Los chicos de la liga juvenil de detectives estaban jugando al fútbol, momento en el cual Conan ve pasar un auto y descubre que venía perdiendo líquido de frenos. Esa calle se cruza más adelante con las vías del tren y todo parece indicar lo peor. Comienza así un caso en el mundo del famoso teatro kabuki como escenario, y un enfrentamiento entre la deducción Ebizo Ichikawa, un famoso actor del teatro kabuki en la vida real, y Conan.

El cuerpo del secretario de Hosso, Takahashi es encontrado estrangulado junto al maletín donde debería estar la máscara que Ebizo va a usar en el teatro, y mientras Conan investiga a los cuatro sospechosos lo secuestran. ¿Conseguirá Conan salir de este apuro?¿Llegará a tiempo antes de que el culpable desaparezca con la máscara?

Un famoso ventrílocuo afirma que su marioneta poseída ha matado a su mujer, por lo que Conan comienza a investigar el caso.

Mientras la policía piensa que el ventrílocuo puede sufrir un trastorno de doble personalidad Conan investiga más a fondo la escena del crimen. ¿Estará realmente loco o es una estrategia para encubrir el asesinato

Heiji tiene que investigar una misteriosa fotografía en el que sale un hombre con una hoz en su espalda corriendo sobre el agua al que le llaman Kamaitachi. El reportero que hizo la foto, Ran y Kazuha creen que la foto es verdadera, mientras que una mujer también reportera cree que es falsificada. Heiji, Conan y Kogoro no saben que pensar, ya que hay un testigo que vio el momento. ¿Es realmente una foto verdadera?

Después de salir heridos la reportera, Kogoro y Heiji el suegro de la dueña del hostal es encontrado asesinado en una habitación cerca de donde se vio correr al Kamaitachi. ¿Será real la foto entonces o se tratará de un truco del verdadero asesino?

Ran, Kogoro y Conan se encuentran en Nagano donde Conan cree haber descubierto la identidad de Rum, el inspector Yamato de la prefectura de Nagano coincide con la descripción que le dio Haibara. Mientras tanto ocurre un de asesinato por un personaje conocido como Bishamonten.

El inspector Yamato es el principal sospechoso de ser Bishamonten después de cometerse un segundo asesinato. Por otro lado aparece un segundo sospechoso de ser Rum, el líder de la sección de policía de Nagano, que según el inspector Yamato parece pertenecer a una organización secreta.

Una tercera víctima cae por un precipicio mientras el inspector Yamato se encuentra en paradero desconocido buscado por la policía de Nagano. ¿Será el inspector el misterioso Bishamonten?

Alguien sospechoso irrumpe en la cotidianidad del Café Poirot donde trabaja Amuro. Conan, mientras desayuna, se interesa por él y comienza a averiguar de quien se trata. Con ayuda de la liga juvenil de detectives buscarán desenmascarar la identidad de esta persona que acecha y vigila a Amuro, y quiere conocer su secreto.

La liga juvenil de detectives se encuentra disfrutando de un buffet de postres y accidentalmente conocen a dos famosas actrices que participaran en un nuevo drama. Un secreto oculto entre ellas y sus blogs personales causan un terrible incidente.

Conan con ayuda de sus amigos y el profesor Agasa revelan la verdad. Al final descubren que son observados por un nuevo integrante de la policía.

La liga juvenil de detectives se ve envuelta en un caso donde el principal sospechoso es un misterioso alien. ¿Qué hay detrás de este misterioso ser? ¿Qué se intenta ocultar?

Conan y Kogoro se ven dentro de una misteriosa desaparición, en su investigación descubren una terrible verdad. Las apariencias pueden engañar, pero las acciones sin justificar revelarán este misterio.

Ran asiste al concierto de Risa Purple, una idol. Kogoro es contratado como su guardaespalda. Sin embargo, antes de que la función arranque, Ran que está vestida igual que Risa es secuestrada erróneamente. Las cosas se ponen peor cuando los secuestradores se dan cuenta de su error y tratan de enterrar viva a Ran, para cubrir sus huellas.

Conan y Kogoro preparan una trampa para descubrir al verdadero culpable detrás del secuestro y poder rescatar a Ran.

