Une lettre de menace est envoyée. Le Kid prévient les autorités qu'il commettra un vol. Il est surpris que la police arrive à perturber ses plans et à le mettre en difficulté. En effet, les forces de l'ordre sont assistées de Shinichi, qui communique par radio depuis un hélicoptère.

Une femme demande à Kogoro de retrouver un ancien ami, qu'elle a connu il y a plus de 30 ans. Après avoir obtenu son adresse, ils se rendent à son appartement. Son voisin le découvre décédé, une blessure à la tête et une photo de la cliente dans la main. Conan a remarqué que la dame a menti à plusieurs occasions.

La victime tient une photo du client de Kogoro - est-ce que cela fait d'elle la principale suspecte ? ! Qu'est-ce que le client cache d'autre à Conan et Kogoro ?

Conan, Ran, Heiji, Kazuha et Kogoro se rendent sur l'île des sirènes à la demande d'un client.

Un festival tourne au vinaigre lorsqu'un des concurrents est retrouvé mort dans une chute d'eau. Conan attend l'aide d'Heiji pour révéler le coupable, mais Heiji et Kazhua sont poussés d'une falaise !

Hattori Heiji emmène la famille Mouri vers une île, sur laquelle une légende raconte qu'il y avait des sirènes. Les personnes qui ont mangé de la chair de sirène auraient obtenu l'immortalité. Lors de la cérémonie annuelle célébrant la légende, 3 femmes sont assassinées.

Les Détectives Junior sont sollicités par un camarade de classe. Un homme s'est invité au restaurant familial pour travailler gratuitement. Ils le soupçonnent d'avoir caché le butin d'un casse d'une bijouterie sous la maison.

Ran, Sonoko et Conan sont dans une salle de jeux d'arcade. Ils y rencontrent leur professeur d'anglais, Jodie. Ran perd un match de jeux de combat contre le champion local. Ce jeu possède des capteurs de sensibilité, faisant sentir les coups reçus. Lorsque le champion affronte un autre challenger, il décède dans son fauteuil.

À la suite de la résolution de l'affaire, Jodie la professeure d'anglais est au téléphone avec une personne inconnue. Elle aurait découvert l'identité de Conan.

Sonoko emmène Ran essayer un cours de poterie, au cours duquel le beau-fils du professeur est assassiné. Il a été retrouvé étranglé par sa propre cravate.

Une fois la police arrivée, Conan est en mesure de révéler le coupable. Ran et Sonoko fabriquent de la poterie pour leurs bien-aimés.

Vodka et Gin sont attablés dans un bar. Ils parlent avec leur autre partenaire, Vermouth, une célèbre actrice blonde vue dans un épisode précédent. Le professeur Agasa et les Détectives Juniors sont en route pour une sortie ski. Durant le trajet en bus, plusieurs hommes armés et masqués prennent le bus en otage pour demander la libération d'un prisonnier. Haibara pense que le professeur de Ran, Jodie, fait partie de l'Organisation.

Après avoir neutralisé les preneurs d'otages, les passagers s'échappent du bus qui explose quelques instants plus tard. La professeure Jodie possède une certaine connaissance des armes. Conan réussit à évacuer Haibara sans qu'elle ne soit repérée par Jodie. Le passager mystérieux communique à la fin de l'épisode avec une personne inconnue, lui affirmant que la cible n'était pas présente.

Un homme reçoit des lettres de menaces et craint pour sa vie. Son ami vient à la rencontre de Kogoro dans un café, pour lui expliquer la situation. Ils marchent ensemble jusqu'à l'immeuble de l'ami menacé lorsque celui-ci tombe du haut de l'immeuble et meurt.

Une connaissance du professeur Agasa l'invite avec les Détectives Juniors. Il offre divers jouets et objets familiaux, car il déménage pour Londres. A son domicile, plusieurs chiens et leurs maîtres sont également présents. Mais un des chiens disparaît et son collier est retrouvé dans l'incinérateur.

