Für Heiji und seine Kendo-Mannschaft steht ein wichtiges Turnier an. Es wird aber ein Mitglied des gegnerischen Teams vermisst und kurz darauf tot aufgefunden. Noch bevor Polizei und Notarzt am Tatort ankommen, ist die Leiche bereits verschwunden, taucht dann aber an einer anderen Stelle wieder auf. Heiji möchte den Fall unbedingt selbst lösen, bevor Conan zum Zuschauen des Finales kommt. Als am nächsten Tag Conan, Ran und Kazahu eine Tour durch die Stadt und zum Schloss Osaka machen, lernen sie eine Reisegruppe kennen. Plötzlich fehlt ein Teil der Gruppe - und es gibt eine Explosion!

Rans Mutter ist Anwältin und muss vor Gericht Shinji Usami verteidigen. Er ist als Hauptverdächtiger in einem Mordfall angeklagt. Das Opfer, Tsuyoshi Hirasawa, hatte vor drei Jahren einen Unfall verschuldet, bei dem der Sohn des Angeklagten umkam. Nun ist Hirasawa tot, und Usami behautet, sich nicht mehr an den Tag der Tat erinnern zu können. Um Klarheit zu bekommen, machen sich Conan, Ran und Eri auf die Suche nach Usamis Exfrau.

Nur eine Person kann das Alibi von Usami bestätigen: Kogoro. Der sagt überraschenderweise im Sinne der Staatsanwaltschaft aus, und das bringt Conan dazu, seine eigenen Ermittlungen zu bemühen. Dabei wird deutlich, dass Kogoro am Tag des Geschehens nicht alleine unterwegs war...

Zum Valentinstag werden Conan und seine Freunde in die Suito Mountain Lodge eingeladen. Schon in der ersten Nacht ereignet sich ein Verbrechen nahe der Hütte, denn der Journalist Nigaki kommt von einem nächtlichen Spaziergang in den Wäldern nicht mehr zurück. Nach einigen Ermittlungen wird deutlich, dass er einem Gewaltverbrechen zum Opfer gefallen ist. Auch Conan beginnt direkt im Anschluss mit seinen Ermittlungen aber der Ort an sich scheint vom Pech verfolgt zu sein...

Alle Verdächtigen im Fall des verschwundenen Journalisten Nigaki scheinen ein wasserfestes Alibi zu haben. Als Täter würde daher also nur der dunkel gekleidete, geheimnisvolle Typ in Frage kommen, den Itakura an dem Abend in der Nähe des Waldes gesehen haben will. Conan allerdings bleibt skeptisch und kommt so auf die Fährte des wahren Täters!

Conans Ermittlungen führen ihn zu Ako. Dieser hat den Journalisten Nigaki umgebracht, weil er vor vier Jahren den Tod seines Bruders gefilmt hat, anstatt ihm zu helfen. Aber auch neue Bösewichte kommen wieder mit ins Spiel!

Hideo Morita hat seine teure Armbanduhr - anscheinend im eigenen Haus - verloren und sucht Hilfe bei der Detektei Mori. Auch die Detective Boys helfen in diesem Fall. Während der Hausdurchsuchung kommt die Nachbarin Eiko Idezuku vorbei und wird kurz darauf ermordet. Conan ist sich sicher, dass Morita etwas mit der Tat zu tun hat...

Conan ist beunruhigt, denn alle Akten der Detektei Mori sind gestohlen worden. Er macht sich große Sorgen um Ran. Allerdings hat Conan für diese Sachen aktuell keinen Kopf, zuerst muss er den Mordfall von Eiko Idetsuki aufklären. Sein Tatverdächtiger ist Morita und das, obwohl er zur Tatzeit eigentlich in einem komplett anderen Zimmer war. Es scheint das perfekte Verbrechen zu sein, das auch Conan an seine Grenzen bringt!

Ran, Conan und Sonoko sind in einem Einkaufszentrum unterwegs, als sie zufällig Zeugen eines Telefonats werden. Nach einem kurzen Stromausfall wird auf einer Rolltreppe die Leiche eines Privatdetektivs gefunden. Genau dieser hatte kurz vorher telefoniert. Er hatte belastende Beweise gegen eine Person vorliegen... Musste er deshalb sterben?

Der Tote hatte einen leeren Umschlag mit drei Symbolen bei sich. Als Jodie ahnt, dass eines der Symbole ein Quadrat ist, ist sie sich ziemlich sicher, was das Opfer damit gemeint haben könnte. Ob die geheimnisvollen Symbole sie zur Lösung bringen werden?

