“A”のいやがらせにうんざりした4人は不審な送り主からの電子メールや携帯メールをすべてブロックする。しかし正体不明の亡霊を遠ざけたからといって、トラブルの種が尽きるわけではない。4人は本当に”A”をかわし続けることができるのだろうか。

前々から計画してきた“アリソンを偲ぶ会”がいよいよ開催される運びになった。最後の準備に追われる4人の前に、アリソンの兄ジェイソンが現われる。だがジェイソンの目的は妹の追悼ではなかった。

何もかもお見通しの”A”は脅迫だけでは飽き足らなくなったのか、巧妙で危険なゲームを仕掛けてくるようになる。ハンナが自動車事故で入院し、”A”の正体が見え始めた今、4人はこれまでの経緯をおさらいすることにした。そもそも”A”を名乗る人物は、どうやってすべてを知り得たのか。

教師と保護者の面談会で、内緒の恋人と父親が対面する。誰にも相手にされないクラスメートに手を差し伸べる。ライバルの告白に心が揺れる。信じてはいけない相手に深入りする。いずれの場面でも”A”は口を出さずにはいられないらしい。4人にとっては、これが今の日常なのだ。

ローズウッドでは誰もが隠し事をしているが、バレるのは時間の問題だ。捜査当局はアリソン事件の解明に全力をあげ、スペンサーを“重要参考人”と決めつけるが、4人は身近な人物に疑いの目を向ける――心を捧げた恋人は良からぬ思惑を秘めているのでは？

しばらくの間、別々に行動せざるを得なくなった4人だが、今ほどお互いが必要なときはない。一方、ローズウッド高校を去ることになったエズラは最後の授業を終えたあと、会って話がしたいとアリアに迫るが、アリアには何も話すことはなかった。アリアはこのままエズラに別れを告げるつもりなのか。

今日は引っ越しの日。新しい我が家に移るエミリーは、環境になじむことができず疎外感を覚える。心穏やかでないのはハンナも同じだが、その理由はケイレブにあった。ケイレブは相変わらずいかがわしい"ビジネス"に関わっているが、悪びれる様子はまるでない。一方、アリアはエズラとジェイソンの板ばさみにあう。

アリア、エミリー、ハンナ、スペンサーが逮捕されて1ヶ月が経ち、ローズウッドの町と4人の少女たちに大きな変化が訪れていた。彼女たちの関係にはもはや親友とは言いがたい、険悪なムードが漂っている。いったい何が彼女たちをこれほど分裂させたのか？

ハンナが最初から心配していたとおり、"A"の電話の解読に関わったケイレブを"A"は懲らしめることにする。ワイルデン刑事とギャレット刑事は、偽のハッキング行為をおこなったとしてケイレブを告発し彼のコンピュータを没収するが、ハンナと友人たちはこれがいい結果にならないことを確信する。警察はケイレブのコンピュータから何を探そうというのか？

アリソンが死ぬ前に知っていたことを何とか探り出したい4人の前に、生前のアリソンを知る人物が現れ、大きな手掛かりを得る可能性が出てくる。ダンカンは4人が求める答えすべてにつながる鍵を握っているようだが、4人は自分たちのガードを緩めて彼を信頼することができるのか？

母親ヴェロニカ・ヘイスティングスが依頼人としてギャレットを引き受けた裏には、何らかの理由があるとスペンサーは確信する。スペンサーは疑いをもち始めるが、母親がなぜその事件を引き受けたのか、その理由についてはあまり多くのことがわからないまま、もっと大きなヘイスティングス家の秘密を見つけてしまう。

エミリーはマヤを失った悲しみに苦しむだけでなく、“あの夜”誰かが自分に薬を飲ませたこと、そしてそれがペイジにどんな影響を与えているかを知って苦しんでいた。ペイジの機嫌を取り持ち、薬の容器のことを説明しようとしたエミリーは、“あの夜”自分がしたことをもっとよく思い出すことになる。