Les Détectives Boys fouillent la maison à la recherche d'indices sur le chien disparu. Lorsque l'horloge grand-père ne sonne pas comme inspectée, elle est examinée de plus près.

Plusieurs personnes ayant emprunté de l'argent à un homme d'affaires sont à son domicile, pour déguster différents vins de sa collection personnelle. Il s'absente pour aller chercher une autre bouteille. Ne revenant pas, sa femme part le chercher et le retrouve mort dans la cave à vin.

La famille Mouri se rend à la plage. Ils tombent sur un groupe d'amis qui reconnaissent le fameux détective Kogoro! La jeune fille la plus fortunée du groupe est retrouvée tuée d'un couteau dans la poitrine. Conan sait que le meurtre a été perpétré par une personne de son groupe.

L'un des étudiants en art est retrouvé poignardé au cœur. Que cache ce groupe de club d'art ?

Un nouvel établissement ouvre ses portes : le K3. Les propriétaires sont 3 athlètes de haut niveau. Hattori Heiji invite la famille Mouri pour cet événement. La seconde partie de soirée est troublée par un coup de feu. Le journaliste qui enquêtait sur les 3 athlètes est retrouvé mort. Ses mains font un signe qui pourrait désigner l'identité du meurtrier.

Un boxeur, un joueur de baseball et un joueur de football. L'un de ces trois hommes a tiré sur un journaliste. Qu'est-ce qui dérange Conan ?

La famille Mouri quitte Oosaka en prenant le Shinkansen. Ils tombent sur l'inspecteur Takagi, qui a pour mission de transporter un suspect lié à une affaire de drogue. Une menace à la bombe mobilise sa collègue dans un autre wagon. Pendant ce temps, le suspect se poignarde le ventre dans les WC, sous la surveillance de l'inspecteur Takagi.

La bombe était un leurre. Un trafiquant de drogue est retrouvé assassiné dans les toilettes du train. Takagi a également du mal à être avec Sato car il veut sortir avec elle.

Genta est la cible d'un tueur ! Les Détectives Boys essaient de comprendre pourquoi Genta est ciblé.

Un petit hôtel demande l'aide de Kogoro. Un homme a déposé une valise en laissant une somme d'argent conséquente. Mais le personnel de l'hôtel pense que cette valise est liée à la mort d'un individu retrouvé pendu dans les bois. Avant que la famille Mouri n'arrive à l'hôtel, un imposteur se faisant passer pour Kogoro prend la valise et l'emmène dans sa chambre. Le soir venu, il est retrouvé mort pendu par sa propre ceinture.

Après un détournement de fonds et un double croisement entre voleurs, Conan parvient à percer le mystère de l'imposteur !

Invités, les Mouri dînent chez un architecte de renom, en compagnie de ses assistants et de son épouse. Aux alentours de 19:30, un coup de feu retentit. L'architecte est retrouvé dans son fauteuil, une balle dans la tête.

Les Détectives Junior s'amusent à la plage, en compagnie du professeur Agasa. Ils tombent par hasard sur Sonoko et Ran. Un pêcheur rencontré sur la plage plus tôt dans la journée, est retrouvé noyé, son corps enveloppé dans un filet de pêche.

Le tueur marmonne son témoignage en parlant avec la police et Conan comprend ! Haibara et Ran améliorent leur relation.

Dans un endroit appelé la "forêt apaisante", il y a un petit village. Le chef de ce village est retrouvé mort, mais tout le monde dans le village a un alibi.

L'idole Yoko Okino invite Kogoro, Ran et Conan à une fête de fiançailles chez une amie à elle. Arrivé sur place, le détective apprend que l'amie en question vit sous la crainte d'un stalker. Plus tard dans la soirée, elle est retrouvée dans sa baignoire, égorgée mais consciente.

