Six mois après avoir débuté, la nouvelle mission de l'Enterprise est toujours au même point : elle n'a fait aucun progrès, même virtuellement. C'est alors que le capitaine Jonathan Archer apprend l'existence d'un travailleur xindi dans une colonie minière. C'est leur seul espoir d'en apprendre un peu plus sur la race extraterrestre qui a attaqué la Terre. Mais il pourrait également bel et bien s'agir d'un piège...

En mission pour inspecter un vaisseau xindi abandonné sur une planète de jungle tropicale, Archer, Reed et Hoshi succombent à un virus qui mute leurs corps et leurs esprits en une forme de vie primitive, en fait celle des habitants depuis longtemps éteints de l'astre. T'Pol, elle, semble être bien portante. Phlox entame alors une course contre la montre pour trouver un antidote qui sauverait la vie de ses collègues. C'est alors qu'un groupe d'aliens, qui ne semblent pas vraiment inoffensifs, atterrit sur la planète...

8 janvier 2154. L'Enterprise découvre un vaisseau xindi-insectoïde écrasé sur une petite planète perdue, tout son équipage mort. Après enquête, Archer et les siens découvrent qu'ils ne sont pas décédés dans l'accident mais se sont intentionnellement tués par suffocation afin que tout le support vital du vaisseau soit transféré à la chambre d'incubation qui contient plusieurs dizaines d'oeufs xindi-insectoïdes. Ces derniers tentent d'éclore, mais le support vital s'effondre. Archer semble déterminé à aider les nouveau-nés à survivre...