大街上有人卖身，恶通天仗势欺人，被小鱼儿设计作弄了一番。京城正举行一场盛大的婚礼，朝中兵部尚书的女儿，也是大太监刘喜的干女儿出阁，热闹非凡。喜堂上，花无缺突然硬闯进来，责新郎胡卓是个负心汉，打斗起来，花无缺武功超群，轻松取胜，强行带走新郎，回移花宫受审。移花宫的邀月、怜星两位宫主吩咐花无缺上黄山赴武林大会，她们不满武林大会竟不邀请移花宫，心有不忿，要花无缺去夺盟主之位，另派花星奴暗中跟踪。小鱼儿也到了黄山，途中结识了女扮男装的铁心兰。

铁心兰来武林大会想找失踪了的父亲铁如云，可是铁如云并没有出现。铁心兰以为没有人认出她女扮男装，又自以为武功高，决心要去杀采花贼，却差点被采花贼占了便宜，幸得花无缺路过救了她。小鱼儿在第一回合的武功较量上，败给了花无缺。但机缘巧合之下，小鱼儿用计侥幸收服了采花贼，胜了第二回合，暂时跟花无缺打成平手。小鱼儿绞尽脑汁想见红叶先生，问明自己的身世，他半夜打晕红叶先生并偷看了他的手折。为选新任武林盟主的比武擂台上，铁心兰阴差阳错胜了第一轮，引来江别鹤的杀心。

江别鹤终于如愿暂代武林盟主，花无缺动身回移花宫。铁心兰要继续寻找父亲，小鱼儿出主意去慕容世家查探。江别鹤拜访老红叶先生，想打探花无缺的身世，老红叶先生悠悠讲出一段江湖隐秘。玉面剑客江枫与仁义剑客燕南天是拜把兄弟，十八年前，他俩联手剿灭恶名昭彰的十二凶星帮，受伤中毒，江枫机缘之下被移花宫的大宫主邀月所救。邀月钟情于江枫，不料江枫却爱上了伺候他的花月奴，两人私奔前往江枫的书童江琴家落脚，并飞鸽传书请燕南天来相助。花月奴诞下一对儿子，但两夫妇惨被江琴出卖，邀月、怜星来到，杀了江枫和花月奴。[

邀月本想把一对婴儿也杀掉，但怜星不忍，便想出一法，把其中一婴儿养大，另一交燕南天抚养，待十八年后，要两兄弟自相残杀，以报复对江枫之仇恨。老红叶揭穿江别鹤就是当年的江琴，并向他敲诈一百万两，江别鹤应允。当年，燕南天中了剧毒，抱着遗孤去恶人谷，求救于鬼医常百草。燕南天体内的毒性奇特，常百草兴奋接受挑战，收留并研究昏迷的燕南天。屠娇娇母性大发，决定抚养弃婴，就是小鱼儿。

小鱼儿和铁心兰逃出慕容家墓，小鱼儿乘机偷了陪葬的玉蝉、软甲，并吃了几口火灵芝。小鱼儿为保护铁心兰身受重伤，苏樱施针相救。小鱼儿与铁心兰启程去江家，欲查问铁如云下落。江别鹤的女儿江玉凤自小师从南海神尼学武，今学成回家。弱质女子江玉燕母亲死前告之身世，嘱她拿信物香囊去找亲父江别鹤。江玉燕途中惨遇坏人，幸得花无缺救出，玉燕对无缺心生倾慕之情。

江别鹤的女儿江玉凤自小从南海神尼学武，今学成回家。原来铁如云仍在江府之中，本来刘喜派人来接收的，可是铁心兰正在江家，不方便接收。江别鹤便将计就计，向小鱼儿等人称自己有一个恩人，正被追杀，江别鹤欲救之，但碍于刘喜是他的干外父，不方便出手，恳求小鱼儿和花无缺帮助他把恩人运出府外。小鱼儿与花无缺不虞有诈，答应江别鹤要求。小鱼儿与无缺成功运送那「恩人」出府，却不知此「恩人」原来就是铁如云！