Il s'est avéré que l'amie de Yoko n'était pas encore morte - elle souffrait juste d'une grave coupure. La police est arrivée rapidement, mais ils n'ont pas pu trouver l'arme du crime. Tout ce qu'ils ont trouvé, c'est une traînée sanglante menant à l'arrière et un manteau ensanglanté. Ainsi, ils ont conclu que l'agresseur devait être le maître chanteur de l'ami de Yoko et qu'il ne faisait pas partie des personnes qui regardaient la bande vidéo. Mais Conan soupçonne que l'arme du crime a été jetée intelligemment.

Conan, Ran et Kogoro visitent une ferme équestre. L'un des hommes y décède – un cheval est-il responsable ?

Les Détectives Boys sont à la recherche d'un clown kidnappeur ! Ils doivent suivre les indices laissés pour sauver un garçon de 5 ans de son ravisseur.

Sato a une réunion de mariage arrangé avec un homme en raison de la persistance de sa mère. Elle arrive pour découvrir que c'est Ninzaburo Shiratori. Elle propose que si Takagi n'arrive pas chez elle avant le coucher du soleil, elle l'épousera qu'elle le veuille ou non. Il accepte, mais Takagi est occupé avec un vol de magasin. Trois des témoins oculaires donnent tous une description différente et trois coupables sont gardés à l'arrière de la voiture de police. Conan au téléphone se prépare à aider Takagi à résoudre l'affaire en tant que Kudo Shinichi.

Takagi résout l'affaire et arrête le coupable lorsqu'il tente de sortir de la voiture de police. Takagi se rattrape et renonce à retrouver Sato à temps pour arrêter le mariage car le soleil est presque couché et la voiture est trop loin. Son groupe vient l'encourager et il court. Conan parvient à arrêter le mariage à temps avec l'aide de Tomoaki Araide. Takagi parvient à rejoindre le restaurant mais le soleil s'est complètement couché. Il voit alors Sato au coin de la rue qui lui dit qu'un cas d'urgence s'était présenté. Takagi sourit en entrant dans la voiture. Pendant ce temps, Shiratori quitte le restaurant, déçu de son mariage proche. Conan commente comment Takagi et Sato lui ont rappelé Ran et lui-même.

Conan fait participer Kogoro au concours Linked Verse pour voir comment le coupable peut se révéler.

Après que Kogoro ait remporté un voyage à Matsue, ils rencontrent un groupe organisant un concours de poésie. Bientôt, l'un des membres est battu à mort et tous les autres membres ne sont pas tristes de le voir mort.

Un voleur est retrouvé mort dans un temple suite à un tremblement de terre. Cependant, le voleur vole dans un pauvre temple loin de chez lui. Quelque chose cloche dans cette affaire.

En sortant d'un cirque, les professeurs et les Detective Boys sauvent un étranger ressemblant fortement au riche propriétaire du cirque d'une foule de journalistes. L'homme dit s'appeler James Black, et être à la recherche d'un homme aux cheveux longs. Il veut remercier les enfants de leur aide, mais est de nouveau confondu pour son sosie fortuné et est enlevé par une bande de malfrats. Il a cependant eut le temps de laisser un indice pour Conan et les autres, et semble au courant des capacités de déduction du jeune détective. Un homme mystérieux rôde autour des évènements.

Les ravisseurs ont appréhendé une voiture de police. Conan et la police partent à la rescousse de James Black et appréhendent les voleurs.

En raison de travaux de construction à proximité, un restaurant tremble constamment, provoquant des assiettes et des verres cassés. Lorsque le propriétaire est retrouvé mort le lendemain, cela ressemble à un accident, mais est-ce le cas ?

Kogoro, Ran et Conan se retrouvent bloqués sur une route enneigée en route vers une source chaude. Ils rencontrent la famille Daimon, qui les laisse passer la nuit, mais le lendemain matin, l'un d'eux est retrouvé mort.

Le père et le frère aîné ont été tués. Est-ce l'œuvre d'une malédiction de samouraï vieille de 500 ans ou quelque chose de plus néfaste ?