各战场由于白绝而陷入混乱之中。鹿丸的部队为了避免同伴之间自相残杀而无法移动身体，医疗部队也为了防止白绝的入侵而无法治疗伤员。而在宁次所在的战场，正当雏田因为遭到变化成自己人的白绝攻击而陷入性命攸关的危机时，鸣人终于到达了那里。由于鸣人抵达了各个战场，忍者联合军借助他的感知能力而接连打倒了白绝。正当忍者联合军因为形势逆转而士气高涨之时，谁也没有注意到某个人物因为秽土转生之术而复苏了…

在我爱罗和大野木面前出现的秽土转生体正是“宇智波斑”。既然真正的斑出现了，那么那个面具男又是何方神圣……正当陷入更深谜团的鸣人他们因此而混乱之时，斑开始发动了攻击。开始迎击的鸣人、我爱罗、大野木等人由于在之前的战斗中有所消耗而陷入了不利的状况，但他们仍然为了阻止斑而合力迎敌。传说中宇智波最强之力那超乎想象的猛攻迅速扰乱了战场，而在这混乱之中，鸣人究竟能否顺利阻止斑……

斑的力量远远超过了想象。不少的忍者被打倒，就连大野木都身负重伤。鸣人也因耗尽查克拉而陷入无法再凭一己之力战斗的状态。忍者们都丧失了战意，但大野木却仍不打算放弃，他为了在这场战斗中取胜换来和平而重新站了起来。鸣人和我爱罗被大野木的姿态震撼而拼尽全力准备再战，但他们面对的却是斑那毫不留情的冷酷攻击。就在几乎陷入绝境之时，纲手和雷影如同疾风一般现身，当今的五影终于全员集结在同一个战场之上！

被五影托付了胜利的鸣人终于与面具男接触！鸣人的本体与比一同在战场上奔驰，并和面具男对峙，然而此时受到秽土转生操纵的人柱力们开始了袭击。6个人柱力使用恐怖的忍术展开攻击，在那之中，鸣人见到了泡沫的身影，大感惊愕。事实上两人曾在过去有过一面之缘，当时鸣人听说泡沫后来下落不明，而如今他却以秽土转生的姿态出现在鸣人的面前。泡沫究竟是为何而丧命……

鸣人、奇拉比两人与秽土转生的六名人柱力的战斗开始了。六名人柱力每个人都有着相当高的战斗力，再加上因轮回眼连在一起的视野而成为强敌。虽然比从敌人的背后发动快速的攻击，但都被敌人躲过去了。然而此时的鸣人回想起了曾经与自己战斗过的、被黑色的收信器操控的佩恩六道，因而决定采取找到收信器并加以破坏的战术。究竟鸣人和比能否阻止人柱力们的行动呢？

正当鸣人陷入危机时，卡卡西和阿凯赶来了。得到这两人的增援，六名人柱力与鸣人等四人之间的战斗开始产生转机，但危机并没有结束，完全尾兽化的五尾与剩下的人柱力开始朝鸣人他们猛攻。八尾也以完全尾兽化来应战，但是四尾和六尾也完全尾兽化并袭击鸣人等人。当巨大的尾兽之间展开战斗的同时，卡卡西与阿凯也出尽全力与人柱力交手，然而此时鸣人却陷入了性命攸关的危机之中……

被四尾吞掉的鸣人在精神世界与四尾面对面，并作了解开锁链封印的约定。但是听到了四尾“不相信人柱力”那番话的九尾，回想起了过去自己被强行封印至鸣人体内的事情，以及自己心中溢满憎恶心念的过去。但，那同时也是九尾与鸣人一同度过的记忆。至今为止鸣人度过的日子以及战斗的心意和行动都被九尾看在眼里。现在，看见鸣人为了拯救四尾而做出的行动，九尾又想到了什么呢……

被四尾吞掉的鸣人在精神世界与四尾面对面，并作了解开锁链封印的约定。但是听到了四尾“不相信人柱力”那番话的九尾，回想起了过去自己被强行封印至鸣人体内的事情，以及自己心中溢满憎恶心念的过去。但，那同时也是九尾与鸣人一同度过的记忆。至今为止鸣人度过的日子以及战斗的心意和行动都被九尾看在眼里。现在，看见鸣人为了拯救四尾而做出的行动，九尾又想到了什么呢……

鸣人漂亮地解开了锁链的封印，取得了四尾·孙的信任。但是封印还是无法完全解开，孙被外道魔像吸了进去。面具男又更进一步地使得剩下的人柱力全部尾兽化并发动袭击，鸣人也因查克拉耗尽而无法动弹。正当束手无策之时，九尾对鸣人说话了。被鸣人的行动打动内心的九尾——九喇嘛表示要将力量借给鸣人，木叶忍者村的鸣人和九喇嘛的组合终于出动！

