코난은 공원에서 놀던 중, 폭주하는 고급차를 보는데 자동차에서는 브레이크 오일이 서서히 흘러나오고 있었다. 브레이크가 작동하지 않는 차가 건널목에 다가가는 그 때, 코난은 스케이트보드를 타고 오른쪽 앞으로 날아들었고, 운전수인 호소오 타쿠야는 반사적으로 핸들을 왼쪽으로 꺾었다. 차는 고지재생공장의 옛 신문, 옛 잡지가 있던 구역 안으로 들어와 잡지더미를 들이박고 멈췄다. 차의 브레이크 호스에는 구멍이 열려있었다. 뒤따라 등장한 치바 형사는 살인미수사건으로 판단하고, 모리 부녀와 소노코도 현장에 온다. 그런데 알고보니 소노코와 호소오는 가부키 회의로 몇번 만난 적이 있는 친한 사이였는데...

카네코를 만나러 가던 도중, 누군가에게 머리에 천을 뒤집어 씌워지고 납치당한 코난. 의식을 잃은 코난은 암흑 속에서 눈을 뜬다. 그 곳은 철거 중인 빌딩의 안이었다. 머리 위에서는 중기의 바큇소리와 콘크리트를 부수는 드릴의 소리가 들려온다. 코난은 휴대폰이 없는 걸 눈치채고, 도움을 청하기 위해 탐정단 뱃지의 스위치를 누르지만 반응은 없었다. 한편, 코고로는 고급 호텔의 로비에서 상담 중인 호소오를 기다리고 있었다. 잠시 후 로비에서 4시간에 달하는 상담을 끝낸 호소오와 로스 존스가 나타난다. 사무소에 있는 란은 코난에게 할 말이 있어서 전화로 연락하지만 연결되지 않아서 이상하게 생각하는데...

인기 복화술사의 의뢰를 받은 코고로를 따라온 란과 코난은 복화술사의 라이브 공연을 관람하게 된다. 의뢰인인 복화술사는 영혼의 친구인 인형에게 인격이 사로잡힌 복화술사가 아내를 살해하는 내용의 공연을 보인다. 복화술사의 의뢰 내용은 라이브 공연에서 보인 것처럼 자신이 다중인격이 되어버렸기 때문에 아내를 살해하지 않도록 감시해달라는 것이었다. 코고로는 의뢰를 거절하지만 다음날 아침에 의뢰인의 아내가 정말로 살해되는 사건이 발생, 의뢰인은 자신의 의식이 사라졌을 시기에 자신이 살해한 것이라고 자백하지만 사건 현장인 거실과 인접한 공간인 침실에서 의심스러운 점이 발견되는데...

인기 복화술사 아내가 살해당하는 사건에서 의뢰인이었던 복화술사가 자신의 의식이 사라졌을 시기에 자신이 살해한 것이라고 진술하지만 현장 상황에서 아내의 외도 상대였던 복화술사의 제자가 스승을 모함한 것으로 보이는 단서가 포착되어 복화술사의 제자가 강력한 용의자로 떠오르게 된다. 하지만 용의자가 되어버린 복화술사의 제자는 강력히 범행을 부인하고 코난은 기자들 앞에서 사건을 언급하던 복화술사의 언동과 사건 현장 상황에서 의심스러운 점을 발견하고 복화술사에게 자신이 다중인격이 되어버렸기 때문에 아내를 살해한다고 제자가 스승을 모함한 것으로 보이는 사건을 다시 조사하는데...

카즈하와 헤이지를 따라서 나가노 산중에 있는 여관을 찾은 모리 부녀와 코난 일행은 여관에 나타났다던 카마이타치의 정체에 대해 취재하러 산중 여관을 방문한 잡지 기자인 나카마 다이고와 코야나기 미도리를 여관 안주인인 오노 타카미가 맞이하는 것을 보게 된다. 하지만 여관 안주인의 의부인 본조 씨가 분위기를 싸늘하게 만드는데 일행은 창고에 있다던 커다란 갈고리형 낫이 카마이타치의 낫이라는 가설을 확인하기 위해 창고에 가지만 갈고리 낫을 발견하자마자 백열전구가 깨지더니 창고에서 헤이지와 모리 탐정, 그리고 코야나기 미도리를 누군가 습격하고 이윽고 여관 안주인의 의부인 본조 씨의 비명소리가 들려오는데...

헤이지와 코난은 카마이타치의 창고 습격에 이어 본조 씨가 갈고리 낫이 꽃힌 채 발견되자 사건 현장의 상황을 사건 접수차 산중 여관을 방문한 야마무라 반장과 모리 탐정에게 설명한다. 본조 씨를 살해한 범인이 노천탕을 활용해 도망친 속임수를 해명하고자 하는 가운데 본조 씨의 비명 소리가 사건 녹화된 것일 가능성이 높아지는 가운데 범인이 어떻게 창고에 있던 갈고리형 낫을 훔쳐 여관 안주인의 의부인 본조씨에게 낫을 꽃고 알리바이를 만들 수가 있었는지 코난과 헤이지가 모리 탐정과 야마무라 반장에게 비명 이후의 사건 경과를 재현하는 실험을 시연해 일련의 사건을 일으킨 범인이 과연 누구인지 알아보자고 제안하는데...