Un tifón inesperado deja a nuestros protagonistas atrapados en la estación de tren de Ofumoto. Allí coinciden con extravagantes personas, con caras ocultas y sorprendentes relaciones. Pasado un tiempo aparece un mensaje chocante en el bolsillo de Kogoro que desencadenará la revelación de todos los misterios y la aclaración de lo ocurrido.

Kogoro es citado en el templo Dongaraji por un caso de amenazas telefónicas. Mientras tanto, Chiba y Takagi buscan al sospechoso de un crimen. Por su parte, Conan escucha una conversación entre vecinas sobre un hecho inusual que le hace sospechar que se trata de un caso. ¿Estas historias estarán conectadas?

Una noticia impactante que hace temblar los cimientos sentimentales de Kogoro y Haibara, lo que provoca que se unan para descubrir la verdad. Un repentino asesinato ocurre cuando la investigación estaba en curso, todo apunta que el culpable es una pareja amorosa. Sólo un error demostrará quien dice la verdad y hará que todo se aclare.

El inspector Megure deduce que los culpables son la famosa pareja, pero otra vez Conan a través de Kogoro revelará quien es el verdadero asesino.

En un día lluvioso la liga juvenil de detectives busca un baño con urgencia. Sin querer, su búsqueda les lleva a refugiarse en un un museo de juguetes y a involucrarse en un misterioso caso que como siempre terminan resolviendo a su manera.

Conan está de visita en un parque que está junto al mar porque Kogoro quiere comer mariscos en una de sus atracciones. Mientras observaban la belleza del lugar nuevamente se ven involucrados en un extraño caso.

Cuando Kogoro, Ran y Conan estaban saliendo de cenar en un restaurante son sorprendidos por un accidente. ¿Accidente? A veces la belleza está acompañada de secretos y mentiras y en este nuevo caso Conan debe ser muy precavido con sus acciones.

Ran, Masumi y Sonoko se disponen a tener una cena en compañía de Conan y comer un Ramen que está para morirse por su sabor. Sin embargo, mientras están disfrutando de su cena, Masumi y Conan se encuentran con una situación incesante, donde la policía también está involucrada.

Una semana antes, después de asesinato, el asesino entró a Ramen Ogura. La policía ha encontrado a tres sospechosos, todos clientes habituales de la tienda. Después del incidente, Yumi se encontró con su ex-novio Shukichi Haneda, que dice que escuchó un ruido extraño cada vez que el culpable dio un paso. Al escuchar la historia de Haneda, Conan se da cuenta de algo.

La liga juvenil de detectives se encuentra en una investigación sobre OVNIs. El puente donde han sido vistos es el sitio en el que un asesinato se ha llevado a cabo en la noche. Un recuerdo de un extraño niño perturba la conciencia de un asesino. ¿Será capaz de cambiar de opinión y entregarse a las autoridades?

Conan, Kogoro, Ran, Heiji y Kazuha van a una cabaña de la Prefectura de Gunma. Ran y Kazuha tenían miedo de los "zombies" que acechan el lugar y quieren volver a casa, pero... un crimen ocurrió allí.

En ese momento, mientras Kogoro estaba intoxicado, vio a algunos "zombies en" la ventana. Heiji corta la cabeza de un zombie, y se da cuenta que son personas disfrazadas los que lo asustaron.

Conan y Heiji resuelven el caso.

Una noche, Kogoro Mouri accidentalmente se confunde en un robo de banco e intenta ayudar a la policía persiguiendo al ladrón. Desafortunadamente para él, el sospechoso sube la escalera de fuego de un edificio, saltando a través de la brecha entre dos tejados para escapar, perdiendo su arma en el proceso. Impulsivamente, Kogoro trata de seguirlo antes de que se le recuerde su severa acrofobia. Mientras se tambalea en el borde del tejado, temblando de miedo, la pistola del culpable es recogida en el callejón de abajo por un desconocido.

Un prestamista de dinero contrata a Kogoro para averiguar quién es el autor de una carta de amenaza extraña. Conan y Kogoro se dirigen al edificio en el que vive, al llegar a la puerta escuchan a un hombre que grita "muere". Cuando entran, ven a un hombre con un cuchillo clavado en el estómago y otro que dice que le han matado. Kogoro dice que la víctima ya había muerto por estrangulación.

