Dopo aver aiutato a riparare una nave xyrilliana con problemi al motore, Trip nota uno strano rigonfiamento sul braccio.

L'Enterprise visita una colonia con miniere di deuterio. I suoi abitanti sembrano però poco intenzionati a venderlo. Cosa stanno nascondendo?

L'equipaggio aiuta una schiava prostituta. Una volta a bordo, l'aliena usa le proprie capacità per raccogliere dati biometrici sugli esseri umani.

L'Enterprise scopre un laboratorio xindi dove viene raffinata la kemocite, l'ingrediente base dell'arma che sarà usata per distruggere la Terra.

Al comando dell'Enterprise perché l'intero equipaggio è in uno stato comatoso, il dottor Phlox comincia a sentire strani rumori.

Il consiglio degli Xindi riporta il capitano Archer sull'Enterprise ma la nave, gravemente danneggiata in un attacco, deve procedere senza la propulsione a curvatura.

L'Enterprise raggiunge la sede del Consiglio degli Xindi, dove il capitano Archer rivolge un appello alle cinque specie che lo compongono.

I potenziati si dirigono verso Stazione 12 dove sono conservati altri embrioni.

Superati il deserto e le tempeste di sabbia, T'Pol e Archer affrontano i Syranniti nella Fornace.

Entità incorporee aliene occupano i corpi di alcuni membri dell'equipaggio dell'Enterprise per studiarne la reazione a un virus mortale che ha colpito Trip e Hoshi.

Sull'Enterprise si scopre che la nave romulana era pilotata telepaticamente da un Aenar, membro di una sottospecie degli andoriani.

Gli uomini dell'Enterprise cedono ai poteri seduttivi di tre schiave orioniane. Trip Tucker è l'unico maschio dell'equipaggio immune al loro fascino.

Una donna dà a T'Pol la prova dell'esistenza di una figlia sua e di Trip Tucker. I due scoprono che la donna era un membro dell'organizzazione xenofoba Terra Primo.