타케다 신겐과 우에스기 신겐이 결전을 치루었다던 카와나카지마를 둘러보던 모리 부녀와 코난 일행은 야마토 경부 일행과 만나 야마모토 칸스케의 명소순례를 마치고 치쿠마 강변에서 경치를 감상하던 도중에 나가노 현경 타케다 반장의 목만 남은 시체를 발견하게 된다. 카노, 사에구사, 아키야마는 피해자인 반장이 단독 행동한 것으로 판단하지만 새로 부임한 쿠로다 수사과장은 만일을 위해 수사하라고 지시한다. 쿠로다 수사과장 명령대로 수사했더니 모로후시 경부가 타케다 반장과 관련된 2건의 사건을 발견하지만 공교롭게도 사건 당일 아침 야마토 반장으로 보이는 인물을 목격했다고 하는 증언이 떠오르는데...

타케다 반장 살인사건을 조사하던 도중 카노 형사마저 시체로 발견되자 유력한 용의자로서 야마토 반장이 떠오르는 가운데 아키야마 형사가 탐문 중 비에 젖은 옷을 갈아입고 오겠다고 말한 후에 강도범의 은신처로 추정되는 사이죠 산으로 갔다는 사에구사 형사의 전화가 모로후시 경부에게 전해진다. 쿠로다 수사과장 등과 동행하여 아키야마 형사를 찾던 도중 아키야마 형사의 다급한 함성이 들리고 자동차에 끌려 절벽 아래로 떨어지는 아키야마 형사를 목격하게 된다. 야마토 반장이 보낸 듯한 휴대전화 문자와 다른 정황 증거로 인해 연이은 일련의 사건을 일으킨 유력한 용의자가 야마토 반장인 것으로 좁혀지는데...

타케다 반장과 카노 쇼지 형사를 연이어 살해한 유력한 용의자로 야마토 반장이 지목되는 가운데 사에구사 경감이 야마토 경감으로 보이는 인물을 목격했다는 정보를 제공한 인물을 만난다는 명목으로 사이죠 산으로 야마토 경부를 만나러 모로후시 경부의 자동차를 운전하면서 사건은 절정을 향해 치닫는다. 하지만 사에구사 경감을 기다리고 있었던 인물은 야마토 반장이 아닌 야마토 반장인 척 문자를 보내 사에구사 경감을 살해하려 대기하고 있던 범인이었다. 그런데 모로후시 경감이 타고 왔던 모로후시 경부의 자동차의 트렁크에는 야마토 반장이 자신을 유력한 용의자로 유도한 진범을 기다리고 있다고 여겨지는데...

어떤 남성이 포와로에서 아침에도 불구하고 모닝세트 대신 햄샌드위치를 시킨다. 학교를 마치고 하교 하던 코난 일행들이 포와로 앞을 지나가자 코난은 의문의 남성이 아직도 포와로에 있는걸 의아해 한다. 코난은 포와로에 가서 아무로에게 아까 남자 손님이 아무로를 계속 보고 있었다며 말하고 아무로는 자신도 느꼈다고 말한다. 그리고 코난이 조직 사람이 아니냐고 물어보지만 조직 사람은 아닌 것 같다고 아무로는 말한다. 나중에 알고 보니 아무로가 만든 샌드위치에 반한 어느 빵집 청년이 샌드위치의 맛을 알아내기 위해 동분서주한 것이었는데...

아가사 박사를 따라 호텔에 있는 케이크 뷔페를 방문하게 된 소년 탐정단(어린이 탐정단) 일행은 거기서 2명의 블로그 여배우를 만나게 되는데 미니 헬기를 조종하던 키타미 사야와 그것을 트집잡는 쇼노 쿄코였다. 공교롬게도 키타미 사야의 시중을 드는 이는 사쿠라코, 그 2명의 여배우는 호텔이 배경이 되는 연속극의 출연진으로 호텔에 머물고 있었다. 그런데 쇼노 쿄코는 키타미 사야에게 무언가 비밀을 잡고 있는 듯한 발언을 하고 이윽고 밀실에서 살해당한 채 발견되는데...

여배우들에 관한 하이바라의 논평을 듣고 동기와 범행 은폐 수법을 알게 된 코난은 쇼노 쿄코가 키타미 사야에게 발언한 비밀이 무언지 깨닫고서 사건을 재연하고 쇼노 쿄코가 본래 키타미 쿄코에게 밝히려는 비밀과 키타미 사야가 쇼노 쿄코에게 살의를 품은 동기가 각기 다름에도 암호로 인해 비극이 일어났음을 밝혀내고 사건을 해결하며 현장을 떠나려는 순간 쿠로다 수사과장이 갑자기 나타나서 코난 일행과 아가사 박사에게 사건을 해결해 주었다며 감사의 인사를 전하는데...

우주인 복장과 관련된 사고가 실제로는 피해자에게 협박받은 범인이 벌인 살인 사건임을 밝혀내며 해결하는 에피소드.

사라진 약혼녀를 찾아달라는 재벌가 아들의 의뢰로 약혼녀가 얽힌 어느 치정 살인의 내막이 밝혀지는 에피소드.

란은 떠오르는 인기 가수인 리서 퍼플의 콘서트에 참석하기로 한다. 게다가 코고로는 그녀의 보디가드 역할을 하기로 한다. 그런데 공연이 시작되기 전에 괴한이 나타나 란을 리사 대신 납치한다. 납치범들이 실수를 찾아 내서 란을 숨겨 놓으려고 할 때 상황이 악화되는데...

소녀, 코 고로, 코난 메구레, 다카기를 찾는데 거의 의식이없는 시간이 범인의 함정에 빠져 납치 사건이 발생하기 전에 란이 전화로 그를 쐈다는 것을 나타냅니다. 그 후에 고객은 전화를 검색 할 수 있지만 경찰은 그를 붙잡을 준비가되어 있습니다. 그래서 Ran은 너무 늦기 전에 구출되었습니다.

