나루토: 옛날 나뭇잎 마을을 습격했던 구미가 몸속에 봉인되어 있는 나루토를 마을 사람들은 가까이하기를 꺼려했기 때문에 늘 외톨이로 지내던 나루토는 자주 숲속에서 홀로 훈련을 하고 있었다. 어느 날 한 사람이 나루토에게 다가오는데...

히나타: 히나타 일족의 장녀로서 3살 생일을 맞은 히나타는 그곳에서 네지와 처음 만나게 되는데...

사스케: 어린 시절 형 이타치와 함께 놀고 싶었던 사스케는 어느 날, 아버지와 어머니가 하루 집을 비우게 되어서 형 이타치와 단둘이 지내게 되는데...

사쿠라: 내성적인 사쿠라는 홀로 지내는 시간이 많은 말수가 적은 여자아이였다. 유일한 친구 이노가 그런 사쿠라에게 어떤 선물을 건네주는데...

가아라: 자신의 탄생과 동시에 어머니를 잃은 데다가 몸속에 미수를 품고 있는 가아라를 마을 사람들은 가까이하기를 꺼려 했다. 하지만 그런 가아라를 어머니처럼 돌봐주는 야사마루가 있었는데...

사카마루: 무슨 일이든지 '귀찮아'로 정리해버리는 시카마루는 쵸지와 절친으로, 수업이 지루해진 시카마루는 쵸지에게 장난을 친다. 그 와중에 나루토도 합류하여 함께 복도로 쫓겨난 장난꾸러기 3명이 하나로 뭉치게 되는데...

지라이야: 어린 시절부터 엉큼했던 지라이야는 여자 목욕탕을 훔쳐보거나 츠나데의 관심을 끌기 위한 작전에 오로치마루를 끌어들인다. 나뭇잎 마을의 전설의 3닌자라고 불리기 전 3명의 이야기.

카카시: 카카시는 아버지 사쿠모가 죽은 뒤 혼자서 살고 있었는데, 닌자로서의 실력이 월등히 뛰어난 카카시에게 흥미를 느낀 린과 오비토는 그의 뒤를 몰래 따라가본다. 하지만 카카시는 그저 멍하니 지낼 뿐 무슨 생각을 하고 있는지 알 수가 없는데...