花星奴为两宫主送信来给花无缺。铁心兰得知无缺两位姑姑邀她回移花宫，便追问无缺，信里写了些什么，有没有提到她？带她回去的原因？回去干吗？……无缺总是摇头说不知道。铁心兰会错意，以为两姑姑邀她回去，是因为她与无缺的关系。但邀月和怜星其实是想把铁心兰杀掉，免得无缺被她弄至心绪不宁，神魂颠倒。花无缺、铁心兰、花星奴离开江府，上路回移花宫。小鱼儿觉得事情有可疑，担心义妹，便悄悄跟着去。

邀月认出小鱼儿的恶人谷武功，知道小鱼儿是江枫儿子，故暂时不杀小鱼儿，要让他和花无缺两兄弟将来自相残杀。铁心兰被邀月所伤，唯有慕容家的火灵芝才能救她。花无缺本想跟小鱼儿去救心兰，但最后却不想忤逆至亲的怜星宫主，决定留下。小鱼儿大骂花无缺懦弱，怒不可遏，掴花无缺。恶人谷里，五大恶人见小鱼儿走了那么久，难道真有逃离恶人谷之法？五恶尝试逃走，最后只得屠娇娇成功出来，找小鱼儿不果。后来她发现外家上下全被杀害，屠家的宝物「六壬神骰」也不见了。屠娇娇发现凶器乃一有飞鹰图案的飞镖，此图案乃慕容家专有。慕容家的家墓秘道已封，罗能也不知所踪，小鱼儿只好扮作女人，假装「卖身葬父」，以混入慕容家，做了婢女，化名「小喇叭」。另一方面，屠娇娇亦扮佣人混入了慕容家，欲找寻宝物「六壬神骰」，竟遇上刚巧也混入了慕容家的小鱼儿。

江别鹤正想依计对付铁心兰、小鱼儿和花无缺，苏樱突然找上门来。江玉燕嫉妒铁心兰，企图暗下毒手，幸好苏樱及时赶到。慕容府里，慕容中、慕容正垂涎「小喇叭」的美色，却发现竟是男儿身，大怒。慕容仙及时现身，救了小鱼儿，原来她早就知道小鱼儿是假扮女子，之前只是戏弄小鱼儿而已。慕容仙准许小鱼儿穿回家丁服装，但小鱼儿却被两位公子作弄以报复。慕容仙遗失了一颗「夜明珠」，小鱼儿与她一起寻找。夜里的山野上，四周满是萤火虫，很浪漫，过程中，二人初萌爱意。

小仙女突然寒毒发作，小鱼儿允诺为她保密。屠娇娇和小鱼儿为找「六壬神骰」夜探密室，却被家丁发现。屠娇娇为找「六壬神骰」劫持小仙女，小鱼儿为小仙女差点和屠娇娇翻脸。原来是江别鹤盗走「六壬神骰」嫁祸给慕容家，却打不开其中的机关。刘喜为了修炼吸功大法，要江别鹤去抓七个纯阳纯阴的男女。江别鹤对刘喜隐瞒了「六壬神骰」的事。淑妃回慕容家省亲，识破小仙女对小鱼儿的心思。

铁心兰的掌伤已到危险时期，小鱼儿在回江家的路上碰到苏樱，却不相信铁心兰在客栈内，急匆匆去了江家。江别鹤将计就计将小鱼儿骗入江家，苏樱及时赶来用火灵芝救了铁心兰。花无缺很担心铁心兰，却被邀月禁锢。怜星不忍看他伤心，偷偷将花无缺放掉，让他去看望铁心兰，但之后必须及时回来。花无缺回到移花宫，接受怜星的要求忘记铁心兰。江玉凤拉小鱼儿去茶楼，正遇上前来找他的慕容仙。