비내리는 기차역에 모인 7명의 용의자를 심문하며 사건의 내막을 밝히면서 또다른 불상사를 막아내는 에피소드.

어느 형제가 사찰의 재산을 가로채려고 침입했다가 주지 스님에게 들키게 되는 에피소드.

J 리그 빅 오사카의 선수인 히고 류스케와 인기 아이돌인 오키노 요코가 백화점에서 사이 좋게 쇼핑하고 있었다는 열애 발각이 뉴스로 보도되어 히고의 팬인 하이바라와 요코의 팬인 모리 탐정은 큰 충격을 받는다. 히고와 요코는 같은 고등학교 졸업생이었지만 하이바라는 히고와 요코의 열애설 조사를 해달라고 모리 탐정에게 의뢰. 모리 탐정은 의지라는 명분이 있었기 때문에 두 사람의 열애가 사실인지를 알아보기로 하는데...

빅 오사카 선수인 히고 류스케와 인기 아이돌인 요코의 열애 발각 뉴스가 보도된다. 히고와 요코는 히고의 고등학교 선배인 아스카가 J 리거 은퇴 후에 운영하는 레스토랑에서 식사를 하고 있었다. 코고로, 코난, 하이바라는 2 명을 감시하고 열애 사실인지 여부를 확인하려다가 히고와 요코가 창고에서 살해 된 아스카의 시체를 발견한다. 코난은 소믈리에인 야마다, 웨이터인 코노에, 웨이트리스인 미네코 중에 범인이 있다고 여기고 살인 사건과 얽힌 열애 발각 사건을 해결하기로 하는데...

우연히 비를 피하러 들어간 저택에서 맞이한 살인 사건의 범인을 소년 탐정단이 기지를 발휘해 구속하는 에피소드.

어느 바닷가 공원에서 발견된 시체를 둘러싼 공방 끝에 시체를 공원에 유기한 인물이 극적으로 밝혀지는 에피소드.(한)시즌 15의 마지막 에피소드

밀실 상태의 서재에서 죽어있던 남편을 발견한 아내의 발언과 사건 현장의 상황에서 느낀 기묘함으로 진실에 다가서는 에피소드.

학교에서 돌아오는 도중에 코난, 란, 소노코, 세라는 라면 담론으로 분위기가 무르익어, 세라가 단골 라면집에 모두를 데리고 가게 된다. 그런데 그 가게는 예전에 독살 사건이 있었던 "진짜로 죽을만큼 위험라면 오구라"였다. 가게에는 오구라 점장과 종업원 마키 외에도 라면에 식초를 뿌려먹는 쇼노, 만두에 간장을 듬뿍 부어먹는 미즈시나, 그리고 국수에 후추를 많이 넣어서 먹으려 한 회사원 나카니시 오사무가 앉아 있었다. 코난은 양념을 많이 사용하는 3 명의 행동을 이상하게 생각하는데...

갑자기 들이닥친 유미와 나에코였지만 1주 전 술집종업원인 아츠코를 살해한 강도살인범을 발견해서 "진짜로 죽을만큼 위험라럼 오구라"에 몰아넣었는데 라면에 식초를 뿌려먹는 쇼노, 만두에 간장을 뿌려먹는 미즈시나, 후추를 자주 찾는 회사원 나카니시 중 누군가라는 사실만 알아냈을 따름이었다. 그런데 오구라 점장은 그 당시에 손님이 한 명 더 있었다면서 유미와 세라가 잘 아는 누군가를 소개한다. 세라와 코난은 그 인물의 증언을 듣고서 호스를 돌리고 있었던 범인이 아직 수백만의 보물을 회수하고자 아직도 라면 가게로 오고 있다고 생각하는데...

어느 장난감 가게를 운영하던 노인이 고리사채업자를 장난감을 이용해 살해한 사건을 해결하는 에피소드.

코고로, 코난, 란은 좀비 영화의 촬영지에 갔다, 그곳에서 헤이지와 카즈하가 나타나게 된다. 한 커플이 이 별장 근처에서 목뼈가 부러진듯한 좀비를 보게 되었다고 해서, 이 말을 듣고 헤이지는 사실인지 확인하러 온 것이다. 그리고, 이 좀비 영화의 속편예고를 찍으러 온 영화 관계자들도 만나게 된다. 찰영자 중 프로듀서가 갑자기 사라지게 되고, 모두 함께 별장 안을 찾기 시작한다. 코난과 헤이지는 쓰러진 프로듀서를 발견하게 되고...

코난은 좀비 영화 촬영지의 대여 별장해서 프로듀서인 하라와키를 발견했다. 스마트폰에는 하라와키가 청산가리(독극물)을 마시는 동영상이 남아 있었다. 하지만, 신고를 하기 위해 차를 움직일 수 있는 것은 숨져버린 하라와키 뿐.. 휴대폰 전파도 터지지 않는 곳에서 코난은 경찰을 부를 수도 없는 상황... 밤 중에 복통을 호소하는 코고로(유명한)은 별장 주위에 좀비가 있다며, 란(미란)이와 카즈하(가영)에게 말한다. 란(미란)과 카즈하(가영)이는 처음에 믿지 않았지만, 그 후, 좀비 떼들이 덤벼들기 시작한다. 그리고 코난과 헤이지는 좀비들과 싸우게 되는데...