El motivo del asesinato parece una venganza contra el prestamista.

Sonoko quiere crear una banda. Después de convencer a Ran, Masumi y Azusa, dice saber cómo tocar la guitarra muy bien, pero al momento de demostrar sus habilidades descubren que realmente no es muy buena y es burlada por dos hombres. Al ver cómo se burlan de Sonoko, Amuro toca una pieza que deja a todos sin habla. Poco después, van a una sala de ensayo, pero todos los instrumentos para alquilar se encuentran ocupados, así que deciden esperar. Aquí se encuentran cuatro mujeres que forman parte de una banda. Poco después, una de ellas se encuentra muerta sobre la batería. Conan, Sera y Amuro investigan.

La policía sospecha que el arma del crimen ha desaparecido junto con el asesino. Conan le pide a una de los sospechosas ver el vídeo hecho con su teléfono celular, y se da cuenta de un detalle que deja en claro quien es la asesina.

Una competencia de globos es la oportunidad perfecta para poder volar en uno de ellos por primera vez, Conan acompaña a Ran y Sonoko en un viaje, que al final se ve necesario que aparezca "la reina de las deducciones" resolviendo un caso.

Un templo inaccesible de noche, una voz misteriosa, un lugar de reflexión en las profundidades del bosque, todo perfecto; pero cuando se oculta el sol, Ran, Kogoro y Conan se ven obligados a permanecer en un hostal hasta el otro día, mientras esperan el transporte de regreso se encuentran con otro misterio a resolver.

La belleza es una de las mejores armas de las mujeres ante los hombres, por ello les es difícil olvidar un bonito rostro así tengan tragos en la cabeza. Nuevamente aparece Kogoro como el salvador de una hermosa mujer, pero Conan y Ran no se dejan llevar por las apariencias y deciden investigar para encontrar las verdaderas razones tras un misterioso crimen.

Kogoro en compañía de Conan están dispuestos a hacer algo a escondidas de Ran y no les importa las inclemencias del clima, pero se percatan de un extraño accidente que ocurre a unos pocos pasos cerca de ellos y van a mirar lo sucedido.

Una chica a quien Kogoro ayudó en un caso del pasado lo invita a una cita en agradecimiento, al ver una nota del itinerario del detective durmiente, Ran envía a Conan a que lo acompañe, pero a medida que avanza su cita turística, Conan y su inagotable curiosidad van armando bien el rompecabezas del caso del pasado y nos hace ver que ese caso no estaba cerrado como ellos pensaban.

Conan reflexiona sobre Sera, que es la hermana menor de Akai y por qué dejó América para volver a Japón. Sí ella vino a confirmar su muerte... ¿Por qué no consultó con el FBI? También piensa en Mary, la chica que esconde Sera en el hotel, y su gran parecido con Haibara. Mientras la liga juvenil de detectives son invitados por el profesor Agasa a un centro comercial en navidad. Allí, un chef es apuñalado, los niños ven al culpable correr, pero cada uno lo describe de manera diferente.

Al final del caso se revela quien es el culpable y Conan se da cuenta de la similitud entre Mary y Haibara debido al rímel bajo los ojos de esta última.

Conan se encuentra atado y confinado en un extraño lugar, ¿cómo llegó a esta situación? Los recuerdos poco a poco llegan de nuevo a su prodigiosa mente después de estar por un tiempo aturdido y va descubriendo porqué se encuentra en esta situación tan terrorífica en compañía de la liga juvenil de detectives.

El entierro se termina y el coche fúnebre que contiene al difunto es llevado al crematorio. Mientras tanto Conan intenta cortar la cuerda que lo ata.

Una chica acude a Kogoro para que resuelva el misterio del OVNI y llegan al lugar de un crimen que investiga Chiba. Mientras tanto, Naeko intenta que Chiba adelgace.

Conan resuelve el caso del crimen y la verdad sobre el OVNI.

Yumi pierde una carta y junto a la liga juvenil de detectives deberán encontrarla a contrarreloj.

Conan acaba por encontrar la forma de llegar a la carta. Haibara le revela a Conan que Haneda Kouji (el hermanastro de Shukichi Haneda, ex novio de Yumi) aparecía en la lista de víctimas de APTX 4869.

