Mientras el Enterprise visita la Tierra por el lanzamiento del Columbia (NX-02), el doctor Phlox es secuestrado y forzado a ayudar a los klingons.

Con la ayuda del Columbia, toda la tripulación del Enterprise soluciona el sabotaje a sus naves y van a intentar liberar a Phlox.

En la Tierra, un grupo de racistas xenofóbicos llamado Terra Prime, hace todo lo posible para terminar con la llegada de alienígenas y las relaciones con más planetas entre la Tierra.

El líder xenofóbico de Terra Prime amenaza con destruir toda la Flota Estelar a menos que todo el que sea alienígena salga del sistema Solar inmediatamente.