La Sonoko ha convidat la Ran a un bufet lliure de pastissos a l'hotel Haido. Pel camí, per culpa d'un malentès, la Ran s'enfronta amb un jove que va al mateix lloc. Quan són a l'hotel senten un soroll molt fort: sembla que algú s'ha tirat al buit i s'ha suïcidat. Però en Conan creu que es tracta d'un assassinat, i el jove d'abans, que afirma que és detectiu, també ho creu.

After investigating the room, Masumi declares the culprit to be Toshiko Hirukawa as she lied about the elevator usage to Conan. She reveals Hirukawa got Usumi drunk, placed him on the wheelchair, and used a system of strings connected to the elevator to throw him out the window. However, re-acting the scene fails, until Conan voices his deductions over the phone as Shinichi revealing the paint cans were placed out of the window to tilt the wheelchair. Hirikawa confesses and reveals her father begged Usumi to apologize for scamming her mother but was refused. Afterwards, her father committed suicide after her mother died from shock. In the aftermath, Usumi's hidden bank account was found and the transactions to it allowed the police to apprehend the scam group. Masumi later enrolls into Ran and Sonoko's classroom.

En Heiji i la Kazuha van a veure en Conan a Tòquio per investigar més a fons la nova detectiu, la Masumi Sera, que cada cop està més envoltada de misteri. Ella aprofita el cas d'un assassinat en un restaurant per enfrontar en Heiji i en Shinichi i comença un duel entre el detectiu de l'est i el detectiu de l'oest. Els agents de l'FBI també estan investigant la Masumi en secret. L'agent Camel ha trobat un cadàver al lavabo d'un restaurant, i la Masumi Sera ha enfrontat en Conan i en Heiji a un duel per veure qui és el que resol primer el cas. S'ha determinat que hi ha tres sospitosos que encara són al restaurant, i comencen els interrogatoris. La batalla entre el detectiu de l'est i el de l'oest està més oberta que mai!

La Masumi Sera, una alumna nova de l'institut, visita l'agència de detectius Mouri amb la Ran. Mentre són allà, arriben tres escriptores de misteri i un home que els pren a tots com a ostatges. L'home és el germà d'una quarta escriptora morta. Oficialment s'hauria suïcidat, però ell està convençut que va morir assassinada per una de les tres escriptores, i exigeix a en Kogoro Mouri que descobreixi quina.

Un home armat amb explosius ha entrat a l'agència de detectius Mouri i ha pres com a ostatges la Ran, en Kogoro, la Sera i tres amigues de la seva germana, que, suposadament, es va suïcidar. Ell està convençut que, en realitat, la va assassinar una de les amigues, i exigeix a en Kogoro i en Shinichi que descobreixin qui és l'assassina. La policia, mentrestant, pren posicions a l'exterior de l'edifici.

L'Isao Sawaguchi és un home que té la Ran, en Kogoro, la Sera i tres dones retinguts a l'agència de detectius Mouri, perquè està convençut que la seva germana Miku, una novel·lista morta en un balneari, no es va suïcidar tal com es va dir, sinó que va ser assassinada. Les deduccions d'en Shinichi ho confirmen. La clau és un exemplar d'"El funeral del déu de la mort", l'exitosa òpera prima de la Miku.

La Sonoko, la Ran i en Conan visiten la nova xocolateria que està a punt d'obrir al barri més exclusiu de Tòquio. El mestre xocolater Tsujimoto i la seva nòvia, la Mayuko, els han convidat a la presentació d'una figura de xocolata que ha guanyat un premi molt prestigiós. Però la figura s'incendia i en Tsujimoto mor atrapat per les flames. En Conan sospita que es tracta d'un assassinat.

En Heiji rep la carta que sembla que un home va enviar després de la seva mort i n'investiga el cas. Es tracta del president d'una empresa de disseny, que, abans de morir al seu xalet, havia deixat un missatge escrit amb sang... que després va desaparèixer. En Heiji va a la casa de la família amb en Conan i companyia per saber-ne més detalls, però llavors el fill del president difunt mor enverinat.

