墨村良守是一个虽然不情愿，却得继承代代相传的结界师这份工作的小学生，因为代表间流结界术正统继承人的方印就出现在他的身上，而年纪比她大了几岁的儿时玩伴雪村时音，同时也是另一个号称是间流结界术正统继承资格的雪村家族的新一代传人，有一天两人在出任务的时候，时音为了保护良守受了重伤，让良守下定决心要变得更强，不再看到任何人受伤害。

　　良守已经长大了，而且他的力量已比以前强大得多，因为他希望能保护雪村不再受到伤害，而且因为雪村喜欢蛋糕做的城堡，所以良守还开始学习怎麼做蛋糕，但是受到保守顽固的爷爷强烈反对。某天晚上，雪村在出任务的时候被困住了，良守为了保护雪村，不惜违背传统，穿上更方便行动的运动鞋，以贴身战的方式成功困住妖怪，接著两人合力消灭了顽强的妖怪。

　　时音突然回忆起她死去的爸爸，让她有点怅然若失，这时一位自称是裏会介绍来的术者-春日夜未，宣称是来乌森之地执行机密任务，却设计困住时音跟良守。原来她是一名操鬼师，因为忌妒正统传人家族，而想靠著乌森之地来增强自己的鬼的力量。

　　操鬼师春日夜未大闹乌森之地，希望能让能力之弱而被瞧不起的夜鬼增强它的力量。但是夜鬼却在吸收了乌森之地的力量之後变得过於强大，也因此失控不再听从春日的掌控。良守在不想伤害它的心态下手下留情，但是却愈来愈无法与它对抗了。

　　良守在学校发现了个浮游中的人类灵，於是尽力苦劝他离开，以免他感染了乌森之地的气而必须要将其退治，但是当他知道这个灵魂是一名点心师傅後，良守开始向他讨教做蛋糕的技巧。时音却反对他对人类灵如此亲近，因为灵魂对一般人而言是有害的。

　　良守的同学-神田百合奈是个有灵感的人，所以也因此发现到良守也能看到灵魂。乌森学园里77个奇异事件之一的“不合时节的樱花”又在不该开花的季节里再度盛开，於是百合奈与同学约好在半夜来赏樱花，结果竟遇上良守与时音在收拾妖怪。

　　一直无法成佛的点心师傅，原来是因为挂念著弟弟俊彦，良守於是决定与“微笑心灵谘询中心”的负责人-大妈，联手为他实现最後的愿望，也就是要让弟弟原谅他，但是首先为了要取信俊彦，要先做出真彦在两人小时候做过的蛋糕。

　　认真的在修练结界术，但是他一心只想增强结界的力量，却忽略了准确与应用上的问题。当晚所出现的妖怪冰渡，它的冰钻攻击竟然能穿透良守的结界，於是擅长应用的时音便利用了良守的力量，成功的将冰渡击倒，让良守重新体认到结界术的奥妙。

　　一位高中部新来的英文老师-三能，似乎连时音也对他很有好感，让觉得三能很可疑的良守很不是滋味的，结果良守的担心是对的，三能竟然是一个可以操控妖怪的异能者，而且不只如此，从三能的身上竟然还散发出不同妖怪的气息。

　　精心制作出的蛋糕，时音虽然觉得好吃却不希望良守沈迷於蛋糕，於是刻意摆出不高兴的样子，良守因此而心灰意冷，爸爸修史为了鼓励良守重拾对蛋糕的热情，决定让他吃吃全国最棒的巧克力蛋糕，但是後来却还是须要良守召唤出式神帮忙排队。

　　斑尾昔日的同伴钢夜突然现身在乌森，原来斑尾和钢夜，在400年前是对合作无间的野狗，後来因为人类入侵让它们失去了栖息处。最後它们含恨而终并成为妖怪，但是在後来结界师间时守上山收服斑尾和钢夜，没想到当时的斑尾竟然对间时守一见钟情。

　　为了打倒钢夜，良守只好采取了斑尾的意见，解开了爷爷千交待万交待绝不能解开的封印，虽然斑尾的力量还是不足以对付钢夜，但是後来经由良守的牵制，让斑尾发出致命的一击，虽然因此而解决了钢夜，但是已然失控的斑尾却必须再度封印起来。

　　良守那身为夜行首领的哥哥正守回来了，因为在以前，时音总是会整天黏著他的哥哥，而後则是因为结界术的能力总是会被拿来和哥哥相比。所以从小良守就不喜欢亲近这个大哥，不过，这次正守回到家里除了探亲之外，似乎还别有目的。

　　正守为了测试良守目前的能力，刻意将植物系妖怪放置在乌森之地，植物系妖怪吸收了乌森的力量之後迅速的繁殖成长，让学校在极快的速度中被一片树海所吞没，良守为了退治它，决定张开超大结界罩住学校。

　　原来正守回到墨村家是为了调查一群打算对乌森之地有所企图的不明组织，但是他也似乎另有打算，他总是在暗地里观察著良守的能力，并确认乌森之地目前的力量。此时，该组织中派出个监视者，其操纵的式神出现在乌森之地，正守会如何处理呢？