ネイトとの衝撃的な出来事も過去となった今、楽しいハロウィーンを過ごすことを、4人は楽しみにしている。だが、一度ローズウッドのゴーストトレインに乗車した彼女たちは、子供っぽいハロウィーンの風物詩以上のことに遭遇する。

アリソンの遺体が家族のもとに戻ってきた今、ディローレンティス家はアリソンをきちんと埋葬する準備に入る。そして4人は再び友人に別れを告げる機会を得るのだった。だが、アリソンの失踪以来続いてきたことを考えると、少女たちは追悼式に行くべきかどうかを悩む。

アリア、エミリー、ハンナは、姿を消したスペンサーの居所を探り出そうとする。彼女たちには最近スペンサーが彼女らしくないことはわかっていたが、失踪するほどまでに思いつめていたのだろうか。もしくは”A”が彼女に何かしたのか。彼女たちは、最悪の結末にならないことを願いながら、その答えを求めて必死に捜索する。

ハロウィーン特別エピソード。”A”の新しい隠れ家にあった、アリソンが生きているかもしれないという手がかりを受けて、アリア、エミリー、ハンナ、スペンサーはエドワード朝時代のドレスに身を包み、 不気味な墓地でのパーティに参加した。

アリソンは生きていると考えたア4人は、以前よりもっと疑問が増えてしまう。断片をつなぎ合わせながら、ハンナは、今実際にアリソンの墓に埋められている遺体が誰かわかれば、必要な答えに近づけるかもしれないと思いつく。ところが調査している間も、エミリーはアリソンが生きていることをどう受け止めればいいのかわからない。

“人形の家”から解放されたライアーズたちだが、監禁されていたときに起こったことに大きな影響を受けている。彼女たちを愛し心配する人たちに見守られながら、家に戻った彼女たちは心の傷を癒そうとするが、あまりうまくいかない。容疑者のアンドリューが拘留中であったとしても、アリア、エミリー、ハンナ、スペンサーは不安でたまらない。

監禁によって自分たちの生活をひっくり返されてしまった少女たちは、それぞれがあの辛い経験の意味を理解しようと答えを模索する。アリアはアンドリューがどんな人間なのかを知ろうとし、エミリーは新しい友人と気持ちを通わせようとする。スペンサーは懸命にアリソンとジェイソンからチャールズのことを聞き出そうする。

数多くのショッキングな新事実に苦しめられた数年間が過ぎ、ライアーズたちはようやく"A"の本当の正体を暴くことができた。それから5年後、どうやら、新しい顔、新しい秘密、そして新しいウソが現れる時がきたようだ。ライアーズたちは、ローズウッドを去った時の自分とは違っている。それぞれが自分の道を追い求め、"A"のいない生活に慣れてきた。だが、すべてが始まった場所に連れ戻されるような出来事が起こったなら、彼女たちはいったいどうするのか？人間関係が再び試され、新しい秘密が明らかにされる時、昔の習慣と新しい生活の狭間で悩みながら、ライアーズたちはこの街に留まり、力を合わせていかなくてはならない。

シャーロットの殺人事件の調査が進展し、個人的な生活が浮き彫りになっていくライアーズたち。スペンサーは母親の秘密を知りたい。アリアは自分がエズラの本に深くかかわっていることをリアムに告白する。アリソンは自分とエリオットが友達以上であることを認める。さらに、モナが忠誠を誓う相手とは？ケイレブ、スペンサー、ハンナは新しい複雑な関係を解決できるのか？一方で、エミリーとハンナに衝撃が走り、その脅威が深刻さを増していく。

アリソンが突然得体の知れない危険に見舞われたのち、終わることのない嫌がらせに我慢の限界を超えたライアーズたちは、自分たちで反撃に出ることを決心する。ハンナとケイレブは嫌がらせをする人物と直接対決するための計画を立て、エミリーとスペンサーは、モナが殺人事件に関与しているかどうか調べようとする。アリアとエズラは小説に取り組み続けているが、どうやら予想以上に険しい道のりになりそうだ。一方、アリソンを思いがけない人物が訪ねてくる。