좀비 영화의 촬영지로 쓰리는 별장에서 하리와키에 이어서 쿄코마저 죽고 만다. 스마트폰에는 쿄코가 좀비에게 물려 죽게되는 영상이 담겨져 있고, 방에 있던 히라와키의 시신이 사라지고 만다. 코난과 헤이지(하인성)은 이번 사건이 8년 전의 부장이 죽은 사건과 관련이 있다고 생각한다. 코난은 8년 전의 사진과 카즈하의 말을 이번 사건의 실마리 삼아 사건의 진상에 다가서게 된다. 그리고 코난은 옷장의 장치에서 이번 사건의 트릭과 함께 범인이 누구인지 알아내게 되는데...

모리 탐정이 잡은 용의자가 연루되었던 사건의 관계자들이 연이어 살해당하는 일의 진상을 알아보는 에피소드.

돈을 빌려주는 회사가 코고로를 고용하여 이상한 위협 편지의 저자를 밝혀내기로 한다. 코난과 코고로는 그들이 살고있는 건물로 간다. 근데 "죽어라"고 외치는 사람이 귀에 들어왔다. 그들이 들어오니, 칼을 든 사람이 휼기를 배에 박았으며, 다른 사람은 죽었다고 한다. 그런데 코고로는 희생자가 이미 목 졸려 죽었다고 전했다.

살인 동기는 같은 돈을 빌려주는 사람에 대한 복수를 닮았다. 살인자는 이미 그가 죽은 후에 그를 찔 렀던 사람입니다. 코난은 코 고로 목소리로 사건을 해결합니다.

코난, 소노코, 란, 그리고 두 친구가 녹음 스튜디오에 가서 노래를 녹음하기로 결정. 그들은 곧 나오는 공연에 대해 논쟁하고 있는 여자 밴드의 멤버들을 만난다. 드러머는 나중에 스튜디오에서 교살된 것을 발견한 그녀의 밴드 멤버 3 명 중의 하나가 그녀를 살해한 것으로 추측되지만, 경찰이 그녀를 죽이는 데 사용 된 끈 같은 무기를 찾을 수 없어서 조사에 몇 가지 문제가 발생하는데...

메구레 경부는 밴드 멤버 3명 중의 하나에게서도 교살 무기를 찾을 수 없자 드러머가 종종 다른 밴드와 싸우며 다른 누군가가 살인을 범했을지 모른다는 결론에 도달하게 된다. 한편 남아있는 세 명의 밴드 멤버의 이야기를 들은 코난은 밴드 연습의 영상을 확인한다. 피해자를 죽이는 데 사용되는 끈 같은 무기가 스튜디오에서 발견되지 않았던 살인자가 누구이며 살인자가 사용했던 놀라운 트릭과 그 이유를 깨닫게 되는데...

열기구 날리기 행사장에서 우연히 사고처럼 일어난 사건의 진상을 파헤치는 에피소드.

하산 중에 길을 잘못 든 코고로와 란, 코난은 지나가던 작가 시모무라 쇼조를 만나 인근에 민박집이 있다는 말을 듣는다. 그 곳에 도착해 경치를 감상하던 란과 코난은 창문 밖으로 공무소 경영자 이마즈와 촌장 마야마가 뒷돈 문제로 다투는 걸 목격한다. 다음 날, 돌아가는 버스 시간을 기다리다 인근에 텐구의 동굴이 있다는 말을 들은 란 일행은 동굴 구경을 나섰다. 이윽고 직원 히라이와 함께 동굴내부 화면을 함께 보다가 누군가 자살시도를 하는 장면을 목격해 동굴 안으로 서둘러 들어갔지만, 이미 촌장 마야마는 죽은 뒤였다. 한편, 코난은 이곳 저곳을 조사하다가 동굴 속에서 이따금씩 들려오는 텐구의 목소리를 듣고는 사건의 진상을 파악하는데...

어느 여성 용의자의 알리바이를 통해 밝혀지는 살인 사건의 내막을 파헤치는 에피소드.

억세게 내리는 비의 정류장 앞에서 일어난 교통사고의 전말을 접힌 우산을 통해 밝히는 에피소드.

어느 사건 의뢰인의 부탁으로 이뤄진 드라이브 데이트에서 얻어낸 어떤 사건의 정보로 숨겨진 진상을 밝혀내는 에피소드.

코난은 세라가 아카이의 여동생이 될 수 있으며 왜 미국을 떠나 일본으로 돌아갈 수 있었는지를 반추해본다. 그가 동생의 생사와 행적을 확인하기 위해 돌아왔을 적에 그는 이전에 FBI에서 일했던 것처럼 더 많은 정보를 요구하지 않은 이유가 궁금해 한다. 한편 아가사 박사는 탐정단과 점심 식사 중에 요리사가 칼에 찔리고 범인이 도망가는 사건이 발생한다. 코난은 겐타, 미츠히코와 아유미를 호출해 범인이 다른 계단을 벗어 났음을 알아낸다. 겐타, 미쓰히코, 아유미 모두가 범인을 보았지만 각자의 설명은 다른 사람들과 완전히 달라 사건 수사의 혼선이 빚어지는데...

메구레 경부는 겐타, 아유미, 미츠히코에게 범인에 대해 질문하지만, 그들이 본 상대방의 증언은 매우 달라 혼선을 빚는다. 코난은 친구들의 감정을 손상시킨 특정 상황에서 같은 사람이 보였기 때문에 친구들의 증언이 모두 다르다는 것을 깨닫게 된다. 탐정단과 코난은 백화점의 여러 층을 방문하여 어째서 다른 범인을 보았다는 증언이 나오게 되었는지 확인한다. 결국 사건을 해결하고 마침내 코난은 영역 밖의 여동생과 하이바라의 닮은 점을 알아차리게 되는데...