“晓”一方的战力迅速减少，战况开始变得对忍者联合军有优势了。各战场的忍者们也击倒了敌人的残党，开始向鸣人与面具男战斗的最前线移动。然而，忍者之中也有人因为知道了宇智波斑用那难以想象的力量毁灭了战场而心怀不安。在这之中，鹿久得知鸣人使用惊人的力量压制住了面具男，决定借此使出一口气提升全部忍者的士气并为鸣人送去增援加以反击的战术……

在大部分忍者都前去参战的木叶忍者村，佐助建立的小队“鹰”的其中一员·香燐正被囚禁着。另一方面，同为“鹰”成员的水月和重吾，为了寻找佐助而潜入大蛇丸的据点，在那里发现了与此次战争关系重大的某件东西。此外，就在第四次忍界大战即将落下帷幕之际，一直在“晓”的根据地静候的佐助也来到外界，在得知了战争的事情后，终于决定向鸣人的所在之处进发……

五影们正在与斑的本尊对峙。斑使用木遁忍术一瞬间制造出一片森林，五影也由于这压倒性的攻击而陷入苦战。在战斗中五影纷纷倒下，大野木一时想过放弃，但他回想起了过去曾经与斑战斗的那个时候，以及自己在幼时曾听到的当时的土影对他说过的话语，因而再度取回了斗志，五影们也如同呼应他的斗志一般而再次站了起来。另一方面，正向着战场前进的佐助发现了某个人物……

纲手施展了只有自己才能使用的禁术·百豪之术，向强敌·宇智波斑挑战。而雷影、大野木、水影、我爱罗等五影也紧随其后合力发动攻击。但，五影虽然发动了几乎将斑封印的猛攻，纲手却因遭受到出乎意料的攻击而受到致命的伤害。另一方面，鼬查出了兜的所在之处，与兜进行了接触，并且在那里与佐助会合了。为了阻止秽土转生之术，鼬与佐助VS兜的战斗开始了。

为了阻止秽土转生之术，佐助和鼬两兄弟联起手来向兜挑战。两人使用强力的瞳术·须佐能乎发动攻击，但面对高速移动的兜却难以奏效。兜过去曾经在与鸣人曾去修行过的妙木山齐名的传承之地“龙地洞”获得了新的力量，可以操纵自然能量，感知能力也因此获得了飞跃性的提升。鼬和佐助为了对抗这股力量，而回忆起了过去两人一同执行的制伏野猪的任务……

佐助违背了即使杀了同伴也要守护木叶忍者村的鼬的心意，一心要摧毁木叶。兜见到佐助的行动与鼬敌对，就说继承了当年大蛇丸谋划的“毁灭木叶”意志的自己与佐助的目的相同，想煽动佐助成为自己的同伴。但佐助表示摧毁木叶完全是自己的意志而否定了兜，并再度开始战斗。鼬将同样生为间谍的兜与过去的自己相重叠，试图说服兜重新审视自己，但……

兜的过去终于被揭露了。年幼时因身受重伤而失去记忆的兜，被在木叶忍者村经营孤儿院的名为“野乃宇”的女性捡回去，并得到了“兜”这个名字。孤儿院由于资金问题而难以继续运营，兜因此运用自野乃宇那里习得的医疗忍术，从事为忍者们治疗的工作，也是在那时初次与大蛇丸见面。此后，身为第三代火影·日斩的幼时好友、组织了暗部养成部队“根”的男人“团藏”，以援助金方面的交涉为由，与大蛇丸一同在孤儿院现身了……

兜为了知晓至今为止的自己到底是何人，将君麻吕与音忍四人众，以及连自己所尊敬的大蛇丸的能力和情报都积蓄到了自己的体内而生存着。想要更进一步取得宇智波一族的能力和情报的兜，为了夺取鼬的力量而发动了攻击。但，鼬却说只靠吞噬他人决不能证明自己的存在，以此否定了兜的行动，并为了设置被称为宇智波禁术的瞳术而展开了反击。掌握对手的命运，号称能决定命运的究极瞳术究竟是……！？

“伊邪那美”是通过身体的感觉使对手陷入术中的瞳术。过去，宇智波一族之间曾兴起为了依靠“伊邪那岐”获取有利的结果而产生的斗争，伊邪那美便是为了阻止此事而开发的术。中了伊邪那美的兜，其意识已经被囚禁在与鼬的幻影进行无限战斗的轮回中。但，一旦接受了自己的命运，便可以自轮回中解脱出来。而鼬则是将兜与过去的自己相重叠，希望兜能察觉自己的错误，因此才施展了伊邪那美……

五影继续着和斑的死斗，即使因斑那压倒性的力量而陷入苦战，仍为了将斑封印而继续奋战。但斑却发动了如山一般巨大的“完成体须佐能乎”，反将五影逼入了绝望之中。另一方面，兜因为中了伊邪那美而停止了行动，成功完成这个作战的鼬终于让兜发动了解开秽土转生之术的印。与此同时，身为秽土转生体的鼬自身也开始消失，在与佐助分别之前，鼬开始对佐助说出自己真实的心意……