En Heiji i en Conan investiguen la mort del president d'una empresa. Abans de morir, l'home va deixar un missatge a les rajoles del lavabo que després va desaparèixer. A la casa de la família es produeix un segon assassinat: el del fill del difunt president. Sembla que els dos casos podrien apuntar a un assassí en sèrie... que ha de estar entre les persones que hi ha a la sala d'estar.

En Heiji i en Conan investiguen la mort d'un empresari. La clau del crim és en un missatge que el difunt va deixar abans de morir però que va desaparèixer després per una il·lusió òptica. Esbrinen que el va assassinar el seu fill, que mor després enverinat. I a continuació mor la seva dona, vicepresidenta de l'empresa, que havia cobert el fillastre del primer crim.

Durant la investigació de la mort del president d'una empresa de disseny, en Heiji i en Conan visiten la residència familiar, on mor també el fill del president i, a continuació, la madrastra d'aquest, la dona del president. En tots els casos, la clau està en les il·lusions òptiques que fa servir l'assassí, que malauradament s'enfronta a uns detectius que les saben identificar i en trauran l'entrellat.

El doctor Agasa va trobar un gerro antic fent endreça a casa seva, i va penjar un vídeo a internet per ensenyar-lo i demanar que algú l'hi vingués a valorar. Quan en Conan, l'Ai, en Mitsuhiko i en Genta arriben a cal doctor, el troben sense coneixement i descobreixen que han segrestat l'Ayumi, que era amb ell. Els segrestadors els envien un missatge dient que, si volen tornar a veure viva l'Ayumi, han de trobar un gat perdut.

Després d'haver estat buscant un gat per poder rescatar l'Ayumi, que estava segrestada, en Conan i els seus amics descobreixen que els segrestadors els han enganyat des del principi: en realitat no els interessava el gat ni el gerro antic que el doctor Agasa tenia a casa seva, sinó una altra cosa aparentment sense valor. En Conan aviat endevina quins dels que van anar a examinar el gerro són els segrestadors.

Quan en Conan, l'Ai i els seus amics de la Lliga de Detectius Júnior surten de veure una pel·lícula del monstre Gomera, troben un cotxe ple de figuretes de plàstic de personatges de les pel·lícules. Pel que sembla, algú ha forçat el pany del cotxe, i a dins hi ha pintat la paraula "More't" amb un esprai vermell. Els joves intenten investigar què ha passat, però els descobreix un bon amic de l'agent Chiba, que resulta que és l'amo del cotxe.

En Conan i els seus amics, juntament amb l'agent Chiba, la Yumi i una agent nova, continuen investigant per descobrir qui ha forçat un seguit de cotxes i hi ha pintat la paraula "More't". L'agent Chiba té com a companya d'investigació la Naeko Miike, que havia sigut el seu primer amor a l'escola primària, tot i que ell no la reconeix. No cal dir que en Conan fa servir els seus dots d'investigador per mirar de resoldre un cas molt enigmàtic.

Últimament, en Kogoro es passa les nits de gresca. La Ran, que està molt enfadada, el critica en veu alta al carrer. Una anciana la sent i li replica que el detectiu Mouri és molt bona persona, i que sempre l'ajuda de franc. Precisament, avui ha d'anar-la a veure. En Conan i la Ran van a casa de l'anciana a esperar-lo, però el Kogoro Mouri que truca a la porta és un impostor.

En Conan ha deduït que l'assassí d'en Gensuke Denkawa és un dels tres veïns que han trobat el cadàver. Aparentment, tenen coartada: ahir, quan van marxar de l'edifici, la víctima tenia la tele posada a tot volum i feia zàping. Això demostraria que cap dels tres era al lloc dels fets quan van matar en Gensuke. Però en Conan sap que tot és un muntatge i, amb la seva ajuda, el fals Kogoro resoldrà el cas.

