在天草式十字凄教与上条的共同作战之下，终于成功击退了后方之水。然而上条才刚回归平稳的日常不久，却又马上在土御门的要求（强迫）之下，与茵蒂克丝搭上前往英国本土的巨型客机“空中巴士365”。在长达九小时的漫长航程中，上条还得忍耐身旁因为肚子饿而不断发牢骚的茵蒂克丝的吵闹声…。正当他离开座位在机内四处张望时，却发现机内有一滩不寻常的血迹…。随后赶到的机组人员的说明下，上条得知有反英的法国极端组织的恐怖分子潜入了机内…！

空中巴士的劫机惊魂落幕，上条和茵蒂克丝平安抵达爱丁堡。与神裂会合后，一行人前往伦敦白金汉宫后，在骑士派领导人骑士团长的带领，上条等人谒见了英国女王伊莉莎及三名皇女，并开始进行会议。为解决以欧陆隧道的爆炸意外为发端，英国正逐渐遭受到孤立的现况，在女王伊莉莎的命令下，骑士团长为首的骑士派负责调查法国方面及欧陆隧道爆炸意外的真相；神裂为首的清教派则着手调查已潜入伦敦、意图改变整个英国的魔法结社“新生之光”的行动。

第二皇女凯莉莎的主导下，骑士派开始在英国本土内展开行动。凯莉莎认为要颠覆英国在英国清教和学园都市为首的科学势力及以罗马正教和俄罗斯成教为首的魔法势力之间的大战中岌岌可危的处境，唯有让英国自两大势力中独立出来形成三足鼎立的局势才能够拯救英国。为了解除手中“正统卡提纳”的使用权限，凯莉莎的下一步是要铲除英国女王伊莉莎以及她的姊妹们。当遭到追杀的第三皇女被凯莉莎逼到走投无路的那一刻，一个男人突然现身，并改变了战局…。