Lelouch Lamperouge se reîntoarce la viața sa obișnuită de student leneș și cartofor, după ce memoria i-a fost ștearsă și umplută cu amintiri false.

Lelouch își primește înapoi memoria și conduce Ordinul Cavalerilor Negri. După ce au devastat Turnul Babel, Cavalerii sunt atacați de o nouă mașină de război.

Zero declară înființarea Statelor Unite ale Japoniei, dar Guilford amenință să execute toți Cavalerii Negri capturați dacă acesta refuză provocarea.

Lelouch are două probleme majore: să scape de Rolo, care vrea să-l ucidă, și să găsească un mod să-i salveze pe Cavalerii Negri.

Zero recâștigă încrederea Cavalerilor Negri. La școală, reîntoarcerea lui Suzaku e privită cu maxim interes, iar consiliul elevilor organizează o petrecere în onoarea sa.

Lelouch trece printr-o criză. Alegerea lui Nunnally ca guvernator general al Zonei 11 este însoțită de zvonuri șocante despre ea.

Decizia lui Zero de a lucra în Regiunea Specială Japoneză produce îngrijorare în rândul Cavalerilor Negri. Lelouch se poartă ciudat.

Ordinul Cavalerilor Negri este acum în China. Federația Chineză este condusă oficial de Lihua, venerabila împărăteasă.

După ce Zero o răpește pe Lihua în timpul nunții cu Prințul Odysseus, Ordinul Cavalerilor Negri și Xing ke încep o luptă pe viață și pe moarte.

Sorții nu par să-i surâdă lui Lelouch în timpul asediului de la Mausoleu. Forțele chineze și britanne sunt copleșitoare.

Lelouch și Shirley ajung față în față. Băiatul trebuie să înfrunte și consecințele neînțelegerilor create prin implicarea lui Sayoko.

Shirley și-a recăpătat memoria și acum își amintește totul despre Lelouch. Tânăra ia legătura cu Suzaku, sperând să dezvăluie identitatea lui Zero.

După o tragică pierdere, Lelouch se hotărăște să anihileze ordinul Geass, să distrugă din temelii organizația și să-l elimine pe Rolo.

Într-o lume paralelă, Lelouch îl înfruntă pe cel care îi este totodată și împărat, și tată. Scopul său ultim este aproape, însă o revelație îl dă peste cap.

Aflată în ascensiune, Federația Statelor Unite îi va oferi lui Lelouch mijloacele și trupele prin care să lupte cu Britania de la egal la egal.

În încercarea de a o salva pe Nunnally, Lelouch își joacă ultima carte: disperat și umil, îl imploră pe Suzaku să-l ajute.

Ajutați de Jeremiah și Guilford, Lelouch și Cavalerii Negri de-abia reușesc să le țină piept lui Suzaku și celorlați Cavaleri ai Mesei Rotunde.

Profitând de absența lui Lelouch, care a fost puternic afectat fizic și psihic, Schneizel se întâlnește cu liderii Cavalerilor Negri.

Marianne i se dezvăluie în adevărata sa formă lui C.C., iar Zero este declarat mort.

Lelouch l-a prins pe tatăl său și este punctul de a afla adevărul despre moartea mamei sale, care se întrupează brusc în fața lui.

Lelouch, acum întronat, distruge tot ceea ce simbolizase Britania până atunci, cu acordul lui Suzaku.

Schneizel îl duce pe Damocles la mare înălțime, amenințând să distrugă întreaga lume cu bombe FLEIJA. E gata să ucidă pentru a răspândi pacea.

Cavalerii Negri își croiesc drum către Avalon și îi salvează pe ostatici, iar Lelouch intră în Damocles.

Lelouch se folosește de Geass și Nunnally, obținând cheia Damoclesului. Mulțumită acestuia – dar și bombelor FLEIJA – a căpătat o forță redutabilă.