Kogoro invita a Ran y a Conan a tomar unas vacaciones, pero un intento de robo, una desaparición y un secuestro no les permite disfrutar de los maravillosos sitios turísticos. ¿Quién está detrás de estos misterios?

El misterio continúa cuando un hombre con una máscara Oni secuestra a punta de pistola a la detective Sato.

Lindos recuerdos de cuando asistía al preescolar llegan a la mente de Ran cuando Shini…Conan la invita a pasear en compañía de Sera y Sonoko por un camino lleno de cerezos en pleno florecimiento. Shinichi también recuerda cómo conoció a Ran y los pequeños inconvenientes que tuvieron que enfrentar en ese entonces con el resto de su clase.

La historia continúa desde la perspectiva de Conan, diciendo que aquella fue la primera vez que resolvió un caso con el corazón.

Conan acompaña a Sonoko a visitar al siempre increíble Makoto-san al dojo de un antiguo sensei suyo. Mientras observan el entrenamiento, el valioso cinturón del sensei desaparece… ¿Quién será el culpable? ¿Por qué habrá desaparecido el cinturón?

Kogoro completa una de sus rutinarias misiones de búsqueda de mascotas, pero de repente se oye un grito en el mismo bloque y entra una vez más en un caso donde nada es lo que parece. ¿Podrán juntos él y Conan encontrar la verdad?

Una extraña muerte en un vecindario tranquilo, un asesinato sin un motivo y todos los posibles culpables cuentan con coartada. Un caso que pone en aprietos a la policía y hace pensar a todos los detectives.

Una extraña muerte en un vecindario tranquilo, un asesinato sin un motivo y todos los posibles culpables cuentan con coartada. Un caso que pone en aprietos a la policía y hace pensar a todos los detectives.

La Liga Juvenil de Detectives busca información en la montaña sobre una actividad escolar, cuando se encuentran con un grupo de escaladores con una cruda historia detrás. El grupo se ve envuelto en un nuevo caso de asesinato, y la ciencia les ayudará a encontrar respuestas en un caso que provoca muchas preguntas.

Kogoro y Conan acompañan a un cliente a revisar la seguridad de su apartamento, pero mientras se marchan escuchan un ruido. Un vecino ha caído por el balcón. ¿Es un accidente o un asesinato? Las sospechas nos llevan a un posible culpable que es encontrado muerto... ¿Pero no hay motivos...?

En al casa del profesor Agasa, Conan y Haibara investigan acerca del crimen de Kohji Haneda en un hotel de EEUU 17 años atrás. El problema comienza cuando los dos chicos se dan cuenta de que en otra habitación del hotel se cometió otro crimen al mismo tiempo.

Conan, Haibara y Okiya se ven envueltos en un caso relacionado con los hombres de negro y nuevas tramas.

Kogoro recibe una llamada para participar en un show de TV en el que se invocará al fantasma de Kohji Haneda por lo que Conan sospecha que Hotta, el espiritista sabe algo sobre la muerte del jugador de shogi.

Hotta es asesinado antes de que Conan pudiera descubrir si estaba relacionado con Rum. Un nuevo caso de asesinato para resolver.

Mamoru Kokubo visita la casa de su tía y la descubre muerta. Conan descubrirá al culpable gracias al mirlo que tiene como mascota.

Una nueva investigación se mezclará con un episodio del pasado de Akai y su amigo el agente infiltrado Scotch.

Conan tratará de disuadir a Okiya para que abandone el lugar del caso, pues Amuro comienza a sospechar acerca de la verdadera identidad de éste. Bourbon descubrirá un terrible secreto.

El nuevo caso ocurrirá en una biblioteca cuando el dueño de la librería aparece sepultado bajo una estantería. ¿Ha sido un accidente o más bien un asesinato bien planeado?

El Profesor Agasa lleva a los niños a una villa con vista al mar, mientras exploran el lugar, Ayumi se encuentra con una persona tendida en el suelo...al parecer esa persona es sospechosa o al menos, eso piensa Conan luego de encontrar una fotografía...

Las investigaciones de Conan lo hacen perderse cerca de un acantilado y las cosas se complican cuando lo empieza a perseguir...un grupo criminal, que lo acorrala en un barranco ¿Podrá Conan salir de este apuro?