Frau Omori kümmert sich um zwei streunende Katzen. Als eine der Katzen zum wiederholten Male unter ein parkendes Auto pinkelt, droht der Besitzer damit, Frau Omori etwas anzutun. Am nächsten Tag ist die alte Dame spurlos verschwunden. Dann taucht der Kater Bruce plötzlich mit einem blutbefleckten Halstuch auf!

Der alte Otonashi erzählt Kogoro, Ran und Conan ein Gruselmärchen über eine umherwandernde Seele eines ermordeten Mädchens. Dann fallen die drei in einen mysteriösen Tiefschlaf, und die Show beginnt: Sie sehen ein Geisterlicht und eine entstellte Fratze im Fernseher!

Conan hat den Verdacht, dass der Mörder des jungen Mädchens den Spuk inszeniert. Wird er Recht behalten?

Takagi sucht im Park verzweifelt nach seinem Notizbuch, das er während eines Streits verloren haben muss. In dem Konflikt ging es um Mordpläne. Zufälligerweise taucht einer der Streithähne im Park auf und benimmt sich merkwürdig. Ist bereits jemand ums Leben gekommen?

Conan erzählt Professor Agasa, dass sämtliche Polizei-Protokolle gestohlen, aber wieder an die Polizei zurückgeschickt wurden. Conan vermutet, dass die Schwarze Organisation dahintersteckt. Doch warum hat der Dieb die Dokumente wieder zurückgeschickt? Unter den Verdächtigen befindet sich eine amerikanische Schauspielerin... Kurz darauf gibt es auch noch einen Toten!

Conan und Heiji gehen davon aus, dass Herr Takai nicht Selbstmord begangen hat, sondern dass er ermordet wurde. Wer ist der Täter?

Conan und die Detective Boys sind im Fußballstadion. Durch ein spektakuläres Tor kurz vor Ende der Spielzeit gewinnt ihr Lieblingsteam. Auf dem Nachhauseweg, in einem mit zahlreichen Fans gefüllten Zug, sehen die Nachwuchsdetektive einen stadtbekannten Hooligan. Als sie, wie die meisten Passagiere, an einem Umsteigebahnhof den Waggon verlassen, liegt der Fußballrowdy plötzlich erstochen am Boden.

Conan nimmt an, dass der Mörder gar nicht im Stadion war, um sein Opfer nach dem Spiel nicht zu verpassen. Doch alle Verdächtigen besitzen gültige Eintrittskarten und wissen über das Spielgeschehen Bescheid. Bis einer von ihnen sich durch eine kleine Bemerkung verrät...

Die Detective Boys bekommen eine Prügelei zwischen den Firmendirektoren Kurata und Suzuki mit. Doch einer davon stirbt und wird in die Berge gebracht und dort vergraben...

Als Conan, Ran und Kogoro in den Bergen das Benzin ausgeht, bietet ihnen der Direktor einer Möbelfabrik Unterschlupf an. Er zeigt ihnen auch seinen Steingarten. Kurz darauf wird dort eine Leiche gefunden!

In dem Fall des Toten im Steingarten ermittelt Inspektor Yokomizo. Kogoro erzählt ihm von seiner Theorie, nach der nur noch Hashimoto als Tatverdächtiger übrig bleibt...

Als Kogoro, Ran und Conan in einem China-Restaurant speisen, ist auch eine Film-Crew anwesend, die eine neue Protagonistin sucht. Der Produzent wird auf Ran aufmerksam und spricht sie an! Doch die anderen Crew-Mitglieder scheinen mit der Wahl nicht einverstanden zu sein. Kurz darauf ist der Produzent tot. War das Essen etwa vergiftet?

Dank Conans genauen und intensiven Ermittlungen entlarvt er den Mörder des Produzenten Kawabata. Er wurde tatsächlich von einem Crew-Mitglied vergiftet!

Ran hat hohes Fieber, sie fällt vom Stuhl und wird bewusstlos. In ihrem Fiebertraum durchlebt sie alte, verdrängte Erinnerungen, wie sie mit Shinichi und seiner Mutter Yukiko Kudo in New York war und auf Sharon Vineyard traf.

Yukiko Kudo, Shinichi und Ran sehen sich ein Musical an. Doch während der Aufführung wird ein Schauspieler erschossen. Es wird vermutet, dass der Schuss von der Loge aus abgegeben wurde - doch Shinichi hat Zweifel!

