Claus et Lavie, deux messagers pilotant un vanship, acceptent une mission apparemment simple qui consiste à délivrer une lettre au comte David Mad-Thane.

L'attaque surprise de la Flotte de Dithis désorganise complètement la flotte de Mad-Thane. Bien qu'illégale selon les règles, la Guilde ne réagit pas pour y mettre un terme comme elle devrait le faire. Le Duc renvoie Claus et Lavie à leur vanship afin qu'ils quittent le vaisseau et pouvoir mener à bien son attaque. Cependant, les deux pilotes n'ont pas fini leur mission et doivent toujours remettre le message de la fille du Duc à son père. Faute de pouvoir le faire, Lavie s'empare d'un micro et commence à lire la lettre, que tout le monde peut entendre...

C'est le jour de la "Norkia Cup" à laquelle Claus et Lavie participent régulièrement. Faute d'avoir pu participer aux essais, ils partent de la dernière place mais remontent petit à petit leurs adversaires. Mais ils sont heurtés en plein vol par un vanship sur le point de s'écraser. Lavie, furieuse, veut continuer la course tandis que Claus décide de se porter au secours des pilotes. Ils découvrent alors que le vanship était en mission et devait livrer un colis, qui s'avère être une petite fille. Le pilote, toujours vivant, demande à Claus d'achever la mission lorsqu'ils sont attaqués par un étrange vaisseau en forme d'étoile...

Claus a accepté de terminer la mission de Ralph Wednesday qui consiste à "livrer" Alvis au Silverna, un mystérieux vaisseau. A peine rentrer chez eux, ils subissent une nouvelle attaque de l'étoile et doivent fuir en catastrophe. Ils parviennent tout juste à se mettre en sécurité. Arrivés au point de rendez-vous fixé pour la livraison, l'étoile revient à la charge pour s'emparer d'Alvis sans que Claus et Lavie ne puissent rien faire. Mais ils sont sauvés in extremis par l'intervention d'Alex Row, commandant du Silverna...

Claus, outré par l'attitude d'Alex Row qui a littéralement pris possession d'Alvis en les ignorant, fait quelques réparations de fortune sur son vanship et se lance à la poursuite du Silverna. Lorsqu'il parvient enfin à le rattraper, le vaisseau lui tire dessus. Échappant de justesse à l'attaque, il n'a d'autre choix que de se poser en catastrophe sur le pont du Silverna où il fait connaissance avec les mécanos de bord...

Dio Eraclea et Lucciola, son "protecteur", enquêtent sur le vaisseau-étoile abattu. Pendant ce temps, Tatiana et Alistair partent livrer un message à l'Empereur d'Anatoray et Alex Row questionne Claus sur ses intentions. Le Silverna est alors attaqué par des vaisseaux-étoiles de la Guilde qui réussissent à s'infiltrer à bord...

Le Silverna fait escale dans un port afin de réparer les dégâts subits lors de l'attaque de la Guilde. Dans le casino de la Station, Lavie tombe sur Mullin Shetland, le militaire qui les a aidé lors de leur mission sur le Claimh Solaris, qui est à la recherche d'un nouveau bâtiment sur lequel s'embarquer...

Claus et Lavie vont participer à la course de vanship la plus convoitée du circuit. Mais la compétition s'annonce difficile avec Dio secondé par Lucciola et Tatiana avec Alister dans les rangs.

La course se poursuit. Claus et Lavie sont bien placés mais harcelés par Dio et Lucciola. Tatiana et Alistair poursuivent la mission confiée par Alex pendant que ce dernier participe aux enchères mettant en vente un objet lié à l'Exile.

Vincent Alzey réussit à retrouver le Silverna. Il ordonne à Alex de se rendre et de lui remettre Alvis. Pendant ce temps, Dio, qui se trouve à bord, se retrouve seul avec la petite fille et lui murmure une étrange phrase.

Le combat entre le Silverna et l'Urbanus est inévitable lorsqu'Alex refuse d'obéir aux ordres de l'Empereur et de remettre Alvis à Vincent. Tous les vanships sont envoyés au combat. Pour se venger d'Alister, Tatiana choisit Claus comme navigateur...

Claus et Tatiana se sont écrasés au milieu du désert. Le vanship est gravement endommagé mais Claus s'attaque malgré tout à sa réparation afin de pouvoir redécoller et partir à la recherche du Silverna bien qu'ils ignorent si le vaisseau a survécu ou non à la bataille.

Lavie se souvient du jour où son père et celui de Claus partirent pour affronter le "grand courant" et n'en revinrent jamais.

Tout le monde est à nouveau à bord du Silverna. Sophia reçoit une missive qui la bouleverse. Claus, perturbé, cherche des réponses auprès d'Alex, en vain. Quant à Dio, il trouve une photo des pères de Claus et Lavie qui fait resurgir des souvenirs.

Sophia se rend dans la Cité impériale et se fait arrêter par l'Empereur qui a déclaré la guerre à Dithis.

Suite à un mystérieux message, Alex ordonne au Silverna de changer de cap pour Horizon Cave où Claus et Lavie retrouvent certains de leur compatriotes avec lesquels ils participaient aux courses de vanships.

Sophia devient impératrice d'Anatoray après la mort de son prédécesseur. Alors qu'Alex débarque, il se met à pleuvoir des pétales de roses rouge qui vont remonter de douloureux souvenirs pour le capitaine du Silverna.

La Guilde, avec Maestro Delphine à sa tête, a déclaré la guerre à l'alliance Anatoray-Dithis. Le Silverna fait route vers les Crocs du Dragon où se trouve également l'Urbanus avant de prendre la direction du Grand Courant.

Le Silverna et l'Urbanus entre dans le Grand Courant à la recherche de l'Exile. Maestro Delphine décide qu'il est grand temps de récupérer Dio et Lucciola, toujours à bord du Silverna.

Claus et Lavie sont de retour sur le Silverna alors que Maestro Delphine l'attaque pour récupérer Dio afin de le préparer pour son rite de passage.

Dio affronte le jugement d'Agoon comme le prévoit le rite de passage. Claus et Alvis assistent à l'épreuve, impuissants. Delphine soumet Alex à un interrogatoire pour récupérer tous les mystères. Malheureusement, le capitaine ne connaît le dernier...

Lucciola décide d'aider Claus et Alvis à s'enfuir mais aussi de libérer Dio pour qu'ils emmènent. Mais pour cela, il va lui falloir affronter Delphine. Pendant ce temps, la bataille pour prendre le contrôle des unités Claudia des mains de la Guilde fait rage.

Claus, Dio et Alvis ont réussi à s'échapper et se sont réfugier à Norkia. Ce qui reste des flottes de Dithis et d'Anatoray se rassemble pour affronter la Guilde.

Claus et Alvis font route pour rejoindre le Silverna. Sur le chemin, ils retrouvent Lavie et le vanship de leurs pères qu'elle a réparé. Ensemble, ils partent affronter le grand courant afin d'atteindre le champ de bataille où s'opposent l'alliance Anatoray-Dithis et la Guilde. L'Exile se met à attaquer les deux camps, sans distinction.

Alors que Delphine, le Silverna et l'Urbanus s'affrontent près de l'EXILE, Dio, pas tout à fait sain d'esprit, poursuit Claus et son équipage vers le Grand Courant.