　　在乌森学园里现身的乌龙大人，他是来找结界师的。结界师一直存在个重要工作，也就是在乌龙大人床铺坏了之时，有义务要帮他修理床铺，但是在进行之前，必须先填饱乌龙大人无底洞似的肚子。而且，所谓的修理床铺，似乎没想像中那麼容易。

　　前往乌龙大人居住的无色沼而去的良守，他跳进了池塘出现的洞穴里，朝著乌龙大人的的床铺前去。但是那里……其实是神的领域。正守叮咛良守，一修复完床铺就快回来，但是良守为了想封印乌森而向乌龙大人追问乌森的秘密，但是回去的洞穴却快消失了。

　　利守是墨村家的老么，平时冷静又聪明乖巧，是个比哥哥良守更能让大家放心的孩子。今日的利守在好友的拜托之下，带著他们到家中做特别作业，但因为他怕朋友会在家中捣乱，於是将良守形容得很可怕。但是，没想到，良守却穿著围裙出来应门。

　　良守还在为解开乌森之谜烦恼著，但是神秘组织决定对乌森之地发动攻势，派出了能操纵羽毛的三位一体妖怪-白羽儿，并且战术性的先以逃避的方式来测试良守他们的能力，而他们竟然因此而拥有了乌森之力，这该如何应付呢。

　　良守和时音与妖怪白羽儿陷入苦战，并非以力量型取胜的时音究竟该如何取得胜机？但靠著时音的灵机一动，她配合著良守困住白羽儿的结界，将结界变化贯穿了白羽儿，而后，他们却又马上发现这背後其实是一个具有组织的行动。

　　良守和时音在烦恼该如何找出，可能披著人皮隐藏在乌森里的妖怪时，初中部来了名转学生-志志尾限，他以惊人的力量消灭了良守的式神，还识破三能是个异能者。当他在使用力量时会散发出强烈的邪气，难道他就是该不明组织派来的？

　　原来志志尾限是派来辅助结界师的，但是良守跟限一开始就不对盤，结果在一次追逐入侵乌森之地妖怪的行动中，限抢先一步退治了妖怪，让两人的冲突更加白热化，而神秘组织的幕後首领也开始按耐不住。

　　自从限被派来辅助良守和时音之後，就一直抢在他们之头将妖怪退治，良守和时音反而成了替志志尾收拾善後的辅佐角色了。就在这时候出现了妖怪大首车，限的战斗方式在此时的失利，反而让良守发挥他的战斗天性。

　　自从限来到乌森学园之後，因为他那冷酷的外形很受到女学生的欢迎，也刚好百合身旁的一位儿时玩伴小葵就与限同班，也因为小葵跟限的几面之缘，而对限抱有好感，虽然良守本人是不太愿意接受这种事实。

　　被称为地区偶像的八王子君也，虽然是外校的学生，但是他却突然出现在乌森学园并指名要找时音。而後他们甚至还状似亲密地离开了学校，看到这情况让良守按捺不住的追上去，才发现原来他是受到了妖怪的控制。

　　黑芒楼里的妖怪们正在计画研发出新型的人皮外衣，准备对乌森之地发动总攻击，但是却有个来自黑芒楼披著旧型人皮的妖怪入侵乌森之地。偏偏良守竟然在这时候感冒，良守的爷爷却又竟然在紧急时刻闪到腰。

　　正守被拔擢为裏会的最高领导阶层“十二人会”中其中一员，但是其他干部似乎对他不怀好意。另一方面，良守的老师黑须的肩膀上竟出现了一只猫灵，良守为了如何不使用武力将它退除乌森而大伤脑筋。

　　妖怪组织黑芒楼竟然在学生上课时间大摇大摆进入乌森学园，这一切都归功於它们身上所披的人皮之隔绝，让良守等人完全没有察觉。负责带队的火黑表明不想动武之意，希望良守等人能跟他们坐下来谈谈。

　　良守和时音联手破解了魔方阵之後，又因为灰泉现出原形之後的溶解液攻击而束手无策，另一方面，限也因为连续两次被火黑打倒让他情绪因此失控，竟然无法自制地现出他混合妖的原形，这场混战会如何下去呢。

　　黑芒楼的刺客逼得志志尾限现出原形，让志志尾不但被迫要离开乌森，也对於自己的过去被揭露而又变得封闭起来。良守为了让志志尾能真正的打开心房，于是咬着牙去询问最可能知道志志尾过去的正守。

　　正守在良守的拜托之下，说出了志志尾限的过去。志志尾在他还不能控制自己力量的幼年时期，曾经因无法控制情绪而伤害到旁人，甚至差点杀了自己的亲姊姊，所以他的家人将他送入了裏会。

　　妖兽师花岛亚十罗突然来到良守等人面前，要求对他们三人进行考试，如果他们没有表现出良好的合作默契的话，就要把志志尾带回裏会。面对老练的妖兽师以及妖兽们，他们该如何应付呢？

