Eric Balfour) treffen auf ihre Väter. Als alte Konflikte wieder aufflammen, erfährt Nathan, dass Audrey (Emily Rose) niemals ihre Bestimmung erfüllen kann, wenn sie beide zusammen sind.