El doctor Agasa visita un vell amic seu que viu a la muntanya, i s'hi emporta els nens perquè puguin capturar escarabats gegants. En Conan i els nens col·loquen esquers enmig d'una roureda i, a mitja nit, surten tots plegats a caçar els escarabats. Quan tornen a casa de l'amic del doctor, se'l troben a terra mig estabornit. Abans de desmaiar-se, els dona una pista sobre la identitat del seu agressor: "Escarabat de Miyama".

Un home apareix mort en un pas subterrani prop de l'estació del metro. L'endemà, en Conan i els seus amics de la Lliga de Detectius Júnior troben un mapa on hi ha marcades amb una creu quatre cases que estan situades molt a prop del lloc de l'assassinat. Té alguna cosa a veure, aquest mapa, amb l'assassinat de la nit anterior? És el mapa d'un lladre que ha marcat els seus pròxims objectius?

El senyor Ooka, xantatgista professional, apareix mort a casa seva, i deixa la lletra 'k' escrita a terra amb la seva pròpia sang. Els dos sospitosos, en Katsutoshi Kusaka i la Kiwako Kaitani, tots dos víctimes dels xantatges del senyor Ooka, l'havien anat a veure poc abans que aparegués mort. Sembla del tot evident que ha de ser un d'ells dos, però de seguida en Conan comença a sospitar d'una tercera persona.

Una nit de pluja, en Chiba coneix una dona en una cafeteria que li demana ajuda perquè se sent amenaçada. Fa un any que rep cartes d'un home que és a la presó, i que va estar involucrat en un accident de trànsit en què va morir el germà d'ella. Quan la dona desapareix misteriosament, en Chiba demana ajuda a en Kogoro Mouri per trobar-la: és qüestió de vida o mort.

En Kogoro assisteix, amb en Conan i la Ran, al comiat de solter d'un vell amic, en Raita, que l'endemà es casa. Ell i la Hatsune es van enamorar a primera vista. Però en Raita és gelós i faldiller, i això causa tensions en la relació. Durant la festa, la Hatsune se'n va al saló de bellesa per posar-se unes ungles postisses, i malauradament ja no en torna.

Durant el comiat de solter d'en Raita Banba, un amic de la infància d'en Kogoro, es produeix una desgràcia: la dona amb qui s'havia de casar l'endemà, la Hatsune, mor calcinada al seu cotxe quan tornava de posar-se unes ungles postisses per a la cerimònia. La teoria del suïcidi queda ràpidament descartada quan es confirma que l'ADN de les restes de pell que troben a les ungles de la víctima coincideix amb el del nuvi.

La Torre Fosca de la residència dels Kyodo està envoltada de misteris. En Seitaro Kyodo, avi de la Nanami, la va construir per amagar-hi un tresor, segons diuen els rumors. La Nanami és companya d'institut de la Ran, i ha convençut en Conan i tota la Lliga de Detectius Júnior perquè l'ajudin a buscar un tresor secret que podria costar la vida a més d'un membre de la família Kyodo.

Després de la desaparició de la Haibara mentre buscaven l'entrada de la misteriosa Torre Fosca, segueixen les desaparicions d'en Genta, d'en Mitsuhiko i de l'Ayumi. En Conan es troba sol davant del perill, amb la responsabilitat de trobar els seus amics, però també de resoldre un presumpte assassinat i de trobar un tresor que encara no se sap del cert si existeix, o si és una altra de les maquinacions d'en Seitaro Kyodo.

En Conan, en Kogoro i la Ran van a fer surf a la platja d'Ohama convidats per una amiga. La Nagisa és una campiona de surf i està casada amb un home més gran amb qui sembla que no s'avingui gaire. Aquella nit hi ha una gran tempesta al mar i l'endemà la noia apareix morta a la platja. Ha sortit a surfejar les grans onades i s'ha ofegat... o l'han assassinada?