　　因为黑芒楼的公主身体快撑不下去了，为了让公主成为乌森的主人，白於是策划准备对乌森之地发动攻击。白还指示火黑让他去煽动志志尾使他动摇，想让志志尾恢复妖怪的本性，志志尾因此陷入了迷惘。

　　雪村家的奶奶时子为了寻找通往黑芒楼的道路而外出，时音也因为奶奶不在身边而感到些许不安。此时，身为夜行首领的正守也带领夜行到远方去执行任务，就在这种纷纷扰扰之时，黑芒楼的大军来了。

　　黑芒楼缜密的计划将良守等人的外援全都斩断了，面对牙银压倒性的力量，整个乌森化为火海，让志志尾了解到除非进行完全变化，否则不可能抵挡。但是一旦完全变化，志志尾可能因此丧失理性。

　　完全变化的志志尾展现惊人的战斗力，终於成功的将强敌牙银打倒了，但是志志尾却因为火黑的偷袭而重伤，虽然众人期望乌森之地的力量能让志志尾起死回生，但是就在志志尾心满意足的那一刻。

　　志志尾限阵亡了，良守还有夜行的人都为了这件事情感伤不已，而黑芒楼也正准备重整战力对乌森之地再发动一次攻击，最让他们担心的夜行的支援，也因为裏会的扇一郎和黑芒楼的勾结而又要再次被隔离开了吗。

　　黑芒楼第一次的大规模行动失败了，但是马上开始策划第二次的计划，那就是要先釐清土地跟主人之间的关系，并且解开乌森之地存在的不解之谜，於是碧闇带著左金来到乌龙大人居住的无色沼，将沼里的水吸干。

　　为了替志志尾限报仇，正守率领夜行的所有人将根据地转移到乌森之地，以避免再受其他事件影响。而良守在知道时子奶奶又要出发前往黑芒楼之后，想尽一切办法要时子带他一起去，但是却被时子以他力量还不足为由拒绝。

　　就在时子拒绝带良守到黑芒楼去之后，良守决定提升自己的能力，但是以良守的个性来说却又拉不下脸拜托自己的爷爷，於是他便自行到山上去找乌鸦当对手。最后终于了解如何用感觉取代双眼去捕捉对手的动静。

　　黑芒楼终於要再度对乌森之地发动攻势了，虽然这次有正守率领的夜行成员协助，但是时音心中还是有说不出的悲观之感，但是在她看过良守乐观的态度之后，终於也能放下心中的石头，准备面对黑芒楼的大军。

　　黑芒楼终於要再度对乌森之地发动攻势了，但是时音心中还是有说不出的悲观之感。

　　良守、时音和夜行所有人面对黑芒楼的大军依然表现的游刃有馀，但是这其实是因为左金保留了实力。而且黑芒楼最主要的目的并非是要攻击乌森之地，其实真正的目的是要让紫远将两名结界师带回黑芒楼。

　　良守自愿被带到黑芒楼之後，他被紫远所放出的丝线给捆绑住，但是由於良守身上不断散发出惊人的气，所以才能免於被黑芒楼的人给控制。就在这个时候，行踪不明的松户平介竟然现身在良守的眼前，他的目的是。

　　良守在松户平介的解救之下总算重获了自由，但是他为了找出被困住在黑芒楼内的影宫，放弃了与火黑的对决机会。在这之後跑遍城堡的他，竟意外遇到了黑芒楼的主人"公主"，而她之後则给了良守特别的力量。

　　松户平介终於找到他这一辈子最大的仇人，黑芒楼的实质领导人-白，原来松户最爱的女人爱的却是白，而松户无法接受白为了追寻自我而放弃爱情的无情举动，这多年来的纠葛将在此了断。

　　良守将影宫救出来之後，要影宫自己先离开，自己要去继续找出火黑为志志尾限报仇，这时候正守在时子的协助之下正要通过隧道前往异界，一场大战即将上演。

　　时音在寻找良守的时候摔到城堡下，意外的被蓝绯帮了一把，於是在时音的询问之下，蓝绯说出了一场让她难以忘怀的往事，那是一段人妖之间的畸恋。

　　良守和火黑终於展开了最後决战，虽然良守在对战中处於劣势，但是在施展了新的结界术之後，局势似乎有逆转的可能性。但是，他却在之後透过火黑的口中得知，他其实在还是人类时就见过这个招术，而这结界术似乎叫作绝界。

　　面对火黑施展全力的攻击，良守尚未完成的绝界已经无法抵挡了。这时候对自己一直以来帮不上忙而感到心急的影宫，於是他跑上前去奋不顾身的为良守挡下火黑的攻击，但是影宫意外的举动却让良守发动了一股惊人的力量。

　　黑芒楼的领导者白与公主间的羁绊，让白得到了迟来的领悟。另一方面，得到公主所给予的力量并发挥出暗藏之力而导致昏死的良守总算被时音给唤醒，於是一行人就在黑芒楼的崩毁之中赶了回来。