코고로는 카라하시 그룹의 전담변호인 키미히코씨로부터 총수 고타로의 유언장이 금고에서 도난당했다는 의뢰를 받고 수사에 나선다. 한편, 코난은 소년탐정단과 함께 신작 게임을 사러 가던 중 문고리가 강제로 파손된 수상한 현장을 목격하고, 아이들을 먼저 보내고 사건을 조사하다가 누군가에 의해 발각되어 모처에 감금되고 만다. 코고로는 키미히코씨와 함께 고타로의 장례식을 준비하던 그의 자녀 코조, 미츠요, 에이스케를 찾아가 알리바이를 묻지만, 서로 달갑지 않은 관계라는 점과 아침에 서로 전화 연락을 주고 받았다는 사실만 확인한다. 그 시각, 하이바라는 소년탐정단의 연락을 받고 묘연해진 코난의 행방을 찾기 시작하고 코난은 자신이 감금된 곳이 운구차임을 알게 되는데...

란은 코고로의 부탁을 받고 상복을 가져다 주기 위해 장례식장에 가던 길에 소년탐정단이 머뭇거리고 있는 것을 발견한다. 란을 만난 소년탐정단은 코난이 조사하던 사건과 코고로가 만나러 갔던 변호사 사무실이 무슨 관계가 있음을 직감하고, 코난을 구하기 위해 코고로가 갔다는 장례식장으로 향한다. 하지만 이미 고타로씨의 운구차는 출발한 뒤였고, 뒤따라 간 코고로 일행은 골롬보 반장의 도움으로 고타로의 관을 열어보지만 그 곳엔 코난이 없었다. 한편 하이바라는 고타로의 운구차 외에 폐차 예정인 구식 운구차가 비슷한 시간대에 출발했음을 알게 되고, 코난과 탐정단 뱃지로 교신하면서 그 차를 뒤쫓는다. 그러던 도중 코난은 사건의 전모를 파악하는데...

치바 형사는 석달 전에 일어난 불가사의한 사건을 조사하고 있었다. 하이도 고교의 부지 안에서 콘크리트에 얼굴을 쳐박힌 상태로 질식사한 잡지 편집자인 나카츠, 시체와 함께 콘크리트에 쓰려져 있던 UFO 마니아아인 쿠치키가 용의자 선상에 오른다. 범인이 피해자의 머리에 씌워 질식사시킨 봉투 형태의 흉기는 발견되지 않았다. 쿠치키는 석달 전까진 침묵하고 있다가 수사가 재개되자 범행을 부인하고 UFO에서 내려온 우주인이 둥둥 떠있은 채로 피해자인 나카츠를 살해했다고 증언한다. 방범 카메라에도 UFO처럼 보이는 기분 상할 만한 그림자가 비추고 있었는데...

얼굴을 콘크리트에 쳐박고 질식사한 나카츠, 함께 사건 현장에 쓰러져 있던 쿠치키는 용의를 부인하고 UFO에서 사건 현장으로 내려온 우주인이 나카츠를 살해했다고 증언한다. 방범 카메라에도 UFO와 유사한 그림자가 비춰지고 있었다. 코난은 치바 형사 일행과 쿠치키 집을 방문하여 쿠치키에게서 이야기를 듣는다. 방문한 쿠치키의 방에서 코난은 어떤 물건을 발견하고 쿠치키의 이해하지 못할 행동에 대한 이유를 알아낸다. 코난은 UFO를 목격한 히나에게 UFO의 형태를 확인하고 사건에 대한 진상을 알아낸 코난은 모두를 불러모아 실험을 진행하는데...

순경인 유미는 왕장전에 관한 뉴스를 보고 나서야 거동이 수상해 보였던 자신의 전 남친 하네다가 쇼기 기사라는 것을 처음으로 알게 된다. 수년 전, 하네다에게 봉투를 건네받고 7장을 모을 때까지 열지 않았으면 좋겠다고 요청받았던 유미지만 하네다가 쇼기의 7관왕 자격을 갖추기 위해 준비하는 것을 모르고 있었다. 그런 유미를 보고서 사토 형사는 봉투의 내용물을 혼인 신고서라고 추측하지만 당일 아침에 유미는 봉투가 끼워진 잡지를 쓰레기장에 두고 왔는데 유미 일행이 다시 쓰레기장을 방문해 보지만 잡지는 사라져 있었다. 지나가던 코난과 함께 있던 소년 탐정단도 유미에게 협력해 봉투를 찾아보기로 하는데...

유미의 말을 듣고서 코난은 관리인이 봉투가 끼워진 잡지를 쓰레기장에서 꺼내 다시 유미의 방문 앞에다 놓았다고 추측, 관리인 하치즈카를 만나지만 하치즈카는 하네다가 유미에게 건네준 봉투에 들어있던 혼인 신고서를 숨겨버리고 컴퓨터에 8자리 숫자로 이뤄진 암호를 걸어둔다. 방에 있던 암호를 해독하고 8자리의 숫자를 입력하면 봉투의 소재를 알아낼 수가 있는데 코난은 1장으로는 성립하지 않는 암호일 수도 있음을 생각해 모두와 함께 다른 1장의 암호를 찾아보게 된다. 그러던 도중, 유미는 암호 종이가 원본이 아닌 복사된 것임을 알아채고 코난은 실마리로 암호를 해독, 유미가 암호를 컴퓨터를 입력하기로 하는데...