江刘氏经常支使下人欺负玉燕，江别鹤一向不满妻子，故对玉燕也生了点同情之心，答应教玉燕武功，但只是教她致命的三招，让她在关键时候可以保命。小鱼儿为救寒毒发作的小仙女，抱着她帮她取暖，让小仙女有了误会，但之后却更加深了彼此的感情。小仙女将小鱼儿带回慕容家接受惩罚，但在淑妃的帮助下得到了慕容无敌的原谅。刘喜为了找会武功的至阴的女子吸其功力练功来到慕容家，与慕容无敌发生了冲突。

刘喜在慕容家嚣张跋扈，目中无人，慕容无敌深夜去试探刘喜的武功，险遭刘喜毒手，幸得淑妃出手相救。刘喜弄权，陷害贤臣，淑妃想劝皇上却无能为力。小仙女跟着小鱼儿去红叶山庄，途中被东厂掳走，关进死亡塔。小鱼儿找到红叶先生，打探出死亡塔的消息，前去救小仙女，却被机关所困。

小仙女被困水池，小鱼儿在死亡塔中误打误撞遇到失踪的铁如云，铁如云道破刘喜捉了五名修习纯阳内功的高手，是为了修炼吸功大法的最后一层，并且告诉小鱼儿，武林中很多高手因被刘喜握有把柄为他驱使，自己被注入“迷魂汤”。江刘氏不但纵容下人欺负玉燕，还逼玉燕亲手毁了母亲的灵牌，玉燕恨极。铁心兰依然在江府休养，与江玉燕感情增进，原来江玉燕懂音律，会吹萧。死亡塔内，小鱼儿和铁如云合力打破了墙，巧遇小仙女，恍如隔世。铁心兰和恶通天来找小鱼儿，铁心兰父女终于重逢，此时刘喜率众追来，打斗中铁如云中了毒掌，要铁心兰与小鱼儿等先走。

小鱼儿和小仙女成功逃出，可是铁如云中毒液未能逃出。回到江府，铁心兰一见那幅地图，便昏倒了，原来此乃铁如云的笔迹。小仙女与小鱼儿回慕容家求父亲帮手，慕容无敌不喜小鱼儿，小仙女却维护。铁心兰四出找各门派帮助对付刘喜。刘喜得知小鱼儿救走小仙女，斥责谈天说地。刘喜与太子微服出巡，刘喜诱导太子追求小仙女，引致小鱼儿与太子起了冲突，甚至打斗。慕容无敌要捉小鱼儿上殿，小仙女却维护他。后来太子死了，刘喜乘机诬害小鱼儿和慕容家。

刘喜诬告慕容家造反，当场杀了慕容中、慕容正，小鱼儿救走小仙女，但慕容无敌却被捕。慕容无敌被判抄家、处死，淑妃贬为庶民，小仙女被通缉。小鱼儿、小仙女和慕容淑劫法场，欲救慕容无敌，却发现是刘喜设的假局。南海神尼出现，牺牲自己以救众人，力战刘喜，终被对方吸功致重伤，而刘喜亦受了伤未能追捕众人。

众人带着重伤的南海神尼逃去，神尼临死前告诉众人，刘喜要在七星连珠之日，以「吸功大法」吸五阳二阴来练神功之阴谋，众人恍然大悟。神尼死了，慕容淑与玉凤十分伤心，运师父尸体回南海安葬，小鱼儿和小仙女则逃回江府暂时栖身。小鱼儿与小仙女翌日发现慕容无敌尸体高挂于城墙，小仙女悲恸不已，痛不欲生。刘喜带人马到江府拿人，小鱼儿与小仙女从后门逃走，后来混入一个杂技团之中，竟重遇恶通天。

小鱼儿和小仙女暂投靠杂技团以藏身，避开刘喜耳目。杂技团生活艰苦，小仙女丧父心痛，小鱼儿想尽办法开解、鼓励她，二人感情大进。巫手巫脚发现二人，欲杀之，慕容淑现身救出二人。