让忍者联合军吃尽苦头的秽土转生之术，在鼬的活跃之下被解开了。阻挡在鸣人面前的人柱力们，以及千代婆婆、迪达拉等强大的忍者们也因此而接连被光包围着消失了。利用“完成体须佐能乎”使五影陷入苦战的斑，其身体也开始被光包覆，眼看也快要消失。但斑却无视这些，向五影发动了最后的攻击，将纲手逼入绝境。而当斑的灵魂终于要自身体中分离、几乎可以确定胜利的同时，灵魂却不知为何重新返回了斑的体内……

水月和重吾与佐助会合了。佐助看见水月拿到的卷轴，就说有一个“不得不见的家伙”，并且似乎要复活大蛇丸。水月认为大蛇丸很危险而大为反对，但佐助还是利用御手洗红豆的咒印施展解邪法印，完美地让大蛇丸复活了。佐助说自己想要知道一心要守护村子的鼬究竟抱持着何种心情，自己应该是怎样的存在，又应该如何行动，大蛇丸因此与佐助做了合作的约定，“鹰”的成员和大蛇丸终于开始行动了……

外道魔像正是十尾的外壳。如今，在获得了九只尾兽的查克拉之后，外道魔像终于开始变化以使十尾复活。为了阻止十尾复活，鸣人、比、卡卡西、阿凯四人开始以肉搏战对面具男发动攻击，但就连碰到他都做不到。面具男巧妙地使用将一切吸入的术以及穿透的术将所有的攻击避开，而与之相对，鸣人却没有可以使用的术了。鸣人使出浑身解数的一击似乎也被面具男躲了过去，但就在这时，面具男的面具上却突然出现了一道裂痕……

面具男的能力并不是“穿透”，而是将身体的一部分移动至时空间，看起来就如同是穿透一般。不仅如此，这时空间还与卡卡西“神威”的时空间相连。面具男否定了现实，也否定了鸣人受到托付之物；与此相反，鸣人与九尾为了证明自己受到托付的事物，而以全力发动攻击。此时，鸣人的螺旋丸将面具男的面具炸裂，面具男的真实身份终于明朗化！！

面具男就是过去本应在神无毗桥之战中战死的卡卡西之友·带土！岂止如此，自秽土转生之术中解脱出来的宇智波斑也登场了！发起这第四次忍界大战的元凶，终于在鸣人他们面前现身了。斑由于计划未能顺利进行而对带土抱怨，这也意味着本以为已经死去的带土从以前开始就和斑密谋着“月之眼计划”。为何带土仍然活着！？他与宇智波斑之间的关系又是如何！？

本以为在神无毗桥之战中战死的带土获救了，而救他的人是同样被人以为在与千手柱间交战时战死的斑。带土想要早日与卡卡西和琳再会，而花费了不少时间在斑之处进行康复训练，总算是恢复到了能自由行动的状态。此时，传来了卡卡西和琳遭到雾忍们的包围而身陷危机的消息。得知此事的带土为了救出两人，从斑的据点飞奔而出，朝着两人所在之处赶去。但带土在那里见到的情景却是……

亲眼目睹卡卡西杀死琳的瞬间，带土因此而陷入绝望，将在场的忍者全部杀光。带土无法接受琳的死，回想起斑利用幻术制造出梦境世界的计划，为了制造出琳存在的世界而继承了斑的意志，以“宇智波斑”的名号自称，开始了自己的行动。作为开端，带土与尚未结成“晓”的弥彦和长门相接触。他打算将拥有轮回眼的长门导入黑暗的世界，而弥彦他们则展开了将自己的村子导向和平的活动。“晓”究竟是如何结成的？“晓”结成的秘话，终于揭开！

亲眼目睹卡卡西杀死琳的瞬间，带土因此而陷入绝望，将在场的忍者全部杀光。带土无法接受琳的死，回想起斑利用幻术制造出梦境世界的计划，为了制造出琳存在的世界而继承了斑的意志，以“宇智波斑”的名号自称，开始了自己的行动。作为开端，带土与尚未结成“晓”的弥彦和长门相接触。他打算将拥有轮回眼的长门导入黑暗的世界，而弥彦他们则展开了将自己的村子导向和平的活动。“晓”究竟是如何结成的？“晓”结成的秘话，终于揭开！

为了木叶忍者村的未来，团藏为阻止与岩忍者村的和平交涉而在暗中活跃着，而由于团藏的话语陷入疑心暗鬼之中的半藏为了摧毁“晓”，打算把弥彦他们诱入陷阱而要求他们与自己会合。弥彦和长门不疑有诈，为了与半藏会合而开始行动。但，伙伴们察觉到所谓的会合其实是个圈套，打算前去救出弥彦和长门，却被带土所阻止了。与一心追求和平的弥彦等人的心意相反，一切正循着带土所认定的“和平根本不存在”这一想法而朝向黑暗进展……