코고로는 코난과 란을 데리고 오이타현의 벳푸 온천으로 간다. 코고로의 진정한 목적은 나카다이 사장의 실종된 딸인 마나미를 찾는 것입니다. 마나미는 전 남자친구인 하야미 히로유키를 만나기 위해 벳푸에 왔을 가능성이 큽니다. 코고로는 마나미를 찾을 수 있지만 그녀는 납치됩니다. 한편, 형사 사토 미와코와 경찰은 오이타현에서 무장 강도를 쫓고 있는데...

마나미는 납치되고 몸값 1억엔이 든 가방은 드론을 이용해 오기쿠보 류지가 옮긴다. 형사 사토와 타카기 역시 무장 강도 사건의 용의자로 오기쿠보를 쫓고 있다. 오기쿠보는 사토를 인질로 잡고 온천으로 향한다. 그곳에서 공범자와 만나 몸값을 나누기로 한다. 형사들은 오기쿠보를 체포하지만 가방 속 1억엔은 사라진다. 코난은 사건을 해결하기 위해 마나미와 오기쿠보의 공범자를 쫓는다.

코난은 란, 소노코, 세라와 함께 벚꽃이 만개한 길을 걷는 동안, 란은 쿠도 신이치를 어떻게 만났는지 회상합니다. 13년 전, 란은 유치원 반에서 몇몇 소년들에게 왕따를 당하고 있었습니다. 이제 막 입학한 신이치가 그녀에게 접근했다. 신이치는 에후네 론스케 선생님이 란을 계속 쳐다보고 있는 것을 보고 무슨 일이 일어나고 있다고 의심합니다. 나중에 에후네가 란에게 편애를 보이자 수상쩍다고 생각한 신이치는 에후네는 각각의 행동을 설명하지만 신이치는 에후네가 뭔가 음모를 꾸미고 있다고 의심하는데...

신이치는 부모에게 에후네 론스케의 란에 대한 수상한 행동에 대해 이야기한다. 다음날 에후네는 아이들을 유치원에서 멀리 떨어진 공원으로 데려간다. 쿠도 유사쿠는 변장을 한 뒤, 아이들을 상태를 확인하러 갔고, 주차된 채 있는 밴의 운전자가 아이들의 사진을 찍고 있는 것을 목격한다. 유사쿠는 에후네의 아내가 공원 옆 병원에 머물고 있다는 사실을 알게 되고 에후네의 음모를 파헤치기 시작한다.

코난과 소노코는 쿄고쿠가 수련 중인 오사카 도장에 도착한다. 도장의 주인인 타카미는 한때 쿄고쿠에게 가라데 훈련에 많은 도움을 주었습니다. 코난과 소노코가 아이들이 연습하는 것을 지켜보는 동안 가지요시가 나타나 타카미의 동의서에 서명을 받습니다. 타카미가 대출을 받을 정도로 도장 운영이 어려워져 도장 매각을 고려하고 있는데.. 도장의 진열장에서 중요한 검은색 벨트를 도난당합니다. 쿄고쿠는 벨트를 훔친 혐의를 받고 타카미에게 싸움을 걸고, 그가 이기면 도장은 열려 있고, 타카미가 이기면 벨트를 돌려주는 제안인데...

코고로와 코난은 방 앞에 서 있는 세 사람(사키의 친구 마이코, 빌딩 매니저 요시에, 배달원 마츠다)이 도움을 요청하자 4층 아파트를 수색한다. 안에는 주민 마에하라와 그의 아내 사키의 시신이 있습니다. 데이 트레이더 마에하라는 최근 돈을 많이 벌었고 귀중품이 아파트에서 사라졌습니다. 메구레 경위는 아파트의 상태와 세 사람의 증언을 통해 사키가 강도인 척하고 마에하라를 살해했지만 피해자로 위장하다가 실수를 하여 스스로 질식했다고 추론한다. 하지만 코난은 사건 현장에서 이상한 점을 눈치채는데...

The body of neighborhood nuisance Tatsuya Amagi is found in the park of a high-class neighborhood. He was stabbed numerous times by an awl-like weapon. Next to the body is the bloodstained medical examination card of neighborhood association president Hikoichi Bando. The police head to Bando's home to question him, but discover Bando has been poisoned with a combination of liquor and pesticides, and near his body is a bloodstained awl.

반도의 집에서 발견된 한 가지 증거는 대학 교수 치노 요스케를 유력한 용의자로 만든다. 그러나 코난은 진짜 살인마가 치노를 누명을 씌운 사건과 이유에 대해 뭔가 잘못되었다는 것을 깨닫습니다. 코난은 카페에서 중요한 단서를 발견하고 실제 일어난 일과 진짜 살인범의 정체를 깨닫는다.

하이킹을 하던 중 코난과 그의 친구들은 산장에서 캠핑카인 에이코, 아시즈카, 하야시다, 타케미를 만납니다. 네 사람은 3년 전 우연히 넘어진 친구 모토키의 죽음을 추모하기 위해 모였습니다. 절벽 아래 텐트에서 혼자 야영을 하던 타케미는 다음날 아침 살해된 채 발견된다!

도둑을 잡기 위해 고용된 코고로. 사건을 처리하는 동안 준코의 이웃 키타가미의 시체는 그녀의 아파트 건물 뒤편 주차장에서 발견됩니다. 코고로는 키타가미가 술에 취해 실수로 자신의 방 704호에서 떨어진 이유. 코난은 키타가미가 도난 방지 장치가 완비된 아파트에 키타가미가 자신의 현관문을 잠그지 않고 남겨둔 것을 이상하게 여깁니다...

