Naruto est dépassé par la maîtrise des 5 éléments et se fait prendre au piège. Pendant ce temps Sora se bat avec un homme et dévoile ses pouvoirs.

Naruto réussit à raisonner Sora et leur combat prend fin. Pendant que Konoha se reconstruit, deux membres d'Akatsuki, Hidan et Kakuzu, font leur apparition.

Le combat de l'Akatsuki contre l'équipe Asuma commence. Hidan dévoile son secret : son immortalité.

Kakashi et l'équipe 8 découvrent la cachette d'Orochimaru pendant que Naruto commence son entraînement avec Jiraya qui consistera à combiner son affinité fūton avec l'affinité suiton des crapauds.

Des Zetsus blancs attaquent l'unité de Shikamaru et un étrange garçon fait pleuvoir. Ils reconnaissent le jeune garçon nommé Yota. Shikamaru, Chôji et Ino se rappellent que Chôji avait lancé ses kunais mais ne les retrouvait pas : Yota est accroché à un arbre par les kunais de Chôji, ils le libèrent. Son estomac gargouille et ils lui donnent leur déjeuner. Sakura les suit et rencontre Yota.