Zero por fin vuelve a despertar y prepara un plan para lograr la independencia de Japón aprovechando que sus enemigos están perplejos ante su regreso de la muerte.

Para disipar las sospechas sobre su identidad, Lelouch deberá volver a la escuela para seguir con su vida corriente como estudiante.

Los britanianos van a ejecutar a los miembros restantes de los Caballeros Negros, así que Zero deberá hacer algo urgentemente si quiere salvarlos.

Suzaku regresa a la Academia Ashford como estudiante, así que Milly le hará una fiesta de bienvenida por todo lo alto.

Nunnally será la nueva virreina del Área 11. Tras enterarse de eso, Zero elabora un plan para frenar su llegada y llevársela.

Nunnally hace una revelación impactante en su discurso como virreina del Área 11. Eso hace que Zero tenga grandes dudas sobre su relevancia para el mundo.

Zero decide dar un pequeño cambio a su estrategia y les hace una propuesta muy arriesgada a los britanianos.

Zero y los demás consiguen llegar hasta Luoyang, pero una vez allí descubren que Britannia y los Altos Eunucos están tramando algo.

Tras llevarse a la emperatriz de la Federación China, Zero emprende la huida. Pero no cuenta con la tenacidad de Xing-ke y sus grandes estrategias.

Zero y los Caballeros Negros están acorralados ante el asedio constante de los Altos Eunucos. ¿Qué podrán hacer para salir del aprieto?

Milly prepara su fiesta de graduación en la escuela y prepara un evento con el que pretende dar un empujón a Shirley y Lelouch.

Shirley recupera la memoria sobre todo lo relacionado con Zero y Lelouch y se siente aterrada al saber la gran verdad sobre la muerte de su padre.

Zero por fin descubre dónde están escondidos la Orden y su líder, V.V., así que decide lanzar una ataque sorpresa para acabar con todo lo relacionado con el Geass.

El emperador y Zero están frente a frente en un espacio paralelo fuera del mundo. Allí comenzará un enfrentamiento que puede cambiar el mundo por completo.

Tras mucho negociar con otros países, finalmente se formará la Federación de Naciones Unidas para hacer frente a Britannia.

Zero sabe que si quiere proteger a Nunnally de algún modo mientras está en manos de Britannia, deberá recurrir a Suzaku.

Tras sobreponerse a la traición de Suzaku, Lelouch inicia una nueva ofensiva para acabar de una vez con Britannia y rescatar a Nunnally.

Suzaku desata una masacre sin igual. Y sin tiempo para reaccionar, Schneizel acude para dialogar con los Caballeros Negros.

A Lelouch se le concede una nueva oportunidad para frenar al emperador de Britannia, y esta vez sabe dónde y cómo hacerlo.

El emperador hace un último intento por convertir la realidad a su antojo, pero se encuentra con la fuerte oposición de Lelouch.

Tras acabar de una vez con el emperador Charles, Lelouch se autoproclama el próximo emperador de Britannia, y esta vez cuenta con la ayuda de Suzaku.

Tras el intento de Lelouch de hacerse con el poder de la Federación de Naciones Unidas, aparece Schneizel con un plan devastador.

Schneizel y Nunnally están disparando indiscriminadamente un armamento devastador, por lo que Zero deberá encontrar un modo de detenerlos.

Lelouch finalmente consigue vencer a Schneizel e instaura una dictadura mundial y nada ni nadie podrá frenarlo ya.