La Ran, la Sonoko i en Conan visiten en Zenzo Sunada, un home molt ric i un gran aficionat als cactus. Mentre sopen a la casa sona l'alarma de l'hivernacle. Quan hi arriben troben en Zenzo mort. Tot sembla indicar que el culpable és el seu fill Yasuyuki, però en Conan no n'està tan segur. En Conan podrà escoltar la veu dels cactus i revelar el misteri d'aquest assassinat?

En Kogoro Mouri és al seu despatx esperant una clienta que, a última hora, li envia un correu per canviar el lloc de la reunió i el cita en un restaurant. Com que la clienta no apareix, en Kogoro i els altres decideixen tornar a l'agència, on hi troben la dona tancada al lavabo amb un home que aparentment s'ha suïcidat. La dona volia que en Kogoro l'ajudés a buscar l'armariet que s'obre amb una clau misteriosa.

En Conan, en Kogoro Mouri, en Toru Amuro i la Ran acompanyen la Kei Kashizuka a casa seva. Mentre escorcollen el pis perquè sospiten que hi ha micròfons ocults, descobreixen que la noia amaga un secret, però ella ja ha fugit i s'ha emportat en Conan com a ostatge. La Ran demana al doctor Agasa que l'ajudi a localitzar-lo, i la jove detectiu Masumi Sera també s'hi afegirà per conèixer en Toru.

En Conan ha descobert la veritat i està disposat a ajudar la seva segrestadora a trobar la persona que busca: el tercer còmplice de l'atracament del banc. Mentrestant, en Kogoro, la Ran i en Toru entren a l'ordinador de l'home que ha aparegut mort a l'agència i hi troben l'adreça d'una dona. El doctor Agasa i l'Ai Haibara, amb l'ajuda d'en Subaru Okiya, continuen intentant localitzar en Conan amb les ulleres rastrejadores.

En Conan ha descobert quina de les tres dones és el tercer còmplice de l'atracament al banc, però no l'hi diu a la Serina Urakawa fins que ella li promet que renunciarà a venjar-se i s'entregarà a la policia. Mentrestant, tres vehicles busquen en Conan: la Masumi Sera amb la seva moto; el cotxe d'en Subaru Okiya, amb la Haibara i el doctor Agasa; i un altre cotxe on hi viatgen en Kogoro, la Ran i en Toru Amuro.

En Conan i la Lliga de Detectius Júnior, amb l'Ai i el doctor Agasa, en Kogoro, la Ran i la Sonoko, van a una barbacoa, a casa d'un matrimoni que van conèixer en un càmping. La parella comença una discussió en privat, que s'escalfa fins que l'home li clava un ganivet a la dona. Però l'Ayumi ho ha vist tot: ella l'havia atacat primer, i ell ha actuat en defensa pròpia.

La barbacoa de l'episodi anterior ha tingut un final dramàtic. A primera vista, tot indica que els amfitrions s'han barallat i la dona ha atacat el marit amb un ganivet. Mentre forcejaven, ell l'ha apunyalat en defensa pròpia. A l'hospital, els metges proven de salvar la vida de la dona. Quan un missatge de mòbil revela que la versió del marit té un punt feble, en Conan comença a lligar caps.

Els nostres amics van de viatge a Nagasaki i irrompen en la filmació d'un thriller històric amb un assassinat. El director li explica a en Kogoro que el guionista ha desaparegut sense haver-los donat la meitat del guió que faltava i li demana que almenys mirin de deduir qui és el culpable per poder tirar endavant el rodatge. Quan van a casa del guionista, descobreixen que seguia la pista d'una banda de lladres d'objectes d'art.

Al final de l'episodi anterior, un desconegut agredeix en Sakota i les sospites recauen en la Ran, però en Conan aconsegueix exculpar-la. Més endavant, es produeix una nova agressió, al mateix temps que arriba una altra part del guió de la pel·lícula, on hi ha un segon assassinat. La Ran acaba fent el paper d'un personatge nou, que té uns diàlegs enigmàtics. En aquests diàlegs hi haurà les pistes per resoldre un cas al món real.