Naruto stellt sich den angreifenden Ninja aus Kirigakure entgegen. Obwohl sie Hotaru in ihre Gewalt bringen wollen, ist ihr eigentliches Ziel Utakata. Dabei soll Hotaru nur ein Druckmittel sein, damit Utakata sie nach Kirigakure begleitet. Tsurugi, ein Oi-Nin erscheint und möchte statt zu kämpfen Verhandlungen mit den Shinobi aus Konoha anstoßen.

Obwohl es im Training mit Fukasaku für Naruto immer wieder Rückschläge gibt, trainiert dieser mit voller Begeisterung weiter. Dieser Übereifer überrascht selbst Fukasaku. Zudem sieht er viele Parallelen zu seinem früheren Schüler Jiraiya. Jedoch konnte Naruto, im Vergleich zu seinem ehemaligen Sensei, die Senjutsukontrolle schneller erlernen.

Pain schwebt über Konohagakure und aktiviert das Shinra Tensei. Dadurch zerstört er das ganze Dorf mitsamt seinen Bewohnern. Kurz nach der Explosion erscheint Naruto gemeinsam mit Fukasaku, Gamabunta, Gamaken, Gamakichi und Gamahiro. Erst nach einiger Zeit erkennen sie, dass der Krater, in welchem sie sich befinden, einst Konohagakure war.

Gemeinsam mit Sakura und Team 10 ist Naruto auf der Suche nach dem „Vermächtnis des vierten Hokage". Dieses Relikt, so lautet es, soll seinem Finder große Macht verleihen. Was die jungen Ninja allerdings nicht wissen, die Geschichte wurde von Maito Guy erfunden, welcher den jungen Ninja eine Lektion erteilen möchte.

Naruto soll so lange hingehalten werden, wie es nur möglich ist. Denn der junge Shinobi soll nichts vom Krieg in Konoha mitbekommen. Hierfür wird eine geheime Mission erfunden. Bei dieser soll eine Armee aus riesigen Tieren der Insel gebildet werden. Währenddessen besprechen die fünf Kage die weitere Vorgehensweise im Kampf.

Hoichi, der Bunpukus Weisheit studiert hat, lockt Gaara und Fuu in eine Falle. Nach und nach verlassen ihre Dämonen ihre Körper.

(* Filler-Folge gemäß animefillerlist.com)

Sasuke findet den Waffenhändler, in dessen Dienst einst ein Kämpfer mit besonderen Fähigkeiten stand. Kann er das Rätsel der menschlichen Bomben lösen?