Mitsuhiko propone a la liga juvenil de detectives ir a un espectáculo de héroes locales dónde ocurrirá un asesinato inesperado.

Conan, Ran, Heiji, Kazuha y Kogoro se ven envueltos en un peligrosos caso cuando el alcalde del pueblo Yadori comunica a Heiji que ha encontrado una pista del tesoro enterrado de Tokugawa. El grupo se asustará cuando descubran que un extranjero murió en un accidente mientras buscaba ese tesoro con un extraño mensaje escrito en un papel.

Los protagonistas investigarán la extraña muerte producida por el Nue, creyendo que solo es un truco del verdadero autor pero la investigación de Conan y Heiji se ve truncada cuando el fuego engulle el jardín de la casa sin ninguna causa, al tiempo que escuchan un nuevo grito del Nue

Los dos detectives más famosos descubren la verdad detrás de las apariciones del monstruo y los asesinatos además del tesoro de Tokugawa, Heiji decide entonces confesar sus sentimientos por Kazuha ¿Logrará hacerlo finalmente?

Ran, Kogoro y Conan visitan la casa de unas clientes del detective. Las dos mujeres interesadas son la esposa y la hija de un sacerdote budista que piden a Kogoro que las proteja a ellas y a su familia de la maldición de la estatua de Buda. El patriarca de la familia se niega a involucrar a un detective en sus asuntos familiares, pero poco después morirá acuchillado

Kogoro es invitado por una empresa de mecánica para averiguar cuál de los empleados robó tecnología punta. El detective durmiente sospecha de Takeshi Tanizaki, uno de los empleados que luego aparece muerto y sólo un pequeño testigo ha presenciado el crímen

Genta persigue al sospechoso de un robo a un anciano, pero acaba haciéndose un chichón y perdiendo al sospechoso de vista. El niño pedirá ayuda a la liga juvenil de detectives para atrapar a un sospechoso que tiene amnesia por culpa de un golpe.

Un nuevo crimen ocurrirá en los probadores de una tienda dónde Ran, Sonoko y Sera estaban probándose bañadores para el verano, Conan se sorprenderá al ver a Ran en bikini, pero también al ver el modelo de Sera, los recuerdos de un lejano verano y del ruido de las olas volverán a Conan.

Tres sospechosas de matar a la víctima en los vestuarios. Conan descubrirá a la asesina pero también recordará de qué conocía a Masumi Sera, por una cosa que ella dice y que demuestra que mintió.

La liga juvenil de detectives está en una nueva excursión cuando comienza a llover torrencialmente. Los niños buscarán cobijo en la mansión Otaguro, donde se aparece un fantasma en forma de luz brillante amarilla.

Los recuerdos de Conan le llevan diez años atrás cuando el joven Shinichi tenía siete años, en un viaje que hizo con Ran y su madre. Los dos niños conocieron a Sera en aquel viaje, sin embargo también conocieron a su familia, sus dos hermanos mayores, su madre y un hombre misterioso que parece ser el padre de la niña.

Un coche se sale de la carretera y cae al mar desde mucha altura, el pequeño Shinichi consigue reunir a los sospechosos y ayudará al inspector Pierrot a resolverlo, sin embargo el caso será resuelto por un viejo conocido de la serie.

Una bomba hacer estallar por los aires un salón de Pachinko, al poco tiempo de que Kogoro reciba un libro despegable. El detective recibirá una llamada anónima diciéndole que otra bomba explotará en la ciudad de Haido y la pista está en el libro que ha recibido.

La siguiente pista para encontrar las nuevas bombas está relacionada con el número 7 ¿Podrán Conan, Ran, Kogoro y la policía encontrar las bombas antes de que exploten?

Kazuha y Heiji llegan a la agencia de detectives buscando a Conan y Ran para proponerles un paseo en un lugar increíble, pero la fecha no acompaña. Los chicos se van al Poirot, y un misterioso cliente confirma los peores presagios sobre la fecha. Por otro lado, una celebración de cumpleaños está a punto de comenzar, pero se pospone porque deriva en una tragedia.

Ninguno de los sospechosos tienen manchas de sangre y eso complica la resolución del caso. Sin embargo una misteriosa pista del extraño hombre de la gabardina, logrará que los detectives resuelvan el caso pero.