בימים של מלחמת השינובי השלישית, האטקה קאקאשי מקבל את המשימה הראשונה שלו כג'ונין. קאקאשי יוצא למשימה ביחד עם חבריו לצוות; אוצ'יהא אוביטו ורין, והסנסיי שלו; יונדאימה הוקאגה לעתיד. השניים נקלעים לעימות עם שינובי מאיווגאקורה, וקאקאשי חושף את ה"צ'ידורי" - הג'וטסו המקורי שלו. קאקאשי נכשל בהריגת השינובי, שנהרג בהמשך על ידי הסנסיי שלו. יום למחרת, קאקאשי, אוביטו ורין נקלעים לעימות נוסף עם שינובים מאיווגאקורה, ואלה מצליחים לקחת בשבי את רין. קאקאשי מתכווח עם חברו לקבוצה, אוביטו, על פעולתיו של שינובי בזמן מלחמה. לבסוף, אוביטו מחליט ללכת להציל את רין, עם או בלי עזרתו של קאקאשי.