Shinichis akribische Ermittlungen zahlen sich aus, und er kann den Täter entlarven. Danach gerät er gemeinsam mit Ran an einen japanischen Serienmörder in New York.

Mitsuhiko ist plötzlich verschwunden. Die Detective Boys finden heraus, dass er sich wohl in einem Wald aufhält. Doch genau dort soll sich auch ein extrem skrupelloser Serienmörder herumtreiben...

Mitsuhiko trifft im Wald auf Numabuchi, der ihn wider Erwarten nicht um-, sondern zu den Detective Boys zurückbringt. Dort wird er von der Polizei festgenommen. Jetzt bleibt nur noch die Frage zu klären, was Mitsuhiko eigentlich in dem Wald wollte...

Auf einer Insel in Okinawa will Bürgermeister Kaneshiro als Tourismus-Gag einen alten Fall auf einer benachbarten Insel lösen lassen. Dabei sollen die Detektive Heiji und Kogoro helfen. Auch das Fernsehen ist vor Ort, um alles zu dokumentieren. Ein großer Spaß - bis ein Mitglied des Filmteams tot am Strand gefunden!

Die gestrandete Gruppe versteckt sich im Haus des Bürgermeisters und wartet auf das Rettungsboot. Dort entdecken sie an den Wänden weitere mysteriöse Nachrichten. Als das Boot endlich ankommt, macht die Gruppe eine schlimme Entdeckung: Der Kapitän wurde ermordet!

Kann Conan die rätselhaften Morde auf der einsamen Todesinsel lösen?

Conan und seine Freunde reisen zu einem Tennisturnier. Sie finden zufällig ein Handy, auf dem eine Nachricht für Sonoko eingeht. Als sie den Besitzer des Telefons ausfindig machen und zu ihm gehen, wird Ran entführt! Kurz darauf geht eine Lösegeldforderung bei der Polizei ein...

Conan möchte in dem Fall auf eigene Faust ermitteln und begibt sich auf die Suche nach Ran. Als er die zweite eingegangene Nachricht nochmals abhört, wird ihm klar, wo sich die Kidnapper versteckt halten.

Conan, Ran und Mori befinden sich auf einem Boot, um von dort aus ein Feuerwerk anzusehen. Mit dabei sind außerdem der Bauunternehmer Kazuyuki Kawai und der Geldverleiher Tsuneo Yamazaki. Die beiden begeben sich an den Bug des Schiffs, um zu angeln. Wenig später finden die Freunde den bewusstlosen Kawai - und Yamazaki ist tot!

Eri muss den Schurken Inoe vor Gericht verteidigen. Dieser soll bei einem Einbruch in eine Immobilienfirma den Geschäftsführer Otsu getötet haben. Der Verdacht gegen Inoe erhärtet sich, als sich herausstellt, dass Otsu ein Verhältnis mit Inoes Tochter hatte. Doch Conan sieht den Fall ganz anders!

Conan muss beweisen, dass der Angeklagte Inoe nicht die Schuld am Tod des Immobilienmaklers Otsu trägt.

Conan, Ran und deren Vater sind auf einem Aussichtsturm und genießen den Blick. Dort lernen sie vier ehemalige Schulkameraden kennen, die dem Trio erzählen, dass ein anderer Schüler vor Jahren mysteriöserweise ums Leben kam. Plötzlich taucht ein weiterer Freund auf - und am nächsten Tag ist er tot!

Die vier ehemaligen Klassenkameraden haben laut Polizei alle ein Alibi. Doch Conan bleibt misstrauisch. Er vermutet, dass es in dem aktuellen Fall eine Verbindung zu dem Todesfall von vor zwölf Jahren gibt...

Bei einer Siegesparade der Tokyo Spirits treffen Conan und seine Freunde auf Inspektorin Sato und Inspektor Shiratori. Diese erzählen, dass sie per Fax eine Drohung erhalten haben. Zunächst verläuft die Veranstaltung unauffällig, doch dann überschlagen sich die Ereignisse...

Conan und seine Freunde sichten Mitsuhikos Videoaufnahmen der Bombenanschläge auf die Parade. Und dabei fällt Conan etwas Entscheidendes auf!

Conan und die Detective Boys fahren nach Akebono, um einem Seriendieb auf die Schliche zu kommen. Dann stoßen sie bei einer alten Dame namens Sanae Hosono auf eine Leiche, die ins Sofa eingenäht ist. Und der Nachbar der Frau will am Vortag angeblich einen Streit mitbekommen haben...