부동산 회사 사장인 히야마가 아가사 박사가 발명한 가위를 쥐고서 죽은 채 발견되어 아가사 박사가 참고인으로 현장에 가게 되었는데 하네다 코지 건으로 사건에 관심이 있던 코난과 오키야 스바루는 아가사 박사의 동행인으로서 현장을 방문하게 된다. 현장에서 히야마 사장을 발견한 건 사탕탕 가게를 운영했던 센바였는데 센바를 수상하게 여기던 아가사 박사의 추리와는 다르게 센바는 현장인 집안으로 흉기를 지닌채 들어올 수도 없었다. 17년 전의 하네다 코지 건과 유사한 점이 사건 현장에 있었기에 센바의 행동을 재현하던 코난과 오키야 스바루는 모순을 느끼게 되는데...

코난과 오키야 스바루는 센바가 사건을 일으킨 범인으로 범행 도구인 흉기를 히야마 사장의 경호원이 모르게 지붕으로 던져 사건 현장으로 반입하여 범행을 저지른 것으로 본다. 코난과 오키야 스바루의 추리를 듣게 되자 센바는 범행을 자백하고 히야마 사장이 자신의 가족을 구슬려 본인 모르게 사탕 가게를 히야마 사장에게 양도한 것을 알게 되자 복수심에 불타올라 범행을 저지르게 되었다고 고백한다. 이후 사건 현장에 남아 있던 수수께끼를 풀이하는 과정에서 코난과 오키야 스바루가 문자 재배열을 하자 하네다 코지 건에서 지금까지 몰랐던 놀라운 사실을 발견하게 되는데...

코고로는 하네다 코지의 영혼을 불러내겠다는 홋타 가이토의 사무실에서 걸려온 전화를 받는다. 처음에 거절한 코고로였지만 늦은 밤에 방영되며 오키노 요코가 진행자라는 사실에 받아들이고 코난과 함께 호텔 로비에서 디렉터 코구리 텟페이를 만나 가이토의 시체를 발견하게 된다. 후에 사건 현장을 둘러보는 동안 옆방에 세라 마스미가 머무는 객실이 있음을 알게 된 코난은 자신이 세라의 방에 목소리 변조 나비 넥타이를 두고 온 것을 기억하지 못한채 현장으로 복귀한다. 한편 코난이 두고 온 나비 넥타이를 나중에 세라와 함께 머무는 메리가 집어들게 되는데...

코난은 사건 현장을 둘러보는 동안 범인이 사용한 속임수를 간파하게 되고 코고로를 잠재워 사건을 해결하려 하지만 목소리 변조 나비 넥타이를 옆방에 두고 온 것을 나중에서야 깨닫게 된다. 한편 세라는 코고로의 목 뒷덜미 근처에 자신의 휴대전화를 놓고 나비 넥타이를 통해 목소리를 변조한 메리의 추리를 들려준다. 메리가 밝힌 범인은 디렉터 코쿠리 텟베이, 트릭은 코난이 생각한 것과 같았다. 추리로 자신이 범인이며 자신의 범행이 드러나자 텟페이는 가이토가 저질렀던 부도덕한 행적을 범행 동기로 밝힌다. 추후에 메리는 세라에게 코난에 대하여 경고하는데...

어느 나른한 오후, 코난과 겐타, 그리고 미츠히코는 공터에서 공놀이를 하고 있었는데 옆집에서 어떤 남자가 괴성을 지른다. 피해자는 구관조를 기르고 있었는데 구관조는 날아가고 없었다. 피해자를 살해했을 것으로 추정되는 인물은 피해자의 조카, 피해자의 말동무, 그리고 피해와 거래를 하던 도서 판매상이었다. 사건 현장에서 날아간 구관조를 발견한 모리 탐정 부녀가 사건 현장에 도착하고서 구관조는 요상한 행동을 하면서 사건 현장을 배회한다. 코난은 용의자의 발언과 이러한 광경을 보고 누가 범행을 저질렀는지 깨닫고 어찌된 일인지 알게 되었는데...

신이치의 집을 청소하던 중 코난과 스바루는 란과 소노코가 ASACA라는 제목으로 17년 전에 작곡된 노래의 가사를 발표할 음악가에 대해 이야기하는 것을 우연히 듣습니다. 이것에 대한 무언가는 그것이 검은 조직과 관련이 있을 수 있다고 믿게 만듭니다. 음악가의 리허설에 도착했을 때 아무로는 카페에서 아즈사와 함께 거기에 있었습니다. 하지만 변장한 베르무트입니다!

음악가 하도는 콘서트홀 무대 위 목에 매달려 발견된다. 아무로가 스바루가 자신의 진정한 모습을 드러내도록 유인하기 시작하자 코난은 자신이나 스바루의 정체가 의심되는 것을 원하지 않기 때문에 균형을 잡으려 합니다. 사건이 진행되는 동안 세 사람 모두 범죄 현장에서 어떤 물건이 사라졌는지 확인합니다. 합동 추리를 통해 코난, 아무로, 스바루는 무대를 수색하고 사건의 진상과 살인범이 피해자의 시신을 들어올리기 위해 사용한 속임수를 알아내는데…

코난 일행은 들고 다닐 수 없는 책을 가지고 노부인을 돕습니다. 가게에 있는 동안 그는 필요하지 않은 새 책을 사기 위해 아들과 논쟁하는 것을 보았습니다. 옆집 공원에서 책 더미가 떨어져 주인을 다치게합니다!

A robbery goes wrong when a gang starts to murder it's victims. One gang member manages to escape, but is shot with a crossbow bolt in the process. While Conan and the Detective Boys are on a weekend adventure with Professor Agasa, they find the shot gang member passed out on a villa property. It seems the gang is still hunting for him.