小鱼儿三人自动找上门想借机刺杀刘喜，反中了刘喜的奸计被擒。七星连珠之日，眼看刘喜已经吸了五阳一阴，正要吸最后一个小仙女的武功。花无缺突然现身，成功救了小仙女和小鱼儿，可是小仙女已被吸了九成的武功，急剧衰老，不久人世。众人无奈暂到江家落脚，小鱼儿四处寻找苏樱来救小仙女。苏樱心系小鱼儿，踌躇要不要现身，经过母亲一番开导，豁然开朗。苏樱看过小仙女也束手无策，回天乏力。

苏樱以昙花毒让小仙女恢复一天的青春，小仙女与小鱼儿成亲，珍惜生命最后一天，翌晨在小鱼儿怀中死去。刘喜回宫，计划对付移花宫。花无缺和铁心兰在街边小吃铺遭江别鹤暗算，花无缺中毒目不能视，在江玉凤的帮助下二人奋力逃脱。铁心兰带花无缺回到移花宫，以死求得邀月、怜星救花无缺。花无缺知道后痛不欲生，想自尽被邀月制止。

小鱼儿得知铁心兰之死，大骂花无缺。小鱼儿自暴自弃，终日借酒浇愁，想要一死以求解脱，闯入“毒王群英会”自愿试毒。小鱼儿服下众家独门巨毒，苏樱突然出现，成功解去小鱼儿身上之毒，夺得“毒王之王”称号。五毒老祖不忿，以「彩虹七色瘴」毒害小鱼儿。苏樱想给小鱼儿解毒，但小鱼儿一心求死拒绝而去。

苏樱路遇歹人，幸得小鱼儿所救。经过苏樱劝解，小鱼儿终于振作，不再寻死。苏樱开了排毒药方给小鱼儿，却被糊里糊涂的恶通天放错了药引。五天过去了，小鱼儿中的毒却仍然没有好转，苏樱只好带小鱼儿向母亲求医。可惜连苏樱的母亲苏如是亦无法解「彩虹七色瘴」的毒，只能以「神奇种子」暂时续其命。苏如是说，世上只有鬼医常百草能救小鱼儿。苏樱与小鱼儿遂往恶人谷，向常百草求医，但常百草一见「神奇种子」，便拒绝救他……

原来常百草与苏如是曾有过节，二人立誓不会接手对方医治过的病人。常百草灵光一闪，想到以小鱼儿之毒攻燕南天之毒，或可同时救活二人。苏樱为常百草找个借口，劝常百草医治燕南天。常百草终于答应，结果真的成功同时救活小鱼儿和燕南天，但燕南天却失忆了。常百草突然发现苏樱可能是自己的亲生女儿，决定帮燕南天恢复记忆后跟苏樱一起回去找苏如是。五大恶人甚喜欢苏樱，亦知道苏樱对小鱼儿有意，于是设计迫小鱼儿跟苏樱成亲。

小鱼儿答应娶苏樱，但又对小仙女未能忘怀，心情十分矛盾。苏樱对小鱼儿说，她不要一丝的施舍和勉强，随即离去。燕南天突然狂性大发，逼问四大恶人自己的身世，于是他们骗燕南天去京城找刘喜。小鱼儿得知后决定去找燕南天，常百草也要离去找苏氏母女，小鱼儿说服四大恶人与自己同赴京城。在京城，众人遇到神智混乱的燕南天，赶在刘喜带人来之前离去。

刘喜令江别鹤和红叶去查疯汉的底细。江别鹤想起此人很可能是燕南天。红叶找江别鹤联手对付刘喜。小鱼儿一行找到苏如是家，苏如是一见常百草却大发脾气，经过小鱼儿一番劝解两人终于言归于好。刘喜从红叶处得知燕南天的下落，派精锐部下前往。其实是红叶有心令刘喜离开京城，好设计迷惑当朝皇上。

红叶设计，先下药令皇上得了不眠症，再令皇上相信江玉凤是他的守护女神。江别鹤软硬兼施要玉凤进宫为妃，玉凤想着小鱼儿，黯然神伤。刘喜到毒王谷抓燕南天，众人不敌，五大恶人被他重伤，危急下苏如是带大家跳入浮沙池，原来这是她提前准备好的秘洞。恶通天出洞找水，结果被刘喜所杀。江玉燕偶然想到胡曲可能是开启“六壬神骰”的钥匙，可仍然没能打开“六壬神骰”。经过一番琢磨，玉燕打开了“六壬神骰”。江别鹤喜不自胜，马上开始修炼其中的神功，不料却走火入魔体内生出剧毒，命在旦夕。

江别鹤找红叶问询解毒方法，红叶告诉他，想活命，须将毒素转嫁给他的血亲。江别鹤为了保命，将毒素转嫁给玉燕，玉燕容颜尽毁。正当玉燕痛苦万分，恰遇苏樱，苏樱给玉燕解了毒。皇上封玉凤为妃，玉凤为了家人答应入宫。玉燕巧言骗玉凤到荒郊野外，偷袭杀死了玉凤。苏樱回到家，只赶上见父亲最后一面。玉燕谎称玉凤离家，向江别鹤建议由自己代替入宫。关外，一个游牧部落意外救了毒发倒地的花无缺。

塔卡公主的比武招亲大会上，无缺出手并获胜，但对公主表示只为报恩不能娶公主。塔卡公主为了昆仑百姓的生活，决定去中原请求皇帝减轻岁贡，在众人的请求下，无缺答应陪同公主同赴中原。玉燕回家归宁，江别鹤戳穿她杀死玉凤的事实。玉燕仗着皇上的宠爱，将江别鹤赶到西陲边疆。玉燕夜访红叶，要他联手对付刘喜，红叶建议引小鱼儿对付刘喜，坐收渔翁之利。玉燕来到毒王谷，假借感谢苏樱，极力说服小鱼儿进宫。

小鱼儿与苏樱随玉燕进了宫。小鱼儿不但设计戏弄了刘喜一番，还偷了他的“宝贝”以威胁他。昆仑部落来朝，提出三个难题，要求若是无人能解，便减半他们的岁贡。小鱼儿解了第一题，约定翌日再比。小鱼儿想不透无缺为何成了昆仑驸马，无缺也不解小鱼儿为何与玉燕同在宫中。第二天比试小鱼儿再胜。

小鱼儿连胜三场，皇上龙心大悦。塔卡自觉无颜回去见昆仑百姓，想服毒自尽，被无缺阻止。小鱼儿向皇上进言减轻昆仑的岁贡，刘喜却诸多干涉。为了帮助花无缺，玉燕向苏樱求得一种奇药，假装怀孕，连刘喜也识不破。皇上得知玉燕有喜，对她更是专宠。刘喜找红叶打探消息，他前脚走，红叶即向玉燕汇报。玉燕称梦见神仙警示，要皇上减轻昆仑的赋税，皇上应允。

刘喜派人搜集玉燕与无缺私相授受的证据，想以此对付她。玉燕先下手为强，假装示好邀请刘喜和丽妃一同吃点心，服毒陷害丽妃，龙颜大怒。红叶告诉刘喜，世上有一种奇药能令女子有假喜脉，但服了此药每月必有一天假喜脉会消失。刘喜正要对玉燕下手，小鱼儿和无缺等人出现，玉燕故意被刘喜挟持助他逃走。无缺答应留下，塔卡独自回昆仑。

玉燕扮成心兰向无缺表白，被无缺拒绝。苏樱苦心研究治愈燕南天失忆症的方法，向玉燕借宝石利用光线折射刺激燕南天。燕南天想起片断，前往移花宫找邀月为义弟报仇，小鱼儿和无缺紧随其后。移花宫内，燕南天、小鱼儿、无缺三人联手仍不敌邀月。燕南天意外发现小鱼儿和无缺是亲兄弟，回忆起了所有前尘旧事。三人逃到心兰绝命的悬崖处，前无去路。邀月发狂，怜星出手制住她，刘喜突然出现偷袭怜星，将二人带回东厂。无缺在悬崖下发现心兰竟未死，原来她被怜星所救。