After falling head first off a cliff into the sea, Conan and the escaped gang member are thought to be dead. Having managed to get into a tunnel under the cliff, they now use their status to try and catch the rest of the gang at their next heist with Haibara's help.

The Detective Boys go to Gifu to explore and see a local hero show. Afterwards, Mitsuhiko goes to ask for their autographs. While waiting, the Detective Boys feel he's been gone a long time. When they go to their tent, they find the heroes and Mitsuhiko have gone missing!

Heiji is invited to Yadori Village along with a historian, archaeologist, reporter, and a writer along with Conan, Ran, and Kazuha. Following a group dinner, a mysterious sound is heard and a fire is started outside. A mythical beast, known as a Nue is thought to be seen outside.

While seeing the Nue outside, the historian goes missing and is found dead in the woods with claw-like marks. Ran and Kazuha move rooms after finding mysterious writings from its deceased inhabitant.

As the Nue appears again, the archaeologist has been poisoned, but everyone was visible while it happened. Conan and Heiji quickly move towards finding the culprit before another murder occurs.

Kogoro, bringing along Ran and Conan, is requested to investigate a Buddha statue rumored to have moved on its own. He meets Eikyo Fukuhara, his family (wife Masako, daughter Yuka, and son Eizen) and Buddhist trainee Junko Wakuda. After dinner, Eikyo displays uncaring behavior, leaves to go pray, and is later found dead with a knife in his neck. Kogoro, after finding clues thanks to Conan, declares Junko to be the killer after he attempted to scare Eikyo. Junko confesses but Conan isn’t satisfied. After finding rice powder near the victim, Kogoro is tranquilized and Conan reveals Masako to be the real killer. She discovered Junko’s scare tactic had failed, stabbed her husband to death, and framed Junko for the murder. Masako confesses stating Eikyo‘s rude and cruel treatment to his family as her motive and has a sense of relief now that he is dead. She maniacally laughs over her actions as she is arrested.

While at a high tech plant, Conan, Ran, and Kogoro witness a murder. One of the employees was strangled. Was it a murder or is there more to it?

A thief makes a run for it after being caught by the person they were stealing from. During his escape, he runs into Genta, who he quickly pushes out of his way. As Genta pursues, the thief runs into another man knocking him unconscious, both tumbling down a hill. When he awakes, he switches clothes to frame the man he knocked out.

As Ran, Sonoko, and Sera try on swim suits, Conan wonders through the department store and overhears a lady accosting the other people near her dressing room. After Conan leaves, he later hears a scream from that area. The rude woman turned up dead.

As Conan investigates the dressing room murder, he thinks about a bigger mystery: what Sera is hiding about her past. Conan and Ran both begin to recall a meeting with her from over 10 years ago.

Conan and the Detective Boys get stranded in the rain and take shelter in a nearby mansion. Upon entering, it is learned the master of the house's wife died several months ago and he believes he is seeing her ghost!

Ten years ago, Masumi, taken by her middle brother Shukichi and their mother Mary, reunite with Shuichi who did not take the test yet to become an FBI agent in the Atsuhama Beach, Shizuoka Prefecture. Mary had an off-screen fight with him where they both managed to injure each other's eye. Throughout the case Mary warns him to stop investigating the disappearance of his father. The Akai family also encountered Shinichi, Ran, and Yukiko who also happened to be there. Shinchi introduces himself as "Holmes Apprentice". All of them end up being involved in a case where two robbers robbed a watch shop with one of them accidentally got killed in an accident, and the other was still on the run.

Ten years ago, immediately after a young Kudo Shinichi meets Akai Shuichi's family on the beach, a car falls off a cliff. It becomes clear the car belonged to two thieves who robbed a watchmaker. The driver died immediately, but their accomplice fled from the sinking car and blended in with the crowd on the beach. With the help of Shinichi and his friends, Shuichi narrows down the suspects to Fukumizu Shigekatsu, Kitamori Yasue, and Oami Raiya. The police detective decides to question the three of them, and Shuichi determines which of them is the robber based on their testimony...

A pop-up book and pink smartphone arrive at the Mori Detective Agency. The book turns out to be a warning of the serial bombings that have been occurring. The culprit is Hirukawa Takuji, half-brother of Imai Kenichi, the now deceased author of the book, and a man with a previous bomb manufacturing conviction. Due to his hatred of detectives, Hirukawa chose the famous Kogoro to become involved in the case. The locations of the bombs are riddles, and Conan works with Kogoro, Megure, and publisher Tomonaga Hiroyuki to find them, but...

A pop-up book and pink smartphone are delivered to the Mori Detective Agency. In the pop-up book are warnings of a series of explosions. The riddle for the location of the third bomb is "the middle of 7." Conan and his friends think of things expressed in sevens and what the middle of those things might be. In a week, it's Thursday. In a rainbow, it's green. In a musical scale, it's fa. Overwhelmed by the number of possibilities, Kogoro holds his head in his hands. At the police station, they begin searching for places, companies, and schools corresponding to Thursday, Green, and fa, but Conan reasons that Hirukawa's target lies elsewhere...

Conan and Heiji go to Poirot to while waiting for Ran and Kazuha. While there, a gathering of old friends is quickly interrupted by a power outage. During the blackout, one of them turns up stabbed with blood splattered everywhere. Yet, nobody has blood on them...

With all of the possible suspects having no blood on them, Conan and Heiji quickly discover the method used. Now they need to discover the motive.