小鱼儿以为无缺已死，十分痛苦。此时无缺寻来，两兄弟喜极相拥。正当众人开心之际，遇到一位移花宫的小宫女，得知邀月和怜星出事，决定先回皇宫再做打算。玉燕要红叶将江别鹤的秘密告诉小鱼儿和无缺，再去给江别鹤通风报信。果然如玉燕所料，江别鹤来找她求救。玉燕奚落了江别鹤一番，独自研究“六壬神骰”中的绝世神功。江别鹤为了修炼神功，自废武功，成了废人，才知自己被玉燕设计了。玉燕在众人面前上演了一出大义灭亲。

刘喜的吸功大法吸不了邀月的嫁衣神功和怜星的混元内力，只得先将二人囚禁。怜星告诉邀月心兰没死，劝邀月不要再执着于仇恨。玉燕练成嫁衣神功最高境界“移花接木”，到牢房吸取了邀月和怜星的功力。玉燕以神功威胁刘喜听从于自己。

无缺去救邀月怜星迟迟未归，心兰突然临盆。听闻无缺遇险，小鱼儿赶去相救，却中了调虎离山计。玉燕授意产婆抱回心兰的孩子，当成是自己诞下的皇子，骗心兰说孩子夭折。小鱼儿回来，苏樱呆呆傻傻，心兰心痛欲绝。无缺安置好邀月怜星，回来才知道发生了这么多事。

玉燕令刘喜杀了知道真相的太医和产婆。心兰思子过度，日渐憔悴。太医诊断苏樱脑部受了重击，得了失心疯。无缺回移花宫看望两位师父，却看到一群所谓的武林正派正要杀死邀月怜星，无缺忍受侮辱和打骂救下师父。玉燕对心兰说出一切真相，杀了心兰并伪装成她自杀。小鱼儿带苏樱找苏如是求医，可苏如是也束手无策。在小鱼儿的精心照料和终日陪伴下，苏樱终于恢复了记忆。这时刘喜杀来，重伤苏如是。

苏如是重伤不治，临死前小鱼儿答应她照顾苏樱一生一世。刘喜追来，小鱼儿用机关挡住刘喜，带着苏樱逃走。玉燕鼓动皇上立皇子为太子，越发不可一世。玉燕找回受伤昏迷的无缺，无缺醒来，却终日以酒浇愁，浑浑噩噩。江玉燕的野心越来越大，她使皇上昏迷不醒，企图弑君夺位。

玉燕妄想害死皇上，自己做女皇，跟无缺双宿双飞。无缺愤然揭穿她心狠手辣的真面目。玉燕说出皇子就是无缺和心兰的儿子。众人赶来皇宫救无缺，却不敌玉燕的“移花接木”神功，燕南天更被玉燕吸去内力重伤而亡。小鱼儿、无缺、苏樱三人苦思对付玉燕的方法，小鱼儿想出一招同归于尽。在小鱼儿和无缺的逼问下，苏樱说出有一种“毒王圣水”，服下再诱玉燕吸去内力，可致她于死地。在去拿药引“午夜魔兰”时，苏樱不慎被它咬伤中毒。苏樱配制好“毒王圣水”之后，毒发而死。小鱼儿再次失去所爱，锥心之痛令他崩溃。

无缺和小鱼儿抽签决定谁前去找玉燕同归于尽，无缺抽中。喝临别酒时，小鱼儿用麻沸散令无缺不能动弹，自己前往。小鱼儿诱玉燕吸了自己剧毒内力，无缺及时赶来，终于杀死了她。这时小鱼儿已经奄奄一息。花无缺在小鱼儿的天颅穴上刺了一针，为了可以让他活下来。六年过去了小鱼儿没有死但是却和小仙女临死时一样就像个植物人不会说话不会动，花无缺每天都陪着他和他说话，直到有一天下了一阵雨出现了彩虹，奇迹出现了小鱼儿醒了他们兄弟两激动的抱在一起。